Présentation du plug-in « MR Urography » pour le

Présentation du plugplug-in « MR Urography » pour le logiciel ImageJ
destiné au diagnostic des obstacles à l’écoulement des urines
Michaël Dolores, Sonia Choubrac, Sylvain Payrouse, Nolwenn Marouteau,
Jean-Nicolas Dacher (Laboratoire Quant-If, Faculté de Médecine de Rouen)
Notre application
Excrétion
- Est simple d’utilisation :
ƒ Intuitive
ƒ Efficace
ƒ Possède une interface lisible
- Et des fonctionnalités avancées
- Permet la génération automatisée de rapport au format PDF
- Possède une documentation utilisateur claire et précise (en
anglais)
- Permet à l’utilisateur de saisir ses informations
- Respecte les normes DICOM
Principe
Médical
La quantification de la gêne à l’écoulement des urines est de
diagnostic difficile. L’IRM permet une excellente approche
morphologique, et en outre, permet de mesurer des paramètres
fonctionnels utiles à la prise en charge des patients adultes ou
enfants. L’analyse est basée sur la quantification dynamique
du signal des reins et de l’appareil excréteur, après
administration de diurétique.
Informatique
Permet d’obtenir une courbe d’excrétion qu’il faut ensuite
analyser pour faire son diagnostic
Objectifs
Procédé
- Analyser et Quantifier les séquences dynamiques d’IRM
-Analyser l’excrétion des urines
- Dessiner une ROI (Region Of Interest) autour du rein
(parenchyme et bassinet)
-Mesurer la fonction rénale séparée
- Visualiser la courbe d’excrétion obtenue
Recalage d’images
Gestion des images
Régler le problème induit par le mouvement respiratoire qui
crée un décalage du rein et de la région d’intérêt.
- Permet la conception de rapports
• avec ajout/suppression d’images avec ou sans ROI
• avec ajout/suppression de graphiques
- Permet de commenter facilement les images
- Définition automatique des noms des images
-Insertion d’un commentaire par défaut pour les différents
graphiques (modifiable).
- Prévisualisation des images
fonctionnalités d’ImageJ)
Utilisation des Outils Existants
ajoutées
(utilisation
des
Édition de rapports
- Deux formats : html (portabilité) et PDF (impression)
- Mise en forme des informations de l’interface (images,
diagnostic, …)
- Informations liées au patient et à l’examen (champs DICOM)
Fonction rénale séparée
Principe
Médical
La fonction rénale séparée est proportionnelle à l’aire sous la
courbe entre le niveau de base P (fin du pic vasculaire et le
pic glomérulaire (G) . On pondère cette mesure d’aire par la
volumétrie de parenchyme fonctionnel. On obtient le résultat
sous la forme d’un pourcentage.
Informatique
Calcul automatique de la fonction rénale en utilisant soit le
volume, soit l’aire sous la courbe ou bien encore les deux.
-Aire sous la courbe
ƒ Dessiner une ROI englobant le parenchyme
ƒ Obtenir la courbe s’y rattachant
ƒ Calculer l’aire sous la courbe entre P et G
-Volume
ƒ Vérifier les valeurs des champs DICOM
ƒ Segmenter les images (segmentation automatique)
ƒ Calculer le volume
Outils utilisés
- Utilisation du langage Java 1.3 de Sun microsystems (java.sun.com)
- Plug-in pour le logiciel ImageJ développé au National Institute of Health (http://rsb.info.nih.gov/ij/) – Installation obligatoire d’ImageJ pour pouvoir utiliser l’application MRU
- Utilisation du paquetage itext-1.3 pour l’édition de rapport au format pdf (http://www.lowagie.com/iText/)