Sous-Colle n°5 – Biochimie/Biologie Moléculaire Biochimie Question 1 A 22 acides aminés sont dits protéinogènes. B Les acides aminés possèdent une chaine latérale unique. C Tous les acides aminés présentent un code à 3 lettres sauf un. D Une chaine aliphatique est le contraire de chaine aromatique. E La Glycine est un acide aminé apolaire. Question 2 A Le groupement Isobutyl est un groupement Isopropyl méthylé. B La Proline présente un noyau Pyrrole oxydable. C La Tyrosine absorbe les UV à une longueur d’onde de 275 nm. D Le Groupement Benzène-Pyrrol du Tryptophane absorbe à 280 nm. E La Tyrosine peut être O-Glycosylée. Question 3 A La Phosphorylation de la Sérine est effectuée par des Phosphatases. B La Phosphatase PTEN transforme de l’Inositol-Triphosphate en Inositol Diphosphate. C La Phosphorylation excessive de la protéine α est une des causes de la maladie d’Alzheimer. D Les Mucines favorisent l’apparition de cancer par ajout excessif de N-Acétyl-Galactosamine. E La Phosphorylation est forcément activatrice d’un mécanisme. 1 Question 4 A Les Cystines sont formées par des liaisons covalentes intra-chaînes. B La Vitamine K est un agent Anti-Coagulant. C L’acide Glutamique décarboxylé est un agent fluidifiant du sang. D La Glutamine est l’acide aminé le plus abondant de l’organisme. E Le Syndrôme CDG est le résultat d’une N-Glycosylation excessive. Question 5 A La Lysine et l’Arginine sont chargés positivement à pH neutre. B Les enzymes HDAC et HMTS sont des enzymes jouant un rôle dans la méthylation. C L’Arginine est un acide aminé essentiel. D La Séléno-Cystéine dérive de la Cystéine. E Un acide aminé essentiel est un acide aminé indispensable. Question 6 A A pH 7, L’Alanine est chargé négativement. B A pH 4, L’Arginine a une charge formelle nulle. C Tous les acides aminés ont une valeur de pKa1 égale à 2,3. D Le pHi de l’acide Glutamique est situé entre le Pka2 et le Pkr. E Le pHi de l’Histidine est particulièrement faible pour un aminoacide basique. 2 Question 7 A Lorsque le Pourpre de Ruhemann est mise en solution avec des acides aminés, ceux-ci émettent une coloration violette. B Tous les acides aminés participent à la formation de protéines. C Le Phosphate de Pyridoxal est une transaminase. D Le GABA est un neurotransmetteur inhibiteur du SNC. E La Carboxylation de l’Histamine entraine la formation d’Histidine. Question 8 A La DOPA entraine la formation indirecte de Mélanine. B La Dopamine est formée par la Tyrosine via un intermédiaire. C Adrénaline est un dérivé des Hormones Thyroïdiennes. D La liaison peptidique est une Liaison Amine. E La liaison peptidique implique la mise en résonnance de la fonction Carboxylique. Question 9 A La Fonction Amine intra-chaine d’un dipeptide est amovible. B La Lysine peut enclencher une liaison isopeptidique. C La Cystéine peut enclencher une liaison isopeptidique. D La Fibrine soluble est issue de la Fibrine et est transformée par un facteur issu de la désamination par une Sérine Protéase. E Gramicidine-S et Bacitracine sont des antibiotiques cycliques. 3 Question 10 A La Réaction d’Edman se fait par une Hydrolyse Acide. B La Réaction de Sanger se fait par un Hydrolyse acide. C Les réactions d’Edman et de Sanger se fondent toute les deux sur le même principe à savoir l’incorporation d’un réactif en N terminal d’une chaine peptidique suivie d’une cassure peptidique partielle ou totale. D Il est couramment fréquent d’étudier un peptide par un séquençage unique effectué via une réaction d’Edman ou de Sanger. E Après application d’une Hydrolyse Acide, la Glutamine se change en Asparagine. Question 11 – Soit le Peptide suivant : LAPACESCESTVRAIMENTLAMERDEVIVEMENTLAFIN A L’Acide 2-Nitro-5-Thiocyanobenzoïque coupe ce peptide en 2. B La Chymotrypsine coupe ce peptide, entre autre, en un dipeptide. C La Trypsine coupe ce peptide en 3 peptides de 11, 15 et 13 résidus. D La Chymotrypsine et la Trypsine ne sont pas de la même famille. E La Thrombine présente la séquence caractéristique : His-Ser-Asp. Question 12 A Le Glutathion est un anti-Peroxydant formé par une liaison isopeptidique. B L’Angiotensine voit sa concentration diminuée lorsque l’ECA est absente. C Le Glucagon est formé par les cellules alpha des îlots de Langerhans. D Les Erythèmes Nécrolytiques migrateurs sont le résultat d’un Glucagonome à un stade avancé. E La TRH est composée d’acides aminés courants. 4 Question 13 A La pénicilline est un peptide cyclique. B La pénicilline dérive du dipeptide suivant : Gly - Ser. C La forme acylée de la Ghréline évoque l’aspect Orexygène de la molécule. D L’Aspartam est conseillé pour les diabétiques souffrants de Phénycétonurie. E La PC1 coupe entre l’Arginine et la Lysine localisées en C terminal du Peptide C de la Pré-Insuline. Question 14 A L’Absence de Carboxypeptidase E conduit toujours à une obésité. B GLP1 est une molécule naturelle. C La forme non acylée de la Ghréline présente un analogue de 8 résidus. D La structure tertiaire est formée par des liaisons covalentes. E Le Syndrôme de Prader-Willi résulte d’une hyperphagie associée à une obésité Morbide. Question 15 A La Taurine est issue d’une décarboxylation de l’acide Cystéique. B La Cystéine suit une Oxydation douce lorsqu’elle forme l’acide Cystéique. C La Cystine se forme par Oxydation Douce. D Le Polyéthylène Glycol présent lors de la compétition GLP1/Glucagon, empêche la filtration rapide du GLP1 par les reins. E Les chaines polypeptidiques fixées à la membrane interne de la cellule sont sous forme tertiaire. 5 Question 16 A L’Acide Laurique est issue du Ficus Lyre. B L’acide Arachidique présente 16 Carbones. C L’Acide Linoléique est un (ω6)[Δ9,12,15]. D Un lipide de configuration Trans présente des propriétés clairement différentes de celles des Lipides saturés. E L’Acide Cérébronique est un Homolipide. Question 17 A Les Cérides sont les analogues Homolipidiques des Céramides. B Un Diacyl-Glycérol présentera un Indice de Saponification doublement inférieure à celui d’un Mono-Acyl-Glycérol. C 𝑀(𝐴𝑐𝑖𝑑𝑒 𝑆𝑡é𝑎𝑟𝑖𝑞𝑢𝑒) =2 𝑀(𝐾𝑂𝐻) D Un Cardiolipine est un Glycérophospholipide. E La Céphaline ne présente pas de de fonction amine libre tout comme la Lécithine. Question 18 A Les Plasmalogènes et le Lyso-glycérophospholipides sont des GPL. B La Sphingosine présente 18 carbones. C Les Gangliosides présentent un résidu d’acide sialique. D Les Cérébrosides sont des oligosides courts. E L’acide Rétinoïque est agent de différenciation cellulaire. 6 Question 19 A L’insaturation diminue la rigidité membranaire et le point de Fusion des Lipides. B L’Hydrogénation permet une conservation optimale des lipides insaturés. C Au cours d’une CCM, la Référence frontale est le rapport du front de l’acide gras sur le front du Solvant. D La Chromatographie en Phase gazeuse nécessite une méthylation des lipides afin d’induire une volatilité des lipides. E La Spectrométrie de masse est constituée de 2 méthodes : La CCPG et l’analyse Lipidomique. Question 20 A L’Acide Acétylsalicylique est un inhibiteur de COX-2 uniquement. B La Face interne de la couche cellulaire comprend les composants les moins polaires. C Une membrane cellulaire est composée majoritairement de Lipides. D Les ions de petite taille diffusent librement à travers la membrane cellulaire. E Les protéines membranaires présentent souvent une interaction non covalente avec la membrane cellulaire. Question 21 A La Sphingo-myéline joue un rôle secondaire dans l’Homéostasie. B Les sphingolipides ont un rôle unique de composants structuraux et de récepteurs membranaire. C Les cérébrosides réagissent face à un stress cellulaire. D Les Globosides présentent un ose simple : le N-Acétyl Galactosamine. E Mais non ! Ce sont les Para-Globosides qui ont cet ose dans leur composition. 7 Question 22 A Sur une CCM, le Ganglioside GM1 migrera plus loin que le Ganglioside GM2. B La maladie de Niemann Picks engendre un défaut de synthèse d’Hexoaminase A. C La Maladie de Tay Sachs & de Niemann Picks ne produisent plus de Céramides. D Dans la Maladie de Tay Sachs, il y a accumulation de GM3. E Dans la maladie de Niemann-Picks, on a une accumulation de Sphingomyéline. Question 23 A Une protéine dont les angles Φ et ψ sont tous deux positifs forme une hélice alpha. B Les liaisons Hydrophobes sont insensibles thermiquement. C Deux protéines fonctionnellement assimilables sont assimilables structurellement. D L’épissage alternatif n’a pas d’influence sur le Domaine « Zinc-Finger ». E L’assemblage génétique de 2 protéines va donner une protéine fonctionnellement différente des protéines mères. Question 24 A La LH possède 7 passages transmembranaires le récepteur à la protéine G. B Une protéine est liée à la membrane cellulaire par son N-terminale uniquement. C La liaison Acyl est une liaison faible. D Les récepteurs à Tyrosine Kinase font intervenir les protéines Co-Smad. E Un récepteur à Tyrosine Kinase peut être inhibé par une Phosphokinase. 8 Question 25 A Le Récepteur à l’insuline présente 2 fois plus de ponts disulfures que son ligand. B Une fois muté, le site « Immunoglobuline like » du récepteur au VEGF présente une activité de 30-40 % uniquement. C La formation de l’Hétérodimère « Récepteur à activité Sérine/Thréonine kinase » ne nécessite pas de Facteur β. D La protéine R-Smad va stabiliser l’Homodimère Co-Smad. E Un Homme à Utérus peut s’auto-féconder. On appelle cela l’auto-procréation. Question 26 A Le ligand d’un récepteur couplé à la protéine G, du groupe 3, est en contact avec la membrane cellulaire. B Il existe des Acides aminés hydrophiles intra-membranaire au sein des récepteurs couplé à la protéine G qui les stabilisent. C L’AMP se fixe sur le site catalytique de la Protéine kinase A. D Le domaine ABC présente autant de passages membranaires que le récepteur à la LH. E MDR est une protéine de nettoyage cellulaire qui fait partie de la même famille que la protéine responsable de la Mucoviscidose. 9 Biologie Moléculaire Question 27 A Momo est un ouf dans sa tête. B L’EDTA est proscrit dans le cas de Saturnisme. C La Génétique inverse consiste à analyser la maladie afin de découvrir la structure de la protéine impliquée. D Le Principe de la Dialyse est fondé sur le phénomène d’Osmose. E La purification par une CCM peut être effectuée pour former des standards. Question 28 A La Purification d’une protéine va augmenter l’activité de l’homogénat initial. B 1 KDa = 8,42 résidus environ. C La Méthode par chimiluminescence est une Chromatographie d’affinité. D On peut déduire d’un Western Blot la disparition du gène de la Dystrophine chez les personnes atteintes de la myopathie de Duchennes. E La Glutathion S Transférase est une étiquette in vitro. Question 29 A La GFP est, comme toutes les étiquettes, utilisée in vitro. B La Gyrase bactérienne est une Hélicase Procaryote. C La Topoisomérase induit moins facilement des Surenroulements positif. D La Topoisomérase va forcément nécessiter de l’énergie sous forme d’ATP. E La Fluoro-quinolone va stabiliser la coupure induite par la Gyrase bactérienne. 10 Question 30 A La Campthotecine. va bloquer une des étapes de la Topoisomérase. B La Réplication nécessite la présence d’une ARN polymérase ADN dépendante. C Chez les Procaryotes, c’est l’ADNpol I qui va dégrader l’amorce d’ARN. D L’ADNpol responsable de la polymérisation des fragments d’Okazaki chez l’Homme est l’ADNpol δ. E L’ADNpol α présente toutes les caractéristiques d’une ADNpol I. Question 31 A La Pol III nécessite l’apport d’une protéine extérieure (protéine « Clamp ») qui va la stabiliser au cours de la synthèse du brin direct. B E. Coli a un génome environ 99,5 ‰ plus faible que celui de Charline. C La Méthylation partielle du brin d’ADN permet une correction du brin fils. D L’ADN ligase est présente dans tous les mécanismes de réplication génomique. E La Gyrase Bactérienne est située au front de la fourche de réplication, devant l’Hélicase. 11 Question 32 – Nous sommes dans un génome Eucaryote en cours de réplication, voici le Schéma : A Le Rond rouge pourrait être une Hélicase. B RPA va se situer sur le brin 1 ou le brin 2. C L’ADNpol δ va agir sur le brin 1 dans le sens 2. D Le Brin 1 va être la matrice du brin discontinu. E Le sens 1 est le sens de propagation de la réplication du brin discontinu. Question 33 – Toujours à propos du Schéma précédent. A L’ADNpol α va avoir une fonction d’Exonucléasique dans le sens 2 uniquement. B La primase va agir dans le sens 1 ou le sens 2. C Une Topoisomérase sera en amont de l’Hélicase. D Le sens de propagation de la fourche est le sens contraire du sens 1. E La fonction exonucléasique de l’ADNpol α est dans le sens inverse de la fonction exonucléasique l’ADNpol δ sur le brin 1. 12 Question 34 A La substitution d’une Guanine en Adénine est une substitution par Transversion. B La forme Cétol est la forme des bases la plus fréquente. C La Désamination peut se faire sur toutes les bases puriques. D Après Oxydation, la Guanine modifiée peut se lier à l’autre base pyrimidique. E La Création d’un site AP, c’est transformer un nucléotide en Phospho-ribose. Question 35 A Un agent intercalant induit la destruction de l’ADN. B L’Aflatoxine B1 est une Mycotoxine qui créer des sites AP. C La Mito-Mycine est une molécule qui créer de liaison covalentes entre brins opposés. D Chez les Procaryotes, la protéine codée par le gène « mut » nécessite une méthylation des brins fils. E Chez les Eucaryotes, les méthylations qui permettent la fonction de correction se font sur des îlots CG. Question 36 A L’Alkyltransferase est une enzyme qui va couper les groupements méthyls présents sur les cytosines du brin d’ADN. B La réparation de type BER se fait chez les Eucaryotes et les Procaryotes. C Chez les Eucaryotes, la réparation NER se fait par action d’ERCC1 et des protéines XP. D Chez les Procaryotes, L’Exinuclase ABC possède une activité Hélicase. E Lex-A est inhibé par Rec-A. 13 Question 37 A Le système SOS se base sur la recombinaison homologue. B Un monobrin cassé peut engendrer une leucémie par activation de la protéine Kmax. C Les Micro-ARN sont impliqués dans la maturation des ARNm. D Les ARNr sont les ARN les plus abondants dans la cellule. E L’ARNpol a toujours une activité 5’3’ dans le sens du brin transcrit. Question 38 A Chez les Procaryotes, Enzyme cœur = Holoenzyme + Facteur β. B Chez les Eucaryotes, l’ARNpol I est situé dans le Nucléole tandis que les ARNpol II et III sont localisées dans le Nucléoplasme. C Chez les Procaryotes, l’initiation de la transcription s’effectue par une étape irréversible. D Le Facteur σ est présent tout le long de la transcription. E Des Facteurs d’élongation permettent à l’ARN polymérase de se dissocier plus facilement du transcrit au cours de la transcription. Question 39 A L’arrêt de la réplication génomique Procaryote se fait toujours par formation d’une structure en épingle à cheveux. B Le mécanisme direct nécessite la protéine ρ. C C’est toujours la matrice d’ADN qui forme la structure en épingle à cheveu, sinon il n’y aurait pas de traduction sur l’ARNm. D Chez les Procaryotes, l’ARNpol peut se fixer toute seule sur la région promotrice. E Chez les Eucaryotes, une des régions promotrices de la transcription est la Boite de Pribnow (-10.) 14 Question 40 A Le Facteur TFII H est le dernier des facteurs d’initiation de la transcription qui se fixe sur l’ARNpol II. B Le Facteur TFIIH phosphoryle un site de l’ARNpol II afin qu’il y ait fixation de nouveau Facteur de transcription. C La Coiffe 7-MéthylGuanosine en 3’ de l’ARNm permet l’exportation de la protéine de par sa localisation en N-term. D La queue poly-A permet la distinction de l’ARNm des autres types d’ARN. E U1 et U6 sont des SnRNP qui participent à l’excision intronique. Question 41 A La Dérégulation des ARNm codant pour des protéines du Cytosquelette peut donner lieu à des démences. B Une élongation en 3’ de la queue de Poly-adénylation est un facteur d’instabilité. C L’ARNr précurseur 45s va subir un épissage alternatif pour donner les ARNr 28s, 18s et 5,8s. D L’assemblage des protéines et des ARNr se fait dans le noyau. E L’assemblage des sous-unités ribosomiques se fait dans le cytoplasme. Question 42 A La Complémentarité entre Codon et Anticodon est respectée lors de la fixation d’un ARNt sur l’ARNm. B UAG est le codon Stop Ambre. C L’acide aminé initiateur de la traduction chez les procaryotes est la N-MéthylMéthionine. D Le Wooble induit le fait d’avoir plus d’ARNt que d’acides aminés. E Un même anti codon peut reconnaître plusieurs codons. 15 Question 43 A Une mutation non-sens fait nécessairement l’objet d’un décalage de lecture. B Les bras latéraux sont constitués des 20 acides aminés protéinogènes. C Le 5’Aminoacyl-Adénylate se fixe sur son ARNt via le ribose d’une Adénine en 3’. D La Séquence de Kozac est situé en 5’ du codon AUG. E La Grande sous unité du ribosome se lie à sa petite sous unité au milieu de l’initiation de la traduction. Question 44 A La Séquence Shine-Dalgarno est complémentaire et anti // à l’ARNr 18s. B Deux codons AUG et 2 codons STOP sont nécessairement présents sur un ARNm pour que cet ARNm soit dit Polycistronique. C La Toxine Diphtérique est active chez les Procaryote uniquement. D La Streptomycine bloque l’initiation de l’initiation de la Traduction. E La Régulation eucaryote peut se faire au niveau de la dégradation de la protéine. Question 45 A A [E] constant, on est en ordre 0 quand la Vmax est atteinte. B Un inhibiteur non compétitif ne change pas la Vmax. C Plus l’enzyme est polaire, plus sa liaison au substrat est grossière. D Le Km est la constante de Michaelis. Elle équivaut à la concentration de Substrat V = Vmax. E Le Km est proportionnel à l’inverse de l’affinité de l’enzyme pour son substrat. 16