PROFIL DE POSTE D’ENSEIGNANT-CHERCHEUR / RECRUTEMENT 2016
MAITRE DE CONFERENCES
Intitulé du poste :
Exploration et évolution de la biodiversité: systématique des organismes du benthos tropical
Département : Département Systématique & Evolution
Unité d’accueil : UMR 7205 ISYEB, équipe « 3E : Exploration, Espèces et Evolution ».
Sections concernées du CNU : 67 et 68
Description détaillée du poste :
Contexte scientifique
Les expéditions organisées par le MNHN dans le domaine marin tropical et les collections ainsi constituées ont
fait progresser les connaissances sur la biodiversité de manière unique au monde : au cours des 10 dernières
années, près de 20% des nouvelles espèces marines décrites dans le monde proviennent de spécimens récoltés
pendant ces expéditions. L’enrichissement des collections d’organismes du benthos marins par ces expéditions et
leur valorisation par un réseau international de taxonomistes animé par des enseignants chercheurs du MNHN,
connaît en effet une dynamique exceptionnelle et apporte des données uniques à l’échelle internationale.
L’accumulation de ces données de systématique permet aujourd’hui d’envisager le développement de
thématiques nouvelles notamment sur la structure et l’évolution des communautés ainsi que sur l’analyse
des scénarios de la biodiversité dans le cadre des changements globaux.
1) Recherche et expertise (50%)
Recherche : Les thématiques de recherches abordées par l’enseignant chercheur concerneront l’évolution
et la structure des communautés des organismes du benthos. L’évolution pourra être abordée à différentes
échelles temporelles en utilisant les méthodes appropriées de phylo-génomique et/ou de génomique des
populations en lien avec l’analyse des données morphologiques et écologiques. L’étude de la structure des
communautés sera abordée selon une approche à la fois biogéographique et macro-écologique (prise en compte
des facteurs structurant de l’environnement comme la profondeur, la nature du substrat, la fragmentation des
habitats) incluant la construction de scénarios des effets des changements globaux sur la biodiversité notamment
à l'aide de modèles de niche.
Concernant les groupes biologiques à étudier, une priorité est donnée aux organismes fixés qui sont supposés
avoir un rôle structurant (« organismes architectes ») sur la distribution et la diversité des autres organismes du
benthos. Cette hypothèse pourra notamment être testée en confrontant les données de taxonomie obtenues
sur les organismes fixés à celles disponibles pour d’autres taxons étudiés par l’équipe à partir de
collections réalisées au cours des mêmes expéditions. Cette comparaison s’intéressera plus particulièrement à
des taxons en association biologique (parasitisme, commensalisme, symbiose).
Le développement de ces thématiques pourront s'appuyer sur les avancées technologiques de la génomique à la
fois dans l’amélioration des délimitations et de la classification des taxons (barcoding multilocus et
phylogénomique) et dans l’étude de la structure des populations et des communautés (connectivité génétique par
des approches de type RadSeq quand les échantillons populationnels sont de taille réduite, génomique
environnementale pour l’étude des réseaux trophiques, etc.). Les thématiques pourront également être
développées à l’aide des outils d’analyse spatiale et temporelle des données de biodiversité (SIG, modèle de
niche, etc.)
Les recherches développées devront reposer sur la valorisation des données de taxonomie issues des collections
constituées par les expéditions naturalistes MNHN dont l’équipe est maître d’œuvre. L’obtention des données de
biodiversité passera par l’animation d’un réseau de taxonomistes au niveau international autour des collections.
Expertise :Les données concernant la structure de la diversité des organismes sont un élément clé pour orienter
les choix des gestionnaires des espaces naturels. Une interaction avec le Service du Patrimoine National (et/ou
l’Agence Française de la Biodiversité) permettra d'analyser et de rendre disponibles les données concernant les
territoires français afin de répondre aux attentes des gestionnaires. Au vu de la charge de collection envisagée est
attendue une expertise pour la CITES, notamment concernant les cnidaires.
2) Collections (40%)
Le/la candidat(e) devra structurer et animer un des secteurs orphelins ou déficitaires incluant la valorisation de