Mémoire Présenté Diagnostic moléculaire du

UNIVERSITE DE OUAGADOUGOU
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UNITE DE FORMATION ET DE RECHERCHE
SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE
(UFR/SVT)
LABORATOIRE DE BIOLOGIE MOLÉCULAIRE
ET DE GÉNÉTIQUE MOLÉCULAIRE
(LABIOGENE)
Mémoire Présenté
Par : OUEDRAOGO Rogomenoma Alice
Pour l’obtention du Master II
de Biologie Moléculaire et de Génétique Moléculaire Appliquées
de l’Université de Ouagadougou
SUR LE THEME:
Diagnostic moléculaire du cytomégalovirus, de l’herpès virus
humain de type 6 et d’Epstein-Barr virus par la PCR en temps
réel chez les femmes enceintes du centre médical saint Camille
de Ouagadougou.
Soutenu le16 Novembre 2013 devant le jury composé de :
Président : Nicolas BARRO, Professeur Titulaire, Université de Ouagadougou ;
Membres : Jacques SIMPORE, Professeur Titulaire, Université de Ouagadougou ;
Virginio PIETRA, Chargé de Recherche, Université de Brescia, Italie ;
Djénéba OUERMI, Maitre Assistant, Université de Ouagadougou.
N° d’Ordre……………..BioGeMA

Master II / BioGéMA / 2012 / Rogomenoma Alice OUEDRAOGO Page i
Préface du Coordonnateur du Master BIOGEMA
De nos jours, les connaissances avancées en génétique et biologie moléculaires sont incontournables
pour conduire des études de hautes valeurs ajoutées en sciences biologiques. Les outils de la Biologie
moléculaire ont permis d’accomplir de grands progrès dans le domaine du diagnostic, de la pharmacie,
de la thérapeutique, de l’agriculture et même dans l’aide à la justice par l’identification humaine. Les
Universités et les laboratoires de recherche des Pays membres de l’UEMOA dans leur grande majorité,
restent arrimés aux pays et laboratoires de recherche du Nord pour leurs besoins en recherches et
activités en génétique et biologie moléculaires. Cet état de fait est lié au déficit en personnel qualifié et le
manque de ressources financières et matériel pour conduire les recherches en local in situ. Cela a pour
conséquence, une non maîtrise de la finalité ainsi que de l’utilisation des résultats et produits des
recherches que nous conduisons, une surenchère du coût des examens et des études en biologie et
génétique moléculaires. Un autre corollaire et non des moindres de cet état de fait est la fuite de capitaux
mais également la fuite des cerveaux car les étudiants les plus compétents envoyés dans les pays du Nord
ont tendance à y rester.
Le master en Biologie Moléculaire et en génétique moléculaires appliquées (BioGeMA) a pour but de
combler le vide constaté dans l’expertise en génétique et biologie moléculaires par la mise à disposition
des pays de l’espace UEMOA, de personnels qualifiés, de haut niveau de compétences pour conduire des
études et recherches en génétique et biologie moléculaires.
Le master BioGeMA est :
 Un Master à dimension sous-régionale
 Géré par un réseau de chercheurs et praticiens en génétique et biologie moléculaires
 Soutenu par une plateforme technologique sous-régionale à LABIOGENE (Laboratoire de
Biologie et de Génétique Moléculaires)
Ce Master a pour objectif de former des biologistes, des pharmaciens, des vétérinaires et des médecins
biologistes capables d’effectuer des diagnostics biomoléculaires dans des centres hospitaliers et
d’élaborer des études d’investigations dans des structures de recherches. En outre, il ouvrira la porte
d’études doctorales aux meilleurs étudiants pour permettre la formation de chercheurs et d’enseignants-
chercheurs afin d’assurer la relève du corps enseignants, la constitution d’une masse critique d’experts
africains et la mise en place d’un véritable réseau africain de recherche dans le domaine ci-dessus cité.
Professeur Jacques SIMPORE
Professeur Titulaire de Biologie Moléculaire et de
Génétique Moléculaire
UFR/SVT - École Doctorale Sciences et Technologies et
Technologies
Université de Ouagadougou – Burkina Faso

Master II / BioGéMA / 2012 / Rogomenoma Alice OUEDRAOGO Page ii
DEDICACES
Je dédie ce mémoire :
A mon Père Yssouf Marc Désiré OUEDRAOGO et à ma Mère Salmata Cécile
OUEDRAOGO/ SAWADOGO pour leur compréhension, bénédictions, encouragements et
assistance ;
A mes Sœurs, frères et Parents pour leur accompagnement, l’affection et la complicité,
A tous les amis qui ont su nous encourager et nous faire sentir leur présence à nos côtés,
A toutes ces femmes VIH séropositives qui souffrent dans leur chair et dans leur âme à cause
du rejet de leur famille et/ou de notre société et à toutes les personnes qui s’investissent pour
leur cause ;

Master II / BioGéMA / 2012 / Rogomenoma Alice OUEDRAOGO Page iii
REMERCIEMENTS
Ce travail a été réalisé au Centre Médical Saint Camille et au Centre de Recherche
Biomoléculaire Pietro Annigoni (CERBA/LABIOGENE) de Ouagadougou (Burkina Faso).
Nous exprimons notre profonde gratitude :
- à notre Maître et directeur de mémoire, le Professeur Jacques SIMPORE, Professeur
titulaire de génétique et de biologie moléculaires ,directeur du CERBA/LABIOGENE, du
laboratoire du CMSC et Recteur de l’Université Saint Thomas d’Aquin (USTA) . Nous
sommes très marquée de l’honneur que vous nous avez fait en nous acceptant dans vos
laboratoires bien équipés, de nous encadrer avec rigueur, patience et une disponibilité
permanente malgré vos multiples charges, de nous avoir choisi un thème pertinent et nous
avoir entouré de votre soutien moral et matériel;
- à notre Maître, le Professeur Nicolas BARRO, pour la haute supervision et le soutien dont
il n’a cessé de montrer à notre endroit. Malgré vos multiples occupations, vous avez accepté
de suivre et de juger ce travail. Soyez-en remercié
- au Professeur Jean-Baptiste NIKIEMA, aux Docteurs Charlemagne GNOULA et
Virginio PIETRA pour la qualité de leur enseignement ;
- au Docteur Cyrille BISSEYE, pour l’encadrement technique au laboratoire et son aide
précieuse dans la réalisation de ce travail ;
- aux Docteurs Djénéba OUERMI , Florencia DJIGMA, Linda Tani SAGNA et à
madame Zoenabo DOUAMBA pour leur disponibilité, leurs conseils et leur contribution
à la réalisation de ce travail ;
- à tous nos enseignants du Master BioGéMA ;
- à la Commission de l’UEMOA pour leur soutien financier dans la réalisation de nos
travaux de mémoire du Master II à travers le Pacer II;
- à la Conférence Episcopale Italienne (CEI) pour leur soutien financier ; à toute l’équipe du
CERBA/LABIOGENE, au personnel du laboratoire du CMSC de OUAGADOUGOU et à
tous les étudiants de notre promotion pour la bonne ambiance, les conseils et les
encouragements ;

Master II / BioGéMA / 2012 / Rogomenoma Alice OUEDRAOGO Page iv
RESUME
Introduction : Les herpès virus sont très répandus dans le monde entier. La présente étude se
porte sur trois herpès virus, notamment EBV, CMV et HHV-6. Ces trois virus évoluant sous
le modèle pandémique sont impliqués dans des infections congénitales pouvant provoquer des
séquelles graves chez les nouveau-nés. L’objectif de cette étude est de déterminer les
prévalences de CMV, EBV et HHV-6 chez les femmes enceintes de Ouagadougou à sérologie
VIH plus ou moins connue.
Méthode : nous avons diagnostiqué par PCR multiplex en temps réel l’infection à EBV,
CMV et HHV-6 dans 200 échantillons constitués de plasma sanguin de femmes enceintes :
dont 100 femmes VIH séropositifs et 100 femmes VIH séronégatifs. L’ADN de ces herpès
virus humains a été extrait à l’aide du Kit «DNA-Sorb-B» de SACACE biotechnologies®
puis amplifié grâce au Kit « Multiplex Real Time PCR Kit for quantitative detection and
differentiation of Cytomegalovirus (CMV), Epstein Barr virus (EBV), and Human Herpes 6
virus (HHV6)» de SACACE biotechnologies®.
Résultats : sur l’ensemble des 200 échantillons analysés, 18 (9,0%) étaient positifs à au
moins un des trois virus, 12 (6,0%) étaient positifs au EBV, 13 (6,5%) positifs au CMV et 12
(6,0%) positifs au HHV-6. Parmi les 18 cas d’infections, nous avons trouvé 10 cas de
coïnfections soit un taux de 55,6% (10/18) dont 90,0% (9,0/10) d’infection multiple
EBV/CMV/HHV6 et 10,0% (1/10) d’association EBV/HHV6. Par ailleurs, des coïnfections
EBV/CMV ou CMV/ HHV6 n’ont pas été détectées chez les femmes enceintes de notre étude.
En fonction de la sérologie VIH, nous avons trouvé 12,0% d’infections aux Herpès Virus
Humains (HHVs) chez les femmes VIH séronégatives et 6,0% chez les femmes VIH
séropositives. Le taux de coïnfection était respectivement de 6,0% et 4,0%. Parmi les VIH
séropositives, la PCR a révélé 7,1% (soit 6/85) d’infection HHVs chez celles qui n’étaient
pas sous thérapie ARV et 0% chez les femmes enceintes VIH séropositives soumises à une
thérapie ARV. Les HHVs ont été beaucoup plus isolés chez les ménagères (P= 0,418).
Conclusion: Nous avons trouvé une faible prévalence du CMV, d’EBV et de HHV6 chez les
femmes enceintes. La prévalence des herpès virus humains était plus élevée chez les femmes
enceintes VIH négatives que chez les femmes enceintes VIH positives mais la différence
n’était pas significative.
Mots clés : Burkina Faso ; Femmes enceintes ; PCR Multiplexe en Temps Réel ; VIH ;
CMV ; EBV et HHV-6