Génétique moléculaire des populations
1 Le polymorphisme moléculaire
Génétique moléculaire des populations
(Depaulis, Brazier et Veuille, 1995)
Polymorphisme moléculaire = polymorphisme de séquence d'ADN
1 La diversité haplotypique
Génétique moléculaire des populations
(Depaulis, Brazier et Veuille, 1995)
Un haplotype est une combinaison donnée de nucléotides polymorphes le long d'une séquence
Polymorphisme moléculaire = polymorphisme de séquence d'ADN
1 La diversité haplotypique
Génétique moléculaire des populations
Polymorphisme moléculaire = polymorphisme de séquence d'ADN
Diversité haplotypique: probabilité que deux haplotypes tirés d'une population soient semblables.
La définition est la même que pour l'hétérozygotie ou la diversité allélique.
Un haplotype est une combinaison donnée de nucléotides polymorphes le long d'une séquence
Hétérozygotie attendue sous
l'hypothèse de H-W
l locus, 2 allèles
Hétérozygotie attendue sous
l'hypothèse de H-W
l locus, k allèles
Estimation à partir d'un
échantillon de taille n
1 La diversité nucléotidique
Génétique moléculaire des populations
Nombre moyen de différences entre deux séquences choisies aléatoirement dans la population:
n: nombre de séquences échantillonnées
dij: nombre de différences observées entre
séquence i et séquence j
n: nombre de séquences échantillonnées
K: nombre d'allèles différents
dij: nombre de différences observées entre
séquence i et séquence j
L: longueur de la séquence étudiée
Diversité nucléotidique:
6
7
8
9
10
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67
68
69
70
71
1
/
71
100%
