Si oui, à partir de votre séquence A inconnue, identifiez 1 espèce qui montre une
homologie avec votre séquence. Précisez
a) le numéro d’accession de la séquence homologue,
b) le nombre de nucléotides total de l’ADNc homologue,
c) le pourcentage d’identité
d) le nombre de nucléotides comparés
e) le nombre de nucléotides identiques qui sont inclus dans la
comparaison.
Si non, expliquez comment vous en arrivez à cette conclusion.
1.7- Un scientifique portugais qui a entendu parler de vos travaux vous fait
parvenir la séquence B et vous demande de vérifier s’il travaille sur le même gène
que vous ou non.
Comparer les 2 séquences.
a) Quel algorithme avez-vous utilisé pour répondre à la question?
b)
c) Quel est le pourcentage d’identité entre les 2 séquences ?
d) Basée sur ces résultats, quelle hypothèse pouvez-vous fournir quant à
l’identité des 2 séquences ?
2- (2 points) Vous analysez ensuite l’organisation génomique du gène que vous avez
identifié (en tenant compte de vos résultats de la section 1). Pour répondre aux prochaines
questions, utilisez la séquence d’un ADNc complet (voir section 1.5a).
2.1- Quel algorithme et quelle génothèque vous permettront d’analyser
l’organisation génomique de votre séquence?
2.2- Combien de clones ont été retrouvés dans la génothèque?
2.3- Sur quel chromosome est portée la séquence?
2.4- Quel est le nombre d’exons de ce gène?
2.5- Cliquez sur l’icône « Map viewer » situé en haut à droite des comparaisons
de séquence. Identifiez les numéros des nucléotides au début et à la fin de l’exon 3
(numérotation par rapport à la séquence de l’ADNc utilisé).
2.6- A partir de « Map viewer », indiquez le pourcentage d’identité entre votre
séquence et celle de l’exon 9.