Apport des puces à ADN dans le diagnostic rapide en

Apport des puces à ADN
dans le diagnostic rapide en routine
…une pathologie, un pathogène, …
Fr
Fré éd dé éricLaurent ricLaurent
LaboratoiredeBactériologie,GroupementHospitalierNord,HospicesCivilsdeLyon
CentreNationaldeRéférencedesStaphylocoques,InsermU851

Qu
Qu’ ’est est‐ ‐cequ cequ’ ’unepuce unepuceà à
ADN?
ADN?
Anglicisme?
"DNAFlea"
microarray

Support
Qu
Qu’ ’est est‐ ‐cequ cequ’ ’unepuce unepuceà à
ADN?
ADN?
Cibles(ADNamplifié)
PCR
RT‐PCR
ADN
ARN
Sondes(n=50à250000)
.ADN:oligonucléotides,produitsPCR
.unspot=unesonde=ungène/allèle
.monobrin
.immobilisées
.attendantdes’hybrideravecunbrin
complémentaire

Applicationsdespuces
Applicationsdespucesà à
ADN
ADN
Pucesdehautedensité
Scannerconfocal
Hybridation
Analysequalitative
et/ouquantitative
Transcriptomique
ARNm
Cy3 Cy5
Marquage différentiel
del’ADNc
Bactérie
s
sauvagevsmutant
condition1vscondition2
Bactérie
s
ARNm
Bactérie
s
Génomique
ADN
Cy3 Cy5
Marquage différentiel de
l’ADN
SoucheBSoucheA
Bactérie
s
ADN

Puce
Puceà à
ADNpourlaroutine
ADNpourlaroutine
• Formatsimpleà manipuler
"Touslesavantagessanslesinconvénients"