ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE

UMR CNRS 6023 Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement, Clermont Université (C.
Amblard)
Directeur de thèse : Christian Desvilettes (PR), co-directeur Gilles Bourdier (PR)
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Dynamique des composés organiques d’origine allochtone ou autochtone dans les réseaux
trophiques d’un écosystème lotique : approche par l’analyse isotopique des composés spécifiques
En rivière, la matière organique à l’origine des flux de matières peut avoir différentes origines : allochtone
(litières) ou production primaire autochtone. Les macroinvertébrés broyeurs, spécialisées dans
l’ingestion/fragmentation de cette litière et les espèces filtreuses de matière organique fine apparaissent de
plus en plus tributaires de la production primaire (biofilms) pour leur développement (Descroix et al. 2010).
Les feuilles mortes immergés se caractérisent par de fortes teneurs en composés réfractaires et un rapport
C:N élevé qui semblent leur conférer une médiocre qualité nutritionnelle. Celle-ci est toutefois susceptible
d’être améliorer par les feutrages de microorganismes (bactéries, hyphomycètes) qui se développent sur la
litière et les particules fines. Le projet aura pour but d’évaluer la provenance du carbone assimilé par des
espèces clés de macroinvertébrés colonisant les litières ou collectant ces particules organiques fines.
L’effort principal portera sur l’origine du carbone lié aux lipides (acides gras et stérols) ainsi qu’aux acides
aminés. L’analyse isotopique des composés spécifiques (AICS) qui permet d’identifier les signatures du
carbone (C13/C12) au niveau de la molécule et de tracer leur origine dans l’écosystème constituera
l’approche méthodologique centrale du projet.
DESCROIX A , BEC A., BOURDIER G., SARGOS D., SAUVANET J., MISSON B. & DESVILETTES C. (2010)- Fatty
acids as biomarkers to indicate main carbon sources of four major invertebrate families in a large River. Fundamental
and Applied Limnology, 177, 39-55.