DEMANDE D’ALLOCATION DE RECHERCHE Septembre 2006 * Nom de l’équipe d’accueil : Génomique évolutive et environnementale du phytoplancton Direction scientifique : Hervé Moreau Thématique de recherche : Biodiversité et dynamique des souches d'Ostreococcus et leurs virus Intitulé du sujet de thèse : Spécificité et coévolution entre Ostreococcus spp. et virus Directeurs de thèse : Nigel Grimsley (DR CNRS) et Yves Desdevises (MC UPMC) Unité de recherche du Directeur de thèse (intitulé, adresse, tel, mail) : Observatoire Océanologique de Banyuls, UPMC, UMR 7628 BP 44, 66651 Banyuls-sur-Mer Cedex 04 68 88 73 96, [email protected] Département : Modèles en biologie cellulaire et évolutive Sujet résumé : Les virus sont des acteurs majeurs de la régulation des populations phytoplanctoniques (1). Les algues phytoplanctoniques du genre Ostreococcus (2), ont une répartition mondiale, et comprennent plusieurs souches récemment caractérisées (3). Différents éléments indiquent clairement qu’Ostreococcus est parasité par plusieurs souches de virus (4). Nos observations prélimaires montrent que des virus d'Ostreococcus sont présents en Méditérranée et dans différents étangs côtiers et qu'ils peuvent être isolés et cultivés en laboratoire. L'objectif de la thèse est de caractériser (incluant séquençage et annotation) ces différentes souches de virus et d'établir leur patrons de spécificité envers les différentes souches d'Ostreococcus (5). Par l'établissement de réseaux phylogénétiques pour les hôtes (le génome d’Ostreococcus est connu) et leurs virus, il sera possible d'étudier la coévolution de cette association à l'aide de méthodes analytiques dédiées. Cela permettra de comprendre l'histoire évolutive de ce système picoalgue-virus et les facteurs qui contrôlent la spécificité des souches virales. 1. Suttle C. 2005. Nature 437:356-461 2. Courties et al. (1994). Nature 370:255 3. Rodriguez et al. 2005. Env. Microbiol. 7:853-9 4. O'Kelly et al. C. 2003. J. Phycol. 39:850-4 5. Schroeder et al. 2003. Appl. Environ. Microbiol. 69:2484-90 Principales références récentes des Directeurs de thèse : Desdevises et al. 2002. Biol J. Linn. Soc. 77:431-43 Desdevises et al. 2002. Evolution 56:2459-71 Gal et al. 1991. EMBO J. 10:1571-1578. Gal S et al. 1992. Virology 187:525-533. Makarenkov et al. 2004. Zool. Script. 33:89-96 Legendre et al. 2002. Syst. Biol. 51:217-34