ORIGINE DES BIOCONTAMINATIONS : les différentes flores, les

ORIGINE DES BIOCONTAMINATIONS : les différentes flores, les voies de transmission et de pénétration
Cours de microbiologie TCSS - 1 -
ORIGINE DES BIOCONTAMINATIONS
LES DIFFERENTES FLORES
LES VOIES DE TRANSMISSION ET DE PENETRATION
Objectifs :
1. Classer les différentes flores
2. Indiquer les principales flores commensales de l’homme
3. Enoncer les principaux modes de contamination directs ou indirects (air, eau, aliments,
terre, productions biologiques, matériels, insectes…)
4. Enoncer les voies de pénétration (cutanée, muqueuse, parentérale, sanguine…)
Biocontamination : les matières premières, les instruments, les aliments sont rarement stériles, ils
peuvent être contaminés par des micro-organismes, on parle de biocontamination. Les micro-
organismes contaminants sont très variés et peuvent être classés selon leur origine exogène ou
endogène.
 Origine exogène : les biocontaminations peuvent provenir des milieux naturels : sol, air, eau.
 L’air : l’atmosphère n’est pas un milieu très favorable à la prolifération microbienne. Dans l’air
extérieur les micro-organismes rencontrés sont plus nombreux à la ville, en été, au-dessus des
terres cultivées fertiles, des eaux de surfaces polluées… les espèces rencontrées ne sont pas
uniformes. Prédominance de bactéries (bacillus, staphylococcus, microcoques…) et de
champignons (aspergillus, penicillium…). Dans l’air confiné des habitations, des écoles, des
hôpitaux… l’air est d’autant plus contaminé qu’il y a beaucoup d’individus. Les micro-organismes
sont véhiculés par les poussières, les gouttelettes de salive.
 L’eau : la flore d’une eau de rivière est très diversifiée : on y trouve des entérobactéries provenant
des rejets égouts, des bactéries pathogènes, telles salmonella ou shigella, responsables de toxi-
infections. L’eau du robinet a été traitée pour détruire les micro-organismes. L’eau de source
contient des bactéries provenant du sol, des végétaux bordant le cours d’eau, et des plantes
aquatiques.
 Le sol : la flore microbienne tellurique est très variée et comprend des bactéries, des
champignons, des algues, des protozoaires et des virus. Les bactéries sont les plus nombreuses :
plusieurs milliards par gramme.
 Origine endogène : les biocontaminations peuvent provenir :
 d’une flore commensale animale (exemple de la viande de boucherie contaminée par des
micro-organismes appartenant à la flore intestinale de l’animal)
 d’une flore commensale humaine en particulier des flores intestinale et cutanée lorsque les
précautions d’hygiène sont négligées
Objectif 1 : classer les différentes flores à l’origine des biocontaminations
Objectif 2 : indiquer les principales flores commensales de l’homme

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Cours de microbiologie TCSS - 2 -
Les flores commensales ou inoffensives vivent sur l’hôte sans lui causer de troubles.
 Il existe des flores commensales au niveau :
 De la peau : flore cutanée.
 Des muqueuses des cavités naturelles : voies aéro-digestives (nez, bouche, pharynx), intestin,
vagin.
 Chaque flore comporte :
 Une flore résidante : c’est une flore de base constituée d’espèces permanentes. Ces espèces
sont dépourvues de rôle pathogène tant quelles restent dans leur habitat normal.
 Une flore transitoire : c’est une flore constituée d’espèces inconstantes ou «touristiques». Ces
espèces peuvent être pathogènes lorsque la flore résidante est perturbée. Parmi les espèces
transitoires susceptibles d’être pathogènes, on peut citer le staphylocoque doré, certaines
entérobactéries, clostridium perfringens…
La flore résidante ne peut être éliminée en totalité par un nettoyage, même par les
antiseptiques les plus puissants contrairement à la flore transitoire. Seul le port de gants
est susceptible de réduire les contaminations par la flore résidante de la peau.
 Différentes flores commensales
Nom de la flore
localisation
Flore de base ou
résidante
Flore transitoire
Flore cutanée
Peau et muqueuses
Staphylocoques blancs
Microcoques
Corynebactéries
Streptocoques
Staphylocoques dorés
Entérobactéries (région
anale, mains)
Pseudomonas aeruginosa
Flore nasale
Nez
Staphylocoques blancs
Staphylocoques dorés (35
à 75% de porteurs)
Flore bucco-
pharyngée
Bouche et gorge
Streptocoques
Corynebactéries
Staphylocoques dorés
Entérobactéries
Pseudomonas aeruginosa
Pneumocoques
Flore intestinale
Intestin
Clostridium perfringens
Streptocoques D
Escherichia coli
Coliformes
Enterocoques
bacillus
Staphylocoques dorés
Pseudomonas aeruginosa
Flore vaginale
Organes génitaux
Lactobacillus (bacilles de
Döderlein)
Streptocoques B et D
Entérobactéries
Clostridium perfringens
Mécanismes de l’infection.
Sources de l’infection :
A partir des deux sources microbiennes essentielles : flores humaines et environnement, l’infection
d’un patient peut répondre à trois mécanismes :
 Infection exogène : les germes responsables de l’infection sont extérieurs au patient. Ils ont été
apportés par l’environnement, une autre personne.
 Infection endogène : le patient est contaminé par ses propres germes constituant la flore
commensale et qui ont migré vers d’autres organes généralement à l’occasion d’une modification
de cette flore sous l’influence d’une antibiothérapie.
 Infection par contiguïté : ce mécanisme intervient chez des patients qui présentent une plaie,
des brûlures ou des escarres. La contamination peut se faire par l’intermédiaire du linge, par voie
manuportée par le patient lui-même ou le personnel ou de proche en proche (région lombo-
sacrée)
Objectif 3 : énoncer les principaux modes de contamination directs et indirects

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Cours de microbiologie TCSS - 3 -
PORTEURS DE GERMES PATIENT
Infection endogène
Infection
exogène
infection par contiguïté
directe ou par l’intermédiaire
des mains ou du linge
La contamination : définition :
C’est l’action d’introduire des micro-organismes issus d’un milieu donné dans un autre milieu qui
devient contaminé. Pour qu’une infection se déclare, il faut qu’un germe pathogène pénètre un
organisme et s’y développe.
les différents modes de contamination :
 La contamination peut être directe : d’un individu malade à un individu sain. Elle peut se faire par
deux voies :
 La voie aérienne : Par gouttelettes inhalées par le patient ou projetées au niveau d’une plaie lors
d’un pansement. Le staphylocoque doré est la bactérie habituellement transmise par cette voie.
 La voie manuportée : les mains peuvent être souillées par des staphylocoques dorés par ex et les
bactéries sont alors transmises directement au patient lors d’un pansement.
 La contamination peut être indirecte : le micro-organisme atteint l’individu par l’intermédiaire d’un
vecteur (eau, aliment, animal, objet…). En milieu hospitalier, ces vecteurs sont représentés pr le
matériel et les divers produits utilisés pour les soins. Un instrument mal stérilisé peut transmettre
des micro-organismes provenant d’un autre malade.
Les sources de l’infection sont multiples. Dans les contaminations exogènes, la voie manuportée joue
un rôle très important. Les précautions d’hygiène devraient donc limiter grandement ce type
d’infection. L’infection endogène, considérée actuellement comme la plus habituelle, est imprévisible.
On peut seulement en diminuer la fréquence et la gravité en évitant les traitements antibiotiques
inutiles ou mal conduits
Flore nasale et
Bucco-pharyngée
CONCLUSION
FLORE INTESTINALE
Nez et Bucco-pharynx
MAINS
FLORE INTESTINALE