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SVETB315 - Microbiologie et virologie
Objectifs
Une connaissance approfondie de la microbiologie est nécessaire au Biologiste. L'origine de la vie est microbienne, le vivant encore aujourd'hui est la
manifestation de cette association symbiotique entre virus bactérie et cellules eucaryotes.
Contenu
L'enseignement de la microbiologie comprend : - des notions étendues de bactériologie générale : structure et physiologie bactérienne, croissance et
milieux de culture, aseptie et antiseptie, infectiosité et virulence, taxonomie, répartition dans la nature ; - des notions et travaux pratiques de technologie
bactériologique ; - des notions de virologie générale.
Table des matières
• INTRODUCTION :
Nouvelle vision du monde bactérien
• HISTORIQUE
Le concept de microorganisme
Le concept de protiste
Carl Woese et le système à 3 domaines
Bref historique de la Microbiologie
avant l’ère pastorienne
l’ère pastorienne
la bactériologie médicale
• LA CELLULE BACTERIENNE : ORGANISATION STRUCTURALE
Composition
Composition chimique du protoplasme bactérien
Composition chimique d’une cellule bactérienne moyenne
Variété et nombre de molécules
Organisation
Forme et taille des bactéries
Les enveloppes bactériennes
La membrane cytoplasmique
La paroi des eubactéries
Généralité sur le peptidoglycane
La paroi des bactéries Gram positives
La paroi des bactéries Gram négatives
La paroi des mycobactéries et la coloration de Zhiehl-Neelsen
Le cytoplasme
Les ribosomes
Le cytosquelette (FtsZ, MreB, crescentine)
Les granules de réserve et organites speciaux
Le nucleoide
Organisation du nucléoide
Dynamique du nucléoide lors de la transcription
Les appendices parietaux
La capsule
Le flagelle
Les pilis
La couche S
• LA CELLULE BACTERIENNE : LE METABOLISME
La nutrition
Catégories nutritionnelles des micro-organismes
Utilisation de nutriments qui ne passent pas la membrane plasmique
Pénétration des nutriments
Les reaction d’appovisionnement
Introduction
Fabrication des précurseurs du métabolisme
chez les chémohéterotrophes
chez les photo- ou chemoautotrophes
Production d'énergie et de puissance réductrice
Phosphorylation au niveau du substrat
Phosphorylation par transfer d’électron dans une chaine respiratoire
Chez les chemohétérotrophes
Prérequis
[SBIOB210] Biochimie générale I ET [SBIOB213] Génétique ET [SBIOB201] Diversité et évolution animale II
Titulaire(s) : Letesson Jean-Jacques
Enseignants
Lieu de l'activité :
Langue d'enseignement : French / Français
NAMUR
Annuel
Ex. Q1
15 h.
Th. Q1 Ex. Q2Th. Q2
45 h.
Descriptif de cours : 2015-2016

respiration aerobique
respiration anaérobique
la fermentation
Chez les chemoautotrophes
Chez les phototrophes
Modalités particulières
Assimilation de l’azote, du Soufre et du Phosphate
Biosynthèse, polymerisation et assemblage
Biosynthèse et assemblage du peptidoglycane
Biosynthèse du LPS
• LA DIVISION BACTERIENNE ET LA CROISSANCE DE LA POPULATION
La croissance de la population : la culture
Croissance balancée
Expression mathématique de la croissance
La mesure de la croissance
Culture bactérienne en milieu non renouvellé
Culture en milieu renouvelé
Facteurs environnementaux et culture
Les milieux de culture
La croissance de la cellule : le cycle de division
Division binaire symetrique et transverse
Le cycle des enveloppes : Le divisome
Le cycle du chromosome : La ségrégation chromosomique
L’interdépendance des deux cycles
Et les plasmides ?
Alternatives à la division binaire
La différentiation cellulaire
La sporulation
• LE GENOME BACTERIEN ET SA PLASTICITE
Composantes du génome
Chromosome
Plasmides
Les éléments génétiques transposables
Les intégrons
Plasticité du génome bactérien
Les mutations et la dynamique de population
Les échanges de matériel génétique
Conjugaison
Transformation
Transduction
• LES AGENTS ANTI-BACTERIENS
Mort bactérienne et Stérilité
Les agents antibactériens de nature physique
- Chaleur
- Radiations
Les agents antibactériens de nature chimique
- Les désinfectants et antiseptiques
• Divers acides et bases organiques
• Métaux lourds
• Composés halogénés
• Alcools
• Phénol et dérivés phénolés
• Agents Oxydants
• Agents alkylants
• Certain colorants
• Résistance aux désinfectants et antiseptiques
- Les antibiotiques :
• Historique
• Antibiotiques inhibant la synthèse de la paroi bactérienne :
• Inhibition de la synthèse de précurseurs de la paroi :
• précurseurs de la paroi sur un lipide porteur, permettant leur transport à travers la membrane plasmique
• Inhibition de l'insertion des unités glycaniques et de la transpeptidation
• Antibiotiques agissant au niveau de la membrane cytoplasmique :
• Antibiotiques inhibiteurs de la synthèse protéique :
• - Inhibiteurs de la sous-unité 50S :
• - Inhibiteurs de la sous-unité 30S :
• - Inhibiteurs de l'ARN polymérase
• - Inhibiteurs de l'ADN-gyrase
• Antibiotiques inhibiteurs du métabolisme des acides nucléiques :
• Par action sur l’antibiotique
• Par action sur la cible
• Antibiotiques agissant par inhibition compétitive (antimétabolites)
• Résistance aux antibiotiques
• ELEMENTS DE VIROLOGIE (virus animaux)
Introduction historique
Les virus comme force évolutive
Propriétés caractéristiques des virus
Classification des virus animaux
Contenu en génome
Contenu en protéines
Principes unificateurs

Fonctions du virion
Nomenclature de l’architecture virale
Moyens d’étude de la structure
Architecture virale
Capside
Encapsider le génome
Enveloppe
Culture et dénombrement
Le cycle de réplication viral
Attachement
Pénétration
Stratégies réplicatives
Virus à ADN
Virus a ARNss
Virus à ARNds
Assemblage, maturation, Sortie
Plasticité et évolution des génomes viraux
Les agents anti-viraux
Introduction
Inhibiteur de fusion
Inhibiteur de déshabillage
Inhibiteur de synthèse des acides nucléiques
Inhibiteur de protéases
Inhibition de Neuraminidase
Pathogénie virale ou l’anti)immunologie (à faire)
Méthodes d'enseignement
Cours ex cathedra et projection de power point
Mode d'évaluation
Examen oral individuel qui porte sur quatre questions, soit une question sur chacune des parties de la matière: Structure et Physiologie, Génétique et
Facteurs antibactériens, Virologie. Trois ou quatre étudiants sont admis simultanément pour la préparation (+ 30 minutes) et reçoivent les mêmes
questions. Le professeur interroge seul. L'examen dure environ 20 minutes. Certaines questions ne sont qu'un prétexte, un point de départ à un voyage
dans la matière.
Sources, références et supports éventuels
Microbiology, by Prescott et al, 6th edition, McGraw-Hill, 2007
Formations concernées Bloc Crédits
Unités d'enseignement supplémentaires au master en biologie des organismes et écologie 1 4
Unités d'enseignement supplémentaires au master en sciences biologiques 1 4
Unités d'enseignement supplémentaires au master en biochimie et biologie moléculaire et cellulaire 1 4
Bachelier en sciences biologiques 3 4