Analyse de la variance phénotypique

Un trait quantitatif (caractère phénotypique continu) peut être
déterminé :
•en partie par le génotype
•en partie par l’environnement
Autrement dit, la variance pour ce trait peut s’écrire :
Vt = Vg + Ve
Si on veut déterminer la variance génétique présente pour un trait,
il faut annuler la variance environnementale, i.e. mesurer le trait en
conditions expérimentales constante.
A
C
B
D
Ve
Vg
Étude de la diversité génétique ; génie génétique
1 Les marqueurs de la diversité génétique
1.1 Les traits quantitatifs
Analyse de la variance phénotypique
A
C
B
D
Vg

1. On extrait les protéines présentes dans un tissu.
3. On fait migrer ces protéines dans un champ électrique (les plus
lourdes et/ou les moins chargées migrent le moins loin).
5. On révèle les protéines par leur activité
Par exemple, pour la malate déshydrogénase (MDH) on révèle
dans une solution contenant du malate et un colorant qui
réagira avec les produits de la déshydrogénation.
Étude de la diversité génétique ; génie génétique
1 Les marqueurs de la diversité génétique
1.2 Les marqueurs protéiques
L'électrophorèse d'iso-enzyme

site d’hybridation de la
sonde ADN
sites de
restriction
site de restriction muté
allèle A
allèle a
Le site muté ne sera pas coupé par l’enzyme de restriction. Le
fragment marqué sera donc plus long. Le fragment peut aussi être
plus ou moins long parce qu'entre les deux sites de restriction il y a
un microsatellite.
aa AA
sens de la
migration
Aa
Étude de la diversité génétique ; génie génétique
1 Les marqueurs de la diversité génétique
1.3 Les marqueurs ADN
Les marqueurs RFLP
Autre type de marqueur ADN déjà vu en cours : les microsatellites.
A
T
A
T
T
A
T
A
C
G
G
CEco R1 A
T
A
T
T
A
T
A
C
G
G
C+

L’ADN est digéré par des enzymes
de restriction
Les fragments de restriction sont
séparés par électrophorèse
L’ADN est dénaturé en milieu alcalin.
Les fragments simple brin sont alors
transférés, par capillarité, du gel à une
membrane de nitrocellulose.
On expose la membrane contenant les
ADN simple brin à une sonde
marquée.
On obtient une bande marquée.
Étude de la diversité génétique ; génie génétique
2 Techniques d'hybridation de l'ADN
2.1 Le Southern Blot
Le principe du Southern Blot

Étude de la diversité génétique ; génie génétique
2 Techniques d'hybridation de l'ADN
2.1 Le Southern Blot
Utilisation du Southern Blot pour le diagnostic
prénatal
Exemple du diagnostic de l'anémie falciforme
CTC
GAG CAC GTG
GAG GUG
glu val
ADN
ARNm
protéine
ß-globine
normale ß-globine de l'anémie falciforme
sonde 1 : CTGACTCCTGAGGAGAAGTCT
sonde 2 : CTGACTCCTGTGGAGAAGTCT
sonde 1 sonde 2