Fiches UE des enseignements de M2 EFCE Habilitation

Fiches UE des enseignements de M2 EFCE
Habilitation 2012-2016

UE Écologie et Evolution des communautés-changements globaux
(EEC)
Mention du Master : Biodiversité Écologie Environnement (BEE)
Spécialité : EFCE
Semestre : 3
Savoir et savoir-faire associés : Cette UE donnera les clés de connaissance essentielles pour comprendre les effets
des changements globaux (agriculture, climat) sur les assemblages d’espèces et la dynamique de la diversité, à
diverses échelles spatiales et temporelles. Les invasions biologiques seront considérées sous l’angle des processus
impliqués et des conséquences induites. Cette UE traitera des mécanismes écologiques et évolutifs impliqués dans
la dynamique de la diversité (règles d’assemblages), en précisant l’importance des interactions biotiques. La
sélection des traits et la notion de traits fonctionnels seront traitées, en relation notamment avec le
fonctionnement des écosystèmes et la notion d’espèces indicatrices.
Mise en œuvre des méthodes utilisées en écologie des communautés, en phylogénie des communautés et en
écologie du paysage. Compréhension des mécanismes sous-jacents de la diversité biologique. Analyse des impacts
des modalités de gestion des milieux sur les communautés. Analyse critique d’articles publiés.
Responsables U E : Anne BONIS et Alain BUTET
Forme de l’enseignement : présentiel
Horaire d'enseignement : 28h cours + 3 h TD
Cours
magistraux T.P. T.D. Projet Stage
28 3
Contenu pédagogique :
- Réponses des communautés à la dynamique des paysages, aux contraintes et aux activités humaines
- réponses des communautés aux contraintes et perturbations, notamment dans le cadre des
changements climatiques
- conséquences écologiques et évolutives des espèces envahissantes
- Mécanismes évolutifs et écologiques impliqués dans la dynamique de la diversité (règles d’assemblages)
- Dynamique des interactions biotiques
- Liens structure-fonction, traits de réponse et traits d’effet
- Méthodes d’analyses, changements d’échelle
- analyse critique d’articles publiés

UE Biodiversité, flux et fonctionnement des écosystèmes (BFF)
Mention du master: Biodiversité Écologie Environnement (BEE)
Spécialité : EFCE
Semestre : 3
Savoir et savoir-faire associés : Comprendre le rôle de la biodiversité dans le fonctionnement (biologique,
chimique, physique) des écosystèmes : Interpréter la biodiversité dans son habitat, la mesurer, en évaluer les
changements ; Quantifier le rôle des organismes dans les cycles des éléments dans la biosphère : voies de
transferts, mécanismes de régulation ; Analyser les réponses des écosystèmes aux changements de biodiversité.
Fonctions écosystémiques et conservation.
Responsables U E : Philippe VANDENKOORNHUYSE & Françoise BINET
Forme de l’enseignement : présentiel
Horaire d'enseignement : 30h
Cours
magistraux
T.P. T.D. Projet Stage
30 0 0
Contenu pédagogique :
UE basée sur une pédagogie originale, l'apprentissage par projet (APP) tutorée par un spécialiste. Dans cette UE
des thèmes au choix sont proposés. Les étudiants choisissent un thème qui n'est pas en lien avec leur stage de
recherche. Les connaissances sont transmises par les étudiants eux-mêmes et une évaluation de synthèse est
réalisée.
Les thèmes proposés (liste non exhaustive)
-cycle du carbone et réchauffement planétaire
-radiation adaptative
-diversité et productivité des écosystèmes
-modélisation en écologie fonctionnelles
-place du virome dans les écosystèmes
-transfert de gènes, résistance, résilience
-bioremédiation ...

UE Evolution des comportements et des traits d'histoire de vie (ECT)
Mention du Master : Biodiversité Écologie Environnement (BEE)
Spécialité : EFCE
Semestre : 3
Savoir et savoir-faire associés : Comprendre l’évolution des fonctions, des traits comportementaux et des
stratégies adaptatives comportementales et phénotypiques ; Maîtriser les concepts des théories modernes de la
Biologie Evolutive, en particulier dans le cadre des modèles phénotypiques (Stratégies Evolutivement Stables...) ;
Connaître les mécanismes à l’origine de la biodiversité et les moyens de retracer son histoire : évolution des
systèmes de reproduction, spéciation, phylogénie, phylogéographie ; Savoir interpréter les méthodes et les
données issues de l’écologie comportementale, de la modélisation mathématique et des phylogénies
Responsable U E : Anne Atlan, Manuel Plantegesnest
Forme de l’enseignement : présentiel
Cours
magistraux
T.P. T.D. Projet Stage
30 0 0 0
Contenu pédagogique :
-Socialité : avantages et désavantages de la vie en groupe. Influence de la distribution des ressources et de la
taille du groupe. Balance entre compétition et risques de prédation.
-Organisation sociale : choix du partenaire social et du partenaire sexuel. Les différents types
d’organisation sociale, sélection sexuelle, coopération, rôle de la parenté.
-Soins parentaux et allocations des ressources selon le sexe. Investissement parental, partage entre les sexes,
influence de la durée de vie des parents, rôle du statut social, sélection de parentèle.
-Les choix liés à la dispersion et dynamique des populations. Qui se disperse (sexe, âge, statut social) ? à
quel moment ? Quels sont les choix de destination ? Critères de choix (qualité de l’environnement physique et social,
rôle de la parenté) ? Philopatrie. Conséquences sur la dynamique des populations.
-Valeur adaptative des comportements. Modèles mathématiques de l'adaptation comportementale. Les
exemples seront pris dans les thèmes suivants : Approvisionnement optimal, Sélection sexuelle, investissement parental
-Apprentissage et valeur de l’information. Les différents types d’apprentissage. L’évolution de
l’apprentissage. Apprentissage et variabilité de l’environnement.
-Modélisation de l'évolution des paramètres principaux de la dynamique des populations (survie,
fécondité, âge de maturité,...)
-Théorie des jeux appliquée à l'évolution. Notion d'ESS. Recherche d'ESS. Application à l'évolution de la
sex-ratio, de la dispersion, du comportement social

-Niveaux de sélection. Notion d'inclusive fitness. Conflits sélectifs. Signatures de la sélection sur les génomes
-Spéciation. Origine et histoire des espèces : Evolution des systèmes de reproduction, spéciation, données
génomiques et histoire des populations et des espèces