01 Cours Gen des populations-41-46

Géné+que moléculaire des popula+ons
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%! géné'que moléculaire des popula'ons #1: 6! ?(!,$C# -# 6! 2),)3*+# -#1 /4/+6!34,1
*+7 +3671# 6#1 marqueurs moléculaires ;.Sq> .Kq> /(4:)7,#1</4+( 5
Géné$que moléculaire des popula$ons
•9#1+(#( 6! diversité géné'que>
•$!(!$:)(71#( 6! structure des popula'ons>
•-):#$:#( 6#1 forces évolu'ves ;1)6#$34,>9+:!34,> 972(!34,> -)(7"#<>
•(#$4,1:(+7(# 6MC71:47(# -)942(!/C7*+# #: )"46+3"# -#1 #1/0$#1@
•la biologie moléculaire ;1)*+#,$#1>&9+:!34,1<>
•la géné'que des popula'ons ;"!(7!34,&2),)3*+# -!,1&6M#1/!$# #:&6#&:#9/1<>
•l’évolu'on ;'4($#1&)"46+3"#1 #:&!-!/:!34,<@
r66#&$4,13:+# 6#&67#,&#,:(#&5
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Géné$que moléculaire des popula$ons
En géné/que moléculaireG/$ *.=%?" KL0 </*& 9
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Géné$que moléculaire des popula$ons
Polymorphisme moléculaire
%# /46G94(/C719# $4((#1/4,- 8 6M#D71:#,$# -# plusieurs allèles 8+, 64$+1@
pG/#1 -# 9!(*+#+(1 +3671)1 5
•SNPs ;9+:!34,1&/4,$:+#66#1<
•Microsatellites (SSR)
•Indels
•Séquences complètes (génomes, exomes, gènes ciblés)
A#1 9!(*+#+(1 /#(9#s#,: -# *+!,3B#( 6! varia'on géné'que intra-et interpopula'onnelle@
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!"#$%&'()*+,-%&.$&/+*0+1(,&23,314)$
5Single nucleo+de polymorphisms 6789%:;/+*0+1(,&
.<),$ %$)=$ #+0*$ .$&>+%$%&.+,%&),$ %34)$,'$ .<?@8
Allele 1: AGGCATTA
Allele 2: AGGTATTA
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Géné$que moléculaire des popula$ons
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5Indels ;0,%$*1(, () .$=$1(, .<),$ () #=)%0$)*% >+%$% .+,% ),$ %34)$,'$
.<?@8
Allele 1: AGGCATTA
Allele 2: AG––ATTA
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Allele 1: CTCTCTCT (4 repeats)
Allele 2: CTCTCT–- (3 repeats)
Allele 3: CTCT---- (2 repeats)
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Géné$que moléculaire des popula$ons
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C$%)*$* =+ /+*0+1(, 23,314)$
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!
Avantage :
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!
Inconvénient :
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B/+/CD4/9'( B'9'*/CD4/9'(
E00'0'FG
E00'0'FH
E00'0'FI
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C$%)*$* =+ /+*0+1(, 23,314)$
•Polymorphismes de longueur des fragments de restric6on (RFLP) —fin des
années 1970
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EX : HaeIII:
M#QRRSTTQI#UFFF
AlwI:
M#QRREVSTQI#UFFF
EcoRI:
M#QRSEEVVTQI#F
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!
EX:
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Électrophorèse :
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&-%( 0' 4'0 K0'( >*-4+'%9( )0$( )'59( +,4*'%9 )0$( *-),&'+'%9O
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