TD N1 GG Enzymes de restriction

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Université des Sciences et de la Technologie d’Oran Mohamed Boudiaf Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie
Département de Génétique Moléculaire et Appliquée
3ème Année Licence Biochimie Année universitaire 2019-2020
TD N°1 DE GENIE GENETIQUE
Exercice 01 :
Quelle est la fréquence de coupure des enzymes de restriction suivant :
1) AGCT pour l’enzyme AluI
2) GAATTC pour l’enzyme EcoRI
3) GCGGCCGC pour l’enzyme NotI
Pour un gène mesurant 30Kb, combien de sites pour chacune des enzymes mentionnés ?
Exercice 02 :
La séquence d’un ADN bicaténaire, correspondant à un gène, est partiellement reportée ci-
dessous.
5’ ATACGGGATCCGAGCTCTCGATCGTCTGCAGAAATTCC 3’
1) Ecrire la séquence et l’orientation du second brin de ce fragment.
2) Soient les enzymes de restriction suivant : BamH I : G/GATCC, Pst I : CTGCA/G, Xho I :
C/TCGAG, Mbo I : /GATC, Sma I : CCC/GGG.
Recopier la séquence de l’ADN et encadrer les sites de restriction en indiquant la position des
coupures.
3) Pour chaque enzyme, écrire les séquences des extrémités des molécules d’ADN digérées et
préciser le type d’extrémités obtenus.
4) Pour chaque enzyme, expliquez la nomenclature utilisée.
Exercice 03 :
La séquence d’ADN ci-dessous vient de vous être fournie :
5’ATCGGTGATCTGCAGTCCCGATCGGGCACCCGGGTTAGCGATCGTTTAAT
GGGTCGGCCCGGGGATCCCGGGCCTGGACTGATCTGACATGGTGTCAGTCA
GTTTCTC 3’
1) Pouvez-vous fragmenter cette molécule avec les endonucléases de restrictions suivantes :
BamHI : G/GATCC, HpaII : C/CGG, PvuI : CGAT/CG, Sau3 : A /GATC, SmaI :
CCC/GGG, XbaI : T/CTAGA?
2) Placez les sites existants et schématisez les extrémités 5et 3’ après coupure pour chaque
enzyme.
3) Afin de relier à nouveau les différents fragments, précisez pour chaque cas lenzyme utilisée.
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