Semestre
ECTS
heures
2
MQEM : Méthodes
Quantitatives avancées en
milieu marin
D’un point de vue théorique, nous abordons des méthodes
standards d’analyse multivariées dont l’objectif consiste à
extraire l’information contenue dans le tableau de données
en tenant compte des relations entre variables. Description
d’un tableau de données. Statistiques de base. Corrélation /
Covariance. ACP, AFC, Analyse discriminante. ACP pour
des courbes. Représentation graphique de courbes.
6
50
2
EMFE : Ecologie
Microbienne et
Fonctionnement des
Ecosystèmes
Etudes des communautés et des processus procaryotiques du
cycle de l’azote et facteur de régulation (dénitrification,
nitrification, réduction dissimilative du nitrate en ammonium,
anammox, fixation d’azote, assimilation, minéralisation de
l’azote) Etudes des communautés et des processus
procaryotiques impliqués dans le cycle du carbone et facteur
de régulation (fixation du carbone, hétérotrophie,
méthanogénèse, methanotrophie, minéralisation du
carbone)Etudes des communautés et des processus
procaryotiques impliqués dans le cycle du soufre et facteur de
régulation
6
50
2
GEN : Génétique des
populations et
phylogéographie
.- rappels: historique, équilibre de Hardy-Weinberg, dérive,
migration,
mutation, sélection
- structuration des populations en milieu marin
- phylogéographie: principes, interprétations, application à la
Méditerranée
- analyses de données de séquence: impact de la sélection,
des processus
démographiques, introduction à la théorie de la coalescence
- aspects génétiques des processus de spéciation
6
50
2
Perturbation Anthropique
Etude des impacts et les mécanismes exogènes (climat) et
endogènes (relations intra et inter spécifiques) qui engendrent
des fluctuations à des différentes échelles d'espace et de
temps, au sein des populations et des écosystèmes marins.
Fluctuations génétiques des populations (acclimatation,
adaptation, théorie de l’équilibre génétique, etc). Montrer
comment les impacts anthropiques se superposent aux
variations naturelles. Expliquer la théorie des perturbations et
exemplifier avec des études de cas : oscillations climatique
dans les écosystèmes à grande échelle (El Nino, NAO etc),
réchauffement climatique en Méditerranée, pêche,
eutrophisation côtière, proliférations de micro et macrophytes
6
50
2
Nutrition minérale des
producteurs primaires
1-Introduction (nutrition minérale et biodiversité – le paradoxe
du plancton, caractéristiques d’une culture en milieu fermé,
principe de la culture continue, modèles à un compartiment, à
deux compartiments, à plus de deux compartiments),
2.Nutrition minérale : les macronutriments (absorption et
assimilation de l’azote, du phosphore, mobilité des
organismes et compétitivité vis-à-vis du phosphore,
métabolisme du silicium et morphogenèse du frustule des
diatomées),
3.Nutrition minérale : les métaux-traces (fonctions
physiologiques des métaux, biodisponibilité des métaux,
mécanismes d’absorption des métaux, relation avec la
spéciation, compétition interspécifique et rôle des ligands,
mécanismes de régulation de la concentration intracellulaire,
compétition entre métaux et toxicité),
4.Les équilibres dissociation-diffusion-
5.Compétition entre espèces (rapport nutritif optimal,
coexistence et dominance, compétition dans un milieu
variable, co–limitations nutritionnelles).
6
50
2
Stage
6
50
2
DIV ; Diversité
dans la biosphère marine
6
50
2
INDI : Indicateurs de la qualité
du milieu marin
Description des principaux indicateur chimique et biologique
et de la qualité du milieu dans les sédiment et la colonne
d’eau : Ammonium, chlorophylle,DBO,métaux lourds ,
Espèces indicatrices (macrophyte, métazoaire benthique,
phytoplancton toxique, bactérie indicatrice de contamination
fécale…), réglementation, réseau nationaux de surveillance.
Etude de cas
6
50
2
STRAT : Stratégie adaptatives
des organismes marins
. Physiologie des poissons. Au travers du modèle biologique
"poisson", le rôle des systèmes sensoriels (olfaction, vision,
chémo- et électro-réception) dans la biologie de ces
organismes, et en quoi cela a des implications sur les
6
50