Cours 7 Biocell

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UE N° SV1
Organisation et mécanismes moléculaires
des cellules eucaryotes
ECUE 1
Biologie cellulaire
S. Lindenthal
Faculté de Médecine
28 ave de Valombrose
[email protected]
Tel.: 0493377715
Plan du cours VII :
3.2.2.3.2. La digestion intracellulaire
- Le lysosome
- Les voies d’entrée aux lysosomes
(la voie endocytose-biodégradation)
- Les corps multivésiculaires
- Le glycocalix lysosomal
3.3. Les compartiments clos
3.3.1. La mitochondrie
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- la plasticité mitochondriale
- la division mitochondriale
- l’emplacement dans la cellule
- le génome mitochondriale
- l’importation des protéines et des lipides dans la
mitochondrie
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
- La réduction du NAD+
- La génération du gradient électrochimique de protons
- La phosphorylation oxydative et la synthèse d’ATP
Rappel du cours VI: Les voies du tri protéique
modification des
chaînes N-liées
O-glycosylation
TRI
(3) Lysosomes,
digestion cellulaire
exocytose
(2) sécrétion régulée
(1) sécrétion constitutive
Fig.13-29 modifiée, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
3
Rappel du cours VI: La digestion intracellulaire
- le lysosome primaire
pH 7,4
« étiquette » de tri des
hydrolases acides : le
mannose-6-phosphate
Hydrolases acides
lipides
polysaccharides
ADN, ARN
protéines
acides gras, glycérol,
bases
monosaccharides
nucléosides
acides aminés
Hydrolases acides
Fig.13-36 modifiée, Biologie
moléculaire de la cellule, Alberts
Fig.13-31 modifiée, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
4
Rappel du cours VI: Les voies d’entrée aux lysosomes
- l’endocytose
endosome
précoce
pH 7,4
endosome
tardive
pH 6,5
fusion
fusion
endocytose
Lysosomes
primaires
recyclage des récepteurs
exocytose
Lysosome
secondaire
pH 5
appareil de Golgi
Cytosol
pH 7,4
Fig13.35 modifiée, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
5
Rappel du cours VI: Les voies d’entrée aux lysosomes
- l’endocytose
de liquide et molécules non triées
(Pinocytose)
de liquide et molécules sélectionnées
(via récepteurs membranaires)
milieu extracellulaire
récepteur
Adaptine
cytosol
Recyclage des
récepteurs
membranaires
fusion avec les lysosomes primaires
6
Rappel du cours VI: Les voies d’entrée aux lysosomes
- l’endocytose
endosome
précoce
pH 7,4
endosome
tardive
pH 6,5
fusion
fusion
endocytose
recyclage des récepteurs
exocytose
Lysosomes
primaires
Lysosome
secondaire
pH 5
appareil de Golgi
Cytosol
pH 7,4
Fig13.35 modifiée, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
7
Rappel du cours VI: Les voies d’entrée aux lysosomes
- la Phagocytose
Milieu extracellulaire
bactérie
fusion
phagocytose
Cytosol
pH 7,4
Lysosomes
primaires
Appareil de Golgi
Lysosome
secondaire
pH 5
Phagocytose de deux hématies par un
macrophage
Micrographie électronique à balayage
8
Fig13.39 Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
3.2.2.3.1. Les voies d’entrée aux lysosomes
- l’Autophagie
mitochondrie
autophagie
fusion
Lysosome
secondaire
pH 5
autophagosome
Lysosomes
primaires
Cytosol
pH 7,4
appareil de Golgi
Fig13.39 Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
9
3.2.2.3.1. Les voies d’entrée aux lysosomes
- l’Autophagie
pH 6,5
pH 7,2
Pompes à H+
pH 6,9
pH 5
3.2.2.3.1. Les voies d’entrée aux lysosomes
- l’entrée directe du cytosol
entrée directe
molécules du cytosol
Lysosome
secondaire
pH 5
11
3.2.2.3.1. La digestion intracellulaire
- le lysosome
sortie de
métabolites dans
le cytosol
Lysosome
secondaire
pH 5
Réutilisation des
métabolites pour la
nutrition cellulaire
exocytose
12
3.2.2.3.1. La digestion intracellulaire
- le lysosome
pH 7,4
pH 5,0
Hydrolases acides
lipides
polysaccharides
ADN, ARN
protéines
acides gras, glycérol,
bases
monosaccharides
nucléosides
acides aminés
perméases
Fig.13-31 modifiée, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
13
Détermination de l’orientation des glycoprotéines et
glycolipides dans la membrane plasmique
3.2.2.3.1. Les voies d’entrée aux lysosomes
- l’endocytose et recyclage des récepteurs
Membrane plasmique
Recyclage des récepteurs :
membrane plasmique/endosomes précoces
Endosome précoce
Recyclage des récepteurs :
Endosomes tardives ou lysosomes/
Appareil de Golgi
Endosome tardif
Lysosome
Appareil de Golgi
Réseau cis-golgien
Recyclage des récepteurs :
Réticulum endoplasmique/
Appareil de Golgi
Réticulum endoplasmique
Protéine (récepteur)
KDEL
protéine résidente
du RE
3.2.2.3.2. La digestion intracellulaire
- les corps multivésiculaires
- La dégradation des protéines et des lipides de la membrane
plasmique (la formation des corps multivésiculaires)
3.2.2.3.2. La digestion intracellulaire
- le glycocalix lysosomal
- La protection du lysosome contre l’autodestruction
3.3. Les organites clos
3.3.1. La mitochondrie
mitochondrie
espace intermembranaire
membrane
externe
membrane
interne
crêtes
Taille : 0,5 - 2 µm
matrice
"La centrale énergétique de la cellule" ou l’organite de conversion énergétique.
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- la plasticité mitochondriale
Cellule de levure
Fig.14-3 Biologie moléculaire de la cellule,
Alberts, 3ième édition
Observation des mitochondries dans une cellule vivante
Une photo est prise tous les trois minutes
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- la plasticité mitochondriale
Fig : PPT Guillet_Pichon; cen-neurologie
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- la plasticité mitochondriale
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- La la biogénèse des mitochondries
division
fusion
Fig.14-63 Biologie moléculaire de la cellule, Alberts, 3ième édition
Fig.14-64 Biologie moléculaire de la cellule, Alberts, 3ième édition
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- L’emplacement de la mitochondrie dans la cellule
Fig.14-4 Biologie moléculaire de la cellule, Alberts, 3ième édition
(A) Cliché de microscopie électronique de mitochondries allongées dans une
cellule vivante de mammifère en culture.
(B) Micrographie en immunofluorescence de la même cellule colorée avec des
anticorps fluorescents qui se fixent aux microtubules.
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- Le génome mitochondrial
Y.Hayashi and
K.Ueda,
J.Cell Sci. 93:
565-570, 1989
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- Le génome mitochondrial
Fig.14-62 Biologie moléculaire de la cellule,
Alberts, 3ième édition
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- la perméabilité de la membrane mitochondriale externe©
ATP
ADP
Pyruvate
Acides
gras
Phosphate
Cytosol
Membrane mitochondriale
externe
porine
ATP
ADP
Pyruvate
Acides
gras
Phosphate
Espace intermembranaire
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- Importation des protéines dans la mitochondrie
Fig. 10.4 The Cell, Cooper
3.3.1.1. L’organisation générale de la mitochondrie
- Transport des lipides du RE vers la mitochondrie
membrane
du RE
Groupe de tête de la
phosphatidylcholine
cytosol
membrane externe
des mitochondries
Protéine d’échange
des phospholipides
Fig.12-60, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
CO2 + H2O
Mitochondrie
respiration aérobie
ATP
(utilisé pour le travail cellulaire)
Molécules
organiques
+ O2
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
- la synthèse de l’ATP
énergie provenant des
molécules organiques
comme le glucose ou
les acides gras
énergie disponible
pour activer des
réactions cellulaires
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
- la transformation d’énergie
Fig.14-12, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
- la réduction du NAD+
NAD+
H
forme oxydée
NADH forme réduite
H
Fig.2-60 modifié, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
Le nicotinamide adénosine dinucléotide réduit (NADH),
un important transporteur d’électrons
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
- La chaîne de transport des électrons
Membrane externe
Membrane interne
Chaîne de transport d’électrons
Fig.14-14 modifié, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
3.3.1.2. La génération du gradient électrochimique
de protons
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
- la cardiolipine
Fig. 10.7 The Cell, Cooper
Membrane interne
de la mitochondrie
3.3.1.2. L’ATP synthase
ATP synthétase
100 Å = 10 nm
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
- La phosphorylation oxydative et la synthèse d’ATP
Fig.14-14, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
Micrographie du feuillet
matriciel de la membrane
interne mitochondriale.
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
- L’ATP synthase
Fig.14-1, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
Fig.14-19, Biologie moléculaire de la cellule, Alberts
3.3.1.2. La fonction de la mitochondrie
-Le gradient électrochimique :
une forme d’énergie utilisable pour une travail de transport
Fig. 10.12 The Cell, Cooper
3.3.2. Le peroxysome
3.3.2.1. L’organisation du peroxysome
Coupe ultrafine
canalicule
Taille : 0,2-1,0 µm
matrice
membrane
région cristalline
Fig. 8/1 Cours de biologie cellulaire, P. Cau, Ellipses
Cellule hépatique de rat
Fig.12-27 Biologie moléculaire de la cellule,
Alberts, 3ième édition
3.3.2. Les fonctions du peroxysome
Reconstitution dans l’espace à
partir de plusieurs coupes sériées
canalicule
O2
Oxydases
H2O2
Catalases
précipité de la réaction
de la catalase
3.3.2. Les fonctions du peroxysome
Les oxydases :
- dégradation de nombreux métabolites
- utilisation d’oxygène
- production d’eau oxygénée H2O2
RH2 + O2 = R + H2O2
La catalase :
- détoxification
- utilisation d’eau oxygénée H2O2
H2O2 + RH2 = R + H2O
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