Cours de microbiologie générale VIRUS Qu’est-ce qu’un virus ? C’est un agent infectieux très simple, défini par une structure se résumant à deux ou trois éléments, selon les virus. Les virus sont donc totalement différents des bactéries ou des parasites, qui sont des cellules, ce que ne sont pas les virus. « Les virus sont les virus » André Lwoff La structure d’un virus : Génome : Un virus comporte toujours un génome qui est de l’ADN ou de l’ARN, de sorte que dans la classification des virus on distingue en premier lieu virus à ADN (Adénovirus ) et virus à ARN (Rétrovirus ) . Capside : Le génome est emballé dans une structure protéique appelée CAPSIDE, d’un mot grec, capsa, signifiant boîte. La capside protège le génome. Elle a une conformation géométrique qui, selon les virus est, soit cubique (icosaédrique), hélicoïdale ou complexe (comportant la conformation cubique et hélicoïdale ) . Enveloppe : D’un mot grec signifiant manteau, c’est l’élément le plus externe de certains virus. La présence ou l’absence d’enveloppe règle en grande partie le mode de transmission des maladies. On distingue les virus enveloppé et les virus nu . Icosahèdre ou cubique Complexe Hélicoïdale Classification des virus : Elle repose désormais sur la structure des virus et non plus sur leur pouvoir pathogène ou leur taille. Les trois premiers critères de la classification sont, dans l’ordre, la nature de l’acide nucléique du génome (ADN ou ARN), la conformation de la capside (hélicoïdale ou icosaédrique), et enfin la présence ou l’absence de l’enveloppe. Melle MAGHNIA Page 1 Cours de microbiologie générale Multiplication virale : Pénétration du virus complet dans la cellule (endocytose) Décapsidation et libération de l’acide nucléique viral Détournement des activités biochimiques cellulaires au profit de la synthèse des constituants viraux Melle MAGHNIA Page 2 Cours de microbiologie générale Conséquences de la multiplication virale pour la cellule Infectée Mort de la cellule : La cellule en meurt, les synthèses cellulaires ayant été gravement perturbées par les virus. C’est l’INFECTION LYTIQUE. C’est ce que donnent la plupart des virus humains dans les cellules. Tolérance de l’infection : la cellule tolère l’infection. Le génome viral et le génome cellulaire se partagent le potentiel de synthèse de la cellule et les deux métabolismes, cellulaire et viral, coexistent, selon un « compromis » acceptable. Exemple : HIV et la rougeole induisent la fusion cellulaire de cette façon la cellule se déplace d’une cellule infecté dans une cellule non infectée sans s’exposer aux anticorps de l’hôte . Transformation cellulaire maligne : Troisième éventualité, la cellule se multiplie de façon anarchique : c’est la TRANSFORMATION CELLULAIRE MALIGNE, la cellule infectée acquérant des caractères généralement attribués aux cellules cancéreuses. PRASITOLOGIE Les interactions microbiennes : Les interactions positives : -Le Commensalisme: état de relations complexes où deux espèces sont associées, mais où une seule en tire bénéfice sans entrainer de troubles ou de dommages pour ce dernier. -Mutualisme : est une association dans laquelle un certain bénéfice réciproque revient aux deux partenaires et qui est obligatoire pour leur vie. Les interactions négatives : -la prédation : est un phénomène où le prédateur attaque une proie , cette dernière peut être plus grande ou plus petite et le résultat normale est la mort de la proie . -le parasitisme :est une relation où l’un des partenaires tire profit de l’autre et où l’hôte est habituellement lésé . Définition de Parasitologie : La parasitologie est l’étude des parasites, de leurs hôtes et de leurs interactions mutuelles. -La parasitologie en médecine humaine étudie les maladies de l’homme provoquées directement ou indirectement par les parasites (parasitoses). -le parasite organisme vivant qui, de façon permanente ou temporaire, doit obligatoirement se nourrir aux dépens d'un autre organisme vivant, qui est son hôte, et sans que sa présence entraîne la destruction de cet hôte. Melle MAGHNIA Page 3 Cours de microbiologie générale Selon la localisation du parasite chez l’hôte: Des ectoparasites: le parasite vit à l’extérieur de son hôte: à la surface ou dans l’épiderme . Des endoparasites : habite le milieu intérieur de l’hôte, se nourrit de son fluide intérieur (sang, lymphe, espace intercellulaire, intracellulaire) les vaisseaux (schistosomes), les tissus (larve de trichine) et parfois les cellules (leishmanies, toxoplasme, plasmodium) Le Cycle parasitaire : Le cycle est la succession des états (transformations) et des circonstances qui permettent de passer d'une génération de parasites à la génération suivante . Les éléments de cycle : Selon le type de cycle évolutif, vont intervenir : le parasite (ou l’agent pathogène) l’hôte définitif (HD) : chez lequel le parasite atteint sa maturité. l’hôte intermédiaire (HI) : héberge le parasite pour une courte période de transition les vecteurs : agents transmetteurs des parasites. Le réservoir de parasites : c’est l’ensemble des structures biotiques et abiotiques qui assurent la survivance d’un parasite exemple : milieu extérieur, Humain (affections strictement humaines), animal (zoonoses) ou tellurique (mycoses, ascaridiose) -Le cycle peut être Direct ou Monoxène: cycle simple avec passage direct du parasite de l’homme infecté à l’homme sain : c’est cycle un à un seul hôte. Exemple : ( amibes, oxyures). Indirect ou Hétéroxène: cycle complexe où le parasite passe par un ou plusieurs hôtes intermédiaires ou vecteurs transformateurs obligatoire de l’agent pathogène en une forme infestante:, mollusques (douves et schistosomes), mammifères (taenias). Les parasites de l'homme étudiés en Médecine appartiennent à trois Règnes du monde vivant, ceux des Protistes, représentés par les Protozoaires (animaux unicellulaires), des Métazoaires (animaux pluricellulaires), avec les Helminthes et les Arthropodes, les Champignons Inferieurs Melle MAGHNIA Page 4 Cours de microbiologie générale LES CHMPIGNONS : Définition : Les champignons ou mycètes constituent un règne très important, dont seul un petit nombre de représentants sont pathogènes pour l'homme. Ce sont des eucaryotes, possédant un noyau et une paroi cellulaire composée de chitine. Les champignons microscopiques (mycètes) se divisent en deux groupes : -champignons unicellulaire (levures) -champignons filamenteux (moisissures) La Reproduction des Champignons : Reproduction sexuée : par fusion de souches sexuées différentes. Reproduction asexuée : consiste en la production des spores . Les infections Provoquées par les Champignons : Mycoses Superficielles : Les dermatophytes sont un groupe de champignons pouvant utiliser la kératine comme nutriment. Dans la peau , les cheveux et les poils, exemple :Eczéma Mycoses Sous-Cutanées : Ces infections sont causées par un grand nombre de champignons, mais sont surtout rencontrées dans les régions tropicales et subtropicales. La plupart de ces germes sont présents dans le sol et pénètrent sous l'épiderme à la suite d'un traumatisme, Exemple : les Mycétomes : Ils se présentent sous la forme de lésions localisées délabrantes drainées vers la surface de la peau, le plus souvent au niveau du pied ou des mains causé par Aspergillus . Mycoses Systémiques ou Profondes : La plupart de ces infections résultent de l'inhalation de spores,. Certaines affectent des individus auparavant en bonne santé, mais beaucoup sont des infections opportunistes. Exemple : Candidoses Le principal agent pathogène est Candida albicans. Levures Melle MAGHNIA Moisissures Page 5 Cours de microbiologie générale LES PROTOZOAIRES Définition : sont des cellules eucaryotes, organismes simples, unicellulaires, mais complets (cette cellule possède toutes les fonctions nécessaires à sa vie : nutrition, mobilité, reproduction, etc…) . Les protozoaires se multiplient par scissiparité ou schizogonie, On peut classer les protozoaires selon leur mobilité en protozoaires : Flagellés : se déplacent en moyen des flagelles ondulants , exemple : leishmania qui provoque la leishmaniose Ciliés : se déplacent par des cils vibratiles Amibe : se déplacent grâce à des prolongement cytoplasmique ou pseudopodes exemple : Entamoeba Hitolytica qui provoque l’amibiase . Sporozoaires : immobiles et en générale endocellulaire exemple: Plasmodium qui cause le paludisme . LES HELMINTHES (METAZOAIRES ) : Les parasites multicellulaires sont des vers dépourvus d'appendices locomoteurs, ayant un rôle pathogène propre. Au cours de leur cycle biologique, ils présentent une forme adulte et une ou plusieurs formes larvaires. Selon le parasite en cause, l'Homme peut héberger le ver adulte et/ou une forme larvaire. Melle MAGHNIA Page 6 Cours de microbiologie générale On classe les Helminthes en deux groupes : Les Némathelminthes (vers ronds) : ils ont un corps non segmenté , un tube digestif , appareil excréteur , système nerveux et un appareil génital . Les Plathelminthes (vers plats): ils ont un Corps aplati ; des Organes de fixation (ventouses , crochets ) et un Tube digestif incomplet ou absent .On distingue la classe des Cestodes + Classe des Trématodes Les Cestodes : Les cestodes ou vers solitaires sont acquis par ingestion de larves présentes dans les chairs insuffisamment cuites de poisson , de boeuf (Taenia saginata) ou de porc (Taenia solium) Les ténias du porc et du boeuf peuvent atteindre 2,50 m de long . Les trématodes : Les trématodes, ou douves, ont un cycle vital complexe impliquant un mollusque (habituellement gastéropode) comme hôte intermédiaire L'adulte se développe chez l'homme. On distingue deux groupes : les douves et les schistosomes . o Douves intestinales : Par exemple : Fasciolopsis buski est une douve intestinale géante (de 2 à 7,5 cm) rencontrée en Extrême Orient, L’infection est transmise par ingestion de légumes d’eau contaminées. o Schistosomes (bilharzies) Par exemple : Schistosoma mansoni est un parasite présent en Afrique Arabie et Madagascar. Nématode Cestode Melle MAGHNIA Trématode Page 7
