10-These de doctorat de GHADBANE Mouloud 2014

DEPARTEMENT DE BIOLOGIE ET DECOLOGIE VEGETALE
Thèse
Présentée par
GHADBANE Mouloud
Pour l’obtention du diplôme de
Doctorat en Sciences
Filière: Biologie
Spécialité: Biologie végétale
Thème
Microflore rhizosphérique de quelques Fabacées
(légumineuses) endémiques dans les régions de Boussaâda
et de Biskra (Algérie)
Soutenue publiquement le 16/12/2014
Devant le Jury
Président
LAOUER Hocine
Pr. UFA Sétif 1
Directeur
HARZALLAH Daoud
Pr. UFA Sétif 1
Examinateurs
KACEM CHAOUCHE Noreddine
Pr. UM Constantine
BAHLOULI Fayçal
Pr. UMB 
Laboratoire de Microbiologie Appliquée
N°………………………………………….…………..…….……/SNV/2014
Université Ferhat Abbas Sétif 1
Faculté des Sciences de la
Nature et de la Vie
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Résumé
L’activité antimicrobienne, l’effet phytostimulateur et les modes d’action des
rhizobactéries isolées à partir de trois Fabacées endémiques d’Algérie (Ononis
angustissima, Astragalus gombo et Calobota saharae) ont été évalués. L’identification
phénotypique et génotypique des isolats à fortes activité antimicrobienne, a mis en
évidence les souches Brevibacillus brevis GM100, Bacillus clausii GM17, Streptomyces
sp. 21, 2A26, 1B10 et 2C34. La sensibilité des extraits purifiés à activité
antimicrobienne des souches productrices des bactériocines B. brevis GM100, B. clausii
GM17 aux différentes protéases démontre leurs natures protéiques. En plus, les analyses
par MALDI-TOF/MS, ont démontré que les deux bactériocines Bac-GM100 et Bac-
GM17, sont des protéines monomériques de poids moléculaire de 4375,66 Da et
5158,11 Da, respectivement. Ces deux bactériocines sont thermostables, actives dans un
pH de 3 à 10 et présentent un large spectre d’activité antimicrobienne. Les quatre
Streptomyces sp., solubilisent le phosphate et produisent les enzymes extracellulaires
qui dégradent la paroi des cellules fongiques (chitinase et protéase), ainsi qu’une
production marquée de l’acide-β-indolacétique (AIA). Les résultats du test In vivo, ont
révélés que les quatre souches de Streptomyces sp. stimulent de manière significative la
croissance et réduisent l’indice de maladie causée par Fusarium oxysporium chez le pois
chiches (Cicer arietinum L.). Ces résultats indiquent que les souches de Streptomyces
sp., Brevibacillus brevis GM100 et Bacillus clausii GM17 isolées à partir de
rhizosphère d’Ononis angustissima pourrait être une source intéressante de substances
bioactives à fort potentiels en lutte biologique.
Mots clés: Brevibacillus brevis, Bacillus clausii, Streptomyces sp., Bactériocine, lutte
biologique

Abstract
The antimicrobial activity, phytostimulating effect and mechanism of action of
rhizobacteria isolated from three endemic legumes in Algeria (Ononis angustissima,
Astragalus gombo and Calobota saharae) were evaluated. Phenotypic and genotypic
identification of isolates with high antimicrobial activity revealed the strains
Brevibacillus brevis GM100, Bacillus clausii GM17, Streptomyces sp. 21, 2A26, 1B10
and 2C34. The sensitivity of the antimicrobial purified extracts from a bacteriocin-
producing strains B. brevis GM100 and B. clausii GM17 in the presence of different
proteases demonstrate their proteinaceous nature. Furthermore, analyses by MALDI-
TOF/MS, demonstrated that both bacteriocins Bac-GM100 and Bac-GM17, are
monomeric proteins with molecular weight of 4375,66 Da and 5158,11 Da,
respectively. These two bacteriocins are thermostable, active in pH range from 3 to 10
and have a large specter of activity. The four Streptomyces sp., solubilize phosphate and
produce extracellular fungal cell-wall degrading enzymes chitinase and protease, as well
as a marked production of acid-β-indoleacetic (AIA).The In vivo results have revealed
that the four strains of Streptomyces sp. significantly stimulate growth and reduce the
disease incidence caused by Fusarium oxysporium in chickpea (Cicer arietinum L.).
These results indicate that the strains of Streptomyces sp., Brevibacillus brevis GM100
and Bacillus clausii GM17 isolated from rhizosphere of Ononis angustissima could be
an interesting source of bioactive substances with a high potential for biological control.
Keywords: Brevibacillus brevis, Bacillus clausii, Streptomyces sp., Bacteriocin,
Biocontrol.

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Remerciements
   ents et les plus sincères à mon
directeur de thèse Monsieur le Professeur HARZALLAH Daoud pour
encadrement et ses conseils.
Je remercie les membres du jury qui ont bien voulu consacrer une
partie de leur temps à ma thèse
Je remercie Monsieur LAOUER HOCINE Professeur Université
Ferhat Abbas            
Je remercie Monsieur KACEM CHAOUCHE NOREDDINE,
Constantine 1 qui a accepté de juger ce travail
      BAHLOULI
Fayçal           
travail de th
Je tiens à remercier Messieurs, BELHADJ Hani, JAOUADI
Bassem,  et JOSE E. González-Pastor
Merci à tous mes amis Djaidja Ahmed, BENDERRADJI Laid,
KELLOU Kamel, BOUAZZA Lyas, BAAZIZ Karim, CHAHREDINE
Sadek, MEDJKAL Samir.
Merci à tous.