Introduction à la structure 3D de molécules avec le logiciel de
visualisation moléculaire
Réalisé par : OTMANE BELAYACH
ZINEB BELKHOUDA
Groupe : 2 2015-2016
Le but :
Apprendre à construire des molécules des structures 3D a l'aide de le logiciel
Gaussview.
Matériel:
Machine de type PC (système ‘exploitation Win XP)
1-La moléculeMe-Ala-Ala- Ala-Me
Me-Ala-Ala-Ala-Ala
2-les distances et les angles et les angles dièdres des différents
atomes suivants :
Liaison
La distance (Å)
liaison
L’angle
liaison
L’angledièdre (Å)
C(5)-H(7)
1,09000
(HĈH)
35,27882
(HNCH)
-25,65417
C(3)-C(5)
1,52500
(CĈC)
30,19445
(CNCC)
60,00001
C(16)-O(20)
1,25840
(OĈN)
120,0000
(OCNH)
-178,67490
N(11)-H(12)
1,00000
(CĈH) (simple)
109,4998
(HCCH)
-164,40995
3-Construction des moléculesa l’aide de (buildre) :
La molecule H2
C(24)-N(22)
1,44900
(CĈH) (C liée
avec O d. l
109,4712
(HCNC)
34,34584
C(6)-N(11)
1,47000
H(8)-H(9)
1,77965
C(31)-O(31)
2,42757
O(20)-N(11)
2,68565
C(6)-N(1)
2,45029
La molecule H2O
La molecule C2H4
La molecule C2H2
La molécule C2H6
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