Introduction à la structure 3D de molécules avec le logiciel de visualisation moléculaire Réalisé par : OTMANE BELAYACH ZINEB BELKHOUDA Groupe :2 2015-2016 Le but : Apprendre à construire des molécules des structures 3D a l'aide de le logiciel Gaussview. Matériel: Machine de type PC (système ‘exploitation Win XP) 1-La moléculeMe-Ala-Ala- Ala-Me Me-Ala-Ala-Ala-Ala 2-les distances et les angles et les angles dièdres des différents atomes suivants : Liaison C(5)-H(7) C(3)-C(5) La distance (Å) 1,09000 1,52500 liaison (HĈH) (CĈC) L’angle 35,27882 30,19445 liaison (HNCH) (CNCC) L’angledièdre (Å) -25,65417 60,00001 C(16)-O(20) N(11)-H(12) 1,25840 1,00000 (OĈN) (CĈH) (simple) 120,0000 109,4998 (OCNH) (HCCH) -178,67490 -164,40995 C(24)-N(22) 1,44900 C(6)-N(11) H(8)-H(9) 1,47000 1,77965 C(31)-O(31) O(20)-N(11) 2,42757 2,68565 C(6)-N(1) 2,45029 (CĈH) (C liée avec O d. l 109,4712 (HCNC) 34,34584 3-Construction des moléculesa l’aide de (buildre) : La molecule H2 La molecule H2O La molecule C2H4 La molecule C2H2 La molécule C2H6 H2:H1-H2 # symbol NA 1 H 2 H 1 - H 1 NB NC bond angle dihedral 0,742000 2 0,742000 0,742000 X Y Z 0 ,0000 0.0000 0,742000 0 .0000 0.0000 0,741938 -0 .006759 0.006759 H2O:O1-H2-H3 # Symbol NA 1 O 2 H 1 3 H 1 NB 2 NC bond Angle dihedral X Y Z 0.000000 0.0000 0.000 0.25800 0.95800 0.00000 0.0000 0.25800 104.5 -0.239864 -0.655831 0.655831