LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE BAIGNADE

UNIVERSITE MOHAMMED V
FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE -RABATANNEE : 2011
THESE N°:100
LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES
EAUX DE BAIGNADE
THESE
Présentée et soutenue publiquement le :…………
PAR
Mr. EL ATTIFFI EL OUADRASSI ALI
Né le 22/06/1987 à KSAR EL KEBIR
Pour l'Obtention du Doctorat en Pharmacie
MOTS CLES : Eaux de baignade, Pollution, Risques sanitaires.
MEMBRES DE JURY
Mr. A.GAOUZI
Professeur de Pédiatrie
Mr. M . ZOUHDI
Professeur de Microbiologie
Mme. S. EL HAMZAOUI
Professeur de Microbiologie
Mme. S.AOUFI
Professeur agrégé de Parasitologie
PRESIDENT
RAPPORTEUR
JUGES
UNIVERSITE MOHAMMED V- SOUISSI
FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE - RABAT
DOYENS HONORAIRES :
1962 – 1969
: Docteur Abdelmalek FARAJ
1969 – 1974
: Professeur Abdellatif BERBICH
1974 – 1981
: Professeur Bachir LAZRAK
1981 – 1989
: Professeur Taieb CHKILI
1989 – 1997
: Professeur Mohamed Tahar ALAOUI
1997 – 2003
: Professeur Abdelmajid BELMAHI
ADMINISTRATION :
Doyen : Professeur Najia HAJJAJ
Vice Doyen chargé des Affaires Académiques et estudiantines
Professeur Mohammed JIDDANE
Vice Doyen chargé de la Recherche et de la Coopération
Professeur Ali BENOMAR
Vice Doyen chargé des Affaires Spécifiques à la Pharmacie
Professeur Yahia CHERRAH
Secrétaire Général : Mr. El Hassane AHALLAT
Conservateur
: Ahmed ZAHIDI
PROFESSEURS :
Février, Septembre, Décembre 1973
1. Pr. CHKILI Taieb
Neuropsychiatrie
Janvier et Décembre 1976
2. Pr. HASSAR Mohamed
Pharmacologie Clinique
Mars, Avril et Septembre 1980
3. Pr. EL KHAMLICHI Abdeslam
4. Pr. MESBAHI Redouane
Neurochirurgie
Cardiologie
5. Mai et Octobre 1981
6. Pr. BOUZOUBAA Abdelmajid
7. Pr. EL MANOUAR Mohamed
8. Pr. HAMANI Ahmed*
9. Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajih
10.
Pr. SBIHI Ahmed
11. Pr. TAOBANE Hamid*
Cardiologie
Traumatologie-Orthopédie
Cardiologie
Chirurgie Cardio-Vasculaire
Anesthésie –Réanimation
Chirurgie Thoracique
12.
13.
14.
15.
16.
17.
Oto-Rhino-Laryngologie
Chirurgie-Cardio-Vasculaire
Anatomie
Chirurgie Thoracique
Physiologie
Mai et Novembre 1982
Pr. ABROUQ Ali*
Pr. BENOMAR M’hammed
Pr. BENSOUDA Mohamed
Pr. BENOSMAN Abdellatif
Pr. LAHBABI ép. AMRANI Naïma
Novembre 1983
18. Pr. ALAOUI TAHIRI Kébir*
19. Pr. BALAFREJ Amina
20. Pr. BELLAKHDAR Fouad
21. Pr. HAJJAJ ép. HASSOUNI Najia
Pneumo-phtisiologie
Pédiatrie
Neurochirurgie
Rhumatologie
22. Pr. SRAIRI Jamal-Eddine
Cardiologie
Décembre 1984
23. Pr. BOUCETTA Mohamed*
24. Pr. EL GUEDDARI Brahim El Khalil
25. Pr. MAAOUNI Abdelaziz
26. Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajdi
27. Pr. NAJI M’Barek *
28. Pr. SETTAF Abdellatif
Neurochirurgie
Radiothérapie
Médecine Interne
Anesthésie -Réanimation
Immuno-Hématologie
Chirurgie
Novembre et Décembre 1985
29. Pr. BENJELLOUN Halima
30. Pr. BENSAID Younes
31. Pr. EL ALAOUI Faris Moulay El Mostafa
32. Pr. IHRAI Hssain
*
33. Pr. IRAQI Ghali
34. Pr. KZADRI Mohamed
Cardiologie
Pathologie Chirurgicale
Neurologie
Stomatologie et Chirurgie Maxillo-Faciale
Pneumo-phtisiologie
Oto-Rhino-laryngologie
Janvier, Février et Décembre 1987
35. Pr. AJANA Ali
36. Pr. AMMAR Fanid
37. Pr. CHAHED OUAZZANI Houria ép.TAOBANE
38. Pr. EL FASSY FIHRI Mohamed Taoufiq
39. Pr. EL HAITEM Naïma
40. Pr. EL MANSOURI Abdellah*
41. Pr. EL YAACOUBI Moradh
42. Pr. ESSAID EL FEYDI Abdellah
43. Pr. LACHKAR Hassan
44. Pr. OHAYON Victor*
45. Pr. YAHYAOUI Mohamed
Radiologie
Pathologie Chirurgicale
Gastro-Entérologie
Pneumo-phtisiologie
Cardiologie
Chimie-Toxicologie Expertise
Traumatologie Orthopédie
Gastro-Entérologie
Médecine Interne
Médecine Interne
Neurologie
Décembre 1988
46. Pr. BENHAMAMOUCH Mohamed Najib
47. Pr. DAFIRI Rachida
48. Pr. FAIK Mohamed
49. Pr. HERMAS Mohamed
50. Pr. TOLOUNE Farida*
Chirurgie Pédiatrique
Radiologie
Urologie
Traumatologie Orthopédie
Médecine Interne
Décembre 1989 Janvier et Novembre 1990
51. Pr. ADNAOUI Mohamed
52. Pr. AOUNI Mohamed
53. Pr. BENAMEUR Mohamed*
54. Pr. BOUKILI MAKHOUKHI Abdelali
55. Pr. CHAD Bouziane
56. Pr. CHKOFF Rachid
57. Pr. KHARBACH Aîcha
58. Pr. MANSOURI Fatima
59. Pr. OUAZZANI Taïbi Mohamed Réda
60. Pr. SEDRATI Omar*
61. Pr. TAZI Saoud Anas
Médecine Interne
Médecine Interne
Radiologie
Cardiologie
Pathologie Chirurgicale
Urologie
Gynécologie -Obstétrique
Anatomie-Pathologique
Neurologie
Dermatologie
Anesthésie Réanimation
Février Avril Juillet et Décembre 1991
62. Pr. AL HAMANY Zaîtounia
63. Pr. ATMANI Mohamed*
Anatomie-Pathologique
Anesthésie Réanimation
64.
65.
66.
67.
68.
69.
70.
71.
72.
73.
74.
75.
76.
77.
78.
79.
80.
81.
82.
Pr. AZZOUZI Abderrahim
Pr. BAYAHIA Rabéa ép. HASSAM
Pr. BELKOUCHI Abdelkader
Pr. BENABDELLAH Chahrazad
Pr. BENCHEKROUN BELABBES Abdellatif
Pr. BENSOUDA Yahia
Pr. BERRAHO Amina
Pr. BEZZAD Rachid
Pr. CHABRAOUI Layachi
Pr. CHANA El Houssaine*
Pr. CHERRAH Yahia
Pr. CHOKAIRI Omar
Pr. FAJRI Ahmed*
Pr. JANATI Idrissi Mohamed*
Pr. KHATTAB Mohamed
Pr. NEJMI Maati
Pr. OUAALINE Mohammed*
Pr. SOULAYMANI Rachida ép.BENCHEIKH
Pr. TAOUFIK Jamal
Anesthésie Réanimation
Néphrologie
Chirurgie Générale
Hématologie
Chirurgie Générale
Pharmacie galénique
Ophtalmologie
Gynécologie Obstétrique
Biochimie et Chimie
Ophtalmologie
Pharmacologie
Histologie Embryologie
Psychiatrie
Chirurgie Générale
Pédiatrie
Anesthésie-Réanimation
Médecine Préventive, Santé Publique et Hygiène
Pharmacologie
Chimie thérapeutique
Décembre 1992
83. Pr. AHALLAT Mohamed
84. Pr. BENOUDA Amina
85. Pr. BENSOUDA Adil
86. Pr. BOUJIDA Mohamed Najib
87. Pr. CHAHED OUAZZANI Laaziza
88. Pr. CHRAIBI Chafiq
89. Pr. DAOUDI Rajae
90. Pr. DEHAYNI Mohamed*
91. Pr. EL HADDOURY Mohamed
92. Pr. EL OUAHABI Abdessamad
93. Pr. FELLAT Rokaya
94. Pr. GHAFIR Driss*
95. Pr. JIDDANE Mohamed
96. Pr. OUAZZANI TAIBI Med Charaf Eddine
97. Pr. TAGHY Ahmed
98. Pr. ZOUHDI Mimoun
Chirurgie Générale
Microbiologie
Anesthésie Réanimation
Radiologie
Gastro-Entérologie
Gynécologie Obstétrique
Ophtalmologie
Gynécologie Obstétrique
Anesthésie Réanimation
Neurochirurgie
Cardiologie
Médecine Interne
Anatomie
Gynécologie Obstétrique
Chirurgie Générale
Microbiologie
Mars 1994
99. Pr. AGNAOU Lahcen
100. Pr. AL BAROUDI Saad
101. Pr. BENCHERIFA Fatiha
102. Pr. BENJAAFAR Noureddine
103. Pr. BENJELLOUN Samir
104. Pr. BEN RAIS Nozha
105. Pr. CAOUI Malika
106. Pr. CHRAIBI Abdelmjid
107. Pr. EL AMRANI Sabah ép. AHALLAT
108. Pr. EL AOUAD Rajae
109. Pr. EL BARDOUNI Ahmed
110. Pr. EL HASSANI My Rachid
111. Pr. EL IDRISSI LAMGHARI Abdennaceur
112. Pr. EL KIRAT Abdelmajid*
113. Pr. ERROUGANI Abdelkader
Ophtalmologie
Chirurgie Générale
Ophtalmologie
Radiothérapie
Chirurgie Générale
Biophysique
Biophysique
Endocrinologie et Maladies Métaboliques
Gynécologie Obstétrique
Immunologie
Traumato-Orthopédie
Radiologie
Médecine Interne
Chirurgie Cardio- Vasculaire
Chirurgie Générale
114.
115.
116.
117.
118.
119.
120.
121.
122.
123.
124.
125.
Pr. ESSAKALI Malika
Pr. ETTAYEBI Fouad
Pr. HADRI Larbi*
Pr. HASSAM Badredine
Pr. IFRINE Lahssan
Pr. JELTHI Ahmed
Pr. MAHFOUD Mustapha
Pr. MOUDENE Ahmed*
Pr. OULBACHA Said
Pr. RHRAB Brahim
Pr. SENOUCI Karima
Pr. SLAOUI Anas
ép. BELKHADIR
Immunologie
Chirurgie Pédiatrique
Médecine Interne
Dermatologie
Chirurgie Générale
Anatomie Pathologique
Traumatologie – Orthopédie
Traumatologie- Orthopédie
Chirurgie Générale
Gynécologie –Obstétrique
Dermatologie
Chirurgie Cardio-Vasculaire
Mars 1994
126. Pr. ABBAR Mohamed*
127. Pr. ABDELHAK M’barek
128. Pr. BELAIDI Halima
129. Pr. BRAHMI Rida Slimane
130. Pr. BENTAHILA Abdelali
131. Pr. BENYAHIA Mohammed Ali
132. Pr. BERRADA Mohamed Saleh
133. Pr. CHAMI Ilham
134. Pr. CHERKAOUI Lalla Ouafae
135. Pr. EL ABBADI Najia
136. Pr. HANINE Ahmed*
137. Pr. JALIL Abdelouahed
138. Pr. LAKHDAR Amina
139. Pr. MOUANE Nezha
Urologie
Chirurgie – Pédiatrique
Neurologie
Gynécologie Obstétrique
Pédiatrie
Gynécologie – Obstétrique
Traumatologie – Orthopédie
Radiologie
Ophtalmologie
Neurochirurgie
Radiologie
Chirurgie Générale
Gynécologie Obstétrique
Pédiatrie
Mars 1995
140. Pr. ABOUQUAL Redouane
141. Pr. AMRAOUI Mohamed
142. Pr. BAIDADA Abdelaziz
143. Pr. BARGACH Samir
144. Pr. BEDDOUCHE Amoqrane*
145. Pr. BENAZZOUZ Mustapha
146. Pr. CHAARI Jilali*
147. Pr. DIMOU M’barek*
148. Pr. DRISSI KAMILI Mohammed Nordine*
149. Pr. EL MESNAOUI Abbes
150. Pr. ESSAKALI HOUSSYNI Leila
151. Pr. FERHATI Driss
152. Pr. HASSOUNI Fadil
153. Pr. HDA Abdelhamid*
154. Pr. IBEN ATTYA ANDALOUSSI Ahmed
155. Pr. IBRAHIMY Wafaa
156. Pr. MANSOURI Aziz
157. Pr. OUAZZANI CHAHDI Bahia
158. Pr. RZIN Abdelkader*
159. Pr. SEFIANI Abdelaziz
160. Pr. ZEGGWAGH Amine Ali
Réanimation Médicale
Chirurgie Générale
Gynécologie Obstétrique
Gynécologie Obstétrique
Urologie
Gastro-Entérologie
Médecine Interne
Anesthésie Réanimation
Anesthésie Réanimation
Chirurgie Générale
Oto-Rhino-Laryngologie
Gynécologie Obstétrique
Médecine Préventive, Santé Publique et Hygiène
Cardiologie
Urologie
Ophtalmologie
Radiothérapie
Ophtalmologie
Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale
Génétique
Réanimation Médicale
Décembre 1996
161. Pr. AMIL Touriya*
Radiologie
162.
163.
164.
165.
166.
167.
168.
169.
170.
171.
172.
173.
174.
Pr. BELKACEM Rachid
Pr. BELMAHI Amin
Pr. BOULANOUAR Abdelkrim
Pr. EL ALAMI EL FARICHA EL Hassan
Pr. EL MELLOUKI Ouafae*
Pr. GAOUZI Ahmed
Pr. MAHFOUDI M’barek*
Pr. MOHAMMADINE EL Hamid
Pr. MOHAMMADI Mohamed
Pr. MOULINE Soumaya
Pr. OUADGHIRI Mohamed
Pr. OUZEDDOUN Naima
Pr. ZBIR EL Mehdi*
Chirurgie Pédiatrie
Chirurgie réparatrice et plastique
Ophtalmologie
Chirurgie Générale
Parasitologie
Pédiatrie
Radiologie
Chirurgie Générale
Médecine Interne
Pneumo-phtisiologie
Traumatologie-Orthopédie
Néphrologie
Cardiologie
Novembre 1997
175. Pr. ALAMI Mohamed Hassan
176. Pr. BEN AMAR Abdesselem
177. Pr. BEN SLIMANE Lounis
178. Pr. BIROUK Nazha
179. Pr. BOULAICH Mohamed
180. Pr. CHAOUIR Souad*
181. Pr. DERRAZ Said
182. Pr. ERREIMI Naima
183. Pr. FELLAT Nadia
184. Pr. GUEDDARI Fatima Zohra
185. Pr. HAIMEUR Charki*
186. Pr. KANOUNI NAWAL
187. Pr. KOUTANI Abdellatif
188. Pr. LAHLOU Mohamed Khalid
189. Pr. MAHRAOUI CHAFIQ
190. Pr. NAZI M’barek*
191. Pr. OUAHABI Hamid*
192. Pr. SAFI Lahcen*
193. Pr. TAOUFIQ Jallal
194. Pr. YOUSFI MALKI Mounia
Gynécologie-Obstétrique
Chirurgie Générale
Urologie
Neurologie
O.RL.
Radiologie
Neurochirurgie
Pédiatrie
Cardiologie
Radiologie
Anesthésie Réanimation
Physiologie
Urologie
Chirurgie Générale
Pédiatrie
Cardiologie
Neurologie
Anesthésie Réanimation
Psychiatrie
Gynécologie Obstétrique
Novembre 1998
195. Pr. AFIFI RAJAA
196. Pr. AIT BENASSER MOULAY Ali*
197. Pr. ALOUANE Mohammed*
198. Pr. BENOMAR ALI
199. Pr. BOUGTAB Abdesslam
200. Pr. ER RIHANI Hassan
201. Pr. EZZAITOUNI Fatima
202. Pr. KABBAJ Najat
203. Pr. LAZRAK Khalid ( M)
Gastro-Entérologie
Pneumo-phtisiologie
Oto-Rhino-Laryngologie
Neurologie
Chirurgie Générale
Oncologie Médicale
Néphrologie
Radiologie
Traumatologie Orthopédie
Novembre 1998
204. Pr. BENKIRANE Majid*
205. Pr. KHATOURI ALI*
206. Pr. LABRAIMI Ahmed*
Hématologie
Cardiologie
Anatomie Pathologique
Janvier 2000
207. Pr. ABID Ahmed*
Pneumophtisiologie
208.
209.
210.
211.
212.
213.
214.
215.
216.
217.
218.
219.
220.
221.
222.
223.
224.
225.
226.
227.
228.
229.
230.
231.
232.
233.
234.
235.
236.
237.
238.
239.
240.
241.
242.
243.
244.
245.
246.
Pr. AIT OUMAR Hassan
Pr. BENCHERIF My Zahid
Pr. BENJELLOUN DAKHAMA Badr.Sououd
Pr. BOURKADI Jamal-Eddine
Pr. CHAOUI Zineb
Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Al Montacer
Pr. ECHARRAB El Mahjoub
Pr. EL FTOUH Mustapha
Pr. EL MOSTARCHID Brahim*
Pr. EL OTMANYAzzedine
Pr. GHANNAM Rachid
Pr. HAMMANI Lahcen
Pr. ISMAILI Mohamed Hatim
Pr. ISMAILI Hassane*
Pr. KRAMI Hayat Ennoufouss
Pr. MAHMOUDI Abdelkrim*
Pr. TACHINANTE Rajae
Pr. TAZI MEZALEK Zoubida
Novembre 2000
Pr. AIDI Saadia
Pr. AIT OURHROUI Mohamed
Pr. AJANA Fatima Zohra
Pr. BENAMR Said
Pr. BENCHEKROUN Nabiha
Pr. CHERTI Mohammed
Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Selma
Pr. EL HASSANI Amine
Pr. EL IDGHIRI Hassan
Pr. EL KHADER Khalid
Pr. EL MAGHRAOUI Abdellah*
Pr. GHARBI Mohamed El Hassan
Pr. HSSAIDA Rachid*
Pr. LACHKAR Azzouz
Pr. LAHLOU Abdou
Pr. MAFTAH Mohamed*
Pr. MAHASSINI Najat
Pr. MDAGHRI ALAOUI Asmae
Pr. NASSIH Mohamed*
Pr. ROUIMI Abdelhadi
Décembre 2001
247. Pr. ABABOU Adil
248. Pr. AOUAD Aicha
249. Pr. BALKHI Hicham*
250. Pr. BELMEKKI Mohammed
251. Pr. BENABDELJLIL Maria
252. Pr. BENAMAR Loubna
253. Pr. BENAMOR Jouda
254. Pr. BENELBARHDADI Imane
255. Pr. BENNANI Rajae
256. Pr. BENOUACHANE Thami
257. Pr. BENYOUSSEF Khalil
258. Pr. BERRADA Rachid
259. Pr. BEZZA Ahmed*
Pédiatrie
Ophtalmologie
Pédiatrie
Pneumo-phtisiologie
Ophtalmologie
Chirurgie Générale
Chirurgie Générale
Pneumo-phtisiologie
Neurochirurgie
Chirurgie Générale
Cardiologie
Radiologie
Anesthésie-Réanimation
Traumatologie Orthopédie
Gastro-Entérologie
Anesthésie-Réanimation
Anesthésie-Réanimation
Médecine Interne
Neurologie
Dermatologie
Gastro-Entérologie
Chirurgie Générale
Ophtalmologie
Cardiologie
²Anesthésie-Réanimation
Pédiatrie
Oto-Rhino-Laryngologie
Urologie
Rhumatologie
Endocrinologie et Maladies Métaboliques
Anesthésie-Réanimation
Urologie
Traumatologie Orthopédie
Neurochirurgie
Anatomie Pathologique
Pédiatrie
Stomatologie Et Chirurgie Maxillo-Faciale
Neurologie
Anesthésie-Réanimation
Cardiologie
Anesthésie-Réanimation
Ophtalmologie
Neurologie
Néphrologie
Pneumo-phtisiologie
Gastro-Entérologie
Cardiologie
Pédiatrie
Dermatologie
Gynécologie Obstétrique
Rhumatologie
260.
261.
262.
263.
264.
265.
266.
267.
268.
269.
270.
271.
272.
273.
274.
275.
276.
277.
278.
279.
280.
281.
282.
283.
284.
285.
286.
287.
288.
289.
290.
291.
292.
Pr. BOUCHIKHI IDRISSI Med Larbi
Pr. BOUHOUCH Rachida
Pr. BOUMDIN El Hassane*
Pr. CHAT Latifa
Pr. CHELLAOUI Mounia
Pr. DAALI Mustapha*
Pr. DRISSI Sidi Mourad*
Pr. EL HAJOUI Ghziel Samira
Pr. EL HIJRI Ahmed
Pr. EL MAAQILI Moulay Rachid
Pr. EL MADHI Tarik
Pr. EL MOUSSAIF Hamid
Pr. EL OUNANI Mohamed
Pr. EL QUESSAR Abdeljlil
Pr. ETTAIR Said
Pr. GAZZAZ Miloudi*
Pr. GOURINDA Hassan
Pr. HRORA Abdelmalek
Pr. KABBAJ Saad
Pr. KABIRI EL Hassane*
Pr. LAMRANI Moulay Omar
Pr. LEKEHAL Brahim
Pr. MAHASSIN Fattouma*
Pr. MEDARHRI Jalil
Pr. MIKDAME Mohammed*
Pr. MOHSINE Raouf
Pr. NABIL Samira
Pr. NOUINI Yassine
Pr. OUALIM Zouhir*
Pr. SABBAH Farid
Pr. SEFIANI Yasser
Pr. TAOUFIQ BENCHEKROUN Soumia
Pr. TAZI MOUKHA Karim
Décembre 2002
293. Pr. AL BOUZIDI Abderrahmane*
294. Pr. AMEUR Ahmed *
295. Pr. AMRI Rachida
296. Pr. AOURARH Aziz*
297. Pr. BAMOU Youssef *
298. Pr. BELMEJDOUB Ghizlene*
299. Pr. BENBOUAZZA Karima
300. Pr. BENZEKRI Laila
301. Pr. BENZZOUBEIR Nadia*
302. Pr. BERNOUSSI Zakiya
303. Pr. BICHRA Mohamed Zakariya
304. Pr. CHOHO Abdelkrim *
305. Pr. CHKIRATE Bouchra
306. Pr. EL ALAMI EL FELLOUS Sidi Zouhair
307. Pr. EL ALJ Haj Ahmed
308. Pr. EL BARNOUSSI Leila
309. Pr. EL HAOURI Mohamed *
310. Pr. EL MANSARI Omar*
311. Pr. ES-SADEL Abdelhamid
Anatomie
Cardiologie
Radiologie
Radiologie
Radiologie
Chirurgie Générale
Radiologie
Gynécologie Obstétrique
Anesthésie-Réanimation
Neuro-Chirurgie
Chirurgie-Pédiatrique
Ophtalmologie
Chirurgie Générale
Radiologie
Pédiatrie
Neuro-Chirurgie
Chirurgie-Pédiatrique
Chirurgie Générale
Anesthésie-Réanimation
Chirurgie Thoracique
Traumatologie Orthopédie
Chirurgie Vasculaire Périphérique
Médecine Interne
Chirurgie Générale
Hématologie Clinique
Chirurgie Générale
Gynécologie Obstétrique
Urologie
Néphrologie
Chirurgie Générale
Chirurgie Vasculaire Périphérique
Pédiatrie
Urologie
Anatomie Pathologique
Urologie
Cardiologie
Gastro-Entérologie
Biochimie-Chimie
Endocrinologie et Maladies Métaboliques
Rhumatologie
Dermatologie
Gastro-Entérologie
Anatomie Pathologique
Psychiatrie
Chirurgie Générale
Pédiatrie
Chirurgie Pédiatrique
Urologie
Gynécologie Obstétrique
Dermatologie
Chirurgie Générale
Chirurgie Générale
312.
313.
314.
315.
316.
317.
318.
319.
320.
321.
322.
323.
324.
325.
326.
327.
328.
329.
330.
331.
332.
333.
Pr. FILALI ADIB Abdelhai
Pr. HADDOUR Leila
Pr. HAJJI Zakia
Pr. IKEN Ali
Pr. ISMAEL Farid
Pr. JAAFAR Abdeloihab*
Pr. KRIOULE Yamina
Pr. LAGHMARI Mina
Pr. MABROUK Hfid*
Pr. MOUSSAOUI RAHALI Driss*
Pr. MOUSTAGHFIR Abdelhamid*
Pr. MOUSTAINE My Rachid
Pr. NAITLHO Abdelhamid*
Pr. OUJILAL Abdelilah
Pr. RACHID Khalid *
Pr. RAISS Mohamed
Pr. RGUIBI IDRISSI Sidi Mustapha*
Pr. RHOU Hakima
Pr. SIAH Samir *
Pr. THIMOU Amal
Pr. ZENTAR Aziz*
Pr. ZRARA Ibtisam*
Gynécologie Obstétrique
Cardiologie
Ophtalmologie
Urologie
Traumatologie Orthopédie
Traumatologie Orthopédie
Pédiatrie
Ophtalmologie
Traumatologie Orthopédie
Gynécologie Obstétrique
Cardiologie
Traumatologie Orthopédie
Médecine Interne
Oto-Rhino-Laryngologie
Traumatologie Orthopédie
Chirurgie Générale
Pneumophtisiologie
Néphrologie
Anesthésie Réanimation
Pédiatrie
Chirurgie Générale
Anatomie Pathologique
PROFESSEURS AGREGES :
Janvier 2004
334. Pr. ABDELLAH El Hassan
335. Pr. AMRANI Mariam
336. Pr. BENBOUZID Mohammed Anas
337. Pr. BENKIRANE Ahmed*
338. Pr. BENRAMDANE Larbi*
339. Pr. BOUGHALEM Mohamed*
340. Pr. BOULAADAS Malik
341. Pr. BOURAZZA Ahmed*
342. Pr. CHAGAR Belkacem*
343. Pr. CHERRADI Nadia
344. Pr. EL FENNI Jamal*
345. Pr. EL HANCHI ZAKI
346. Pr. EL KHORASSANI Mohamed
347. Pr. EL YOUNASSI Badreddine*
348. Pr. HACHI Hafid
349. Pr. JABOUIRIK Fatima
350. Pr. KARMANE Abdelouahed
351. Pr. KHABOUZE Samira
352. Pr. KHARMAZ Mohamed
353. Pr. LEZREK Mohammed*
354. Pr. MOUGHIL Said
355. Pr. NAOUMI Asmae*
356. Pr. SAADI Nozha
357. Pr. SASSENOU ISMAIL*
358. Pr. TARIB Abdelilah*
359. Pr. TIJAMI Fouad
Ophtalmologie
Anatomie Pathologique
Oto-Rhino-Laryngologie
Gastro-Entérologie
Chimie Analytique
Anesthésie Réanimation
Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale
Neurologie
Traumatologie Orthopédie
Anatomie Pathologique
Radiologie
Gynécologie Obstétrique
Pédiatrie
Cardiologie
Chirurgie Générale
Pédiatrie
Ophtalmologie
Gynécologie Obstétrique
Traumatologie Orthopédie
Urologie
Chirurgie Cardio-Vasculaire
Ophtalmologie
Gynécologie Obstétrique
Gastro-Entérologie
Pharmacie Clinique
Chirurgie Générale
360. Pr. ZARZUR Jamila
Cardiologie
Janvier 2005
361. Pr. ABBASSI Abdellah
362. Pr. AL KANDRY Sif Eddine*
363. Pr. ALAOUI Ahmed Essaid
364. Pr. ALLALI Fadoua
365. Pr. AMAR Yamama
366. Pr. AMAZOUZI Abdellah
367. Pr. AZIZ Noureddine*
368. Pr. BAHIRI Rachid
369. Pr. BARKAT Amina
370. Pr. BENHALIMA Hanane
371. Pr. BENHARBIT Mohamed
372. Pr. BENYASS Aatif
373. Pr. BERNOUSSI Abdelghani
374. Pr. BOUKLATA Salwa
375. Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Mohamed
376. Pr. DOUDOUH Abderrahim*
377. Pr. EL HAMZAOUI Sakina
378. Pr. HAJJI Leila
379. Pr. HESSISSEN Leila
380. Pr. JIDAL Mohamed*
381. Pr. KARIM Abdelouahed
382. Pr. KENDOUSSI Mohamed*
383. Pr. LAAROUSSI Mohamed
384. Pr. LYAGOUBI Mohammed
385. Pr. NIAMANE Radouane*
386. Pr. RAGALA Abdelhak
387. Pr. SBIHI Souad
388. Pr. TNACHERI OUAZZANI Btissam
389. Pr. ZERAIDI Najia
Chirurgie Réparatrice et Plastique
Chirurgie Générale
Microbiologie
Rhumatologie
Néphrologie
Ophtalmologie
Radiologie
Rhumatologie
Pédiatrie
Stomatologie et Chirurgie Maxillo Faciale
Ophtalmologie
Cardiologie
Ophtalmologie
Radiologie
Ophtalmologie
Biophysique
Microbiologie
Cardiologie
Pédiatrie
Radiologie
Ophtalmologie
Cardiologie
Chirurgie Cardio-vasculaire
Parasitologie
Rhumatologie
Gynécologie Obstétrique
Histo-Embryologie Cytogénétique
Ophtalmologie
Gynécologie Obstétrique
AVRIL 2006
423. Pr. ACHEMLAL Lahsen*
424. Pr. AFIFI Yasser
425. Pr. AKJOUJ Said*
426. Pr. BELGNAOUI Fatima Zahra
427 Pr. BELMEKKI Abdelkader*
428. Pr. BENCHEIKH Razika
429 Pr. BIYI Abdelhamid*
430. Pr. BOUHAFS Mohamed El Amine
431. Pr. BOULAHYA Abdellatif*
432. Pr. CHEIKHAOUI Younes
433. Pr. CHENGUETI ANSARI Anas
434. Pr. DOGHMI Nawal
435. Pr. ESSAMRI Wafaa
436. Pr. FELLAT Ibtissam
437. Pr. FAROUDY Mamoun
438. Pr. GHADOUANE Mohammed*
439. Pr. HARMOUCHE Hicham
440. Pr. HANAFI Sidi Mohamed*
441 Pr. IDRISS LAHLOU Amine
Rhumatologie
Dermatologie
Radiologie
Dermatologie
Hématologie
O.R.L
Biophysique
Chirurgie - Pédiatrique
Chirurgie Cardio – Vasculaire
Chirurgie Cardio – Vasculaire
Gynécologie Obstétrique
Cardiologie
Gastro-entérologie
Cardiologie
Anesthésie Réanimation
Urologie
Médecine Interne
Anesthésie Réanimation
Microbiologie
442. Pr. JROUNDI Laila
443. Pr. KARMOUNI Tariq
444. Pr. KILI Amina
445. Pr. KISRA Hassan
446. Pr. KISRA Mounir
447. Pr. KHARCHAFI Aziz*
448. Pr. LAATIRIS Abdelkader*
449. Pr. LMIMOUNI Badreddine*
450. Pr. MANSOURI Hamid*
451. Pr. NAZIH Naoual
452. Pr. OUANASS Abderrazzak
453. Pr. SAFI Soumaya*
454. Pr. SEKKAT Fatima Zahra
455. Pr. SEFIANI Sana
456. Pr. SOUALHI Mouna
457. Pr. TELLAL Saida*
458. Pr. ZAHRAOUI Rachida
Radiologie
Urologie
Pédiatrie
Psychiatrie
Chirurgie – Pédiatrique
Médecine Interne
Pharmacie Galénique
Parasitologie
Radiothérapie
O.R.L
Psychiatrie
Endocrinologie
Psychiatrie
Anatomie Pathologique
Pneumo – Phtisiologie
Biochimie
Pneumo – Phtisiologie
Octobre 2007
458. Pr. LARAQUI HOUSSEINI Leila
459. Pr. EL MOUSSAOUI Rachid
460. Pr. MOUSSAOUI Abdelmajid
461. Pr. LALAOUI SALIM Jaafar *
462. Pr. BAITE Abdelouahed *
463. Pr. TOUATI Zakia
464. Pr. OUZZIF Ez zohra
*
465. Pr. BALOUCH Lhousaine *
466. Pr. SELKANE Chakir
*
467. Pr. EL BEKKALI Youssef *
468. Pr. AIT HOUSSA Mahdi *
469. Pr. EL ABSI Mohamed
470. Pr. EHIRCHIOU Abdelkader *
471. Pr. ACHOUR Abdessamad *
472. Pr. TAJDINE Mohammed Tariq*
473. Pr. GHARIB Noureddine
474. Pr. TABERKANET Mustafa *
475. Pr. ISMAILI Nadia
476. Pr. MASRAR Azlarab
477. Pr. RABHI Monsef *
478. Pr. MRABET Mustapha *
479. Pr. SEKHSOKH Yessine *
480. Pr. SEFFAR Myriame
481. Pr. LOUZI Lhoussain *
482. Pr. MRANI Saad *
483. Pr. GANA Rachid
484. Pr. ICHOU Mohamed *
485. Pr. TACHFOUTI Samira
486. Pr. BOUTIMZINE Nourdine
487. Pr. MELLAL Zakaria
488. Pr. AMMAR Haddou *
489. Pr. AOUFI Sarra
490. Pr. TLIGUI Houssain
491. Pr. MOUTAJ Redouane *
492. Pr. ACHACHI Leila
Anatomie pathologique
Anesthésie réanimation
Anesthésier réanimation
Anesthésie réanimation
Anesthésie réanimation
Cardiologie
Biochimie
Biochimie
Chirurgie cardio vasculaire
Chirurgie cardio vasculaire
Chirurgie cardio vasculaire
Chirurgie générale
Chirurgie générale
Chirurgie générale
Chirurgie générale
Chirurgie plastique
Chirurgie vasculaire périphérique
Dermatologie
Hématologie biologique
Médecine interne
Médecine préventive santé publique et hygiène
Microbiologie
Microbiologie
Microbiologie
Virologie
Neuro chirurgie
Oncologie médicale
Ophtalmologie
Ophtalmologie
Ophtalmologie
ORL
Parasitologie
Parasitologie
Parasitologie
Pneumo phtisiologie
493. Pr. MARC Karima
494. Pr. BENZIANE Hamid *
495. Pr. CHERKAOUI Naoual *
496. Pr. EL OMARI Fatima
497. Pr. MAHI Mohamed *
498. Pr. RADOUANE Bouchaib*
499. Pr. KEBDANI Tayeb
500. Pr. SIFAT Hassan *
501. Pr. HADADI Khalid *
502. Pr. ABIDI Khalid
503. Pr. MADANI Naoufel
504. Pr. TANANE Mansour *
505. Pr. AMHAJJI Larbi *
Pneumo phtisiologie
Pharmacie clinique
Pharmacie galénique
Psychiatrie
Radiologie
Radiologie
Radiothérapie
Radiothérapie
Radiothérapie
Réanimation médicale
Réanimation médicale
Traumatologie orthopédie
Traumatologie orthopédie
Mars 2009
Pr. BJIJOU Younes
Pr. AZENDOUR Hicham *
Pr. BELYAMANI Lahcen*
Pr. BOUHSAIN Sanae *
Pr. OUKERRAJ Latifa
Pr. LAMSAOURI Jamal *
Pr. MARMADE Lahcen
Pr. AMAHZOUNE Brahim*
Pr. AIT ALI Abdelmounaim *
Pr. BOUNAIM Ahmed *
Pr. EL MALKI Hadj Omar
Pr. MSSROURI Rahal
Pr. CHTATA Hassan Toufik *
Pr. BOUI Mohammed *
Pr. KABBAJ Nawal
Pr. FATHI Khalid
Pr. MESSAOUDI Nezha *
Pr. CHAKOUR Mohammed *
Pr. DOGHMI Kamal
*
Pr. ABOUZAHIR Ali
*
Pr. ENNIBI Khalid *
Pr. EL OUENNASS Mostapha
Pr. ZOUHAIR Said*
Pr. L’kassimi Hachemi*
Pr. AKHADDAR Ali
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Pr. AIT BENHADDOU El hachmia
Pr. AGADR Aomar *
Pr. KARBOUBI Lamya
Pr. MESKINI Toufik
Pr. KABIRI Meryem
Pr. RHORFI Ismail Abderrahmani *
Pr. BASSOU Driss *
Pr. ALLALI Nazik
Pr. NASSAR Ittimade
Pr. HASSIKOU Hasna *
Pr. AMINE Bouchra
Pr. BOUSSOUGA Mostapha *
Pr. KADI Said *
Anatomie
Anesthésie Réanimation
Anesthésie Réanimation
Biochimie
Cardiologie
Chimie Thérapeutique
Chirurgie Cardio-vasculaire
Chirurgie Cardio-vasculaire
Chirurgie Générale
Chirurgie Générale
Chirurgie Générale
Chirurgie Générale
Chirurgie Vasculaire Périphérique
Dermatologie
Gastro-entérologie
Gynécologie obstétrique
Hématologie biologique
Hématologie biologique
Hématologie clinique
Médecine interne
Médecine interne
Microbiologie
Microbiologie
Microbiologie
Neuro-chirurgie
Neurologie
Pédiatrie
Pédiatrie
Pédiatrie
Pédiatrie
Pneumo-phtisiologie
Radiologie
Radiologie
Radiologie
Rhumatologie
Rhumatologie
Traumatologie orthopédique
Traumatologie orthopédique
Octobre 2010
Pr. AMEZIANE Taoufiq*
Pr. ERRABIH Ikram
Pr. CHERRADI Ghizlan
Pr. MOSADIK Ahlam
Pr. ALILOU Mustapha
Pr. KANOUNI Lamya
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Pr. DARBI Abdellatif*
Pr. EL HAFIDI Naima
Pr. MALIH Mohamed*
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Pr. EL SAYEGH Hachem
Pr. MOUJAHID Mountassir*
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Pr. BOUAITY Brahim*
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Pr. NAZIH Mouna*
Pr. LAMALMI Najat
Pr. ZOUAIDIA Fouad
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Pr. CHADLI Mariama*
ENSEIGNANTS SCIENTIFIQUES
PROFESSEURS
1. Pr. ABOUDRAR Saadia
2. Pr. ALAMI OUHABI Naima
3. Pr. ALAOUI KATIM
4. Pr. ALAOUI SLIMANI Lalla Naïma
5. Pr. ANSAR M’hammed
6. Pr. BOUKLOUZE Abdelaziz
7. Pr. BOUHOUCHE Ahmed
8. Pr. BOURJOUANE Mohamed
9. Pr. CHAHED OUAZZANI Lalla Chadia
10. Pr. DAKKA Taoufiq
11. Pr. DRAOUI Mustapha
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15. Pr. HMAMOUCHI Mohamed
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17. Pr. KABBAJ Ouafae
18. Pr. KHANFRI Jamal Eddine
19. Pr. REDHA Ahlam
20. Pr. OULAD BOUYAHYA IDRISSI Med
21. Pr. TOUATI Driss
22. Pr. ZAHIDI Ahmed
23. Pr. ZELLOU Amina
* Enseignants Militaires
Médecine interne
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Anesthésie réanimation
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Radiologie
Radiologie
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Pédiatrie
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Physiologie
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Zootechnie
Pharmacologie
Chimie Organique
Biochimie
Biologie
Biochimie
Chimie Organique
Pharmacognosie
Pharmacologie
Chimie Organique
DEDICACES
A LA MEMOIRE DE MA GRANDE MERE HALIMA
KHLIFIA
Ce travail est pour moi le fruit de tes prières.
Que la terre de TOUBA te soit légère.
A MES TRES CHERS PARENTS
EL ATTIFFI EL OUADRASSI AHMED
EL FAILALI NABILA
Dont leurs mérites, leurs sacrifices, leurs qualités humaines
m’ont permis de vivre ce jour :
Les mots me manquent pour exprimer toute la reconnaissance,
la fierté et le profond amour que je vous porte pour les
sacrifices qu’ils ont consenti pour ma réussite, qu’ils trouvent
ici le témoignage de mon attachement ma reconnaissance,
gratitude et respect, que dieu leur préservent bonne santé et
longue vie. Tous mes sentiments de reconnaissance pour vous.
A MES SOEURS : CHEMSS ET YOUSSRA
J’espère atteint le seuil de vos espérances. Que ce travail soit
l’expression de ma profonde affection, je vous remercie pour
le soutient moral et l’encouragement que vous m’avez
accordés.
Je vous souhaite tout le bonheur que vous méritez
En leur souhaitant un brillant avenir.
A MES GRANDS PARENTS
A TOUTE LA FAMILLE EL ATTIFFI
A TOUTE LA FAMILLE EL FILALI
Que je ne pourrais nommer de peur d’en oublier mon
attachement et mes affections les plus sincères
A MES AMI(E) S
A tout ceux qui ont su m’apporter aide et soutient aux
moments propices, Je dédie ce travail, reconnaissant et
remerciant chaleureusement.
REMERCIEMENTS
A NOTRE
MAITRE ET PRESIDENT DE THESE
Monsieur le professeur A.GAOUZI
Professeur de Pédiatrie
Malgré vos multiples occupations, vous avez spontanément
accepté de présider ce jury de thèse.
Votre courtoisie, votre modestie et votre sens des
responsabilités font de vous un maître respecté et estimé par
toute une génération d’étudiants.
Veuillez trouvez ici l’expression de nos remerciements les
plus sincères et de notre profonde reconnaissance.
A NOTRE
MAITRE ET RAPPORTEUR DE THESE
Monsieur le professeur M.ZOUHDI
Professeur de Microbiologie
Vous nous avez confié ce travail et vous avez mis les moyens
nécessaires pour sa réalisation.
Votre disponibilité constante, votre amour du travail bien fait
et votre abord facile forcent l’admiration et le respect.
Puisse ce travail répondre à vos attentes et être le témoignage
de notre profonde et vive gratitude.
A NOTRE
MAITRE ET JUGE DE THESE
Madame le professeur S.AOUFI
Professeur agrégé de Parasitologie
La spontanéité avec laquelle vous avez accepté de juger ce
travail nous réjouit.
Plus qu’un honneur, c’est une joie pour nous, de vous compter
parmi nos juges et de pouvoir profiter de vos compétences.
Nous vous prions, cher Maître, d’accepter nos vifs
remerciements et notre profonde gratitude.
A NOTRE
MAITRE ET JUGE DE THESE
Madame le professeur S.EL HAMZAOUI
Professeur de Microbiologie
Vous nous faites un grand honneur en acceptant de nous
consacrer de votre temps.
Nous sommes sensibles à l’amabilité avec laquelle vous nous
avez accueillie. C’est avec respect et sincérité que nous vous
remercions.
« En cette journée mondiale de l’eau, prenons la résolution d’en
faire plus pour que tous les êtres humains disposent d’eau
salubre. Et réaffirmons notre volonté de mieux gérer les
ressources en eau de notre planète, qui sont la clef de notre
survie et d’un développement durable au XXIe siècle »
KOFI ANNAN.
Journée mondiale de l’eau, 22 mars 2005
Table des matières
INTRODUCTION .............................................................................................................................. 1
I.LE LITTORAL MAROCAIN ...................................................................................................... 4
I.1. Spécificités ....................................................................................................................................... 4
I.2. Pressions ................................................................................................................................................. 4
I.2.1. Urbanisation – littoralisation ........................................................................................ 4
I.2.2. La pression démographique sur le littoral ................................................................. 5
I.2.3. Industrialisation ............................................................................................................ 5
I.2.4. Tourisme ........................................................................................................................ 6
I.2.5. Agriculture ..................................................................................................................... 6
I.2.6. Transport maritime ........................................................................................................ 7
I.2.7. Surexploitation des ressources naturelles .................................................................. 7
II. LES POLLUTIONS MARITIMES ......................................................................................... 8
II.1.Pollution par les eaux usées domestiques........................................................................ 9
II.2. Pollution par les eaux usées industrielles ...................................................................... 11
II.3. La pollution par les eaux de ruissellement ..................................................................... 11
II.4. La pollution d’origine atmosphérique ............................................................................ 12
II.5. La pollution par les activités maritimes ......................................................................... 12
II.6. La pollution par les déchets solides ............................................................................... 13
II.7. La pollution radioactive ................................................................................................... 14
II.8. La pollution due aux activités estivales ......................................................................... 14
II.9. La pollution thermique ..................................................................................................... 14
II.10. La pollution microbiologique ....................................................................................... 15
II.10.1. Les sources de contamination ......................................................................... 15
II.10.2. Les bactéries ..................................................................................................... 17
II.10.3. Les virus ............................................................................................................ 17
II.10.4. Les protozoaires .............................................................................................. 18
II.10.5. Les helminthes .................................................................................................. 19
II.10.6. Les champignons .............................................................................................. 19
III. L’EVALUATION DE LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX - LES
GERMES
INDICATEURS DE CONTAMINATION FECALE ...................................... 20
III.1.Définition des indicateurs bactériens de contamination fécale ................................. .23
III.1.1. Les coliformes totaux ........................................................................................ 23
III.1.2. Les coliformes fécaux ......................................................................................... 24
III.1.3. Les Entérocoques intestinaux ........................................................................... 24
III.1.4. Le rapport coliformes fécaux/streptocoques fécaux ...................................... 25
III.2.Autres indicateurs ............................................................................................................ 25
IV. LES METHODES DE DETECTION DES MICRO-ORGANISMES
INDICATEURS ............................................................................................................................... 27
IV.1. La mise en culture .................................................................................................... 27
IV.2. La problématique des bactéries fécales non cultivables ..................................... 31
IV.3. Les méthodes moléculaires ..................................................................................... 34
IV.4. L’énumération des E. coli viables par hybridation in situ .................................. 36
IV.5. La mesure directe de l’activité β-D-glucuronidasique ........................................ 38
V. LES NORMES DE QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE
BAIGNADE ....................................................................................................................................... 41
VI. LA SURVIE DES BACTERIES DANS LE MILIEU MARIN ....................................... 45
VI.1. Les facteurs influençant la survie des microorganismes en milieu marin .......... 47
VI.1.1. Facteurs physico-chimiques ................................................................................... 47
VI.1.1.1. La dilution ............................................................................................................. 47
VI.1.1.2. L’adsorption .......................................................................................................... 48
VI.1.1.3. La sédimentation ................................................................................................... 48
VI.1.1.4. La lumière............................................................................................................... 48
VI.1.1.5. La température ..................................................................................................... 49
VI.1.1.6. Les variations de pH ............................................................................................ 49
VI.1.1.7. La salinité .............................................................................................................. 49
VI.1.2. Facteurs biologiques ................................................................................................ 50
VII. RISQUES SANITAIRES LIES A LA BAIGNADE DANS LES EAUX
POLLUEES ....................................................................................................................................... 52
VII.1.Introduction ................................................................................................................ .52
VII.2. Historique ................................................................................................................... 52
VII.3. Les microorganismes impliqués et les pathologies observées ............................ 53
VII.3.1. Les bactéries ............................................................................................... 53
VII.3.2. Les virus ...................................................................................................... 55
VII.3.3. Les champignons ....................................................................................... 55
VII.3.4. Les protozoaires ......................................................................................... 56
VII.3.5. Micro-algues et cyanobactéries ................................................................ 56
VII.4. Les risques liés aux contaminants chimiques ....................................................... 57
VIII. LES EPIDEMIES LIEES AUX EAUX DE BAIGNADE ............................................ 59
VIII.1. E. coli O157 :H7 ........................................................................................................ 59
VIII.2. Autres ........................................................................................................................... 60
IX. LA SURVEILLANCE DE LA QUALITE DES EAUX DE BAIGNADE AU
MAROC ............................................................................................................................................. 61
IX.1. Organisation des contrôles ......................................................................................... 61
IX.2. Les procédures d’exécution des programmes ......................................................... 62
IX.3. Qualité hygiénique des plages du Royaume : Saison 2009-2010.......................... 66
CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS........................................................................... 68
RESUMES
ANNEXES
BIBLIOGRAPHIE
INTRODUCTION
1
L'hydrosphère est le fondement de la vie et des équilibres écologiques,
ses usages sont donc multiples, mais s'agissant de santé humaine, ils sont
dominés par l'agriculture et l'aquaculture, l'industrie et l'artisanat, surtout, la
fourniture collective ou individuelle d'eau potable, utilisable à des fins
alimentaires (eau de boisson, cuisine) mais aussi domestiques et d'hygiène, et
les loisirs aquatiques, dont la baignade.
Notre civilisation moderne utilise de plus en plus le milieu aquatique
pour les loisirs, les vacances et diverses activités nautiques et ludiques.
Il existe diverses catégories de baignades, aménagées ou non, littorales (eau de
mer) ou intérieures (eau douce: rivière, lac, étang) qui connaissent des
problèmes spécifiques liés à la contamination par des eaux usées, plus ou moins
épurées, ou des eaux de ruissellement qui véhiculent divers polluants.
Si la baignade constitue une activité de loisirs qui permet détente et
exercices physiques bénéfiques pour la santé, elle peut néanmoins présenter
certains risques. Ceux-ci sont liés, soit à la qualité de l’eau, soit à des activités
associées à la baignade et souvent à des comportements.
Le Maroc dispose d’un vaste territoire maritime : le littoral
méditerranéen et atlantique, qui est soumis à la pression démographique sans
cesse croissante des agglomérations urbaines et à l’influence des différentes
activités industrielles, portuaires et touristiques. Il reçoit, en plus, les apports des
2
bassins versants des rivières et des cours d’eau, ainsi qu'une grande partie des
eaux usées urbaines et industrielles.
L’objectif de ce mémoire est :
 de déterminer les différents types de pollutions qui peuvent influencer la
qualité des eaux de baignade ;
 de définir les méthodes d’évaluation de la qualité microbiologique des
eaux de baignade ;
 et d’étudier l’impact sanitaire de la qualité microbiologique des eaux de
baignade.
3
I . LE LITTORAL MAROCAIN :
I.1. Spécificités :
Le Maroc est doté d'une frange littorale qui s’étend sur la façade atlantique
de Cap Spartel à Lagouira (2 934 km) et sur la façade méditerranéenne de Cap
Spartel à Saïdia (512 km). Cette zone côtière constitue un pôle d’attraction
important pour les activités socio-économiques d’intérêt national, compte tenu
de son poids démographique, économique et de sa fonction dans l’organisation
de l’espace national(1).
Ce littoral présente divers milieux physiques tels que les plages, les dunes,
les rivages, les estuaires, les falaises, les lagunes, les vasières, etc.). C’est une
zone complexe, vulnérable fortement convoitée. Il présente une flore et une
faune originale. C’est aussi un espace de conflits, de convergence d’intérêts et
d’acteurs entraînant une littoralisation pesante des côtes(2).
I.2. Pressions :
I.2.1. Urbanisation – littoralisation :
L’urbanisation des côtes a été très marquante ces dernières décennies. Le
taux d’urbanisation en 1971 était de 35 % et il est passé à 42,8 % puis à 51 %
respectivement en 1982 et 1994 pour atteindre 55,1 % en 2004(2).L’urbanisation
classique progresse le long de la côte et aboutit à des formes d’occupation
linéaire.
L’urbanisation touristique planifiée en pleine expansion avec la multiplication
de projets immobiliers et touristiques se développe aux dépens des espaces
vierges.
4
I.2.2. La pression démographique sur le littoral :
La population marocaine recensée en 2004 est estimée à 29,9 millions
d’habitants contre près de 26 millions en 1994(2).
La population côtière représente 60 %. Cela traduit à l'évidence une dynamique
démographique importante aboutissant à une occupation des zones côtières et à
une littoralisation de la population et des activités induites. La densité moyenne
de population au niveau du littoral atlantique est d’environ 162 hab./km² contre
90 hab./ km² au niveau de la méditerranée(2).
A cette pression endogène s’ajoute celle du tourisme , si bien qu’en période de
pointe (juillet-aout), le cumul des résidents (permanents et secondaire) et des
touristes porte les densités littorales à des niveaux très élevés pouvant atteindre
au niveau de certaines zones plus de 300 habitants par kilomètre carré.
I.2.3. Industrialisation :
La côte joue le rôle de pôle nerveux de l'économie nationale du fait de la
concentration industrielle (80 % des effectifs permanents des industries),
touristique (50 % de la capacité d'accueil) et commerciale (92 % du commerce
extérieur)(3).
Cette concentration exerce sur le littoral des pressions à travers notamment les
rejets d’eaux résiduaires générées par ce secteur souvent déversés sans
traitement préalable directement dans le milieu marin.
5
I.2.4. Tourisme :
L'urbanisation touristique planifiée est en pleine expansion dans de
nombreuses régions de la côte, notamment dans les régions de Tanger, Tétouan,
AI Hoceima, Saidia, Rabat-Casablanca et Agadir réduisant le nombre d'espaces
maritimes vierges qui risquent eux-mêmes de ne pas le rester longtemps. Dans
bon nombre de ces régions, l'occupation revêt des formes illicites à cause d'un
déséquilibre flagrant entre offre et demande d'espaces côtiers. On assiste ainsi à
une “durcification” progressive du littoral par la construction de complexes
hôteliers ou de résidences secondaires et la multiplication des infrastructures
d'accompagnement (routes panoramiques, ports de plaisance, etc.). Outre
l’énorme problème des rejets domestiques incontrôlés, ces équipements
touristiques réduisent les possibilités d’échanges entre terre et mer,
déséquilibrant ainsi l’écologie du littoral.
I.2.5. Agriculture :
Dans de nombreuses régions littorales du pays, et particulièrement à
proximité des zones humides, les pratiques agricoles en matière d'utilisation
d'engrais et de pesticides ont souvent un impact considérable sur la qualité des
eaux du fait du drainage des oueds. Ces impacts sont flagrants prés de certains
milieux comme le complexe lagunaire de Oualidia Sidi Moussa où la culture
sous serre a considérablement affecté les eaux de la lagune, ou encore les
lagunes de Moulay Bousselham ou de Khnifiss, où l'agriculture et le
pastoralisme sont des activités importantes(3).
6
I.2.6. Transport maritime :
Les eaux marocaines méditerranéennes et atlantiques connaissent une
navigation maritime intense. Des centaines de bateaux longent quotidiennement
nos côtes, notamment des pétroliers et des tankers qui constituent une menace
permanente de la pollution marine.
I.2.7. Surexploitation des ressources naturelles :
Le littoral marocain souffre également d’un problème majeur qu’est la
dégradation des dunes et l’érosion des plages, principalement à cause d’une
demande sans cesse croissante en matériaux de construction, en particulier de
sable pour le secteur du bâtiment. Cette demande, estimée à près de 13 millions
de tonnes, et qui sera plus que le double en 2015(3), est en grande partie
satisfaite par des prélèvements, souvent illicites et peu coûteux, au niveau des
plages et des dunes littorales. En effet, de plus de 160 points de prélèvements
recensés, quelques-uns seulement semblent officiellement autorisés.
C’est un problème d’autant plus important qu’il concerne 11 des 16 régions
administratives du pays et près d’une trentaine de communes. Il en résulte que
de nombreuses plages s’appauvrissent en sable (baie de Tanger, Moulay
Bousselham, Monica, Kariat Arekmane) et, selon certaines études (RDH 50,
2005), sur un échantillon de 47 plages analysées 7 ont complètement disparu et
19 sont soumises à une dégradation aiguë.
7
II. LES POLLUTIONS MARITIMES :
La pollution marine est « L’introduction par l’Homme, directement ou
indirectement, de substances ou d’énergies dans le milieu marin, estuaires
compris, et qui a pour conséquence ou est susceptible d’engendrer des effets
nuisibles tels qu’ils porteraient atteinte aux ressources vivantes et à la vie
marine, mettraient la santé humaine en danger, gêneraient les activités marines,
telles que la pêche et autre utilisation légitime de la mer »(4).
Plateformes pétrolières
5%
Déchets solides
5%
Atmosphère 20%
Rejets liquides
industriels
10%
Transport maritime
10%
Agriculture 20%
Eaux usées 30%
Figure 1: Origine de la pollution marine(5).
8
II.1. Pollution par les eaux usées domestiques :
L’évacuation directe dans le milieu marin des eaux usées brutes est à
l’heure actuelle la plus importante source de pollution du littoral marocain. Les
conséquences de ces rejets sur l’équilibre du milieu marin sont nombreuses,
aussi bien sur le plan physico-chimique, chimique que biologique.
Selon un nouveau rapport du Programme des Nations Unies pour
l’environnement (PNUE), une marée montante d’eaux usées menace la santé et
la richesse d’un nombre important d’océans et mers à travers le monde, tandis
que des progrès sont notables en matière de pollution pétrolière et chimique.
Dans de nombreux pays en développement, de 80 à 90 pour cent des eaux usées
déversées sur les côtes sont des effluents bruts, c'est à dire des rejets qui n'ont
pas été traités(6),ainsi que 60 % des eaux usées urbaines rejetées dans la mer
méditerranéenne ne sont pas traitées préalablement(7).
Les eaux usées domestiques (eaux-vannes et eaux ménagères) urbaines
contiennent une multitude d’agents pathogènes excrétés par la voie intestinale
ou urinaire et susceptibles de déclencher des maladies transmissibles. Ces agents
peuvent être classés en quatre catégories principales : les bactéries, les virus, les
parasites et les champignons.
Parmi tous les microorganismes couramment rencontrés dans les eaux usées
urbaines, il est important de distinguer leur origine, ainsi que les pathologies
qu’ils sont susceptibles d’engendrer. En se basant sur ces deux critères, nous
pouvons définir trois catégories de germes(8) :

les germes d’origine tellurique non pathogènes et non infectieux,
9
entraînés par les eaux de ruissellement.

Les germes d’origine fécale, humaine ou animale, le plus
fréquemment non pathogènes, qui regroupent principalement des bactéries, et
sont couramment utilisés comme germes témoins de contamination fécale.

Les germes pathogènes parmi lesquels nous distinguons : certaines
bactéries, les virus et les parasites.
Pour tous ces microorganismes, l’eau représente un vecteur de choix pour
atteindre leur cible. La transmission se fait préférentiellement par voie digestive
(ingestion d’eau d’alimentation ou de baignade contaminée ou d’aliments
souillés comme les coquillages), mais peut également se faire par voie
cutanéo-muqueuse lors des activités de baignades.
La résistance de ces micro-organismes à la salinité du milieu marin diffère
suivant les espèces et varie de quelques dizaines de minutes pour les plus
fragiles à plusieurs semaines pour les plus résistantes.
Ainsi, parmi les espèces les plus résistantes, on peut citer les œufs des parasites
intestinaux (Tænia, Ascaris, etc.), les spores de champignons microscopiques
pathogènes (Candida, Trichophyton, etc.).
Pour les espèces moyennement résistantes dans le milieu marin, il y a les
bactéries pathogènes comme sérotypes de salmonelles, le vibrion cholérique,
certains Pseudomonas (bacille pyocyanique), le staphylocoque doré et
clostridium(9).
Certains facteurs comme la température de l’eau de mer, la teneur en oxygène
dissout et la teneur en matières organiques conditionnent la résistance de microorganismes pathogènes dans le milieu marin(10).
10
II.2. Pollution par les eaux usées industrielles :
Généralement, les eaux usées industrielles sont riches en matières minérales et
organiques non ou difficilement biodégradables, surtout les déchets de
l’industrie.
Ces eaux usées sont chargées de substances dérivées de pétrole et en premier
lieu les essences, fuels, et les huiles utilisées dans divers moteurs à combustion.
On trouve aussi les métaux lourds tel que le mercure (appareils électriques,
produits pharmaceutiques), le cadmium (industrie métallurgique), l’argent, le
chrome, le zinc, le cuivre, le plomb.
À côté des métaux lourds, on a les métalloïdes (phosphore, arsenic, fluor et le
chlore), les acides et les cyanures(11, 12), sans oublier les sels qui viennent des
détergents et des engrais chimiques (nitrites, nitrates, orthophosphate).
L’accumulation de ces substances a des impacts directs sur l’équilibre
biologique du milieu marin à moyen ou à long terme et dont les conséquences
sur la faune et la flore marines peuvent être très graves, surtout sur les
ressources halieutiques(10).
II.3. La pollution par les eaux de ruissellement :
Les eaux de ruissellement contiennent surtout des matières en suspension
d'origine végétale, des hydrocarbures, des polluants venant de l'atmosphère
comme le gaz sulfureux, les composés du plomb, les gaz nitreux et carbonique,
des détergents et tout polluant se trouvant accidentellement sur la chaussée(13).
Ces eaux résultent du lessivage et de l’érosion des sols et basins versant par les
eaux de précipitation.
11
II.4. La pollution d’origine atmosphérique :
Les principales sources de la pollution atmosphérique sont les activités
industrielles et la circulation automobile, cette pollution a un impact non
négligeable sur l’équilibre de la faune et de la flore marines et par conséquent
sur les ressources halieutiques.
II.5. La pollution par les activités maritimes :
La navigation maritime et les installations portuaires sont les principaux
responsables de la pollution par les hydrocarbures(HC) aussi bien au voisinage
des côtes qu’en haute mer. Cette pollution peut être soit accidentelle (accidents
maritimes, marées noires, etc.) ou intentionnelle (dégazage des pétroliers en
haute mer, nettoyage des cuves de navires). Il est à noter que pour le Maroc, les
pollutions dues à des accidents en mer ne peuvent être considérées comme un
risque hypothétique, mais comme un danger potentiel et quotidien compte tenu
de l'intensité du trafic aussi bien le long des sites atlantiques que méditerranéens.
A titre d'exemple, la Méditerranée, mer semi-fermée, représente 7 % de la
surface mondiale des eaux, enregistre 17 % de la pollution globale des mers et
se classe ainsi à la première place des mers du monde en terme de pollution
(concentration moyenne de goudron dans les eaux de surface de la Méditerranée
est de 5 mg/m² alors que la moyenne pour tous les océans pour ce paramètre est
de 0.8 mg/m²)(1).
12
II.6. La pollution par les déchets solides :
Ce sont d'abord tous les débris solides qui s'accumulent le long des laisses
de hautes mers: bouteille, sacs et autres récipients en matière plastique, bois,
débris de filets et de filins... Ces déchets proviennent de décharges, autorisées ou
non, le long du littoral et des cours d'eau allant à la mer, des réseaux d'eau
pluviale, des rejets directs d'émissaires sans dégrillage, de l'abandon débris sur la
plage par les baigneurs et les casses croûteuses peu scrupuleuses, du
déversement à partir de navire (commerce et plaisance)... Ces objets constituent
surtout une nuisance visuelle qui déprécie l'attrait d'une plage. Flottant au large,
ils peuvent constituer une entrave à la pêche et à la navigation. Elles peuvent
être l'origine de pollution par hydrocarbures. Dans les laisses de hautes mers, les
déchets les plus fréquents sont les matières plastiques.
Voici quelques exemples de déchets et leur persistance :
Tableau I : déchets en mer par types, par description et par persistance(14)
Déchets
Description
Persistance
Plastiques
Fragments, bâches, sacs et récipients
Indéfiniment
Polystyrène
Verres, emballages et balises
Plus de 30 ans
Caoutchouc
Gants, bottes et pneus
Plus de 50 ans
Bois
Bois Construction, palettes, fragments
Plus de 10 ans
Métaux
Cannettes, barils d’essence, aérosols et
Plus de 100 ans
débris
Verre
Bouteilles, ampoules
Environ 4000 ans
Relatifs aux déchets
Tampons, préservatifs, fèces
Environ 30 ans
sanitaires
13
II.7. La pollution radioactive :
La pollution radioactive se trouve au niveau des rejets des centrales
électronucléaires et des centres de traitement des déchets(5).
Cette pollution peut être transportée par des organismes planctoniques ou par
des poissons ayant concentré des éléments radioactifs.
II.8. La pollution due aux activités estivales :
Durant la période estivale, les plages constituent un pôle d’attraction
important pour une population hétérogène. Les différentes études menées à cet
effet, en particulier celles du Ministère de la Santé, du Ministère de
l’Équipement et du Département de l’Environnement an Maroc, ont montré que
les plages les plus polluées sont celles qui reçoivent une forte masse
d’estivants(1).
Les baigneurs peuvent transmettre au milieu marin les germes qu’ils hébergent
au niveau de la peau et des muqueuses.
II.9. La pollution thermique :
Elle est plus rare sur les côtes que dans les rivières du fait du volume et du
brassage des eaux. Certaines implantations industrielles, en particulier les
centrales électriques, consomment de l'eau pour leur refroidissement qu'elles
rejettent ensuite à une température supérieure. Une centrale de 1000 MW utilise
14
et rejette plusieurs dizaines de m³ d'eau par seconde dont la température se
trouve élevée de 7 à 8 °C(5).
Cette élévation de température entraîne :
 Une diminution de la teneur de l’eau en oxygène.
 Une diminution du pH due à la diminution de l’oxygène dissous.
 Une augmentation de la salinité en favorisant l’évaporation.
 Stimule la vitesse de multiplication des algues unicellulaires entraînant
l'eutrophisation(5).
II.10. La pollution microbiologique :
II.10.1. Les sources de contamination :
Les sources de pollution microbiologiques sont issues notamment de
mauvais
raccordements
d'habitations
au
réseau
d'assainissement,
de
débordements des réseaux d'eaux usées, de rejets de station d'épuration d'eaux
résiduaires et du ruissellement sur les sols lors des pluies importantes.
L'existence de dispositifs d'assainissement autonome défectueux dans certaines
zones d'habitation, mais aussi la pollution diffuse apportée par les rejets mal
maîtrisés des zones d'élevages, en particulier par temps de pluie, constitue des
causes de pollution microbiologique.
L'impact des rejets sur une zone de baignade dépend de divers facteurs :
quantité de pollution rejetée, éloignement du point de rejet par rapport à la zone
de baignade permettant une certaine auto-épuration des rejets, caractéristiques
de la dispersion des rejets des courants marins, la charge microbienne des rejets,
et de la survie des micro-organismes dans le milieu aquatique.
15
Les baignades constituent une source de pollution, celle-ci est étroitement liée à
la densité des baigneurs et la capacité de renouvellement de l’eau.
Au niveau du sable, la contamination est essentiellement directe, ainsi que cette
contamination peut avoir comme origine l’eau de mer.
Le degré de contamination microbiologique du sable est influencé par plusieurs
facteurs tels que la concentration des polluants, la fréquence de nettoyage des
plages, la capacité de dispersion par les vents, la survie des bactéries et leur
concentration dans les éléments polluants.
Figure 2 : 0rigines des sources potentielles de contamination fécale dans le
milieu marin(15).
16
II.10.2. Les bactéries :
Les bactéries sont des procaryotes de taille variable entre 0,1 et 10 µm.
Elles possèdent tout le matériel cellulaire nécessaire à leur multiplication.
Certaines d’entre elles peuvent être rencontrées sous forme de spores : ce
phénomène de sporulation a lieu en réponse à un environnement qui leur est peu
favorable. Le pouvoir pathogène d’une bactérie est soit spécifique (il engendre
des pathologies spécifiques), soit opportuniste (il ne s’exprime que sur des
individus affaiblis).
L’ingestion est la voie de contamination majoritaire.
L’annexe 1 répertorie différents exemples de bactéries retrouvées dans les eaux
usées(16).
Parmi ces bactéries, les plus connues sont les espèces du genre Salmonella qui
sont presque toutes pathogènes (responsables de fièvres typhoïdes et
paratyphoïdes ainsi que de gastroentérites) et les Escherichia coli dont certaines
souches sont responsables de redoutables gastroentérites et diarrhées.
II.10.3. Les virus :
Les virus sont des organismes de très petite taille (10 à 350 nm). Ils ne sont
constitués que d'une molécule d'ADN ou d'ARN, entourée d'une capside. Ne
possédant ni noyau, ni capacité de synthèse, ce sont des parasites obligatoires
d'une cellule vivante dont ils détournent, à leur profit, les systèmes
enzymatiques, énergétiques et de synthèse.
17
L’infection d’un individu par un virus hydrique se produit dans la majorité des
cas par l’ingestion, sauf pour le Coronavirus où elle peut aussi avoir lieu par
inhalation. Les virus sont relativement spécifiques d'un hôte. Il existe des virus
adaptés à chaque type d'hôtes (animaux, hommes, plantes, champignons, algues,
bactéries). Les virus entériques transmis par ingestion sont, avec les virus
respiratoires transmis par inhalation d'aérosols, les plus importants pour la santé
humaine.
L’annexe 1 recense la plupart des virus que l’on peut trouver dans les eaux
usées ainsi que les symptômes de la maladie qui leur est associée(16).
II.10.4. Les protozoaires :
Les protozoaires sont des organismes unicellulaires eucaryotes, plus
complexes et plus gros que les bactéries. Leur taille varie de quelques microns à
quelques millimètres, mais la plupart des espèces ne dépassent pas quelques
centaines de microns. La plupart des protozoaires pathogènes sont des
organismes parasites et se développent aux dépens de leur hôte. Ils sont souvent
rencontrés dans les eaux où ils se nourrissent de matière organique ou de
bactéries. Certains protozoaires adoptent au cours de leur cycle de vie une forme
de résistance, appelée kyste (en particulier, oocyte pour Cryptosporidium et
kyste pour Giardia).
L’annexe 1 reprend des exemples de protozoaires d’origine hydrique, dont les
plus importants sont Cryptosporidium et Giardia(16).
18
II.10.5. Les helminthes :
Il peut s’agir de vers plats (plathelminthes), ou ronds (némathelminthes), qui
comprennent de nombreuses formes de parasites souvent à l’origine de maladies
très graves. Ce sont pour la plupart, des vers intestinaux, rejetés avec les
matières fécales animales ou humaines (souvent sous forme d’œufs très
résistants). La contamination se fait par voie digestive lors de l’absorption d’eau
contaminée par des œufs ou des larves, ou alors par voie transcutanée c’est à
dire, par fixation puis pénétration de larves à travers la peau.
Différents exemples d’helminthes sont repris en annexe 1(16).
II.10.6. Les champignons :
Ce sont des organismes privés de tout organe de locomotion, incapables
d’effectuer la photosynthèse, et de ce fait, réduit à l’état de parasite ou à celui de
saprophytes (organismes qui tirent leur nourriture de matières organiques en
voie de décomposition).
Les champignons recherchés dans l’eau se transmettent par voie cutanéomuqueuse, et sont à l’origine d’affections cutanées. Ce sont les moisissures et
les levures (mycètes unicellulaires).
Parmi les moisissures, nous pouvons citer comme espèces pathogènes :
 Allescheria boydii,
 Géotrichum candidum,
 Aspergillus fumigatus,
Parmi les levures, nous pouvons citer Candida albicans, espèce très répandue,
d’origine fécale, et responsables de diverses mycoses (infections cutanéomuqueuses buccales, vaginales et cutanées).
19
III. L’EVALUATION DE LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE
DES EAUX - LES GERMES INDICATEURS DE
CONTAMINATION FECALE :
Dans les milieux aquatiques, la détection de tous les pathogènes
potentiels est très difficile et incertaine en raison de(17) :
 la très grande variété et diversité des micro-organismes pathogènes qui
peuvent être présents dans l’eau (virus, bactéries, protozoaires…) ;
 la faible abondance de chaque espèce de pathogène (nécessité de
concentrer de très grands volumes d’eau pour les détecter) ;
 l’inexistence de méthodes standardisées et rapides pour la détection de
tous ces micro-organismes pathogènes.
Même si des outils moléculaires pour détecter plusieurs pathogènes à la fois se
développent progressivement, il est aujourd’hui impossible de fonder la
surveillance en routine de la qualité microbiologique des eaux sur la recherche
des pathogènes. L’évaluation de la qualité microbiologique des eaux est, par
conséquent, basée sur le concept de germes dits « indicateurs de
contamination ». Ces indicateurs ou bactéries indicatrices de contamination
n’ont pas nécessairement par eux-mêmes un caractère pathogène, mais leur
présence indique l’existence d’une contamination par des matières fécales. Leur
concentration est une indication du niveau de risque de présence de microorganismes pathogènes.
Un indicateur idéal est par définition une espèce ou un groupe de bactéries qui
présente certaines caractéristiques. Celles-ci sont reprises dans le Tableau II.
20
Tableau II : Caractéristiques d’un indicateur idéal de contamination
fécale(18)
Propriété
Pathogénicité
Occurrence
Survie
Reproduction
Inactivation
Source
Coût
Caractéristique d’un indicateur
Pas pathogène
Présent en même temps que les pathogènes, absent en absence de
de contamination fécale
Taux de survie similaire à celui des pathogènes
Ne se reproduit pas dans les eaux naturelles
Inactivé par les différents traitements au même niveau que les pathogènes
La seule source dans les eaux naturelles est la contamination fécale
Méthodes de détection bon marché, rapides et faciles à mettre en œuvre
Le choix d’un tel indicateur doit répondre à un certain nombre d’exigences ou
de critères(19) :
 ils doivent toujours être présents lorsque les microorganismes pathogènes
sont présents ;
 ils doivent apparaître en plus grand nombre que les agents pathogènes
associés;
 ils doivent avoir le même comportement que les agents pathogènes dans
l’environnement naturel et au cours des procédés de fabrication ;
 ils doivent être mis en évidence, dénombrés et identifiés à l’aide de
techniques simples.
Différents groupes de bactéries sont utilisés comme indicateurs de
contamination fécale dans différents pays et sous différentes juridictions. Les
coliformes totaux et fécaux ont été très longtemps les principaux indicateurs de
contamination fécale mais aujourd’hui, Escherichia coli et les entérocoques
21
intestinaux sont reconnus comme plus appropriés(20, 21) et proposés pour
remplacer les coliformes dans certaines normes de qualité microbiologique des
eaux. Il est cependant important de comprendre les potentialités et les limitations
de ces différents indicateurs. Quelques caractéristiques des indicateurs les plus
couramment utilisés sont présentées ci-dessous :
 Coliformes totaux (CT). La pertinence de ce groupe comme indicateur
est aujourd’hui fortement contestée du fait que toutes les espèces incluses
dans les CT ne sont pas spécifiques de la flore intestinale des animaux à
sang chaud. En effet, certaines espèces sont d’origine tellurique ou
aquatique et sont capables de se développer dans l’environnement
aquatique(22, 23).
 Coliformes fécaux (CF) (aussi appelés Coliformes Thermotolérants).
Les CF constituent un sous-groupe des CT capables de se développer à
44 °C. Les CF sont considérés comme plus appropriés comme indicateurs
de contamination fécale que les CT. Ce groupe est majoritairement
constitué de Escherichia coli mais comprend aussi des Klebsiellas, des
Enterobacter et des Citrobacter. Certains auteurs ont rapporté la présence
de ces dernières espèces dans des eaux sans qu’aucune contamination
fécale ne soit suspectée(24, 25), tel que , Havelaar(26) montre qu'en
Finlande la majorité des coliformes thermotolérants détectés dans une
eau provenaient d'eaux usées d'industries de bois et de papier.
 E. coli. De nombreuses études ont montré que cette espèce était
généralement associée à une source fécale (20, 23, 24, 27-29).
Aujourd’hui E.coli est considéré comme le meilleur indicateur d’une
contamination récente du milieu aquatique par du matériel fécal humain
ou d’animaux à sang chaud(20). Cependant, quelques études (30-32)
22
suggèrent qu’en milieux tropicaux certaines souches d’E. coli puissent
faire partie de la flore autochtone des rivières ; cette espèce ne serait donc
pas un indicateur idéal de contamination fécale en milieux tropicaux.
 Entérocoques intestinaux. Ce groupe est aussi considéré comme un bon
indicateur spécifique de la contamination fécale. Plusieurs études ont
montré que l’abondance des entérocoques intestinaux était mieux corrélée
à l’apparition de maladies gastro-intestinales chez les baigneurs
fréquentant des plages aux eaux contaminées que l’abondance des CT ou
CF (33, 34).Le fait que les entérocoques intestinaux survivent plus
longtemps dans le milieu naturel que les E. coli peut constituer un
avantage de ce groupe si l’on cherche à identifier une contamination
fécale ancienne (35, 36)
III.1. Définition des indicateurs bactériens de contamination fécale :
III.1.1. Les coliformes totaux :
Ils sont définis comme l’ensemble des bactéries aérobies et anaérobies
facultatives Gram négatif, non sporulantes, en forme de bâtonnet, qui sont
capables de se multiplier en présence de sels biliaires ou d’autres agents de
surface ayant des propriétés équivalentes et de fermenter le lactose avec
production d’acide et de gaz en 48 heures à 35-37°C.
Les principaux genres inclus dans le groupe sont : Citrobacter, Enterobacter,
Escherichia, Klebsiella et Serratia (37). La presque totalité des espèces est non
pathogène et ne représente pas de risque direct pour la santé (20, 38), à
l’exception de certaines souches d'Escherichia coli (E. coli) ainsi que de rares
bactéries pathogènes opportunistes.
23
III.1.2. Les coliformes fécaux :
Les coliformes fécaux, ou coliformes thermotolérants, sont un sousgroupe des coliformes totaux capables de fermenter le lactose à une température
de 44,5C°. L’espèce la plus fréquemment associée à ce groupe bactérien est
l'Escherichia coli (E. coli) et, dans une moindre mesure, certaines espèces des
genres Citrobacter, Enterobacter et Klebsiella (20, 39, 40). La bactérie E. coli
représente toutefois 80 à 90 % des coliformes thermotolérants détectés(20, 41).
III.1.3. Les Entérocoques intestinaux :
Ils constituent un sous-groupe des Streptocoques fécaux ; ce sont des
bactéries Gram positives, catalases négatives, en forme de cocci, commensaux
du tube digestif.
Les entérocoques appartiennent au groupe D de Lancefield, les plus
fréquemment isolés sont Enterococcus faecalis et à un moindre degré
Enterococcus faecium(42).
Ils peuvent être définis comme des microorganismes capables de se
développer entre 10 et 45 °C à pH 9,6 et dans 6.5% de NaCl , ou comme des
microorganismes capables de se développer en aérobiose et d’hydrolyser le 4methylumbeliferyl β -D Glucoside en présence d’acétate de thallium, acide
nalidixique et 2,3,5- triphenyltetrazolium chloride (TTC).
24
III.1.4. Le rapport coliformes fécaux/streptocoques fécaux :
le rapport coliformes fécaux/entérocoques est un élément informatif de premier
ordre pour déterminer la source de contamination(43) :
Rapport CF/SF
Source de contamination
R>4
origine exclusivement humaine
4>R>2
origine mixte à prédominance humaine
2>R>1
origine incertaine
1>R>0.7
origine mixte à prédominance humaine
0.7>R
origine principalement animale
Ce rapport doit être, cependant, appliqué avec prudence, car il varie énormément
avec la température de l’eau de mer, l’éloignement de la source de
contamination et avec le temps d’immersion des contaminants.
III.2. Autres indicateurs :
Des études récentes ont mis en évidence le fait que l’abondance de bactéries
indicatrices en général n’était pas bien corrélée à la présence de virus
pathogènes (44-46) . Les bactériophages et plus particulièrement les coliphages
ont été proposés comme des indicateurs spécifiques pour les virus entériques.
Les bactériophages sont des virus qui infectent des bactéries ; ceux qui infectent
en particulier E. coli et les autres coliformes sont appelés des coliphages.
Trois groupes sont actuellement testés comme indicateurs: les coliphages
somatiques, les coliphages anti-mâle à ARN ou phages F-RNA (qui se lient aux
25
pili sexuels des bactéries F+) et les phages infectant Bacteroides fragilis. Cette
approche est en plein développement, mais des limitations pour l’usage des
coliphages comme indicateurs subsistent:
 de nombreux paramètres influencent le devenir des coliphages dans les
milieux naturels (densité des bactéries hôtes, et des phages eux-mêmes,
température, pH, etc.) et peu d’informations pertinentes existent à ce
sujet ;
 ils sont présents en nombre très variable et leur abondance n’a pas été
démontrée comme ayant un rapport avec l’apparition d’infections ;
 finalement, les analyses sont encore très chères et nécessitent une étape
de concentration(47).
Clostridium perfringens a aussi été proposé. Cette bactérie anaérobie stricte ne
se multiplie que dans le tractus intestinal d'animaux à sang chaud et ses spores
résistent remarquablement aux conditions défavorables, beaucoup mieux que les
virus entériques. Cependant, du fait de cette très forte résistance, Clostridium
s'avère être un indicateur trop conservatif et se révèle non corrélé avec les virus
entériques(48).
Une collaboration internationale (Projet virobathe) vise à établir des normes
pour l’énumération des virus dans les eaux à usage récréatif.
Enfin, certains auteurs (22, 49) proposent une évaluation de la qualité
microbiologique des eaux basée sur l’énumération simultanée de plusieurs
indicateurs complémentaires.
26
IV.
LES METHODES DE
ORGANISMES INDICATEURS :
DETECTION
DES
MICRO-
IV.1. La mise en culture :
Les méthodes traditionnelles pour l’énumération des bactéries fécales sont
basées sur leur mise en culture. Bien que, ces dernières années, nombre de
publications aient proposé des méthodes alternatives aux méthodes classiques de
dénombrement des bactéries fécales dans les eaux de surface, ces dernières sont
néanmoins encore utilisées de manière systématique pour le contrôle en routine
de la qualité microbiologique des eaux et sont toujours les seules reprises dans
les normes.
Deux grands types de méthodes basées sur la mise en culture sont régulièrement
utilisés :
- La détermination du nombre le plus probable (NPP) : des dilutions
décimales de l’échantillon sont inoculées dans une série de tubes contenant un
milieu de culture liquide spécifique. La loi de Poisson permet de calculer le NPP
sur base de la proportion de tubes positifs dans chaque dilution.
- La méthode de filtration sur membrane (MF) : un volume défini de
l’échantillon est filtré et la membrane est incubée sur un milieu gélosé
spécifique. Différents milieux et conditions d’incubation (temps et température)
peuvent être utilisés selon le type de bactéries fécales recherché(50) . Après
incubation, on dénombre les colonies visibles à l’œil nu et l’on considère que
chaque colonie résulte de la multiplication sur le milieu d’une cellule
bactérienne. Le résultat s’exprime en UFC (unité formant colonie) par unité de
volume.
27
Pour l’énumération des coliformes et des E.coli, les milieux spécifiques
classiques utilisés pour la détermination du NPP ou des UFC possèdent du
lactose et un indicateur pour identifier la production d’acide. Ils contiennent
aussi des détergents et/ou des sels biliaires pour inhiber la croissance des Gram
positifs et des levures.
Le milieu liquide spécifique le plus utilisé en France pour l’énumération des
coliformes dans l’eau est le bouillon lactosé au vert brillant. Les milieux gélosés
spécifiques les plus utilisés pour l’énumération des coliformes sont: le milieu
m-Endo et le milieu lactosé TTC-Tergitol.
Pour augmenter la spécificité et diminuer le temps de réponse des méthodes
basées sur la mise en culture, des propriétés enzymatiques des coliformes et des
E. coli sont aujourd’hui exploitées. La détection de l’activité de la β-Dgalactosidase (une enzyme spécifique des coliformes) et celle de la β-Dglucuronidase (une enzyme spécifique des E. coli) sont utilisées pour mettre en
évidence la présence de ces bactéries. Des substrats chromogéniques et
fluorogéniques ont été incorporés dans les milieux de culture ; l’hydrolyse de
ces substrats par les enzymes spécifiques donne lieu à des produits colorés ou
fluorescents qui permettent une détection aisée de l’activité enzymatique
ciblée(51). Quelques milieux de culture basés sur ces propriétés enzymatiques
permettent la détection simultanée des coliformes et des E. coli.
Un exemple d’un dénombrement sur gélose d’E. coli est présenté par la
figure 3. Le substrat fluorogénique incorporé à la gélose fait apparaître les
cellules d’E. coli en mauve.
28
Figure 3 : Photographie d’un dénombrement des E. coli sur un milieu de
culture contenant un substrat chromogénique (milieu Chromocult Agar).
Les colonies d’E. coli apparaissent colorées en mauve sur ce milieu(52).
La connaissance des propriétés enzymatiques de ces bactéries a également
permis de développer l’approche dite “defined substrate technique” (53) : Elle
consiste à fournir comme seul substrat dans le milieu, un composé nécessitant
l’activité enzymatique ciblée pour pouvoir être utilisé ; seul le groupe de
bactéries ciblé peut donc croître. Une méthode normalisée (ISO 1899-1) et
miniaturisée est aujourd’hui utilisée pour l’énumération des E. coli pour le
contrôle de routine de la qualité microbiologique des eaux. Dans cette méthode
29
NPP miniaturisée, une microplaque de 96 puits contenant un substrat
fluorogénique pouvant être hydrolysé par la β-D-glucuronidase est utilisé. Après
incubation de la microplaque, 36 h à 44 °C, chaque puit est inoculé avec des
dilutions décimales de l’échantillon d’eau. Les puits positifs sont énumérés sous
illumination UV et le NPP est calculé (voir figure 4).
Figure 4 : Photographie d’un dénombrement des E. coli par la technique
microplaque. Les puits positifs (où il y a eu croissance des E. coli)
apparaissent fluorescents sous illumination UV. Chaque rangée verticale de
puits correspond à une dilution de l’échantillon (échantillon de plus en plus
dilué de gauche à droite). Le nombre de puits fluorescents est compté pour
chaque dilution de l’échantillon ce qui permet une estimation du NPP d’E.
coli dans l’échantillon.
30
Les méthodes basées sur la mise en culture présentent deux inconvénients
majeurs.
Tout d’abord, le temps de réponse est relativement long (de 24 à 48 h pour la
détermination du NPP). Elles ne permettent donc pas de détecter immédiatement
les pollutions fécales en milieu naturel, ce qui constitue un handicap
considérable quand une réponse rapide sur l’état de contamination d’une eau
naturelle est souhaitée, par exemple aux prises d’eau des usines de production
d’eau potable en rivière ou dans les zones de baignade fréquentées.
D’autre part, ces méthodes peuvent sous-estimer le nombre de bactéries fécales
présentes dans un échantillon d’eau, en ne prenant pas en compte celles qui ne
sont plus capables de se diviser.
IV.2. La problématique des bactéries fécales non cultivables :
A l’origine de l’utilisation des méthodes basée sur la mise en culture, on
considérait que la différence entre bactéries «mortes» et bactéries «vivantes »
s’exprimait par la capacité de ces cellules à se multiplier ou pas dans ou sur des
milieux et dans des conditions considérées optimums pour leur croissance.
Aujourd’hui, on sait pertinemment que la frontière entre la vie et la mort d’une
bactérie ne peut être définie par cet unique et simple concept.
En effet, depuis le courant des années 1980, d’importants développements
méthodologiques très variés ont permis de mettre en évidence l’existence d’une
proportion importante de bactéries présentes dans les milieux aquatiques
naturels qui n’étaient pas capables de se développer dans les milieux de culture
(bactéries non cultivables) mais présentaient certaines caractéristiques qui
31
démontraient leur activité ou leur viabilité. Diverses méthodes sont utilisées
pour évaluer l’activité ou la viabilité des bactéries(54) : mesure de l’intégrité
cellulaire comme l’intégrité membranaire ou le potentiel de membrane, mesures
d’activités métaboliques comme l’utilisation d’un substrat ou la synthèse de
protéines, la détection d’une activité respiratoire ou d’une activité enzymatique
ou encore la détection de synthèse d’ARNm ou d’ARNr. Les bactéries
présentant certaines activités mais incapables de se multiplier en culture ont été
intitulées « Bactéries Viables mais Non Cultivables », ou VBNC(55).
Certains auteurs(56, 57) ont proposé l’utilisation du terme ANC (Actives Non
Cultivables) comme plus approprié que le terme VNBC pour décrire ces
bactéries vu que la « viabilité » dont on parle est souvent définie par la mesure
de certaines propriétés cellulaires qui ne sont pas forcement en relation avec la
capacité de ces cellules à se reproduire. Cet état VBNC ou ANC a été mis en
évidence pour des bactéries autochtones du milieu aquatique mais aussi pour
diverses bactéries entériques dans le milieu aquatique(55).
L’habitat naturel des E. coli est l’intestin des animaux à sang chaud qui offre un
environnement à température constante et élevée (37 °C) et des concentrations
élevées en substrats organiques aisément assimilables comme les acides aminés
et les sucres, tous facteurs favorables au développement bactérien.
Une fois rejetées dans le milieu naturel, ces bactéries se trouvent confrontées à
des conditions défavorables telles que la limitation en nutriments, le stress
osmotique, de faibles températures et des variations de pH ainsi que face à de
multiples prédateurs. Une partie de ces bactéries peuvent survivre à ces
conditions défavorables en entrant dans l’état VBNC(58, 59).
En effet, de nombreuses publications montrent qu’après leur introduction dans
un milieu aquatique naturel, les bactéries fécales perdent assez rapidement leur
32
faculté de croître dans ou sur les milieux spécifiques utilisés pour leur
dénombrement mais conservent beaucoup plus longtemps certaines activités
métaboliques (59-61). Différentes études ont, par ailleurs, suggéré que ces
bactéries actives mais non cultivables pouvaient conserver leur pathogénicité
(62, 63). Si les bactéries entériques VBNC présentes dans les milieux aquatiques
sont effectivement capables de « ressusciter » de ce stade « dormant » et de se
reproduire le risque sanitaire serait alors systématiquement sous-estimé par les
méthodes de dénombrement par mise en culture(64).
Aujourd’hui, le concept de bactéries VBNC fait encore l’objet de débats
passionnés sur la signification exacte de cet état(56, 59). Deux visions
divergentes s’opposent(65, 66). La première présente l’état VBNC comme une
stratégie de survie, et donc un processus actif qui conduit à une différenciation.
Cette hypothèse veut que cet état soit réversible et que dans certaines conditions
ces cellules « ressuscitent » et soient capables de se reproduire. L’autre vision
présente cet état comme une étape irréversible conduisant vers la mort. Ces
cellules seraient capables de maintenir certaines activités métaboliques ou
respiratoires pendant un temps limité mais ne seraient pas capables de
« ressusciter ».
De nombreuses études ont tenté d’induire une « ressuscitation », celle-ci serait la
meilleure mesure d’une réelle viabilité (67-69). Dans la plupart de ces études, la
« ressuscitation » n’a été possible que sur les cultures qui sont restées dans l’état
VBNC pour de courtes périodes de temps(65). D’autres auteurs contestent ces
résultats en suggérant que la croissance observée était due à quelques cellules
cultivables présentes en abondance inférieure à la limite de détection de la
méthode d’énumération par mise en culture utilisée(70).
33
L’intérêt croissant pour le développement de nouvelles méthodes de
dénombrement spécifiques capables de détecter les bactéries fécales dans l’état
VBNC dans les eaux de surface découle tout naturellement de ce qui précède.
IV.3. Les méthodes moléculaires :
Les méthodes moléculaires de détection de bactéries fécales (pathogènes et
indicateurs) ont été l’objet d’un important travail de recherche durant les
dernières années. Les méthodes moléculaires présentent l’avantage d’être
rapides, spécifiques ; elles ne nécessitent pas d’étape de mise en culture mais
présentent l’inconvénient d’être chères et de nécessiter un personnel très
qualifié. De plus, certaines ne font pas toujours la distinction entre les bactéries
vivantes et mortes.
La méthode moléculaire est basée sur l’extraction de l’ADN des microorganismes présents dans l’échantillon suivie de la multiplication, par la
technique d’amplification génique, d’une séquence du génome ou ADN
spécifique du micro-organisme recherché. Cette multiplication appelée PCR
(pour Polymerase Chain Reaction en anglais), dont le principe est expliqué à la
figure 4, permet de recopier en plusieurs centaines de millions d’exemplaires le
fragment d’ADN. Il est alors possible de visualiser la présence d’un microorganisme présent en très faible nombre dans l’échantillon de départ.
Des variantes de cette technique (PCR compétitive et PCR en temps réel)
permettent aujourd’hui, sur la base du nombre de copies du gène après
amplification, de dénombrer les micro-organismes dans l’échantillon. Ces
méthodes sensibles présentent néanmoins l’inconvénient de ne pas permettre la
distinction entre un micro-organisme vivant et un fragment en bon état
de son ADN présent dans l’échantillon.
34
Figure 5 : Schéma du principe de l’amplification génique (PCR)(52).
35
IV.4. L’énumération des E. coli viables par hybridation in situ :
L’hybridation in situ avec une sonde fluorescente (FISH - Fluorescent In Situ
Hybridisation), consiste à marquer la cellule cible avec une sonde moléculaire
spécifique du micro-organisme ciblé liée à un composé fluorescent.
Cette sonde moléculaire est en fait l’homologue d’une séquence de bases
spécifiques de l’ARN du microorganisme cible.
Dans le cas du micro-organisme cible, la sonde moléculaire se lie par
appariement à la séquence de base homologue de l’ARN de la cellule cible qui
devient fluorescente et détectable en microscopie à épifluorescence. Dans le cas
d’un micro-organisme non-cible, il n’y pas appariement et donc pas de
marquage de la cellule.
Récemment, cette procédure d’hybridation in situ appliquée aux E. coli a été
couplée avec un test de viabilité pour ne détecter en microscopie que les
cellules viables(71).
Ce test consiste à incuber les bactéries dans un milieu riche en présence
d’antibiotiques qui inhibent la division cellulaire ; à la suite de cette incubation,
les cellules actives sont allongées, ce qui permet de les distinguer des inactives.
Cette élongation des cellules actives s’accompagne d’un accroissement du
contenu en ARN sans changer le nombre de bactéries. Ce couplage offre donc le
double avantage de faciliter la détection des bactéries, après marquage par une
sonde moléculaire fluorescente, et de permettre la seule énumération des cellules
actives (cellules présentant une activité métabolique dans les conditions
d’incubation en présence du milieu riche).
Des exemples de dénombrement des E. coli par cette méthode sont présentés par
la figure 6.
36
À l’inverse des méthodes basées sur la mise en culture, cette technique offre
l’avantage de dénombrer l’ensemble des E. coli viables et non pas seulement
les E. coli cultivables (capable de se multiplier sur les milieux de culture), mais
elle présente l’inconvénient d’être relativement lourde à mettre en œuvre et de
nécessiter un personnel formé aux techniques de biologie moléculaire et à la
microscopie.
Cette technique a permis de montrer que la proportion des E. coli viables mais
non cultivables était plus importante dans les milieux peu contaminés par
rapport aux milieux fortement contaminés(52).
Ceci s’explique probablement par le fait que des conditions plus stressantes
(stress nutritionnel, effet de la lumière), qui sont responsables de la plus grande
fraction de bactéries viables mais non cultivables sont rencontrées dans les
milieux les moins contaminés.
Figure 6 : Hybridation in situ avec une sonde moléculaire des E. coli
présents dans un échantillon d’eau usée traitée (10 ml filtrés) (I) et dans un
échantillon d’eau (100 ml filtrés) (II). Sur les deux photos, la flèche « a »
indique une cellule d’E. coli fluorescent en rouge(52).
37
IV.5. La mesure directe de l’activité β-D-glucuronidasique :
La mesure de l’activité de la β-D-glucuronidase des E. coli sans passage
par une étape de mise en culture des échantillons a été proposée comme
alternative aux dénombrements par mise en culture dans les eaux côtières(72).
La méthode consiste à filtrer un échantillon d’eau (en général 100 ml), à
incuber le filtre dans un tampon à pH optimal (6.9) et à température optimale
(44 °C) en présence du substrat fluorogène (4-méthylumbelliferyl-β-Dglucuronide (MUGlu) en concentration saturante et à mesurer l’apparition de la
fluorescence au cours du temps(73). L’apparition de la fluorescence est due à la
methylumbelliferone (MUF) résultant de l’hydrolyse du substrat MUGlu par la
β-D-glucuronidase des E. coli et est proportionnelle à la quantité d’enzymes
présentes dans l’échantillon qui est elle-même proportionnelle au nombre des
E.coli dans l’échantillon.
Ce protocole permet de mesurer l’activité GLU en moins d’une heure.
Le résultat de la mesure exprimé en terme d’activité enzymatique est converti en
abondance d’E. coli grâce à une calibration du type de celle présentée à la
figure7.
38
Figure 7 : Relation linéaire en coordonnées logarithmiques, entre l’activité
GLU et la concentration en E. coli cultivables (estimée par la méthode «
microplaque »)(52).
La mesure directe de l’activité GLU avec le type de protocole décrit ci-dessus a
été appliquée avec succès à divers types d’échantillons : eaux de mer, eaux
douces et eaux usées (73-75).
Ces différents travaux ont tous montré une corrélation significative entre le Log
de l’activité GLU et celui de l’abondance en coliformes fécaux dénombrés sur
gélose.
La rapidité, la simplicité du protocole expérimental et un coût équivalent à celui
des méthodes de dénombrement sur gélose ont permis de proposer cette
approche comme une méthode rapide pour évaluer la qualité microbiologique
des eaux douces (76) et marines (77).
39
Tel que dans une étude montrant l’efficacité de cette analyse enzymatique, cinq
cents échantillons provenant de différents sites côtiers (côte atlantique française)
et d'eau douce ont été analysés par cette méthode, les résultats obtenus par la
mesure de l'activité β D-glucuronidase sont conformes pour plus de 90 % des
échantillons analysés à ceux estimés par la méthode standard (ISO 9308-3)(78).
De plus, pour moins de 1 % d'échantillons, le niveau de qualité en E. coli peut
être sous-estimé contrairement à la méthode de référence.
Les inconvénients liés à cette méthode sont la nécessité d’une calibration par
rapport à une méthode de mise en culture pour obtenir un résultat exprimé en
concentration d’E. coli ainsi que la possible interférence, dans certaines
conditions environnementales, de micro-organismes non ciblés (bactéries non
E. coli possédant une activité glucuronidasique) et de la turbidité.
40
V. LES NORMES DE QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES
EAUX DE BAIGNADE :
Pour un niveau de contamination microbiologique donné, le risque
sanitaire dépend de l’usage qui est fait de l’eau. L’eau qui est directement
consommée, qui est utilisée comme ressource dans une usine de production
d’eau potable, qui sert pour l’hygiène, la baignade ou pour d’autres activités
récréatives nautiques, ou encore qui est utilisée pour l’irrigation des cultures
n’expose évidemment pas aux mêmes risques sanitaires. De ce fait, des normes
différentes ont été établies pour chacun de ces usages.
Les études épidémiologiques permettent de faire le lien entre l’exposition à un
facteur donné et l’incidence d’infections dues à cette exposition. Elles donnent
une estimation du risque en fonction d’un niveau d’exposition ou dose (dans le
cas des maladies d’origine hydrique, une abondance d’indicateurs) et peuvent
donc être utilisées pour définir des normes appropriées.
Les études épidémiologiques qui conduisent à la définition de normes doivent
être de la plus grande rigueur de façon à entraîner l’adhésion à ces normes.
Néanmoins, ce type d’étude ne donne qu’une estimation statistique d’une
relation risque/facteur contrairement à d’autres méthodes expérimentales, mais
elles sont souvent pour diverses raisons (éthiques, logistiques, financières, etc.)
les seules accessibles. Les limites méthodologiques des études épidémiologiques
sont généralement atteintes lorsqu’il s’agit de mesurer de très faibles
changements du risque, ce qui implique le traitement d’échantillons trop vastes
pour être
accessibles.
41
Des études épidémiologiques sont à l’origine des normes pour la réutilisation
des eaux usées(79) et de la norme pour les eaux à usage récréatif(80)
contrairement aux normes pour l’eau de boisson qui sont basées sur le principe
de précaution (absence totale d’indicateurs de contamination fécale) (81).
Pruss (82) présente une revue des études épidémiologiques disponibles
concernant les eaux à usage récréatif. Sur 22 études identifiées seulement 7
concernaient les eaux douces (83-88). Cette revue met en évidence une forte
corrélation entre l’abondance d’indicateurs et l’occurrence de maladies gastrointestinales et montre qu’E. coli est le meilleur indicateur de risque sanitaire
pour les eaux douces.
Pour un usage donné de l’eau, les normes n’ont aucune raison d’être identiques
partout dans le monde. En effet, des facteurs locaux influencent le risque que
constitue un niveau de contamination donné. Ce sont, entre autres :
 le background génétique et immunologique de la population, ce dernier
étant lui-même corrélé à la prévalence d’infections diverses dans cette
population et à l’écologie microbienne de la région considérée;
 le type de pathogènes présents et leur proportion par rapport aux
indicateurs ;
 la différence de survie des microorganismes d’origine fécale dans des
milieux aquatiques différents.
Il faut noter qu’aujourd’hui le niveau des normes est en général établi partout
dans le monde sur base d’études épidémiologiques conduites seulement en
régions tempérées et dont les résultats ne sont probablement pas directement
transposables à d’autres régions comme les régions tropicales ; il semble
42
aujourd’hui important de lancer des études épidémiologiques spécifiques à
chaque région pour y garantir la pertinence des normes de qualité
microbiologique.
Parmi les normes microbiologiques des eaux de baignade, on distingue les
normes proposées par l’OMS et le PNUE et la nouvelle directive Européenne
2006/7/CEE (voir tableaux ci-dessous).
Tableau III : Les normes microbiologiques pour les eaux de baignade
proposées par l’OMS et le PNUE en 1983(89).
Nombre
Paramètres
Concentration par
100 ml à ne pas
dépasser
50%
90%
du temps
minimum
d'échantillons
Coliformes
Fécaux
100
1000
10
100
1000
10
Streptocoques
Fécaux
43
Tableau IV : Les normes microbiologiques requises pour les eaux de
baignade déterminée par la directive 2006/7/CEE.
Paramètres
Excellente qualité
Bonne qualité
Qualité suffisante
Entérocoques intestinaux
(CFU /100ml)
100*
200*
185**
Escherichia Coli
(CFU/100ml)
250*
500*
500**
* : évaluation au 95ème percentile
** : évaluation au 90ème percentile
Même si des critiques peuvent être émises sur la manière dont ces normes ont
été établies et sur leur réelle signification sanitaire, personne ne peut nier
l’utilité de leur caractère préventif. Une meilleure gestion du risque sanitaire
associé à l’eau nécessite de poursuivre les études épidémiologiques afin de
mieux appréhender la relation entre la présence des indicateurs et l’apparition de
maladies mais nécessite aussi d’approfondir l’étude de l’écologie des germes
indicateurs et pathogènes dans le milieu aquatique naturel.
44
VI. LA SURVIE DES BACTERIES DANS LE MILIEU MARIN :
Le concept classique d’auto-épuration bactérienne par l’eau de mer a été
longtemps retenu. Jusqu’aux années 70, il était admis que les bactéries
pathogènes d’origine humaine étaient détruites en quelques heures dans l’eau de
mer. La plupart des auteurs considèrent la température et la diminution
d’intensité
lumineuse
comme
seules
responsables
des
décroissances
bactériennes en milieu marin, mais certains n’excluent pas l’intervention
d’autres facteurs défavorables tels que la salinité, les carences en éléments
nutritifs, la sédimentation, l’antibiose entre les bactéries et certaines substances
antibactériennes produites par les algues ou les bactéries marines. Par contre, la
présence de matière organique, notamment dans les sédiments, favoriserait le
processus de survie des E. coli et des salmonelles(90).
Les résultats in vivo de ces expériences ont montré que les E. coli évoluaient
rapidement en 1 à 4 jours vers un état non cultivable dans les milieux carencés
en éléments nutritifs(90). E. coli subit des processus adaptatifs structuraux telle
la diminution de sa taille, un changement de la composition de ses enveloppes,
avec disparition de certaines protéines.
Tout ceci s’accompagne d’une modification de l’activité enzymatique
notamment de la β-galactosidase. Or, comme la numération des coliformes
fécaux en milieu spécifique est fondée sur la dégradation du lactose, liée
essentiellement à l’activité de cette galactosidase, cette méthode peut être remise
en cause pour l’identification des E. coli en milieu marin. Par contre, ces formes
dormantes garderaient leur pouvoir pathogène. Des résultats similaires ont été
retrouvés avec Vibrio, Salmonella et Shigella(90).
45
Les bactéries et virus, hôtes habituels de l’intestin de l’homme et des animaux à
sang chaud, qui arrivent dans le milieu marin, se retrouvent dans un milieu
hostile peu propice à leur croissance. Incapables de se multiplier dans cet
environnement, ces microorganismes vont y survivre plus ou moins longtemps
en fonction des paramètres physiques, chimiques et biologiques du milieu
(figure 8). Les microorganismes sont soit libres dans la masse d’eau, soit
associés à des particules organiques ou minéraux. Suivant le poids de ces
particules, les microorganismes vont être soumis à une dilution tout au long de
l’estuaire ou à une sédimentation favorable à leur concentration. Ainsi, on
estime que les sédiments sont plus contaminés que l’eau environnante et vont
constituer un réservoir potentiel pour une recontamination ultérieure des eaux à
la faveur de la remise en suspension des microorganismes lors des phénomènes
naturels (crues, tempête) ou d’activités humaines (dragages). Le temps de survie
des microorganismes est défini par le temps nécessaire à la disparition de 90%
de la population initiale, exprimé par le T90. De quelques heures à quelques
jours pour les bactéries, cette survie est prolongée, pour les virus, de plusieurs
semaines à plusieurs mois.
46
Figure 8 : Les paramètres physiques, chimiques et biologiques influençant
la survie des germes en milieu marin(15).
VI.1. Les facteurs influençant la survie des microorganismes en
milieu marin :
VI.1.1. Facteurs physico-chimiques :
VI.1.1.1. La dilution :
Elle intervient immédiatement après le rejet. Elle est favorisée par le
mélange des eaux : courants, turbulence et action des marées. On estime que 90
à 99% des bactéries d’égout sont détruites après 48 heures de suspension dans
47
l’eau de mer et que leur nombre décroit avec la distance beaucoup plus
rapidement que l’on pourrait s’y attendre du fait de la simple dilution.
VI.1.1.2. L’adsorption :
C’est la fixation des polluants sur toutes les particules organiques ou
minérales en suspension dans le milieu aquatique. C’est un phénomène bien
connu par lequel les microbes s’accrochent à des corpuscules dont ils suivent le
sort ; l’adsorption contribue donc à un isolement des germes et à une efficace
dissociation de la charge polluante, car elle peut atteindre 90 à 95% des bactéries
et des virus).
VI.1.1.3. La sédimentation :
Directe ou indirecte (après adsorption), elle détermine la disparition
momentanée des microbes. Cette disparition peut être provisoire, car il peut y
avoir remis en suspension des sédiments et des bactéries. Très efficace en eaux
calmes, elle se trouve amoindrie par la turbulence du milieu.
VI.1.1.4. La lumière :
Certaines études ont montré que les coliformes fécaux dans l’eau de mer
sont très sensibles à la lumière solaire(91). Ceci peut être expliqué par l’effet
bactéricide de la fraction UV des radiations solaires sur la cellule, en induisant
des dommages par libération des ions peroxyde qui agissent sur la cellule en la
rendant perméable aux sels inorganiques, ce qui fait varier alors sa pression
osmotique.
48
Une turbidité élevée de l’eau limite la pénétration des rayons UV dans l’eau et
contribue également à réduire l’efficacité des rayons UV vis-à-vis des cellules
microbiennes.
VI.1.1.5. La température :
Généralement les basses températures favorisent la survie des bactéries
dans le milieu marin en limitant leurs dépenses énergétiques par diminution des
activités métaboliques des bactéries(91).
VI.1.1.6. Les variations de pH :
Des travaux ont montré que la survie des coliformes fécaux(CF) a été
influencée par le pH du milieu d’incubation. En effet, les pH basiques entraînent
une nette diminution de la survie des CF(91).
VI.1.1.7. La salinité :
La salinité est aussi un facteur de stress très important que subissent les
bactéries de pollution fécale en arrivant au milieu marin(92), où la bactérie doit
rétablir l’équilibre osmotique entre le milieu extérieur et son cytoplasme. Ce
rétablissement met en jeu des mécanismes complexes qui font appel à
l’augmentation de la concentration de certains solutés (osmo-régulateurs) dans
la bactérie.
49
Ainsi, les fortes variations de salinité d’un milieu à l’autre ont tendance à
empêcher l’accoutumance des bactéries allochtones à leur nouveau milieu, ce
qui conduit à la décroissance de leur nombre.
Des auteurs(93) ont souligné également que la présence de particules organiques
permet aux microorganismes de lutter plus efficacement contre le stress salin.
VI.1.2. Facteurs biologiques :
Compétition interspécifique: la présence des microorganismes autochtones, plus
aptes à se multiplier dans leur milieu naturel, implique la décroissance des
bactéries allochtones.
Prédation : On peut citer les :
-Bactéries prédatrices : comme les Bdellovibrio (groupe de bactéries de petite
taille qui se fixent sur d’autres bactéries pour les « dévorer » ; ce sont des
vibrions très mobiles qui n’attaquent que les bactéries Gram négatives); et les
Myxobactéries (germes à Gram négatif ayant pour singularité d’hydrolyser les
molécules insolubles, de lyser les cellules bactériennes et de les utiliser comme
substrat).
-Les bactériophages : extrêmement répondus dans la nature ; ils parasitent et
détruisent bactéries et Cyanophycées. Ils peuvent détruire une population
bactérienne entière ou seulement une partie de celle-ci, s’intégrer dans le
chromosome pour établir la lysogénie.
-Les prédateurs microphages : Ce sont tous les organismes qui se nourrissent de
microbes. Ils sont représentés par les amibes, les flagellés, les ciliés ou des êtres
plus évolués tels que les mollusques filtrants qui absorbent une grande quantité
50
de bactéries et de virus avec leur nourriture. Il faut souligner que pour ces deux
derniers, les germes absorbés ne sont pas nécessairement détruits.
L’oligotrophie : peut être liée à l’absence de substances nutritives ou à la non
biodisponibilité de la matière organique.
51
VII. RISQUES SANITAIRES LIES A LA BAIGNADE DANS LES
EAUX POLLUEES :
VII.1. Introduction :
La baignade dans les eaux naturelles peut entraîner un contact plus ou
moins intense avec des germes pathogènes qui peuvent être présents dans l’eau
en plus ou moins grande quantité. Les pathologies associées à ces germes
concernent la sphère O.R.L., l’appareil digestif, les yeux et la peau, et une
grande variété d’agents pathogènes présents dans les eaux naturelles sont
responsables de ces diverses maladies dont les plus fréquentes sont répertoriées
dans l’annexe 2.
Le risque encouru par le baigneur dépend de plusieurs facteurs :
 du niveau de contamination de l’eau,
 de l’état de santé du baigneur,
 des modalités de la baignade (durée, immersion de la tête…).
La
transmission des microorganismes peut se faire par voie féco-orale
(ingestion d’eau) ou par contact avec la peau et les muqueuses(94).
VII.2. Historique :
Jusqu’en 1975 environ, les risques sanitaires liés à la baignade ont été ignorés.
À partir des années 1980, plusieurs personnes s’intéressent à ces risques,
notamment Cabelli et Foulon aux États-Unis.
Les études réalisées révèlent une convergence certaine entre les pathologies
observées (diarrhées, vomissements, nausées,…) et l’existence d’une pollution
52
fécale marquée. Lors de différentes études, il s’avère que les baigneurs
présentent plus de troubles gastro-intestinaux que les non-baigneurs, tout comme
les baigneurs des zones soumises à des pollutions fécales comparés à ceux des
zones saines.
Les travaux de Foulon (1983) ont mis en évidence l’apparition de troubles
dermatologiques et d’affections O.R.L. attribués à la baignade et plus
précisément aux conditions de baignade (avec immersion ou non de la tête par
les baigneurs).
Toutefois, l’ingestion d’eau apparaît comme le
mode principal d’agression
et l’on suppose qu’un baigneur ingère de 75 à 100 ml d’eau lorsqu’il nage la tête
sous l’eau(95).
Prüss(96) a réalisé une synthèse bibliographique épidémiologique. Il ressort de
cette synthèse que la mauvaise qualité microbiologique des eaux de baignade est
souvent corrélée à l’apparition de pathologies plus ou moins graves chez
l’homme.
VII.3. Les microorganismes impliqués et les pathologies observées :
Les micro-organismes pathogènes les plus fréquemment rencontrés dans les
eaux douces et salées sont repris dans l’annexe 2, ainsi que les pathologies dont
ils sont responsables.
VII.3.1. Les bactéries :
Les bactéries pathogènes incluent des espèces d’origine fécale humaine ou
animale, qui appartiennent aux genres Shigella (S. sonnei et flexneri),
Salmonella, Campylobacter (C. jejuni et C. coli), Yersinia (Y. enterocolitica),
Escherichia (E. coli pathogènes) et Vibrio (V. cholerae)(52).
53
D’autres bactéries pathogènes comme les Legionellas (L. pneumophila) et
certaines espèces du genre Vibrio ne sont pas des bactéries d’origine entérique
mais des pathogènes dont l’habitat naturel est l’environnement et plus
particulièrement les systèmes aquatiques.
Les bactéries pathogènes opportunistes peuvent être d’origine fécale. Elles
appartiennent à une grande diversité de genres comme les genres Pseudomonas,
Aeromonas, Klebsiella, Flavobacterium, Enterobacter,Citrobacter, Serratia,
Acinetobacter, Proteus, Providencia et Mycobacterium, et Nocardia. Ces
pathogènes opportunistes affectent essentiellement des sujets sensibles comme
les enfants, les personnes âgées ou les immunodéprimés.
Les entérobactéries pathogènes induisent essentiellement des gastro-entérites qui
se déclarent dans les quarante-huit heures qui suivent la baignade(97).
Dermatites, infections des yeux et de la sphère ORL font aussi partie des risques
sanitaires liés à la présence de ces bactéries dans les eaux de baignade.
La fièvre typhoïde est causée par Salmonella typhi, maladie infectieuse aiguë et
contagieuse, elle est la première maladie pour laquelle une augmentation
d’occurrence a été observée chez les baigneurs(98). Les Salmonella paratyphi
A, B et C sont également à l'origine de fièvres entériques.
Staphylococcus aureus est à l’origine d’infections cutanées. Les enfants (moins
de 16 ans) sont les plus touchés par ces troubles de santé.
Leptospira interrogans
responsable de la leptospirose, portée par certains
animaux infectés (rats, bétail, chiens,…), qui la rejettent dans leurs urines, est
présent dans les eaux douces et les berges boueuses. La leptospirose, maladie
d’origine animale, transmissible à l’homme, se transmet essentiellement par voie
indirecte, lors de baignades en eau douce. Les leptospires pénètrent dans
54
l'organisme par l'intermédiaire de plaies, de lésions cutanées ou par les
muqueuses. La contamination par voie digestive (absorption d'aliments souillés
par les urines d'animaux malades) est exceptionnelle.
VII.3.2. Les virus :
Les virus pathogènes d’origine fécale (virus de l’hépatite A, entérovirus,
rotavirus, calicivirus astrovirus, norovirus) sont souvent à l’origine de maladies
transmises par les eaux polluées.
Le virus de Norwalk et les virus Norwalk-like sont à l’orgine de gastro-entérites
ayant une période d’incubation de 15 à 48 heures, alors que celles engendrées
par des rotavirus se déclarent principalement au bout de 2 à 4 jours. Les
adénovirus peuvent, eux, induire des gastro-entérites ayant des périodes
d’incubation pouvant aller jusqu’à deux semaines(97).Virus Norwalk et
Norwalk-like
sont
principalement
responsables
d’épidémies
de
gastro-entérites chez les adultes alors que les rotavirus et astrovirus sont à
l’origine d’épidémies chez les enfants.
Entérovirus et adénovirus sont aussi responsables de problèmes respiratoires.
Ces pathologies observées à la suite d’une baignade, ont été classées dans la
catégorie « Acute Febrile Respiratory Illness » .Fièvre, maux de tête et de
gorge, douleurs dans le corps, fatigue, anorexie et toux comptent parmi ces
troubles respiratoires.
VII.3.3. Les champignons :
Les champignons sont présents dans les eaux de mer. Penicillium spp.,
Aspergillus spp. et Alternaria spp sont les champignons filamenteux le plus
souvent retrouvés dans les eaux de baignade. Candida spp. est, quant à elle, la
55
levure la plus communément dosée dans les eaux de mer. Ces levures et
champignons sont à l’origine d’infections oculaires, respiratoires, de la sphère
ORL, de la peau et de dérangements gastriques.
7.3.4. Les protozoaires :
Des protozoaires tels que Giardia (sous forme kystique) et que les oocytes de
Crytosporidium survivent dans l’eau de mer. Les oocytes de
Toxoplasma
gondii est, lui, infectieux s’il est sous forme sporulée. Ces formes sporulées ont
une durée de vie de quelques mois dans l’eau de mer.
Les pathologies induites par ces parasites sont principalement des gastroentérites. Les diarrhées parasitiques ont des périodes d’incubation variant entre
sept et dix jours(97).
7.3.5. Micro-algues et cyanobactéries :
De nombreuses espèces toxiques de dinoflagellés, de diatomées, de
nanoflagellés et de cyanobactéries (algues de couleur bleu-vert) présentes dans
le milieu marin provoquent des pathologies humaines. La toxicité de ces microsalgues pour l’homme tient aux toxines qu’elles libèrent. Le principal danger
vient de ce qu’elles s’accumulent dans les fruits de mer et les poissons qui sont
ensuite consommés par l’homme, chez qui elles provoquent des intoxications.
La « dermatite du baigneur » (ou « des nageurs ») est un eczéma de contact
sévère qui se manifeste après immersion dans de l’eau de mer où se trouvent des
efflorescences de certaines espèces de cyanobactéries. Elle provoque des
démangeaisons et des brûlures dans les minutes ou dans les heures qui suivent la
baignade.
Des
composés
toxiques
56
comme
l’aplysiatoxine,
la
débromoaplysiatoxine et la lyngbyatoxine A ont été isolés dans les
cyanobactéries marines. Ils sont très inflammatoires et contribuent dans une
large mesure aux tumeurs de la peau(99).
Nodularia spumigena a été la première cyanobactérie reconnue comme mortelle
chez l’animal. Elle produit une hépatotoxine, la nodularine, qui provoque
d’importantes hémorragies du foie chez les mammifères et altère la structure de
cet organe.
L’inhalation d’embruns chargés de fragments de dinoflagellés ou de toxines
(brévétoxines) libérés dans l’écume par des micros-algues lysées peut être
dangereuse pour l’homme. Les signes et symptômes sont une irritation sévère de
la conjonctive et des muqueuses (en particulier celles du nez) suivie d’une toux
persistante, d’éternuements et de picotements des lèvres.
VII.4. Les risques liés aux contaminants chimiques :
Il arrive que des contaminants chimiques naturels ou anthropiques pénètrent
dans les eaux de surface ou se déposent sur les plages. L’exposition est un
facteur crucial à prendre en compte pour déterminer le risque d’intoxication par
les produits chimiques présents dans les eaux de baignade. Le type d’activités de
loisir pratiquées est donc important. L’exposition se fait par contact direct avec
la peau, les yeux et les muqueuses, par inhalation ou par ingestion(99).
La fréquence, l’ampleur et la probabilité de l’exposition sont des critères
déterminants pour évaluer le risque lié à un contaminant donné.
Par exemple, le chrome rejeté par les tanneries peut provoquer des irritations
importantes et peut engendrer des cancers de la peau.
57
Le mercure, contenu dans les détergents, peut donner des allergies et des
complications neurologiques quand il est avalé.
Plusieurs autres métaux lourds tels que l’argent, le cuivre, le plomb et le
cadmium peuvent avoir des conséquences très nuisibles.
58
VIII. LES EPIDEMIES LIEES AUX EAUX DE BAIGNADE :
VIII.1. E. coli O157 :H7 :
À l’échelle mondiale, la plupart des épidémies liées à l’ingestion d’eau
contaminée par des E. coli sont associées à des baignades dans des eaux de
surface naturelles (en rivière, lac, ou étang) ou dans des piscines ou des
pataugeoires(100, 101). Ces épidémies étaient dues à des souches E. coli
O157:H7 , mais aussi à des souches E. coli non-O157. La plupart du temps, ces
épidémies étaient associées à une forte contamination microbiologique des eaux
ou à un traitement (chloration) insuffisant des eaux de piscine et de
pataugeoire(102).
La première flambée d’E. coli 0157: H7 associée à l'eau de loisirs est survenue
à l'été 1991. L'épidémie a concerné 21 cas d’E. coli 0157: H7, tous associés à la
baignade dans le lac Bleu près de Portland, Oregon(103).
Quatre autres foyers d’E. coli 0157: H7 ont été épidémiologiquement liés à la
baignade dans les lacs d'eau douce (103). En août 1999, 36 patients ont élaboré
E. coli 0157: H7. La plupart avaient des antécédents de la natation dans le lac
Battle Ground, situé à Battle Ground Lake State Park dans le comité de Clark, à
Washington (28 nageurs et nageuses de 8 contacts, 35 selles-culture ont
confirmé, une sérologie confirmée).
Entre 1997 et 2000, la plupart des épidémies liées à l’ingestion accidentelle
d’eau de baignade survenues aux États-Unis étaient dues à des E. coli
pathogènes(102).
En 2001, quatre cas d’E. coli O157:H7 ont été déclarés à la Direction de santé
publique de Montréal-Centre. Il s’agissait de quatre jeunes garçons, âgés entre 3
et 7 ans. Suite aux enquêtes épidémiologiques, l’eau de baignade à une plage
59
publique de la région de Montréal pouvait être le facteur d’exposition commun à
tous les cas(104).
VIII.2. Autres :
La shigellose : en 1994, une épidémie de shigellose à Shigella sonnei de 59 cas
liée à des baignades dans un lac de l’Ain dans la région de RHÔNE-ALPES en
France s’est produite(105).
La schistosomiase : en 1996, 54 cas de dermatite cercarienne dues au
shistosoma sp. sont survenus dans la région du Québec, dont 52 cas élaborés lors
de baignade dans des lacs, et 2 cas produits lors de baignade dans une plage
publique(106).
La cryptosporidiose :
 En 1988, 60 cas de cryptosporidiose furent rapportés dans le comté de Los
Angeles(USA). Tous les individus infectés étaient nageurs et leur seul lien
était l’utilisation d’une piscine contaminée par C.parvum(107).
 Entre 1983 et 2005, 149 épidémies de cryptosporidiose se sont
enregistrées en Angleterre et Pays de Galles dont 43 sont dus au
contamination de piscines(108).
60
IX. LA SURVEILLANCE DE LA QUALITE DES EAUX DE
BAIGNADE AU MAROC :
IX.1. Organisation des contrôles :
La surveillance de la qualité des eaux de baignade est organisée conjointement
par le Ministère de l’Équipement et des Transports (MET) et le Secrétariat
d’État chargé de l’Eau et de l’Environnement (SEEE), selon les normes
marocaines et internationales (OMS et PNUE).
Sa mise en œuvre est réalisée par :
 le Laboratoire National de L’Environnement relevant du Secrétariat
d’État chargé de l’Eau et de l’Environnement ;

le Laboratoire Public d’Essais et d’Études (LPEE) par l’intermédiaire de
l’unité mobile du Centre d’Études et de Recherche de l’Environnement et
de la Pollution (CEREP) pour le compte du Ministère de l’Équipement et
des Transports.
En 2010, 129 plages (35 au niveau de la Méditerranée et 94 au niveau de
l’Atlantique) réparties sur 23 wilayas et provinces ont fait l’objet de surveillance
de la qualité microbiologique(2).
Le nombre de plages objet du Programme national de surveillance évolue depuis
plusieurs années. Il est passé de 50 en 1999 à 129 plages en 2010 comme le
montre la figure 9.
61
140
129
114
120
100
100
79
80
60
79
79
79
86
92
93
50
40
20
0
Figure 9 : Evolution du nombre des plages au Maroc
IX.2. Les procédures d’exécution des programmes :
Les eaux de baignade des plages couvertes par le programme font l’objet de
contrôle entre les mois, mai et septembre, avec une campagne de référence au
mois de février. La fréquence des prélèvements est bimensuelle durant la saison
balnéaire.
Les sites de surveillance sont choisis en fonction de l’importance de leur
fréquentation, de la nature des lieux (Relief, forme du rivage…) et des risques
particuliers de pollution (rejet d’eaux usées…).
62
L’évaluation de la qualité des eaux porte sur la recherche des paramètres
microbiologiques [coliformes fécaux (Escherichia coli) et streptocoques fécaux
(entérocoques)] conformément à la norme nationale NM 03.7.200, aux normes
internationales et directives de l’OMS/PNUE, applicables à la surveillance
sanitaire des eaux de baignade.
L’évaluation des résultats relatifs à la qualité des eaux de baignade est basée sur
un traitement statistique des résultats issus des analyses microbiologiques. Cette
évaluation conduit à une classification de la qualité des eaux selon la grille de la
norme marocaine.
Cette grille de qualité dresse les fourchettes de valeurs limites (guides et
impératives) à prendre en considération (cf. tableau ci-dessous) :
Tableau V : les nombres guides et les nombres impératifs selon la norme
marocaine.
Paramètres microbiologiques
Valeurs guides (VG) par
100 ml
valeurs impératives (VI) par
100 ml
Coliformes fécaux
100
2000
Streptocoques fécaux
100
400
63
Pour le classement des eaux de baignade, quatre catégories (ou classes) sont
distinguées, à savoir :
Catégorie A : Eaux de bonne qualité pour la baignade
 Au moins 80 % des résultats en E.coli ou en coliformes fécaux sont
inférieurs ou égaux au nombre guide (100/100 ml).
 Au moins 95 % des résultats en E.coli ou en coliformes fécaux sont
inférieurs ou égaux au nombre impératif (2000/100ml).
 Au moins 90 % des résultats en streptocoques fécaux sont inférieurs ou
égaux au nombre guide (100/100ml).
Catégorie B : Eaux de qualité moyenne pour la baignade
L’eau est de qualité moyenne lorsque le nombre impératif fixé par la directive
pour les E.coli ou coliformes fécaux est respecté dans au moins 95 % des
prélèvements (2000/100 ml), les conditions relatives aux nombres guides n’étant
pas, en tout ou en partie vérifiées.
Les eaux classées en catégorie
7
Les eaux classées en catégorie A ou B sont conformes à la norme
64
Catégorie C : Eaux momentanément polluées
L’eau des points de surveillance pour lesquels la fréquence de dépassement du
nombre impératif pour E.coli ou coliformes fécaux est comprise entre 5 % et
33,3 % est considérée comme pouvant être momentanément polluée.
Cette pollution peut faire l’objet de mesures immédiates ou à moyen terme,
permettant d’améliorer définitivement la qualité de l’eau.
Il est important de noter que si moins de 20 prélèvements sont effectués pendant
toute la saison sur un point, un seul dépassement du nombre impératif en E.coli
ou coliformes fécaux, suffit pour entraîner le classement de la plage en
catégorie C.
Catégorie D : Eaux de mauvaise qualité
Lorsque, pour le paramètre E.coli ou coliformes fécaux, les conditions relatives
aux nombres impératifs sont dépassées au moins une fois sur trois, l’eau de
baignade concernée est considérée comme de mauvaise qualité. Toutes les zones
classées en catégorie D durant deux années de suite doivent être interdites à la
baignade, sauf si des améliorations significatives apparaissent.
Les eaux classées en catégorie C ou D ne sont pas conformes à la norme
65
IX.3. Qualité hygiénique des plages du Royaume : Saison 2009-2010
333 stations de prélèvements ont fait l’objet d’un nombre suffisant de
prélèvements pour le classement et ont permis de déclarer 322 stations (soit 96,7
%) de qualité microbiologique conforme aux exigences réglementaires pour la
baignade. La quasi-totalité des 11 stations (soit 3,3 %) déclarées non conformes
pour la baignade de la saison 2009-2010 subit l’influence des rejets d’eaux
usées ou connaît une forte concentration de baigneurs, conjuguées à
l’insuffisance des infrastructures d’hygiène(2).
3,30%
96,50%
Non conformes C et D
Conformes A et B
Figure 10 : Qualité hygiénique des plages au Maroc 2009-2010
66
80
70
60
50
Catégorie A
40
Catégorie B
30
Catégorie C
20
Catégorie D
10
0
Figure11 : Evolution de la qualité hygiénique des plages au Maroc
67
CONCLUSION
ET
RECOMMANDATIONS
68
Au terme de cette recherche, nous avons constaté que les sources de
pollution des eaux de baignade sont nombreuses, dont les rejets des eaux usées
(domestiques et industrielles) constituent la source la plus importante de la
pollution des eaux de mer dans le monde, surtout dans les pays en
développement.
L’influence de ces pollutions se manifeste
au niveau de la qualité
microbiologique des eaux plus qu’au niveau de la qualité physicochimique.
Ainsi que l’altération de la qualité microbiologique des eaux de baignade peut
entrainer des risques non négligeables sur la santé humaine, ces risques se
représentent principalement sous forme de gastro-entérites, dermatites, et
infections des yeux et de la sphère O.R.L .
Pour l’évaluation de la qualité de ces eaux, on utilise des germes indicateurs qui
montrent l’existence d’une contamination par les matières fécales, dont E.coli
reste le meilleur indicateur d’une contamination récente de l’eau par le matériel
fécal, même que des études récentes proposent d’autres indicateurs comme les
coliphages.
L’évolution de la biologie moléculaire a permis d’apporter de nouvelles
méthodes de détection de germes indicateurs qui sont plus spécifiques et rapides,
mais ces méthodes sont chères.
La qualité des eaux de baignade et globalement l’hygiène des plages s’est
nettement améliorée au cours des cinq dernières années sur le littoral marocain,
69
certaines zones présentent encore une vulnérabilité due aux rejets directs et aux
apports telluriques en particulier en temps de pluies.
Une dynamique de refonte de la réglementation régissant la qualité des eaux de
baignade est actuellement en marche en Europe, le Maroc suit également et
progressivement cette dynamique.
Afin de hausser davantage le niveau de gestion de la qualité des eaux de
baignade et être proactif devant une éventuelle déviation de la qualité, il
convient de mettre en place ce qui suit :
• élaboration de profils de vulnérabilité des eaux de baignade (détermination des
divers flux, hiérarchisation selon le degré d’impact, voies de transfert, fréquence
d’apparition) ;
• maîtrise des risques sanitaires en cas de dysfonctionnement de systèmes
d’assainissement, fortes précipitations… en vue de prédire le rayon d’impact, sa
durée et son moment d’apparition ;
• activer la mise en place des stations d'épuration des eaux usées et des
dispositifs d'assainissement nécessaires et adéquats, aussi bien pour les rejets
solides que pour les rejets liquides, au niveau des villes côtières ;
• mettre en place et appliquer les dispositifs législatifs et réglementaires
nécessaires pour préserver le littoral, notamment par l'activation de la
promulgation de la loi sur la protection du littoral, les normes de rejets liquides,
etc. ;
• veiller au respect des dispositions des textes réglementaires régissant le littoral,
notamment celles relatives aux carrières et aux études d'impact sur
l'environnement ;
• créer une institution nationale chargée de l'aménagement des zones côtières ;
70
• doter les littoraux de schémas directeurs d'aménagement ; et les plages de plans
d'aménagements d'infrastructures de loisirs, d'hygiène et de sécurité ;
• renforcer le contrôle de l'exploitation illicite et anarchique du sable des dunes
côtières ;
• doter les ports en moyens de dépollution nécessaires ;
• renforcer les plages en moyens matériels et humains pour la sécurité, l'hygiène
et le nettoyage des plages ;
• poursuivre les actions de sensibilisation de la population sur la qualité et la
propreté des plages ;
• utiliser les différents moyens de communication pour informer la population
sur la qualité des plages ;
• améliorer le cadre d'investissement sur le littoral en procédant à la mise en
place des infrastructures de base et en améliorant la cadre de vie dans la zone
littorale.
Enfin, il faudrait arriver un jour à mettre en place un organisme autonome et
efficace doté de moyens technique, financier et institutionnel capables de faire
respecter la nature.
71
RESUMES
Résumé
Titre : LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE BAIGNADE
Auteur : EL ATTIFFI EL OUADRASSI ALI
Mots clés : Eaux de baignade, Pollution, Risques sanitaires
Les eaux de baignade constituent une part importante des loisirs actifs au
monde. La qualité hygiénique de ces eaux est d’une importance capitale.
Le risque sanitaire lié à la pollution des eaux de baignade est avant tous
microbiologique. La transmission des microorganismes peut se faire par
ingestion d’eau ou par contact direct avec la peau et les muqueuses.
Principalement amenés par les rejets des eaux usées, les bactéries et les
virus d’origine fécale sont les principaux microorganismes qui altèrent la qualité
sanitaire des eaux de baignade.
Le contrôle des eaux de baignade repose essentiellement sur la détection et
l’énumération de bactéries indicatrices de risque fécale (les coliformes
thérmotolérants, E. coli, entérocoques), et de certaines bactéries pathogènes
(salmonelles). Ce contrôle est réalisé selon des méthodes classiques
d’énumération après mise en culture sur milieu spécifique, et des méthodes
enzymatiques pour E. coli .Par ailleurs, les progrès récents de la biologie
moléculaire ont développé des techniques pour rechercher divers types de
bactéries et virus tel que les entérovirus.
Les eaux de baignade sont généralement classées en quatre catégories, dont
les catégories A et B sont conformes, et les catégories C et D ne sont pas
conformes à la norme.
Summary
Title: MICROBIOLOGICAL QUALITY OF BATHING WATER
Author: EL ATTIFFI OUADRASSI ALI
Keywords: Bathing Water, Pollution, Health Hazards
Bathing waters are an important part in active leisure in the world. The
hygienic quality of these waters is of paramount importance.
The health risk associated with pollution of bathing water is above all
microbiological. The transmission of microorganisms can be achieved by
ingestion of water or by direct contact with skin and mucous membranes.
Mainly brought about by discharges of sewage, bacteria and viruses of fecal
origin are the main microorganisms that affect the sanitary quality of bathing
water.
Monitoring of bathing water is mainly based on the detection and enumeration
of fecal indicator bacteria risk (thermotolerant coliforms, E. coli, enterococci),
and certain pathogenic bacteria (Salmonella). This control is performed
according to standard methods of enumeration after culturing in specific
medium, and enzymatic methods for E. coli. In addition, recent advances in
molecular biology have developed techniques to search for various types of
bacteria and viruses such as enteroviruses.
Bathing waters are usually classified into four categories, including
Category A and B are consistent, and categories C and D are not compliant.
‫ملخص‬
‫العىوان ‪ :‬انجودة انًَكشوبَونوجَت نًَبه انسببحت‬
‫الكاحب ‪ :‬انعطَفٌ انودساسٌ عهٌ‬
‫الكلماث الزئيسيت ‪ :‬يَبه انسببحت‪ ،‬انخهود ‪,‬انًخبطش انصحَت‬
‫يَبه االسخحًبو حشكم جضءا هبيب فٌ أولبث انفشاغ و األنشطت فٌ انعبنى‪ .‬نوعَت هزه انًَبه‬
‫انصحَت‬
‫حشكم أهًَت لصوى‪.‬‬
‫انًخبطش انصحَت انًشحبطت بخهود يَبه انسببحت هٌ لبم كم شٌء يَكشوبَونوجَت‪ .‬وًٍكن ححمَك‬
‫انخمبل انًَكشوببث عن طشٍك انفى ين انًبء أو عن طشٍك االحصبل انًببشش يع انجهذ واألغشَت‬
‫انًخبطَت‪.‬‬
‫جهبج أسبسب ين لبم عن حصشٍف يَبه انصشف انصحٌ‪ ،‬انبكخَشٍب وانفَشوسبث ين اصم بشاصً‬
‫هٌ انكبئنبث انذلَمت انشئَسَت انخٌ حؤرش عهي نوعَت يَبه انسببحت‪.‬‬
‫وحسخنذ أسبسب يشالبت يَبه انسببحت عهي انكشف وحعذاد بكخَشٍب انبشاص يؤششة (انمونونَبث‬
‫انًخحًهت نهحشاسة‪ ،‬كوالً‪ ،‬انًعوٍت) ‪ ،‬وانبكخَشٍب انًسببت نأليشاض (انسبنًونَال)‪ٍ .‬خى حنفَز هزه‬
‫انشلببت وفمب نهطشق انكالسَكَت و انعذ بعذ صسع فٌ وسط يعَن ‪ ،‬وانطشق األنضًٍَت نهمونونَت ‪.‬‬
‫إضبفت ‪ ,‬انخطوساث انحذٍزت فٌ يجبل انبَونوجَب انجضٍئَت وضعج حمنَبث يخمذيت نهبحذ عن يخخهف‬
‫أنواع انبكخَشٍب وانفَشوسبث يزم انفَشوسبث انًعوٍت‪.‬‬
‫وعبدة يب حصنف يَبه انسببحت فٌ أسبع فئبث‪ ،‬بًب فٌ رنك انفئت ‪ A‬و ‪ B‬يخنبسمت ‪ ،‬وفئبث ‪ C‬و ‪D‬‬
‫نَسج يخوافمت‪.‬‬
ANNEXES
Annexe 1(16) : Liste de quelques pathogènes des eaux usées et leurs symptômes
Bactéries
Enterococcus faecalis
Salmonella
Shigella
Enterobacter
Yersinia enterocolitica
Legionella
Escherichia Coli
(certaines souches)
Campylobacter jejuni
Staphylococcus
Pseudomonas aeruginosa
Virus
Entérovirus :
-Coxsackievirus A et B
-Echovirus
-Poliovirus
Virus de Norwalk
Virus de l’hépatite A
Virus de l’hépatite E
Rotavirus
Reovirus
Caicivirus
Coronavirus
Adénovirus
Protozoaires
Giardia lamblia
Cryptosporidium parvum
Toxoplasma
Microsporidium
la résistance à presque tous les antibiotiques
Gastro-entérites, autres infections
Typhoïde, gastro-entérites et septicémie
Diarrhées
Cystites, pleurésies, méningites
Diarrhée
Pneumonie, autres maladies respiratoires
Diarrhée
Gastro-entérites , diarrhées (l’infection entérique
bactérienne la plus répandue en Amérique du Nord)
Affections cutanées et sous cutanées
Infections ORL, septicémies
Méningite, conjonctivite, péricardite, myocardite,
diarrhée, encéphalite
Méningite, conjonctivite, péricardite, myocardite,
diarrhée, encéphalite
Paralysie, méningite, fièvres
violente gastro-entérite qui dure de 24 à 48
heures
hépatite A
Hépatite E
Gastro-entérites
Maladie respiratoire, entérite
Diarrhée
Gastro-entérites
Infections respiratoires, infections conjonctivales
Douleurs abdominales, diarrhée (la giardiase est maintenant
l’infection humaine entérique non bactérienne ayant la plus forte
incidence)
Diarrhées accompagnées de douleurs abdominales, de vomissement et de
fièvre
Toxoplasmose
Diarrhée
Helminthes
Taenia
Ascaris
Diarrhée, douleur musculaire
Troubles digestifs
Annexe 2 : Principaux groupes et genres d’agents pathogènes responsables de maladies
d’origine hydrique(17).
Groupes de micro-organismes
Virus
Bactéries
Protozoaires
Pathogènes
Pathologies
Méningite, paralysie, fièvres,
Entérovirus (polio, écho, coxsackie myocardie,
problèmes respiratoires et diarrhée
Hépatite A et E
Infections hépatiques
Norovirus
Diarrhée / gastro-entérite
Sapporovirus
Diarrhée / gastro-entérite
Rotavirus
Diarrhée / gastro-entérite
Astrovirus
Diarrhée
Diarrhée, infections oculaires et
Adenovirus
problèmes respiratoires
Reovirus
Problèmes respiratoires et entériques
Salmonella
Fièvre typhoïde et diarrhée
Shigelia
Diarrhée
Diarrhée (cause première des
Campylobacter
intoxications alimentaires)
Yersinia enterolitica
Diarrhée
Escherichia coli O157 :H7 et certaines Diarrhée risque de complications
autres souches
(urémie hémolytique) chez les enfants
Legionella pneumophila
Pneumonie et autres infections
Respiratoires
Naegleria
Méningo-encéphalite
Entomoeba histolytica
Dysenterie amibienne
Giardia lamblia
Diarrhée chronique
Cryptosporidium parvum
Diarrhée sévère, mortelle chez les
individus immunodéprimés
Cyclospora
Diarrhée
Microsporidies incluant Entercytozoan Diarrhées chroniques, affaiblissement,
spp., Encephalitozoan spp., Septata problèmes pulmonaires, oculaires,
spp., Pleistophora spp., Nosema spp musculaires et rénaux
Microcystis
Cyanobact éries
Anabaena
Aphanizomenon
Dinophysis
Phytoplancton toxique
Helminthes
Alexandrium
Ascaris lumbricoides
Diarrhée par ingestion des toxines
produites par ces organismes (la toxine
microcystine est impliquée dans des
Pathologies neurologiques liées à
l’ingestion de neurotoxines
Pathologies neurologiques liées à
l’ingestion de neurotoxines
Intoxications diarrhéiques
Pathologies neurologiques liées à
l’ingestion de neurotoxines
Ascariasis
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Serment de Galien
Je jure en présence des maîtres de cette faculté :
- D’honorer ceux qui m’ont instruit dans les préceptes de mon art et de
leur témoigner ma reconnaisse en restant fidèle à leur renseignement.
- D’exercer ma profession avec conscience, dans l’intérêt de la santé
public, sans jamais oublier ma responsabilité et mes devoirs envers le
malade et sa dignité humain.
- D’être fidèle dans l’exercice de la pharmacie à la législation en
vigueur, aux règles de l’honneur, de la probité et du désintéressement.
- De ne dévoiler à personne les secrets qui m’auraient été confiés ou
dont j’aurais eu connaissance dans l’exercice de ma profession, de ne
jamais consentir à utiliser mes connaissances et mon état pour
corrompre les mœurs et favoriser les actes criminels.
- Que les hommes m’accordent leur estime si je suis
fidèle à mes promesses, que je sois méprisé de mes
confrères si je manquais à mes engagements.
‫‬‫‬‫‬‫‬‫‬‫‪-‬‬
‫أن أراقب هللا فً مهنتً‬
‫أن أبجل أساتذتً الذٌن تعلمت على أٌدٌهم مبادئ مهنتً وأعترف لهم‬
‫بالجمٌل وأبقى دوما وفٌا لتعالٌمهم‪.‬‬
‫أن أزاول مهنتً بوازع من ضمٌري لما فٌه صالح الصحة العمومٌة‪ ،‬وأن‬
‫ال أقصر أبدا فً مسؤولٌتً وواجباتً تجاه المرٌض وكرامته اإلنسانٌة‪.‬‬
‫أن ألتزم أثناء ممارستً للصٌدلة بالقوانٌن المعمول بها وبأدب السلوك‬
‫والشرف‪ ،‬وكذا باالستقامة والترفع‪.‬‬
‫أن ال أفشً األسرار التً قد تعهد إلى أو التً قد أطلع علٌها أثناء القٌام‬
‫بمهامً‪ ،‬وأن ال أوافق على استعمال معلوماتً إلفساد األخالق أو تشجٌع‬
‫األعمال اإلجرامٌة‪.‬‬
‫ألحضى بتقدٌر الناس إن أنا تقٌدت بعهودي‪ ،‬أو أحتقر من طرف زمالئً‬
‫إن أنا لم أف بالتزاماتً‪.‬‬
‫شهٌد" "وهللا على ما أقول‬
‫جامعة محمد الخامس‬
‫كلية الطب والصيدلة بالرباط‬
‫أطروحة رقم ‪100 :‬‬
‫سىـت ‪20114‬‬
‫الجودة الميكروبيولوجية‬
‫لمياه السباحة‬
‫أطزوحت‬
‫قذمج وووقشج عالويت يوم ‪........................4‬‬
‫مه طزف‬
‫السيد‪ :‬العطيفي الودراسي علي‬
‫المشداد في ‪ 1321/00/22‬بالقصز الكبيز‪.‬‬
‫لـنـيـل شـهـادة الـدكـتـوراه فــي الصيدلة‬
‫الكلماث األساسيت‪ :‬مياه السباحة – التلوث – المخاطر الصحية‪.‬‬
‫ححج إشزاف اللجىت المكووت مه األساحذة‬
‫السيذ ‪ 4‬أحمذ كاوسي‬
‫أسخبر فٌ طب األطفبل‬
‫السيذ ‪ 4‬ميمون سهذي‬
‫أسخبر فٌ عهى األحَبء انذلَمت‬
‫السيذة ‪ 4‬سكيىت الحمشاوي‬
‫أسخبرة فٌ عهى األحَبء انذلَمت‬
‫السيذة ‪ 4‬سارة عوفي‬
‫أسخبرة يبشصة فٌ عهى انطفَهَبث‬
‫رئيس‬
‫مشزف‬
‫أعضاء‬