Détection et identification des souches de Campylobacter

Détection et identification des
souches de Campylobacter
Campylobacter est le principal agent causal des gastroentérites
d’origine bactérienne dans le monde industrialisé.
La campylobactériose s’accompagne de diarrhée, de
crampes abdominales, de vomissements et de fièvre.
Une dysenterie peut également s’installer. La bactérie
Campylobacter contamine les aliments et l’eau. La volaille constitue la principale source d’infection à Campylobacter chez l’homme. Entre 2,1 et 2,4 millions de cas
d’infection à Campylobacter sont déclarés aux ÉtatsUnis chaque année, et tout près de 1 000 décès.
Le défi
Il faut pouvoir détecter la bactérie pathogène Campylobacter afin d’en freiner la propagation, de traiter les cas
d’infection et d’en établir l’épidémiologie. Bien que la maladie
se déclare sporadiquement, des éclosions peuvent survenir. Il
importe d’identifier les souches de Campylobacter afin de pouvoir retracer l’historique de la transmission de la souche ou des souches incriminées et pour faciliter le rappel des aliments contaminés. La plupart des techniques
de détection et d’identification des souches de Campylobacter sont loin d’être
parfaites. Comme il s’agit d’une bactérie difficile à cultiver, on doit compter sur une
technologie de détection moins dépendante de l’amplification des échantillons. La
sensibilité de la méthode est également un facteur important. Les technologies actuelles d’identification des souches sont fondées sur le polymorphisme de restriction
(RFLP) ou les sondes d’ADN, et leur complexité limite leur emploi généralisé.
Il est urgent de mettre au point une trousse de détection sensible, rapide et facile à
utiliser, capable de déceler et d’identifier simultanément et avec un haut degré de
sensibilité toutes les espèces du genre Campylobacter.
La solution
Les chercheurs affiliés au Laboratoire national de microbiologie (LNM) à Winnipeg,
au Manitoba, ont mis au point une technologie simple et sensible de détection de
Campylobacter et d’identification des souches, qui produit des résultats spécifiques
reproductibles. La trousse permet, dans un délai de trois heures, de détecter la
bactérie et d’identifier simultanément les principales souches responsables de la
campylobactériose même à des concentrations infimes. La trousse n’utilise pas les
techniques complexes de RFLP ou de sondes d’ADN.
Aucune autre technologie ne permet de détecter et d’identifier simultanément un si
grand nombre d’espèces du genre Campylobacter.
Détection et identification des
souches de Campylobacter
La trousse du LNM fait appel à des épreuves multiplexes d’amplification par la polymérase (PCR) pour détecter simultanément dans un même essai les gènes caractéristiques de toutes les souches des espèces suivantes : C. jejuni, C. coli, C. lari, C.
upsaliensis et C. fetus. Les brins d’une molécule d’ADN sont séparés et servent de
matrice pour générer une molécule d’ADN identique à celle de départ. La trousse du
LNM renferme des amorces capables de se fixer à un brin d’ADN simple. Si un brin
d’ADN portant l’un des gènes d’intérêt se trouve dans l’échantillon analysé, l’amorce
complémentaire s’y apparie et le brin est régénéré, signalant la présence du gène et
la souche de Campylobacter qui lui est associée.
La trousse du LNM cible le gène hipO et le gène de l’ARNr 23S pour détecter C. jejuni,
le gène glyA pour détecter C. coli, C. lari et C. upsaliensis, et le gène sapB2 pour
détecter C. fetus. Elle renferme une solution d’amplification qui facilite la polymérisation des brins d’ADN et un témoin positif pour confirmer que l’essai se déroule dans
des conditions favorables à une telle polymérisation. On peut analyser en un seul
passage des échantillons d’aliments ou de selles que l’on croit contaminés par l’une
ou l’autre des espèces pathogènes du genre Campylobacter sans avoir à préparer les
échantillons ni à isoler les pathogènes.
L’occasion d’affaire
Le Laboratoire national de microbiologie a mis au point une trousse qui détecte la
bactérie Campylobacter et identifie la ou les souches présentes; elle répond à un
besoin pressant en offrant une épreuve de détection simple, utilisable par les laboratoires cliniques et sur les lieux d’inspection. Sa facilité d’utilisation, sa sensibilité et
sa fiabilité en font un outil dont on pourra se servir couramment dans les divers milieux de pratique et de recherche médicales et sur les lieux d’inspection des aliments
et d’analyse de l’eau. Elle se prête à des usages tant civils que militaires et pourrait
conquérir le marché mondial.
Nous invitons les investisseurs désirant faire fructifier cette technologie à
s’adresser au :
Bureau de la gestion de la propriété intellectuelle et du développement commercial
Laboratoire national de microbiologie
Agence de la santé publique du Canada
1015, rue Arlington, Winnipeg (Manitoba) R3E 3R2
Tél. : 204-789-2000
Téléc. : 204-789-2097
Courriel : [email protected]