Master Sciences du Vivant - UFR de Biologie Sujet de stage de Master 2 Recherche Année 2009/2010 Laboratoire : Institut de Biologie Structurale Intitulé de l'équipe : Laboratoire de RMN Directeur : Eva Pebay-Peyroula Responsable : Bernhard Brutscher Nom et qualité du responsable du stage : Jean-Pierre Simorre HDR oui non Catherine Bougault Adresse : 41 rue Jules Horowitz – 38027 Grenoble Cedex 1 Tél : 04-38-78-57-99 (ou 96-33) email :[email protected] ([email protected]) Spécialité MASTER : Biologie Cellulaire et Intégrative Biodiversité - Ecologie – Environnement Biochimie, Biologie Structurale Titre du sujet : Interactions protéine/peptidoglycane corrélées aux mécanismes bactériens de résistance aux antibiotiques Objectifs recherchés (3 lignes max) : Compréhension des interactions peptidoglycane – protéines pour développer de nouveaux antibiotiques Résumé (10 lignes max) : Si l’introduction des antibiotiques dans les pratiques médicales a considérablement réduit le taux de mortalité causé par les maladies infectieuses, les bactéries pathogènes ont développé des mécanismes de résistance de plus en plus complexes et efficaces à l’encontre des composés antibactériens usuellement utilisés. Sans équivalent chez les organismes eucaryotes, le peptidoglycane de la paroi bactérienne, ainsi que les systèmes enzymatiques liés à sa biosynthèse et à la morphogenèse de la cellule, constituent une cible idéale pour le développement de nouveaux antibiotiques. Nous proposons d’étudier, à la fois par RMN solide et liquide, l’interaction entre de nouvelles protéines potentiellement impliquées dans les phénomènes de biosynthèse/recyclage du peptidoglycane (ou dans la division bactérienne) avec des fragments ou des sacculi entiers formant la paroi bactérienne. Ces études seront menées en collaboration avec différents partenaires français et européens. Approches & matériel utilisés (3 lignes max) : Production d’échantillons protéiques et de peptidoglycane incluant des marquages isotopiques; étude des interactions par RMN liquide et solide Publications pertinentes de l'équipe (3 max) : 1) Boudet J., Chouquet A., Chahboune A., Giustini C., Joris B., Simorre J.-P., Bougault C. (2007) 1H, 13C, 15N resonance assignments of YajG, an Escherichia coli protein of unknown structure and function. J. Biomol NMR Assign, 1, 89-91. 2) Kern T., Hediger S., Müller P., Giustini C., Joris B., Bougault C., Vollmer W., Simorre J.-P. (2008) Toward the characterization of peptidoglycan structure and protein-peptidoglycan interactions by solid-state NMR spectroscopy. J. Am. Chem. Soc. 130,5618-5619. Domaines de compétences souhaités (quelques mots clés) : Pour BCI indiquez aussi la sous-spécialité (Biologie Végétale, Développement et Différenciation, Immunologie, Neurosciences, Physiologie, Microbiologie) Biologie structurale, Biochimie et biologie moléculaire