Examen cytobactériologique urinaire (ECBU) 18 juin 2009 Michelle BOYER L’examen cytobactériologique urinaire (ECBU) est l’analyse bactériologique la plus fréquemment pratiquée au laboratoire. 14 3 Indications • Situations d’infection urinaire (IU) sauf cystites aiguës simples d’évolution favorable. • Dépistage des colonisations: grossesse, chirurgie urinaire. NOMENCLATURE DES ACTES DE BIOLOGIE MEDICALE = 18€90 Etapes de l’ECBU: • Prélèvement, conservation • Examen direct (cellules, bactéries) • Culture, compte de germes. 1- Prélèvement, conservation • L’urine est normalement stérile. • Facilement contaminée par la flore commensale. • Toilette, élimination du 1er jet. • Flacon stérile • Temps de stase ( au moins 4h) • Problème des patients incontinents • Recueil chez l’enfant: milieu de jet, poches (= collecteur) à urines, moins de 30 mn • 2h à température ambiante • 24h à +4° • Jusqu’à 48h en flacon + borate Sinon: • Modification du compte de germe • Altération des cellules 2 - Examen direct Cytologie - bactériurie Etape capitale pour le dépistage et le diagnostic rapide (Afssaps) Résultat en urgence ( Pédiatrie) Leucocyturie et hématurie: • mesure microscopique • ou automatique Mesure quantitative Le seuil normal de la leucocyturie est de: 10/mm3 ou 104/ml Si le comptage est automatisé, normes fabricant: ex: 25/mm3 adulte, 10/mm3 enfant Le seuil de l’hématurie est de: 10/mm3 ou 104/ml Si le comptage est automatisé, normes fabricant: ex: 20/mm3 adulte, 10/mm3 enfant Autres éléments: Résultat semi-quantitatif • Cellules épithéliales • cristaux • Cylindres • Parasites Bactériurie: Résultat semi-quantitatif • Par microscopie (coloration de Gram) • ou automate + microscopie Le seuil de détection est de 105 UFC/ml identique pour les 2 techniques (microscopique ou automatique) La coloration de Gram donne une orientation sur le type de bactérie Exemples: Bacilles gram négatif polymicrobien • La présence de bactéries: Si + : ≥ 105 UFC/ml → Gram pour orientation du traitement Si - : < 105 UFC/ml, mais IU possible! Si flore variée (± cellules épithéliales): contamination • La présence de leucocytes: en faveur d’une IU si ≥ 10/mm3 ou ≥ 104 /ml +/- cylindres leucocytaires et amas de leucocytes ( pyurie) Mais… La leucocyturie peut être absente au cours d’authentiques IU: - prélèvement très précoce - patients neutropéniques - enfant de moins de 3 mois - lyse des leucocytes (conservation) Inversement… La leucocyturie peut être présente et non spécifique d’IU: ex: urétrite, vulvo-vaginite, maladie inflammatoire (Kawasaki), porteur de sonde, vessie neurologique… • L’absence de leucocyturie et de bactériurie a une excellente valeur prédictive négative ( proche de 100%) • La valeur prédictive positive est médiocre. 3 - Culture, identification, numération, antibiogramme La culture est nécessaire pour: • Préciser l’espèce bactérienne (IU mono ou bimicrobienne) • Réaliser l’antibiogramme Palmarès des bactéries ( CH de Roanne): • Escherichia coli 50% • Enterococcus sp. 10% • Proteus mirabilis 5% • Klebsiella pneumoniae 5% La numération de germes en UFC/ml est nécessaire à l’interprétation. Plusieurs seuils en fonction de la forme clinique et de l’espèce bactérienne. • ≥ 103 UFC/ml: cystites aiguës à E.coli et autres entérobactéries ou Staph. saprophyticus. • ≥ 105 UFC/ml: cystites à autres bactéries ( entérocoque) • ≥ 104 UFC/ml: pyélonéphrites et prostatites Interprétation de l’ECBU: doit prendre en compte • L’état clinique du patient (enfant < 3mois, personne âgée…) • Les conditions de réalisation du prélèvement. • L’existence d’une antibiothérapie. Cas particuliers: Symptômes urinaires + bactériurie à l’examen direct + culture stérile: → UI décapitée ( traitement ATB) → bactérie difficile à cultiver (ex:anaérobie) Si la leucocyturie est présente + absence de bactériurie à l’examen direct + culture stérile: → tuberculose → traitement antibiotique Prudence: Si la leucocyturie est absente et la bactériologie significative: → IU chez le jeune enfant, → IU chez le neutropénique, → IU lorsque le prélèvement est très précoce Très souvent: Chez une femme: nombreuses cellules épithéliales + bacilles Gram positif (lactobacilles) à l’examen direct + culture (103 ou 104 UFC/ml) flore polymorphe : → contamination vaginale