L’endocardite infectieuse: maladie fréquente et grave Le diagnostic microbiologique : apport précieux Optimiser le diagnostic microbiologique: Bonne pratique des hémocultures et de l’examen microbiologique des valves cardiaques La microbiologie des endocardites infectieuses s’est modifiée Comment? 1/ Amélioration des systèmes d’hémocultures: Modernisation (automatisation) Optimisation de la composition des milieux de culture ( cysteine; phosphate de pyridoxal) 2/ Développement des techniques moléculaires (Bartonella, Tropheryma,….) Les streptocoques- les entérocoques: -Nbreuses espèces commensales de la cavité buccale et des voies respiratoires ( S. mitis, S.sanguinis, S.gordonii, S.oralis) - Les streptocoques d’origine digestive (SGD, SGB) et les entérocoques. - Les streptocoques à croissance difficile, dits « streptocoques déficients », 2 genres: Abiotrophia , Granulicatella. HC négatives / Rce aux ATB: échec thérapeutique Les staphylocoques: S. aureus+++ SCN *valve native ou sur valvulopathie non connue S. epidermidis S. lugdunensis!! ( EI très rare mais très grave) Si mauvaise identification: S. lugdunensis=S. epidermidis: conséquence grave sur la prise en charge; * Identification complète au niveau de l’espèce+++ *Porte d’entrée cutanée (endocardites du toxicomane à Staphylocoques du cœur droit) Porteurs de catheters veineux Les bactéries à développement intracellulaire (HC négative +++) -Bartonella ( B. quintana/ B. henselae) Sérologie , PCR - Coxiella Burnetti (fièvre Q) Sérogie, PCR -Tropheryma whipplei ( mdie de Wipple) PCR -Chlamydia, exceptionnelle Les bactéries du groupe HACCEK: -BGN d’origine buccale: Haemophilus (infulenzae, aphrophilus, parainfluenzae, paraphrophilus) Actinobacillus Cardiobacterium hominis Capnocytophaga Eikenella corroden Kingella (kingae, denitrificans) -Croissance extrêmement lente (3 à 4 semaines d’incubation) et exigente ( subcultures sur milieux enrichis) Autres: legionella, brucella, entérobactéries.. 1/ les hémocultures Un flacon anaérobie et un autre aérobie Les milieux: permettent l’isolement des bactéries les plus souvent responsables d’endocardite (Staphylococque, Entérocoques et Streptocoques) • • Doivent contenir de l’hémine et du nicotinamide-adéninedinucléotide (HACCEK) Des radicaux thiols (L-cystéine): les streptocoques déficients Eviter les contaminants: -L’antisepsie de la peau: 1à 2 min de contact avec l’antiseptique (alcool à70° puis produit iodé) -La désinfection du capuchon du flacon d’hémoculture( alcool à 70° ou produit iodé) qu’on laisse sécher avant usage. -Ponction veineuse++; jamais de recueils de sang par cathéter prélever une quantité de sang suffisante: -la densité des bactéries présentes dans le sang est généralement faible -Chez l’enfant cette densité est plus importante -il existe une relation directe entre le volume de sang inoculé dans les flacons et le rendement de la technique -10ml chez l’adulte, 2à 3 ml chez l’enfant -!! Prendre en considération la dilution de sang dans le bouillon (1/10): atténue l’effet de nombreux facteurs antibactériens Effectuer le nombre d’hémocultures nécessaire: Endocardite : bactériémie permanente 3 séries d’hémoculture séparées de 30 à 60 min Hémocultures et antibiothérapie: Prélever les hémocultures avant antibiothérapie Systèmes d’hémoculture supposés neutraliser l’effet des antibiotiques: coût exorbitant, utilisation fastidieuse, pas de réel apport Examen et durée d’incubation des flacons d’hémocultures: -Suspicion d’endocardite: informer le laboratoire de microbiologie -les flacons sont inspectés en vue de rechercher des signes de croissance 2 fois par jour -flacons diphasique ( castaneda) pour certaines espèces ( Neisseria, haemophilus) Repiquage systématique précoce (72H) sur des milieux enrichis Prolongation de la période d’incubation jusqu’à 45j Résultats des hémocultures: -Dès la positivité de l’hémoculture: ED et communication des résultats ( cocci, bacille) : orientation de l’antibiothérapie -les bactéries varient selon le type d’endocardite mais restent dominées par les cocci à Gram positif Si les hc demeurent négatives: *bactéries intracellulaires facultatives (Bartonella, Legionella,Mycobacterium) Le prélévement devrait être réalisé sur tube pour technique de centrifigation lyse ( type tube DuPont-Isolator) Puis inoculer sur des milieux de culture spécifique *bactéries ne cultivant pas sur milieux acellulaires Sérologie, PCR 2/Examen microbiologique des valves Si chirurgie ou autopsie - Étude histologique ( infiltrat inflammatoire, végétations) - Etude bactériologique Valve recueillie dans un pot stérile ne contenant aucun liquide Transport rapide Broyeur stérile + qq gttes de BHI Examen direct après coloration de Gram Ensemencement de milieux gélosés enrichis adaptés Ensemencement dans des flacons d’hémocultures Biologie moléculaire Le reste de la suspension: -80°C (examens en immunofluorescence directe/ cultures sur systèmes cellulaires 1/EI à hémocultures positives: -majoritaires ( 85%) Streptocoques, entérocoque et staphylocoques L’identification de l’éspèce n’est pas facile Les galeries phénotypiques insuffisante: séquençage de certains gènes (Abiotrophia defectivia ou Granulicatella adiacens) 2/ EI à hémocultures « négativées » ( par les antibiotiques) L’utilisation d’hémocultures contenant des résines adsorbant les ATB : apport limité 3/ EI à hémocultures souvent négatives: Microorganismes à croissance lente ou difficile Streptocoques déficients, HACEK, Brucella, champignons Amélioration du diagnostic: 4 semaines d’incubation, subcultures appropriées 4/ EI à HC conventionnelles toujours négatives Bartonella, Chlamydia, Coxiella, Tropheryma whipplei Sérologie Diagnostic moléculaire Culture cellulaire 5/ EI sans micro-organisme identifiable Contexte clinique, echographique et biologique et en absence de toute antibiothérapie, aucune des méthodes de diagnostic microbiologique n’aboutit à l’identification de micro-organisme Dans notre pratique hospitalière: Effectuer les hémocultures de manière rigoureuse Quand la microbiologie conventionnelle n’est pas concluante penser aux germes inhabituels Optimiser le diagnostic microbiologique par les méthodes moléculaires Si chirurgie, faire toujours un examen histologique et un autre bactériologique des valves