Lire la résistance aux antibiotiques directement dans les gènes
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Date: 27.10.2016 Le Temps 1002 Lausanne 021 331 78 00 www.letemps.ch Genre de média: Médias imprimés Type de média: Presse journ./hebd. Tirage: 36'802 Parution: 6x/semaine N° de thème: 525.004 N° d'abonnement: 1073491 Page: 10 Surface: 48'802 mm² Lire la résistance aux antibiotiques directement dans les gènes bactériens -wu_ Faute d'identification rapide des résistances bactériennes, les médecins ont recours aux antibiotiques à Large spectre. (123RF) NATHALIE JOLLIEN @NathalieJoll MÉDECINE Repérer, en cas d'in- l'identification précise de gènes fection, toutes les résistances aux de résistance inclus dans le antibiotiques dans le génome de génome des bactéries. Le problème est que les moyens bactéries, afin d'utiliser les molécules les plus efficaces: des méde- actuels pour déterminer la nature temps de l'ordre de l'heure, la vie du patient étant en jeu. C'est le cas notamment pour les septicémies - infections généralisées de l'organisme - ou pour les infections cins genevois développent une de l'infection bactérienne datent sévères des patients immunosupapproche novatrice pour lutter d'une autre ère. Aujourd'hui primés comme les transplantés. contre ces organismes toujours encore, les bactéries sont mises Dans ces cas, le premier geste des en culture pour être identifiées, plus coriaces comme le faisait au XIXe siècle médecins est donc de prescrire un Le phénomène de résistances Louis Pasteur, pionnier de la antibiotique à large spectre qui est aux antibiotiques est un problème microbiologie. La croissance des efficace sur un grand nombre de de santé de première importance. bactéries prélevées sur le patient bactéries. Il faut ensuite attendre Le secrétaire général de l'Organi- est testée dans des milieux conte- l'identification des bactéries et de sation des Nations unies (ONU), nant divers antibiotiques. Si les leurs éventuelles résistances pour Ban Ki-moon, le qualifie même de bactéries ne se développent pas pouvoir choisir un antibiotique «menace fondamentale». A tel dans un milieu précis, c'est que spécifique et combattre l'infection point que l'ONU a traité cette pro- l'antibiotique y est efficace. Il sera de manière ciblée. blématique lors de son assemblée alors prescrit au patient. Mais le Un des inconvénients des antigénérale, en septembre dernier. temps nécessaire pour la réalisa- biotiques à large spectre est qu'ils Aux HUG, une équipe de cher- tion de ces tests n'est pas néglicheurs développe de nouvelles geable: plusieurs jours en approches en vue d'enrayer la moyenne. menace. Leur technique pourrait Or, lors d'une infection bactépermettre de prescrire des anti- rienne grave, le traitement doit se biotiques spécifiques grâce à faire en urgence dans un laps de Observation des médias Analyse des médias Gestion de l'information Services linguistiques ne détruisent pas seulement les bactéries responsables de l'infection. Toutes les autres bactéries inoffensives composant le microbiote (la flore bactérienne natu- relle) le sont également. Seules restent les éventuelles bactéries ARGUS der Presse AG Rüdigerstrasse 15, case postale, 8027 Zurich Tél. 044 388 82 00, Fax 044 388 82 01 www.argus.ch Réf. Argus: 63194971 Coupure Page: 1/2 Date: 27.10.2016 Le Temps 1002 Lausanne 021 331 78 00 www.letemps.ch Genre de média: Médias imprimés Type de média: Presse journ./hebd. Tirage: 36'802 Parution: 6x/semaine N° de thème: 525.004 N° d'abonnement: 1073491 Page: 10 Surface: 48'802 mm² du Laboratoire de recherche du Laboratoire d'épidémiologie tion génétique leur conférant la génomique genevois, explique: du CHUV. C'est notamment le cas capacité de ne pas être détruites. «L'idée est d'aller chercher cette pour le staphylocoque doré, qui Dans le cas où de tels organismes information directement dans est dans le top trois des bactéries existent, ils sont alors favorisés leurs gènes. C'est comme cher- responsables d'infections.» par l'antibiotique et vont se mul- cher une aiguille dans une botte «Bien sûr, ce n'est pas toujours tiplier. Le risque étant ensuite que de foin: un échantillon provenant aussi simple, remarque Jacques cette multiplication provoque une d'un patient contient beaucoup Schrenzel. Parfois, il suffit d'une nouvelle infection de l'organisme, plus de cellules humaines que de ou deux mutations dans un gène voire que les bactéries résistantes cellules bactériennes. Un de nos d'importance pour qu'une résisaxes de recherche vise donc tance apparaisse, elles ne sont pas soient transmises à autrui. d'abord à pouvoir facilement iso- forcément faciles à détecter. Et ler l'ADN des bactéries.» tous les mécanismes de résisIdentifier Le «résistome» Afin de pouvoir identifier plus Puis vient l'étape du séquençage tance ne sont pas encore connus.» rapidement les bactéries résis- du génome. Des techniques dites L'approche génétique comporte tantes et utiliser le bon antibio- de nouvelle génération, utilisées aussi ses lacunes. «Tout n'est pas tique, des scientifiques des HUG depuis 2005 environ, permettent visible dans les gènes, rapdéveloppent actuellement diffé- d'obtenir un génome très rapide- pelle-t-il. Une structure peut être rentes techniques. Jacques ment et à moindre coût. Une fois existante mais pas forcément Schrenzel, médecin responsable séquencé, il faut pouvoir y déce- activée. Dans le cas des pompes ler des signes de résistance aux cellulaires, qui permettent d'évaLes moyens actuels antibiotiques. Pour cela, l'équipe cuer des substances comme les des HUG a développé un algo- antibiotiques par exemple, notre rithme qui recherche des approche permet de savoir si ces séquences précises que l'on sait pompes existent mais pas si elles correspondre à des résistances fonctionnent.» résistantes, porteuses d'une muta- pour déterminer la nature de l'infection bactérienne datent d'une autre ère Pour l'heure, ces techniques autrement dit l'ensemble des sont encore en développement. gènes de résistance, est bien «Mais une grande étude visant à aux antibiotiques. «Le résistome, connu pour certaines bactéries, valider l'approche est en cours», explique Dominique Blanc, chef conclut Jacques Schrenzel. - Observation des médias Analyse des médias Gestion de l'information Services linguistiques ARGUS der Presse AG Rüdigerstrasse 15, case postale, 8027 Zurich Tél. 044 388 82 00, Fax 044 388 82 01 www.argus.ch Réf. Argus: 63194971 Coupure Page: 2/2
