Métabolisme des glucides CYCLE DE KREBS I. HISTORIQUE Le cycle de Krebs a été élucidé grâce aux travaux de Hans Krebs 1937. prix Nobel de médecine en 1953. II. DÉFINITION Le cycle de Krebs (ou de l’acide citrique) est la voie terminale d’oxydation du glucose et d’autres molécules énergétiques (acides aminés, acides gras). L’Acétyl‐CoA est l’intermédiaire commun de dégradation de glucides, acides aminés et acides gras et la molécule qui entre dans le cycle. Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 1 Métabolisme des glucides III. LOCALISATION DU CYCLE DE KREBS La décarboxylation du pyruvate pour former l’Acétyl‐CoA et toutes les réactions de la voie ont lieu dans la matrice mitochondriale. Chez les procaryotes, ce cycle se déroule dans le cytosol (pas de mitochondries) IV. ENTRÉE DU PYRUVATE DANS LA MITOCHONDRIE Une protéine membranaire transporteuse d'anions organiques transporte le pyruvate à travers la membrane interne en même temps qu'un ion Potassium chargé positivement. V. SYNTHÈSE DE L’ACÉTYL‐COA Après l’entrée du pyruvate dans la mitochondrie, sa décarboxylation oxydative par la pyruvate déshydrogénase entraine la formation d’une molécule énergétiquement activée (acétyl‐CoA) et NADH Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 2 Métabolisme des glucides Cette réaction est irréversible. L’acétyl-CoA intégrera le cycle de Krebs, ou sera le précurseur de la synthèse des lipides PYRUVATE DÉSHYDROGÉNASE Complexe multienzymatique: Pyruvate déshydrogénase est composée de plusieurs sousunités Cofacteurs de la pyruvate déshydrogénase: • la Thiamine (nécessaire pour la décarboxylation). • FAD et NAD+ (oxydoréduction) • Coenzyme A (transporteur d’acyle) • Acide lipoïque Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 3 Métabolisme des glucides VI. LES DIFERENTES ETAPES DU CYCLE DE KREBS 8 réactions l’oxydation complète de l’acétyl‐CoA récupération de l’énergie sous forme de NADH, FADH2 et GTP Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 4 Métabolisme des glucides RÉACTION 1: Synthèse du citrate Réaction de condensation entre l’acétyl coA et l’Oxaloacétate ; Catalysée par la citrate synthase Réaction irréversible ; l’une des étapes de régulation du cycle Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 5 Métabolisme des glucides Isocitrate RÉACTION 2: Isomérisation du citrate Le citrate est isomérisé en isocitrate Catalysée par la cis‐aconitase Se déroule en deux étapes: Déshydratation pour former cis‐Aconitate Hydratation pour former isocitrate RÉACTION 3: Décarboxylation Oxydative de l’Isocitrate en α-Cétoglutarate Déshydrogénation de l’Isocitrate en oxalosuccinate (instable) Décarboxylation de l’oxalosuccinate en α-cétoglutarate Catalysée par l’isocitrate déshydrogénase a coenzyme NAD irréversible et limitante Oxalosuccinate α-Cétoglutarate RÉACTION 4: Décarboxylation oxydative de l’α cétoglutarte en succinyl –coA α-Cétoglutarate déshydrogénase est un complexe enzymatique très similaire à la Pyruvate déshydrogénase. Réaction irréversible Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 6 Métabolisme des glucides α-Cétoglutarate Succinyl CoA RÉACTION 5: FORMATION DU SUCCINATE La Succinyl‐CoA synthétase , utilise la liaison riche en énergie du succinyl‐CoenzymeA pour synthétiser du GTP à partir de GDP et phosphate inorganique (Pi). Cette étape (réversible) est la seule du cycle à fournir directement une liaison riche en énergie. Le GTP peut facilement transférer son phosphore à l’ADP: GTP + ADP GDP + ATP RÉACTION 6: Déshydrogénation du Succinate en Fumarate Le Succinate est oxydé en fumarate Catalysée par la succinate déshydrogénase, cofacteur FAD (flavine adénine dinucléotide). Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 7 Métabolisme des glucides RÉACTION 7: Hydratation du Fumarate en L-malate Hydratation du fumarate en L‐malate. La fumarase réversible. Intermédiaire carbanion Fumarate Malate RÉACTION 8: Régénération de l’oxaloacétate L'oxydation du malate en oxaloacétate Catalysée par la Malate déshydrogénase Couplée à la réduction du NAD+ en NADH, H+ malate oxaloacétate Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 8 Métabolisme des glucides VII. BILAN DU CYCLE DE KREBS Les NADH,H+ et FADH2 formés sont oxydés par la chaine de transport des électrons générant ainsi (03) molécules d’ ATP par molécule de NADH oxydée et deux (02) d’ATP par molécule de FADH2 oxydée 1 GTP ---------------------- > 1 ATP 3 NADH --------------------> 3x 3 ATP 1 FADH2 --------------------> 2 ATP Au total 12 molécules d’ATP sont formées lors de l’oxydation d’une molécule d’ acétyl CoA en Co2 par tour de cycle . Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 9 Métabolisme des glucides Bilan énergétique de l’oxydation complète du glucose en CO2 : 38 molécules d ’ATP VIII. RÉGULATION DU CYCLE DE KREBS Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 10 Métabolisme des glucides 1. Régulation au niveau de La pyruvate déshydrogénase: est Inhibée par le produit (compétitive) acetyl‐CoA, NADH; ATP est un inhibiteur allostérique. Régulation par modification covalente : l’enzyme peut exister sous deux formes: une forme active non phosphorylée et une forme inactive phosphorylée. 2. Régulation au niveau de la citrate synthase ATP est un inhibiteur allostérique de la citrate synthase; inhibition à rétro‐contrôle compétitif par le succinyl‐CoA. 3. Régulation au niveau de l’isocitrate déshydrogénase ATP est un inhibiteur allostérique de la Isocitrate déshydrogénase, tandis que l’ADP est un activateur; NADH inhibiteur compétitif (produit). 4. Régulation au niveau α cétoglutarate déshydrogénase Inhibition compétitive de l’ α cétoglutarate DSHase par le produit succinyl‐CoA et le NADH. Université de Mostaganem – Faculté de médecine – Pr Benchikh (2014-2015) Page 11