sujet de stage n° 7

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Master 2 R et P : Spécialité MRESTE
Méthodes de Recherche en Environnement - Santé – Toxicologie - Ecotoxicologie
Mention ISM, Ingénieries pour la Santé et le Médicament
Responsable : Pr Anne MAITRE : TIMC-EPSP, UJF/UFR Médecine, CHU Grenoble
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Référent Toxicologie et Modélisation : Dominique BICOUT : TIMC-EPSP, UJF/VETAGROSUP Lyon
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Référent Ecotoxicologie : Muriel RAVETON : LECA-P3E, UJF/UFR Biologie
SUJET DE STAGE N° 7
Numéro et type de labellisation du laboratoire d’accueil : UMR 13000 BioEpAR, Oniris, Nantes
Ecole doctorale de rattachement :
Nom du laboratoire : Equipe MODEC « Modélisation et décision en santé animale » dans l'unité BioEpAR
« Bioagression, Épidémiologie et Analyse de Risques »
Adresse du laboratoire :
Athlanpole La Chanterie, BP 40706, 44307 Nantes cedex 3
Nom du responsable du stage et coordonnées (tél, fax, email) :
- Catherine Belloc (MC, UMR BioEpAR / équipe MODEC)
Contact : téléphone : 02.40.68.77.91 – e-mail : [email protected]
- Suzanne Touzeau (CR, UR Mathématique et Informatique Appliquées / équipe DynEnVie)
- Natacha Go (Doctorante, UR MIA & BioEpAR
Contact : téléphone : 02.40.68.78.59 – 06.09.46.09.10 – e-mail : [email protected] ou [email protected]
TITRE DU SUJET
Étude des interactions entre le virus de l'Influenza et les cellules de la réponse immunitaire innée par une
approche de modélisation.
PROBLEMATIQUE
Les maladies respiratoires sont un problème majeur de santé publique et animale et maîtriser leur gravité est un enjeu.
Dans le cas d'une origine est infectieuse, limiter l'inflammation des tissus pulmonaires tout en conservant une réponse
immunitaire efficace est la stratégie optimale. Dans cet objectif, une bonne compréhension des interactions qui ont lieu
entre l'agent pathogène et les cellules immunitaires, en particulier celles responsables de l'inflammation (macrophages et
cellules dendritiques), est nécessaire. Ceci est d’autant plus pertinent lorsque l'agent pathogène a pour cellule cible les
macrophages et/ou cellules dendritiques, acteurs clefs de la réponse immunitaire innée. Or, ces interactions sont encore
mal connues, et leur maîtrise et de ce fait compromise. Vue la complexité des mécanismes immunitaires, et la grande
variabilité des réponses inter-individuelle et inter-souches, l'approche modélisatrice présente un intérêt pour explorer les
mécanismes d'interaction entre le virus est les cellules immunitaires, en complément d'études expérimentales et
observationnelles.
Le virus influenza est une entité pertinente pour l'étude de ces interactions. Il touche 10 à 20 % de la population
mondiale en saison épidemique. Il affecte également plusieurs filières de production animale : en élevages porcins par
exemple, on estime qu’environ 25 % des animaux sont infectés à l'échelle mondiale. Il provoque d'importants troubles
respiratoires et se réplique principalement dans les cellules de l'épithélium respiratoire (incluant des macrophages et des
cellules dendritiques).
OBJECTIFS
–
d'apporter des connaissances dans la compréhension des mécanismes immunitaires innées lors d'une infection
par le virus influenza,
–
de tester différentes hypothèses de gestion de l'infection favorisant la réponse immunitaire tout en limitant
l'inflammation.
util utilisé sera un modèle mathématique dynamique déterministe non-linéaire adapté à partir d'un modèle pré-existant
développé pour un autre virus porcin responsable de troubles respiratoire
Secrétariat pédagogique : [email protected]
UFR de Médecine – Domaine de la Merci – 38706 La Tronche cedex – France - Tél : (0)4.76.63.75.01 – Fax : (0)4.76.63.75.02
PRINCIPES DU PROTOCOLE
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La première étape sera de s'approprier le modèle existant.
–
La seconde étape sera de l'adapter au virus Influenza (tant pour les mécanismes à représenter que pour les
valeurs des paramètres du modèle).
–
La dernière étape sera d'exploiter ce modèle en testant différentes hypothèses (paramètres et variables
exogènes) pouvant influencer la réponse immunitaire et la dynamique intra-hôte de l'infection.
Mots Clés (5 max) :
Dominante du sujet :
1) expérimentale de laboratoire,
Précisez la(les) dominante(s) :
2) expérimentale de terrain,
3) épidémiologie de terrain,
4) traitement de données.
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