Laurent FINET, Dorothée OXOBY
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Lille Laurent FINET, Dorothée OXOBY ORGANISATION STRUCTURALE DES PROTEINES Travaux des Actions Académiques Mutualisées • Première STL-BGB Niveau Thème du programme Situations • 1STL CBSV, Thème 1, chapitre 1.5: Les molécules des organismes vivants présentent des structures et des propriétés spécifiques. • 1STL ANGLAIS TECHNO: écoute et/ou lecture d'un commentaire d'animation. • AT de CBSV : Découverte des différentes structures des protéines à travers une animation et un commentaire en anglais. pédagogiques • https://mywebspace.wisc.edu/jonovic/web/proteins/Proteins.swf Liens internet Compétences B2i Matériels TICE Mots clés • Domaine 1 : s'approprier un environnement informatique de travail. • Domaine 3 : créer, produire, traiter , exploiter des données. • Domaine 4 : s'informer et se documenter. • Un poste PC par binôme • Une connexion internet • Logiciel de traitement de texte • Acides aminés, structures primaire, secondaire, tertiaire, quaternaire, liaisons hydrogènes, liaisons électrostatiques, intéractions hydrophobes, ponts disulfures... • structure des acides aminés, ionisation des acides aminés Approfondir Page 1 Lille Laurent FINET, Dorothée OXOBY Activité n° 1 Synthèse et structure primaire des protéines Animation 1 : Objectifs Durée conseillée Consignes • Découvrir l'origine de l'enchaînement des acides aminés dans la structure primaire des protéines. Animation 2 : • 15 minutes •Cliquer sur l'image pour accéder à l'animation sur la structure des protéines. Répondre aux questions ci-dessous en utilisant comme support de réponse un document de type traitement de texte. Schéma 1 : Questions 1- A partir de l’animation n°1, quel est l’organite qui permet la synthèse des protéines au sein des cellules ? 2- Que représentent les lettres sur l’ARN messager ? 3- L’enchaînement des acides aminés est-il dû au hasard ? Justifier. 4- A partir du schéma n°1 qui présente la liaison peptidique, citer les fonctions chimiques mises en jeu dans la formation de cette liaison. 5- Comment sont classés les acides aminés dans la partie acides aminés de l’animation 2? Complément : une autre animation est disponible sur la transcription (de l’ADN à l’ARN): http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/ADN_Prot/ADN_ARN/ADN_ARN.swf Page 2 Lille Laurent FINET, Dorothée OXOBY Activité n° 2 Structure secondaire des protéines Objectifs •Comprendre le mécanisme de formation des deux structures principales (hélice alpha et feuillet béta) Durée conseillée • 15 minutes Consigne • Poursuivre l'animation n°1 et répondre aux questions ci-dessous en utilisant comme support de réponse un document de type traitement de texte. Questions 1- D’après l’animation 2, quels sont les deux types d’organisation de structure secondaire ? 2- Quelles sont les liaisons qui permettent la formation et le maintien de ces structures ? Entre quels atomes se forment-elles ? 3- De quel type de liaison s’agit-il ? 4- Est-ce que les 4 types d’acides aminés sont impliqués dans ce type de liaison ? 5- Que signifie le terme « antiparallèle » ? Page 3 Lille Laurent FINET, Dorothée OXOBY Activité n° 3 Les structures tertiaire et quaternaire Objectifs • Comprendre le mécanisme de formation de la structure tertiaire. Durée conseillée • 15 minutes Consigne • Poursuivre l'animation n°1 et répondre aux questions ci-dessous en utilisant comme support de réponse un document de type traitement de texte. Questions 1- D’après l’animation 2 dans la partie structure des protéines, quel est le seul acide aminé mis en jeu dans la formation du pont disulfure ? 2- De quel type de liaison s’agit-il ? 3- Justifier la localisation des domaines hydrophobes et hydrophiles. 4- Quelles sont les deux autres interactions mises en jeu dans la formation de la structure tertiaire ? 5- Quels sont les acides aminés impliqués dans ces deux autres interactions ? Justifier. 6- Quel est le but de la formation de ces différentes interactions ? 7- Décrire la structure quaternaire. Page 4
