texte de la publicite

TEXTE DE LA PUBLICITE
Titre :
Analyse fonctionnelle du transcriptome de 2 espèces d insectes lépidoptères pour BIVI-Montpellier
Objet détaillé :
Analyse fonctionnelle du transcriptome de 2 espèces d’insectes lépidoptères pour BIVI du centre de Montpellier est un Projet
en 4 parties :
I. Transcriptome de référence pour le lépidoptère Ostrinia sp.
II. Analyse du transcriptome du lépidoptère Ostrinia sp. dans 8 conditions différentes (RNA seq)
III. Analyse du transcriptome du lépidoptère Spodoptera sp. dans 10 conditions différentes (RNA seq)
IV. Analyse des petits ARNs du lépidoptère Spodoptera sp. dans 2 conditions différentes
Unité administrative :
UMR1231BIVI
Code référentiel inter EPST :
52.54
Caractéristiques du besoin (description, lieu d’exécution, durée, volume, etc.) :
Projet en 4 parties, comme indiqué ci-dessous
I. Transcriptome de référence pour le lépidoptère Ostrinia sp.
I.1. Banque normalisée à partir d’ARN totaux
I.2. Séquençage 454
II. Analyse du transcriptome du lépidoptère Ostrinia sp. dans 8 conditions différentes (RNA seq)
II.1. Banque ADNc (8 échantillons) à partir d’ARN totaux
II.2. Séquençage Illumina 36 bases : 4 séquençages (2 échantillons/séquençage)
II.3. Analyse bio-informatique (mapping sur le transcriptome 454 ci-dessus ; analyse des SNPs)
III. Analyse du transcriptome du lépidoptère Spodoptera sp. dans 10 conditions différentes (RNA seq)
III.1. Banque ADNc (10 échantillons) à partir d’ARN totaux
III.2 option A. Séquençage Illumina 36 bases : 1 séquençage (2 échantillons/séquençage) + 8 séquençages (1
échantillon/séquençage)
III.2 option B. Séquençage Illumina 36 bases : 3 séquençages (2 échantillons/séquençage) + 4 séquençages (1
échantillon/séquençage)
III.3. Analyse bio-informatique (mapping sur 2 transcriptomes 454 déjà disponibles et sur 1 génome)
IV. Analyse des petits ARNs du lépidoptère Spodoptera sp. dans 2 conditions différentes
IV.1. Banque miRNA (15-50 bases) à partir d’ARN totaux
IV.2. Séquençage Illumina 36 bases : 1 séquençage (2 échantillons/séquençage)
IV.3. Analyse bio-informatique (mapping sur 2 transcriptomes déjà 454 disponibles et sur 1 génome)
L’attendu est un nombre suffisant de lectures permettant une quantification relative des transcrits présents dans les
échantillons.
Proposer un devis en respectant les 4 parties de façon distincte. Pour la partie 2, le candidat indiquera le montant de base et
montant pour chaque option.
Lieu de livraison : UMR1231 (BIVI) Université Montpellier 2 - Case Courrier 101 -Place Eugène Bataillon -34 095
Montpellier Cedex 5
Date souhaitée pour la livraison des résultats : novembre 2010
Adresse où l’on peut retirer un dossier (le cas échéant) :
Sans objet.
Le texte de la publicité et la déclaration du candidat (DC5 à remplir et à joindre à l’offre) sont joints à la présente.
Remise des candidatures/offres (à préciser) et date limite de remise :
L'adresse où doivent parvenir les offres est la suivante :
UMR1231 (BIVI) Université Montpellier 2 - Case Courrier 101 -Place Eugène Bataillon -34 095 Montpellier Cedex 5
Date limite de remise des offres : 13 août 2010 avant 16 H 00.
Critères de sélection :
Valeur technique (40%) note sur 20
Prix (30%) note sur 20
Délai de livraison des résultats (30%) note sur 20
Contact principal :
Pour les questions d’ordre technique : Nathalie VOLKOFF – Tél. : +33 (0)4 67 14 41 18 – Fax : +33 (0)4 67 14 42 99 –
Courriel : [email protected]
Autre contact (nom, prénom, adresse, tel, fax, courriel) :
D’ordre administratif : Tél : 04.99.61.27.67 – Fax :04.99.61.30.48 – Courriel : [email protected]