CYCLES BIOGEOCHIMIQUES DU FER ET DU MANGANESE ET CONTROLES MICROBIENS Alain Préat & David C. Gillan Fe3+ Mn4+ Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Laboratoire de Biologie marine CP 160/15 [email protected] Plan de la partie microbiologie : 1. Micro-organismes : introduction et définitions. 2. Bioénergétique microbienne; particularités du Fe et Mn. 3. Architecture des parois et membrannes cellulaires (EPS, gaines, capsules) 4. Architecture des biofilms et des communautés microbiennes. 5. Importance des métaux pour les micro-organismes. 6. Types d’interactions entre métaux et biofilms. 7. Ferrobactéries et manganobactéries (taxonomie) 8. Exemples actuels de communautés microbiennes incrustées de Fe et de Mn Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Chaînes transporteuses d’électrons H2 = 2H+ + 2eH+ H+ Extérieur Intérieur Hydrogénase H+ ATPase H+ Q cyt b cyt c cyt a OH- OH- OH1/2 O2 ADP ATP H2O H+ Théorie chimio-osmotique (Peter Mitchell 1961) Etablissement d’une force proton-motrice (fpm) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 5. Importance des métaux pour les micro-organismes Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Importance des métaux pour micro-organismes • Génération d’énergie (voir 1ere partie) • Métalloenzymes Cuivre Superoxyde dismutase : SOD (Cu/Zn) Cytochrome oxydase = complexe IV (Fe et Cu) 1/2O2 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb + 2e- + 2H+ = H2O O2 Etat de base = oxygène triplet O=O 1s22s22p4 2 e- non appariés dans 2 orbitales moléculaires dégénérées (orbitales antiliantes) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb O2 = bon accepteur d’électrons ROS = Reactive Oxygen Species Très réactif : destruction lipides, DNA, etc... Très longue durée de vie O2- + O2- SOD + 2H+ = H2O2 + O2 Catalase H2O2 + H2O2 = 2H2O + O2 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Zinc Superoxyde dismutase : SOD (Cu/Zn) DNA polymérase, RNA polymérase Protéines à doigt Zn (interaction DNA) Carboxypeptidase A Phosphatase alcaline Hydrolyse extrémité C des protéines Hydrolye groupes phosphates Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb H2 Nickel Hydrogénases (Ni-Fe) Uréase (urée + H2O CO2 + 2NH3) Cofacteur F430 (coupure groupes méthyles, bact. méthanogènes) Cobalt Vitamine B12 Nitriles hydratases R-C N + H2O → R-C(O)NH2 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Manganèse Photosystème II Superoxide dismutase à Mn Fer Superoxyde dismutase à Fe : Fe-SOD Nitrogénases (Fixation N2) Cytochromes a, b, c : hèmes (transport d’e-) Protéines Fe-S (transport d’e-) : ferredoxines Cyt-Fe2+ = Cyt-Fe3+ + e- Fe Anneau porphyrine Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Molybdène Molybdoflavoprotéines (réduction nitrate) Nitrogénases (Fixation N2) N N N2 + 6H+ + énergie = 2NH3 Tungstène (W) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Formate déshydrogénase (métabolisme anaérobie) Métaux “non-essentiels” (pas de métalloenzymes connus) Vanadium (V) Peut remplacer le Mo dans Nitrogénases Oxyanion toxique car ressemble au PO43(vanadate : VO43- ) Chrome (Cr) Bcp bact. capables de le réduire: Cr(VI) Cr(III) Oxyanion toxique car ressemble au SO42(chromate : CrO42-) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Cr(VI) Argent Très toxique (isoélectronique du Cu) Agent anti-microbien puissant Complexes très forts avec S Cadmium Très toxique (isoélectronique du Zn) Peut être méthylé par bactéries Mercure Plomb Très toxique (isoélectronique du Zn) Peut être méthylé par bactéries (diméthylmercure volatile et toxique) Toxique. Inhibiteur ferrochelatase (hèmes) Peut être méthylé par bactéries Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Cu: 3d104s1 Ag: 4d105s1 Zn: 3d104s2 Cd: 4d105s2 Hg: 5d106s2 Semi-métaux Arsenic (As) Oxyanion (V) ressemble au PO43Peut servir d’accepteur d’électrons (anaérobie) Peut être méthylé par bactéries e- Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb AsO43- (V) Arsenate - abondant ds zones oxydées : HAsO42- peu mobile - adsorbé sur oxyhydroxydes Fe/Mn O- As O OAsO33- (III) Arsenite - soluble - mobile Antimoine (Sb) Isoélectronique avec arsenic Formation d’oxyanions Peut être méthylé par bactéries Accepteur d’e- ? Sb(V) - milieux faibl. réducteur - aérobies - adsorbé sur oxyhydroxides Fe/Mn Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Sb(III) - En cond. réduites - SbS2- dans sédiments Dangers des métaux Modification d’activités enzymatiques par substitution de métaux. Exemple de la Superoxide dismutase bovine (BSOD) Activité BSOD naturelle (Zn2Cu2BSOD) Cu2Cu2BSOD Co2Cu2BSOD Cd2Cu2BSOD E2Zn2BSOD E2Co2BSOD Zn2Zn2BSOD (E = pas de métal incorporé) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 100% 100% 90% 70% 0% 0% 0% (Kendrick et al. 1992) Danger des métaux non complexés Réaction de Fenton: Fe(II) + H2O2 Radical hydroxyle (10-9s) Fe(III) + OH- + OH• Anion hydroxyle Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Plasmides de résistance aux métaux • Ag+, AsO2-, AsO43-, Cd2+, Co2+, CrO42-, Cu2+, Hg2+, Ni2+, Pb2+, Sb3+, TeO32-, Tl+, Zn2+ • Systèmes d’efflux nécessitant une dépense d’ATP (ATPase) ou une entrée de H+ (antiport proton/cathion) Silver (1996) Gene 179:9-19 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb En résumé : effet des métaux au niveau cellulaire - Substitution métaux métalloenzymes : modification activité - Modification activité SOD (accumulation O2-) - Ressemblance avec PO43- et SO42- (oxyanions) - Réaction de Fenton (génération directe OH•) - Consommation ATP - Dépolarisation membrane plasmique Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 6. Types d’interactions entre métaux et biofilms. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Types d’interactions entre métaux et biofilms. 1. Interactions passives : micro-organismes vivants ou non 2. Interactions actives : micro-organismes vivants Résultat variable : - Immobilisation (capsule, incorporation métalloenzymes) Oxydé / réduit Précipitation (nucléation, formation biominéral) Méthylation + volatilisation Exporté (système d’efflux) Rem : • Biominéralisation biologiquement induite • Biominéralisation biologiquement contrôlée Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Interactions passives Biosorption sur divers groupes fonctionnels : Carboxyles, hydroxyles, sulfhydryles, amino, imino, imidazole, sulfates, sulfonates. -COOH -OH -SH -NH4 -CNH -SO4 -S(=0)2-O- Sites de Biosorption : (i) Paroi (ac. muramique + ac. teichoïques) (ii) Membrane externe Gram-négatives (LPS) (iii) Capsules Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Interactions actives (i) Méthylation + volatilisation (ii) Accumulation intracellulaire (iii) Précipitation extracellulaire “involontaire” (iv) Complexation extracellulaire (v) Réactions Redox des chaînes transporteuses d’électrons Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb (i) Volatilisation Méthylation des métaux Hg, As, Pb, Se, Te, Cd, Sn, Bi Exemple : Hg Hg° hν 40 000 t/an atm. - mines - fuel Hg2+ bact. CH3 -Hg+ bact. Méthylmercure CH3-Hg-CH3 Diméthylmercure (volatil) Formes très toxiques (X100 p/r Hg°) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb (ii) Accumulation intracellulaire - Pompes membrannaires ioniques (métaux = nutriments) - Formation de biominéraux intracellulaires Exemple : Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Fe3O4 (magnetite) Bactéries magnétotactiques : magnetosomes Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb http://magnum.mpi-bremen.de/magneto (iii) Précipitation extracellulaire “involontaire” - Excrétion/consommation de substances chimiques - Modification pH et conditions Redox milieu ext. - Dégradation de matière organique (acides humiques, tannins) Modification de la spéciation des métaux Biominéralisation biologiquement induite Exemples : - Production S2- par bactéries sulfato-réductrices précipitation sulfures métalliques (CdS, ZnS, etc...) - Production HPO42- suivie précipitation phosphates métalliques (Me HPO42-) (Citrobacter) - & Préat A. Geol F404 ulb Gillan D.C. (iv) Complexation extracellulaire • Complexation “volontaire” Utilisation de molécules organiques à très haute affinité pour les métaux Exemples : sidérophores (Fe3+), métallothionéines • Complexation “involontaire” : production d’oxalate, citrate suite au métabolisme. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Sidérophores : composé chélatant le Fe3+ et produit par un micro-organisme Ferrichrome, enterobactine, mycobactine, bacillibactine, ferrioxamine, etc... 669.1 Da Le sidérophore le plus puissant K(Fe3+) = 1052 M-1 EDTA : K ≈ 1025 M-1 enterobactine E. coli Carrano et al. (1979) J Am Chem Soc 101:5401 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Métallothionéines (MT) : Petites protéines (3 500 - 14 000 Da), riches en Cystéines (S), stables à la chaleur, capables de complexer les métaux. Procaryotes et eucaryotes (plantes, animaux) Transport / régulation : Zn, ... Détoxification : Cd, ... Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb (v) Réactions Redox des chaînes transporteuses d’électrons Extracellulaire, “volontaire” (génération d’énergie) • Réactions de réduction (processus dissimilatif) Le métal oxydé sert d’accepteur terminal d’électrons. Formation d’un biominéral dans certains cas (ex: Cr, Se, U) • Réactions d’oxydation. Le métal réduit sert de donneur d’électrons. Métal = source d’énergie (électrons) Formation d’un biominéral dans certains cas Fe++ Fe+++ Mn++ Mn+++ Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 7. Ferrobactéries et manganobactéries Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Ferrobactéries = bactéries capables d’oxyder du Fe2+ et/ou de précipiter du Fe3+ Manganobactéries = bactéries capables d’oxyder du Mn2+ et/ou de précipiter du Mn4+ - La précipitation est extracellulaire ou intracellulaire - Importance biogéochimique (gdes qtés) ! Ces bactéries ne sont pas toujours ferro-oxydantes ou mangano-oxydantes! Etudier vitesse d’oxydation (cultures) + contrôles négatifs Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb A pH 7.0, la ferro-oxydation est plus difficile à étudier que la mangano-oxydation car l’oxydation spontanée (non biologique) du Fe2+ est très rapide. Etudier les interfaces Exemple : eau de mer pH 7.4-8.4; S‰ = 32; pO2 = 0.21 - d[Fe(II)] = k [Fe(II)] pO2 [OH-] dt k = (2.2 ± 0.2) 106 Roekens & Van Grieken (1983) Mar Chem 13:195-202 Vitesse d’oxydation : τ1/2 = 1.1 min à pH 8.3 et 20°C 2.6 min à pH 8.3 et 10°C Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Eau de mer pH < 7.1 - d[Fe(II)] = k [Fe(II)] pO2 [OH-] dt k = (2.4 ± 0.4) 1013 Roekens & Van Grieken (1983) Mar Chem 13:195-202 Vitesse d’oxydation : τ1/2 = 30 min à 20°C 158 min à 10°C Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Profils de pH dans les sédiments marins (côte belge) Face à Oostende Face à Zeebrugge 130 pH profile Depth (cm) Depth (cm) -4 7.5 -8 -12 -16 -20 4 6 2 4 0 2 -2 6.5 7 7.5 8 -4 -6 -8 0 -2 8 -6 -8 -12 -10 -14 -12 Fe2+ « stable » Ferro-oxydation microbienne possible! 8.4 -4 -10 Sédiments vaseux Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Depth (cm) 0 7 435 pH profile 700 pH profile 4 6.5 A 50 km Sable 8.8 Ferrobactéries et Manganobactéries Protéobactéries α Magnetospirillum magnetotacticum Magnetotactic bacteria (MTB) Vibrio en forme de Spirillum; Ø 0.3 µm; magnetosomes (magnétite Fe3O4 et greigite Fe3S4); micro-aérobie; eau douce. Hémisphère N : déplacement vers le N (flagelles) Hémisphère S : déplacement vers le S (flagelles) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Magnetospirillum 1 µm 0.5 µm 0.1 µm Bergey’s Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 0.1 µm Ferrobactéries et Manganobactéries Protéobactéries α Pedomicrobium manganicum P. americanum P. ferrugineum Eaux douces, tubes, surface roches. Bactérie à hyphes, bourgeonnante. Oxydation enzymatique du Mn2+, précipitation sur EPS Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 1 µm Bergey’s Bergey’s Ferrobactéries et Manganobactéries Protéobactéries β Sphaerotilus Leptothrix Bactéries filamenteuses engainées, neutrophiles, aérobies, Gram -, chémo-organotrophes. Cycle de vie avec cellules essaimeuses flagellées (cond. déf.) Gaines vides! Eaux douces courantes riches en MO, égouts Si Fe et Mn présent : gaines incrustées oxyhydroxydes Fe / Mn (précipitation chimique + microbienne) Sphaerotilus : incapable d’oxyder Mn2+. Leptothrix : Oxydation du Mn2+ et du Fe2+. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Sphaerotilus Gaine = complexe lipo-polysaccharido-protéique formant des tubes linéaires. Extérieur à la membrane externe Blooms de Sphaerotilus : automne, ruisseaux (feuilles) Usines de traitement des eaux d’égouts : problème (masses de filaments augmentant volume des boues) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Sphaerotilus natans Bergey’s Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Leptothrix discophora Bergey’s Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Gaines vides de Leptothrix ochracea Bergey’s Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Leptothrix Gaine avec une protéine oxydant le Mn Mn2+ + 1/2 O2 + H2O ΔG°’ = - 68 kJ Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb MnO2 + 2H+ Ferrobactéries et Manganobactéries Protéobactéries β 0.5 µm Gallionella ferruginea Bergey’s - Bactérie chimio-lithothrophe, autotrophe, ferro-oxydante, neutrophile, micro-aérobie, Gram -. - Comporte un pédoncule torsadé riche en oxyhydroxydes de Fe (pédoncule excrété à la surface de la cellule) - Commune dans eaux douces riches en Fe Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Bergey’s 0.25 µm Pédoncules de Gallionella 0.5 µm fibrilles 40-50 nm de Ø 5 µm Ridgway et al. (1981) AEM 41:288-297 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Ferrobactéries et Manganobactéries Protéobactéries γ • Acidithiobacillus ferrooxidans Chémo-lithotrophe obligé, aérobie, pH 2.0-3.5 Bacilles Pyrite Gleisner et al. (2006) Chem Geol 225:16-29 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb • Acidithiobacillus ferrooxidans : Bio-extraction “microbial leaching” “biolessivage” Définition : Extraction de métaux à partir de leurs minerais en employant des micro-organismes. Cu : 20% Méthodes conventionnelles (fonderies) Cher, polluant (SO2), consommation énergie. Mais : rapide. Bio-extraction Génère eaux acides riches en métaux, lent Mais : peu cher (50%), OK pour minerais peu concentrés Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb - Tas de minerais arrosé avec acide + Fe(III) + bactéries (Acidithiobacillus spp) - Oxydation des sulfures par Fe(III) : Cu2S + 4Fe3+ → 2Cu2++4Fe2++S2(chalcocite) bactéries (Cu+) O 2 SO42- Fe(III) - Eau acide riche en Cu2+ récupérée et traitée par le procédé SX/EW (solvent-extraction / electrowinning) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Lomas Bayas, Chile Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Lomas Bayas, Chile Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Ferrobactéries et Manganobactéries Protéobactéries δ • Desulfovibrio magneticus 1 µm Bactérie sulfato-réductrice Anaérobie strict Sakaguchi et al. (2002) IJSEM 52:215-221 Magnétosomes Sédiments eau douce riches en sulfures Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Ferrobactéries et Manganobactéries Protéobactéries ζ (zêta) Mariprofundus ferrooxidans Emerson et al. 2007. PLoS ONE 2(8) e667 ± équivalent de Gallionella en milieu marin, sources hydroth. (Loihi Seamount, Pacific Ocean). - Bactérie chimio-lithothrophe, autotrophe, ferro-oxydante, neutrophile, micro-aérobie, Gram -. - Comporte un pédoncule torsadé riche en oxyhydroxydes de Fe (pédoncule excrété à la surface de la cellule) - Optimum 30°C, pH 6.0 - 6.5 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Ferrobactéries et Manganobactéries Phyl. Nitrospira Leptospirillum ferrooxidans (acidophile) 5 µm Candidatus Magnetobacterium bavaricum (bact. « géante » magnétotactique) Battaglia et al. (1994) Ant. Leeuw. 66 Hanzlik et al. (2002) J Magn Magn Mat 248:258-267 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Ferrobactéries et Manganobactéries Siderocapsaceae (Pribram, 1929) Bactéries unicellulaires, non filamenteuses, non pédonculées, associées à des dépôts de Fe (III) ou de Mn (IV). Aérobies / micro-aérobies; pH 6-7 Eaux douces (lacs, sols, marais, tubes) Position phylogénétique inconnue. Sp décrites sur base de leur morphologie dans le milieu naturel. « Siderocapsa », « Naumanniella », « Siderococcus », « Ochrobium » Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 10 µm Naumanniella neustonica (Bergey’s) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Ferrobactéries et Manganobactéries Budding and/or appendaged bacteria Metallogenium Cellules coccoïdes, 0.2-1.5 µm Ø, dépôts de Mn en étoile Aérobies, pH 6.8-7.2 Eaux douces (blooms), sols Inconnu en milieu marin Microfossiles de 2.109 ans (Eoastrion) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Microcolonies de « M. personatum » (Bergey’s) 8. Exemples actuels de communautés microbiennes incrustées de Fe et de Mn Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 1. Montacuta ferruginosa (Bivalve) 1 mm Picture : Gilan D.C. Fe3+ Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Echinocardium cordatum (oursin irrégulier) Biofilm en 3 strates 10 µm Gillan D.C., De Ridder C. The microbial community associated with Montacuta ferruginosa, a commensal bivalve of the echinoid Echinocardium cordatum. In: Emerson R.H., Smith A.B., Campbell A.C. (eds), Echinoderm research 1995. Balkema, Rotterdam, pp. 71-76. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb bivalve juvénile Nombreuses bactéries filamenteuses encroûtées de Fe(III) bivalve adulte Picture : Gilan D.C. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Picture : Gilan D.C. Picture : Gilan D.C. Picture : Gilan D.C. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Pictures : Gilan D.C. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Choanoflagellés Picture : Gilan D.C. Ciliés suctoriales Picture : Gilan D.C. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Spectre EDAX de M. ferruginosa. (energy dispersve X-ray analysis) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb M. ferruginosa Spectre EDAX en deux dimensions Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Nature du minéral ? - Phosphate ferrique amorphe ? (FePO4)2 5H2O Ne se forment qu’à pH acide Minéral pur Colloïdes de taille homogène dans EPS Biominéralisation (form. in situ) - Oxyhydroxide de Fe(III) avec adsorption de PO4? Ferrihydrite : Fe2O3.2FeOOH2.6H2O Se forme à pH neutre Minéral non pur (Mn, As, Cu, etc...) Colloïdes de diverses tailles dans EPS Bioaccumulation Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Spectre DRIR (méthode KBr) splitting Gillan & De Ridder (2001) Chem Geol 177:371 Oxyhydroxide de Fe(III) avec adsorption de PO4 Bioaccumulation Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Gillan & De Ridder (2001) Chem Geol 177:371 Eléments en faveur d’une Biominéralisation - colloïdes ds EPS - « pureté » du minéral (EDAX) Pictures : Gilan D.C. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Test de la ferro-oxydation Ferro-oxydation présente ds biofilm Préparation d’extraits de biofilm: - Traitement à l’acide oxalique (sonication, centrifugation) - Chromatographie d’exclusion (Sephadex G-25) élimination Fe et acide oxalique Test : - Source de Fe2+ : ferrocyanure de K (10 mM) - Tampon MES pH 6.0 - TMPD (2 mM) : détecteur de Fe3+ Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Présence d’un facteur ferro-oxydant ! Formation de TMPD Témoin Gillan et al. (2000) Geomicrobiol J. 17:141-150 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Dégradation de complexes organiques du Fe3+ Suspension de biofilms frais 6 tubes expérimentaux 6 tubes témoins (chauffage 15 min 100°C) Ajout à tous les tubes citrate de Fe(III) 1 mM Incubation à 20°C en aérobie (agitation) Dosage du fer total en suspension (AAS) Expérience à pH 6.5 ou pH 8.2 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb pH 6.5 Dégradation de complexes organiques du Fe3+ Gillan et al. (2000) Geomicrobiol J. 17:141-150 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 2. Urothoe poseidonis (amphipode marin) Picture : Gilan D.C. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 250 µm Picture : Gilan D.C. Picture : Gilan D.C. Picture : Gilan D.C. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Gillan et al. (2004) J Sea Res 52:21 Picture : Gilan D.C. Picture : Gilan D.C. Picture : Gilan D.C. Picture : Gilan D.C. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb U. poseidonis Gillan et al. (2004) J Sea Res 52:21 Spectre EDAX Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Variation du recouvrement en Fe en fct des saisons Gillan et al. (2004) J Sea Res 52:21 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Bactéries filamenteuses : nouvelle sp de Thiothrix Bactérie sulfo-oxydante aérobie Gillan & Dubilier (2004) Appl Environ Microbiol 70:3772 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Lien avec ferro-oxydation? DAPI Sonde UP23b Gillan & Dubilier (2004) Appl Environ Microbiol 70:3772 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 3. Hydrobia ulvae (gastéropode marin, intertidal) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 500 µm 1 µm 10 µm 1 µm Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 100 µm Gillan & Cadée (2000) J Sea Res 43:83 Hydrobia ulvae Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 4. Loihi seamount 30 km S Hawaii Sommet: - 975 m Hauteur: 3000 m Actif. Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Emerson & Moyer (2002) Appl Environ Microbiol 68:3085 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Emerson & Moyer (2002) Appl Environ Microbiol 68:3085 Fluides hydrothermaux riches en Fe2+ et CO2 t°C : 10-167°C Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb max 268 µM max 17 mM Emerson & Moyer (2002) Appl Environ Microbiol 68:3085 Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Emerson & Moyer (2002) Appl Environ Microbiol 68:3085 Morphotypes d’oxydes de Fer (Loihi) Isolation d’une souche ferro-oxydante (JV-1) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb 5. Tapis de ferrobactéries, Forest de Marselisborg (Aarhus, Denmark) Emerson & Revsbech 1994 (Appl Environ Microbiol 60:4022-4031) Eau douce pH neutre (7.1-7.6) Résurgence 250 µM Fe2+ Emerson & Revsbech 1994 (Appl Environ Microbiol 60:4022-4031) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Emerson & Revsbech 1994 (Appl Environ Microbiol 60:4022-4031) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Emerson & Revsbech 1994 (Appl Environ Microbiol 60:4022-4031) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Emerson & Revsbech 1994 (Appl Environ Microbiol 60:4022-4031) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Etude de la ferro-oxydation microbienne Eau sans Fe2+ et aérobiose Eau riche en Fe2+ et anoxie (60-120 µM FeCl2) Emerson & Revsbech 1994 (Appl Environ Microbiol 60:4032-4038) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Vitesse d’oxydation (chim+biol) : Max 1 200 nmol Fe2+ par heure (1 cm3 mat) 50 à 80% = oxydation biologique Emerson & Revsbech 1994 (Appl Environ Microbiol 60:4032-4038) Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb En Belgique aussi ! Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Ardennes Hautes Fagnes Site de la Helle Dépôts ferrugineux dans le lit d’un ruisseau Nature argileuse du sol + pluie = tourbières. pH diminue percolation, dissolution de pyrite, résurgence : Fe2+ Papier S. (2006) UMH Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Carrières d’Hautrage Carrière Danube-Bouchon Argiles et sables (riche en M.O. et pyrite) Mattes bactériennes ferrugineuses fréquentes en carrières Résurgences et formation de dépôts pariétaux Papier S. (2006) UMH Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Papier S. (2006) UMH Papier S. (2006) UMH Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb Papier S. (2006) UMH Gillan D.C. & Préat A. Geol F404 ulb