évolution - pedagogix

• Historique
 Les précurseurs
 Darwin
 La théorie synthétique de l’évolution
• La théorie de l ’évolution aujourd’hui
 La sélection naturelle: la raison du plus fort?
 L’apparition de nouveaux organes: Evolution
des processus développementaux
 L’évolution à l’échelle des génomes

Génomique:
Le décryptage des génomes
La théorie de l’évolution aujourd’hui

• Génome: ensemble de l’information génétique d’un organisme contenue
dans l’ADN.
• Séquence de l’ADN: succession des nucléotides = information
• Renversement de la méthode par rapport à la génétique moléculaire
“classique”:
Le décryptage des génomes
phénotype mutation  gène  séquence
séquence du génome  séquence des gènes fonction

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•Progrès technologiques majeurs: méthodes de séquençage ( « lecture» de la
séquence en nucléotide de l’ADN) automatique
L’avènement de la génomique
Dia: J. van Helden
• Enjeux économiques énormes.
• 2012: plusieurs milliers de génomes complètement séquencés.
- La base de données du NCBI (ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/) répertorie les génomes complets
de : >2000 procaryotes (bactéries et archées)
Une centaine de levures (levure de bière et de boulangerie, … )
Quelques dizaines de mammifères (homme, souris, rat, chien, ...)
Une poignée d’insectes (drosophile, abeille, anophèle)
Quelques plantes (Arabette - Arabidopsis thaliana, riz, mais)
Un ver nématode (Caenorhabditis elegans)
Quelques protistes (Plasmodium falciparum, Trypanosoma brucei,…,)
De nombreux virus
- D’autres centres de génomique donnent accès à d’autres génomes séquencés.
ENSEMBL http://www.ensembl.org/
UCSC mailto:http://genome.ucsc.edu/
Sanger Institute http://www.sanger.ac.uk/genbiol/
• Un grand nombre de génomes additionnels ont été séquencés par des compagnies
privées, et ne sont pas accessibles au public.

Source: http://en.wikipedia.org/wiki/File:Genome_Sizes.png
La taille des génomes
• Taille du génome humain: 3. 109 paires de bases (nucléotides)
• Tendanciellement, la taille du génome est plus importante chez les organismes plus
complexes (exceptions!!!!)
• Multiplication du nombre de génomes séquencés, séquençage de plus “gros” génomes
associée à l’amélioration des techniques de séquençage