MEDECINE 64 - MCU 1138 - Fiche de poste - validée -1

Campagne Emplois Enseignants-Chercheurs 2015
Université Paris-Sud
UFR Médecine
N° Emploi : 64 MCF 1138
Bactériologie, Biochimie et Biologie Moléculaire des mécanismes de résistance aux antibiotiques
Bacteriology, Biochemistry and Molecular Biology of antibiotic resistance mechanisms
Enseignement
Le Maître de conférences participera à différents enseignements de Microbiologie Médicale, de
Génétique Microbienne, de Biochimie et de Biologie Moléculaire destinés aux étudiants de la Faculté de
Médecine et de Pharmacie de l’Université Paris Saclay et à des étudiants de niveaux M1 et M2. Il
assurera des enseignements dans :
- UE de Biochimie « biochimie métabolique et enzymologie » en PACES (Fac. de Médecine; 60h eTD)
- Tronc commun du Master 1 santé : Biochimie, génétique et génomique (Fac. de Médecine; 50h eTD)
- M1-M2 de Microbiologie, M1 UE Médicaments, et l’UE Microbiologie et biotechnologies
pharmaceutiques, et dans le module thérapeutiques anti-infectieuses et M2 Microbiologie: microbiotes,
agents pathogènes et thérapeutiques anti-infectieuses (Fac. de Pharmacie; 8h cours, 20h TD, soit 32h
eTD)
- DFGSM3 Bactériologie Médicale (Fac. de Médecine; 40 eTD)
- Master 2 IMVI (Infectiologie : Microbiologie, Virologie, Immunologie, Paris 6, 7, Pasteur), module
résistance aux antibiotiques. (15h eTD)
Recherche
La résistance aux antibiotiques et plus particulièrement la résistance aux carbapénèmes est un enjeu
majeur de Santé Publique. Les carbapénèmes sont les ß-lactamines possédant le spectre d’activité le plus
large. Leur utilisation est actuellement compromise par l’émergence dans le monde d’entérobactéries
résistantes par production d’une carbapénèmase. Il s’agit essentiellement des ß-lactamases de type KPC,
OXA-48 et des métallo-enzymes IMP/VIM ou plus récemment NDM-1. L’émergence et la rapide
dissémination de ces enzymes s’expliquent en partie par la présence d’éléments génétiques mobiles de
type transposon ou séquence d’insertion mais aussi par l’existence de clones épidémiques à l’origine de la
diffusion mondiale des souches.
Titre : Structure-Fonction et Expression de Carbapénèmases
1. Objectifs
D'un point de vue général, le projet s'appuie sur des compétences et des collaborations bien établies et est
dans la continuité des recherches menées jusqu'ici sur la résistance aux antibiotiques avec le souhait
néanmoins d'aborder deux aspects plus fondamentaux en relation avec les ß-lactamases: (i) la régulation
de l'expression des carbapénèmases et (ii) leur analyse structurale et fonctionnelle
2. Projet de recherche
Le projet de recherche qui sera confié au Maître de conférences aura pour but de mieux comprendre, pour
tenter de la contrôler, l'évolution actuelle des ß-lactamases dont les variations qualitatives (mutations) et
quantitatives (expression) permettent aux bactéries de s'adapter aux antibiotiques. Ainsi, il se focalisera
sur l'analyse structurale et fonctionnelle de carbapénèmases, et sur l'étude de l'expression in vitro de leurs
gènes. Il s’intéressera au transcriptome de K. pneumoniae, un pathogène hospitalier redoutable de part sa

multi-résistance aux antibiotiques et son pouvoir épidémique, ainsi qu’aux plasmides impliqués dans la
diffusion des gènes codant pour les carbapénèmases KPC, NDM et OXA-48. Ce travail contribuera à la
compréhension globale de la réponse adaptative au niveau transcriptionnel des bactéries à Gram-négatif
ainsi qu’au décryptage des mécanismes de régulation de l’expression des β-lactamases. De plus, les
objectifs du Maître de conférences seront de s’impliquer fortement dans les différents projets relatifs à
l'analyse des pré-requis structuraux nécessaires à la modélisation et à la mise au point d'inhibiteurs de ß-
lactamases dans le cadre du LabEx LERMIT.
Le candidat devra posséder une excellente connaissance des mécanismes de résistance aux antibiotiques
et plus particulièrement aux β-lactamines chez les bacilles à Gram-négatif. Des connaissances de la
régulation de l’expression des gènes, de la manipulation des ARNs, des outils bioinformatiques (analyse
de séquençage massif de plasmides, de génomes bactériens et de RNA-seq) seront nécessaires pour les
expériences à venir. D’autre part, une connaissance de l’utilisation du serveur web « galaxy » pour les
analyses de RNA-seq est recommandée. Le recrutement du Maître de Conférences permettra de renforcer
l’équipe de recherche afin de maintenir la lisibilité internationale, d’assurer une réactivité accrue dans un
domaine très compétitif, et d’y apporter les compétences requises au développement de nouveaux axes de
recherche originaux.
Laboratoire(s) d'accueil :
La future équipe d’accueil (labellisation en cours) est le résultat de la recomposition de l’équipe INSERM
UMR-S 914. La nouvelle équipe (10 personnes), présente de nombreux atouts: expertise dans le domaine
de la résistance aux antibiotiques, adossement au Centre National de Référence de la Résistance aux
antibiotiques, adossement au LabEx LERMIT, et lisibilité internationale.
Type (UMR, EA, JE,
ERT) N° Nbre de chercheurs Nbre d'enseignants- chercheurs
EA : Structure, dynamique,
fonction, et expression de
ß-lactamases à large spectre
En cours
d’attribution
0 2
Contact Enseignement :
Responsable enseignement Masters Responsable Enseignement PACES
Pr Anne Mantel Pr Philippe Chaumet Riffaud - Service médecine nucléaire
Hôpital Kremlin Bicêtre Hôpital Kremlin Bicêtre.
[email protected] [email protected]
Responsable enseignement Microbiologie (DFGSM3, M1, M2)
Dr Thierry NAAS
Hôpital de Bicêtre – Service de bactériologie
Contact : [email protected] ou bien thierr[email protected]php.fr
Responsable activités de recherche:
Dr Thierry NAAS
Hôpital de Bicêtre – Service de bactériologie
78 rue du Général Leclerc – 97 275 Le Kremlin Bicêtre
Tél [phone] –
Contact : [email protected] ou bien thierr[email protected]php.fr
Transmission du dossier uniquement via l’application RECRUT-EC :
http://recrutement-ec.u-psud.fr/cgi-bin/WebObjects/P11ComiteSelection.woa