Usages vétérinaires des antibiotiques, résistance - Janvier 2006 -

Usages vétérinaires des antibiotiques, résistance
bactérienne et conséquences pour la santé humaine
-Janvier 2006 -
nCoordination
Mme Corinne Danan (Afssa – DERNS)
nSecrétariat administratif (Afssa – DERNS)
Mme Aurore Petit
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Composition du Groupe de travail
Président
M. Didier GUILLEMOT (Institut Pasteur - Paris)
Membres du comité d’experts spécialisé Microbiologie :
Mme Anne BRISABOIS
M.Hubert BRUGERE
M.Roland LECLERCQ
M. Francis MEGRAUD
Membres du comité d’experts spécialisé Alimentation animale :
M.Jean François GUILLOT
Membres du comité d’experts spécialisé Santé animale :
Mme Arlette LAVAL
M.Yves MILLEMANN
M. Pascal SANDERS
Autres experts :
Mme Anne BOUCHARDON (Afssa - Ploufragan)
Mme Elisabeth CHASLUS-DANCLA (INRA – Nouzilly)
Mme ClaireCHAUVIN (Afssa - Ploufragan)
M. Pierre COLIN (Afssa – Brest)
M. Henri DABERNAT (Centre Hospitalier Universitaire Purpan - Toulouse)
Mme Isabelle KEMPF (Afssa - Ploufragan)
Mme Danièle MEUNIER (Afssa - Lyon)
M. Gérard MOULIN (Agence Nationale du Médicament Vétérinaire)
Mme Isabelle PELLANNE (Afssaps)
M. Benoît SCHLEMMER (Hôpital Saint-Louis – Paris ; Président du Comité national de suivi du Plan
pour préserver l’efficacité des antibiotiques)
M. Pierre-Louis TOUTAIN (Ecole Nationale Vétérinaire - Toulouse)
Agence française de sécurité sanitairedes aliments
Mme Hélène Aubry-Damon (Derns-UERB)
Mme Corinne Danan (Derns-UERB)
Mme Muriel Eliaszewicz (Derns)
Répartition des contributions
Section I. Usage des antibiotiques chez l’animal
C. Chauvin (coordinateur), P. Colin (coordinateur), J.F. Guillot, A. Laval, Y. Millemann, G. Moulin,
I. Pellanne.
Section II. Impact de l’usage des antibiotiques sur la résistance chez l’animal (incluant
la surveillance de la résistance bactérienne chez l’animal
A. Brisabois, I. Kempf, D. Meunier, Y. Millemann, P. Sanders (coordinateur), P.L. Toutain.
Section III. Diffusion de la résistance à l’Homme et conséquences pour la santé publique
A. Bouchardon, A. Brisabois, E. Chaslus-Dancla (coordinateur), P. Colin, H. Dabernat, D. Guillemot
(coordinateur), R. Leclercq, F
.Mégraud, B. Schlemmer, P
.L. Toutain.
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Relecteurs :
Experts des Comités spécialisés placés auprès de l’Afssa
Microbiologie » : Mmes Marie-Laure De Buyser et Christine Vernozy-Rozand, M. Hubert Brugère.
-«Alimentation animale » : MM. Michel Etienne, Hervé Pouliquen et Philippe Schmidely.
Santé animale » : MM. Bertrand Faroult, Alain Milon et Jacques Poirier.
Comité extérieur de lecture
NOM Affiliation
Jacques Acar Hôpital Saint-Joseph, Paris
Jean-Pierre Alno Syndicat National des Groupements Techniques Vétérinaires
Véronique Vaillant Institut de Veille sanitaire
Geneviève Benard Ecole nationale vétérinaire, Toulouse
Claude Danglot Centre de recherche et de contrôle des eaux de Paris
Patrick Dehaumont Agence nationale du médicament vétérinaire
Dominique De Furst,
Jean-Michel Azanowsky Direction générale de la santé
Vincent Jarlier Hôpital Pitié-Salpêtrière, Paris
François L’hériteau Centre de Coordination de la Lutte contre les Infections Nosocomiales, Paris Nord
Yves Levi Faculté de Pharmacie, Chatenay-Malabry
Philippe Maugendre Agence française de sécurité sanitaire des produits de santé
Antoine Monteil Société anonyme de gestion des eaux de Paris
Jean-PierreOrand Direction générale de l’alimentation
Frédérique Touffet Agence française de sécurité sanitaire environnementale
Organismes extérieurs consultés :
Assemblée permanente des chambres d’agriculture, Association des fabricants d’aliments du bétail,
Association française des directeurs et cadres de laboratoires vétérinaires publics d’analyses, Association
française des vétérinaires pour animaux de compagnie, Association des vétérinaires salariés de l’ouest,
Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement, Centre national de
référence des antibiotiques, Centre national de référence des Salmonella,ChambreRégionale d’Agriculture
de Normandie, Conseil de l’ordre des pharmaciens, Conseil Supérieur de l’Ordre des Vétérinaires Français,
Fédération nationale des syndicats exploitants agricoles, Groupe de défense sanitaire d’Indre-et-Loire,
Groupe français de l’association mondiale des vétérinaires de l’aviculture, Service de microbiologie de
l’hôpital européen Georges-Pompidou, Institut technique de l’aviculture, Institut de l’élevage, Institut
technique du porc, Les entreprises du médicament, Office national interprofessionnel des viandes de
l’élevage et de l’agriculture, Observatoire national de l’épidémiologie de la résistance bactérienne aux
antibiotiques, Service des maladies infectieuses du centre hospitalier régional universitaire de Tours, Service
des maladies infectieuses et tropicales du centre hospitalier universitaire de Dijon, Société française de
buiatrie, Société française de microbiologie, Syndicat de l’industrie du médicament vétérinaire et réactif,
Syndicat national des groupements techniques vétérinaires, Syndicat national des producteurs d’additifs et
d’ingrédients de la chaîne alimentaire, Syndicat national des vétérinaires d’exercice libéral, Union fédérale
des consommateurs - Que Choisir, Union des groupements de producteurs de viande bovine.
Suite à la consultation nationale organisée en novembre 2005 sur le projet de rapport du groupe de travail,
les principaux commentaires ayant appelé une réponse du groupe de travail, sans modification du rapport,
sont rassemblés en annexe 17.
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Sommaire général
Introduction générale................................................................................................................... 7
Section 1 : Usage des antibiotiques ............................................................................................. 9
I. Contexte réglementaire et conditions d’utilisation des antibiotiques chez l’animal......................... 10
II. Les antibiotiques concernés...................................................................................................... 19
III. Les méthodes et outils de suivi des utilisations des antibiotiques ................................................ 20
IV. Les quantités d’antibiotiques utilisées........................................................................................ 26
V. Analyse des points critiques...................................................................................................... 34
VI. Résumé et recommandations.................................................................................................... 36
VII. Bibliographie............................................................................................................................ 40
Section 2 : Impact de l’usage des antibiotiques sur la résistance bactérienne chez l’animal....... 43
I. Définitions de la résistance bactérienne aux antibiotiques ........................................................... 44
II. Suivi de la résistance aux antibiotiques en filière de production animale....................................... 61
III. Analyse de l’impact de l’usage des antibiotiques sur la résistance bactérienne chez l’animal......... 75
IV. Impact environnemental............................................................................................................ 90
V. Résumé et recommandations.................................................................................................... 95
VI. Bibliographie............................................................................................................................ 102
Section 3 : Diffusion de la résistance à l’homme et conséquences pour la santé publique.......... 113
I. Y a t-il des conséquences de la résistance bactérienne aux antibiotiques en termes
de Santé Publique ? ................................................................................................................. 114
II. A-t-on la preuve que des gènes de résistance ont été acquis par les bactéries humaines
àpartir de bactéries animales ?................................................................................................. 116
III. Dispose t-on d’études épidémiologiques démonstratives de la transmission de bactéries
résistantes de l’animal à l’homme ? ........................................................................................... 133
IV.Faut-il définir,pour l’homme ou pour l’animal, des antibiotiques « critiques » ?............................. 140
V. Résumé et recommandations.................................................................................................... 141
VI. Bibliographie............................................................................................................................ 143
Conclusion générale .................................................................................................................... 157
Recommandations générales ...................................................................................................... 161
Annexes....................................................................................................................................... 167
Abréviations................................................................................................................................. 207
Remerciements............................................................................................................................ 208
Glossaire...................................................................................................................................... 209
Liste des annexes.......................................................................................................................... 211
Liste des tableaux ......................................................................................................................... 212
Liste des figures ............................................................................................................................ 214
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