Publications

Bibliographie – PCR à partir de matrices difciles
Plus de 17 000 articles scientiques citant l’Ex Taq™ DNA Polymerase
Génotypage chez les patients :
Génotypage des microsatellites (AT-repeats) du virus P. Falciparum :
Origins of the Recent Emergence of Plasmodium falciparum Pyrimethamine Resistance Alleles in Madagascar
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, June 2010, p. 2323–2329. Travaux effectués à l’Institut Pasteur et à l’AP-HP.
Résumé : Une étude portant sur le génotypage des microsatellites (AT-repeats) dans les séquences environnantes du gène dhfr du virus P. Falciparum responsable de palu-
disme. Les ADN viraux des 322 isolats de P. falciparum ont été puriés à partir du sang de patients infectés. Les séquences cibles ont été ampliées par PCR nichées avec
l’Ex Taq™ DNA Polymerase et la TaKaRa Taq™ DNA Polymerase, puis séquencées. Les microsatellites contenant jusqu’à 17 répétitions d’AT ont été identiés dans les ré-
gions à plus de 6,5 kb du gène dhfr.
SNP des locus cibles sur les ADNg des patients malades :
A major susceptibility locus for HTLV-1 infection in childhood maps to chromosome 6q27
Human Molecular Genetics, 2006, Vol. 15, No. 22 3306–3312. Travaux effectués à la Faculté de Médecine Necker, à l’Institut Pasteur et au Centre National de
Génotypage.
Résumé : l’Ex Taq DNA Polymerase a été utilisée pour l’étude du polymorphisms (SNP) de deux gènes identiés chez les enfants infectés par les HTLV-1. Les séquences
cibles des ADN génomiques des enfants infectés ont été ampliées par PCR avec l’Ex Taq™ DNA Polymerase puis séquencées.
Génotypage chez les plantes à partir d’ADNg ou d’ADNc :
NODULE ROOT and COCHLEATA Maintain Nodule Development and Are Legume Orthologs of Arabidopsis BLADE-ON-PETIOLE GenesW OA
The Plant Cell, Vol. 24: 4498–4510, November 2012. Travaux effectués à l’Institut des Sciences du Végétal, CNRS à Gif sur Yvette
Résumé : l’Ex Taq™ DNA Polymerase a été utilisée pour les études de génotypage chez l’Arabidopsis. Les cibles ont été ampliées par PCR à partir de l’ADNg ou de l’ADNc
de l’Arabidopsis et puis séquencées.
RT-PCR circulaire pour amplier les ARN ribosomaux des chloroplastes :
RNR1, a 30–50 exoribonuclease belonging to the RNR superfamily, catalyzes 30 maturation of chloroplast ribosomal RNAs in Arabidopsis thaliana
Nucleic Acids Research, 2005, Vol. 33, No. 8 2751–2763. Travaux effectués à l’Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, CNRS à Strasbourg en collaboration
avec l’Institute for Plant Research à Cornell University, USA.
Résumé : C’est une étude portant sur le rôle de l’exoribonucléase RNR1 chloroplastique dans la maturation d’ARN ribosomaux 23S, 15S et 5S de chloroplastes chez Arabidopsis
thaliana. l’Ex Taq™ DNA Polymerase a été utilisée pour déterminer le niveau d’expression du gène RNR1 par la RT-PCR ou pour vérier l’intégrité des extrémités des ARN
ribosomaux des chloroplastes par la RT-PCR circulaire. l’Ex Taq™ DNA Polymerase a permit également d’amplier les régions d’ADNg correspondant aux ARN ribosomaux des
chloroplastes. Les amplicons sont ensuite utilisés comme matrice pour synthétiser les sondes d’ARN ribosomaux par la transcription in vitro.
PCR à partir d’ADNg méthylés convertis par le traitement au bisulte :
Divergent Whole-Genome Methylation Maps of Human and Chimpanzee Brains Reveal Epigenetic Basis of Human Regulatory Evolution
The American Journal of Human Genetics, 2012, Vol. 91, 455–465. Travaux effectués à School of Biology, Georgia Institute of Technology, Atlanta, GA 30332, USA
Divergent
Résumé : cet article concerne une étude épigénétique des cerveaux humains ou des chimpanzés. Les cartographies de méthylation des cerveaux ont été établies à partir des
banques ADNg convertis par le traitement au bisulte. Ces ADNg convertis ont été ensuite ampliés par la PCR avec l’Ex Taq™ DNA Polymerase avant la cartographie.