[SEMAINE 3]
Nelly Léger (UMR BOREA) prélevant des
échantillons de poissons lanternes
Tous les animaux abritent de
nombreuses bactéries dans leur tube
digestif et sur la peau, et leur rôle dans la
biologie des hôtes a longtemps été sous-
estimé. La diversité de ce microbiote est
particulièrement peu documentée chez
les poissons, malgré son importance
probable pour la nutrition ou encore la
résistance aux maladies. L'UMR BOREA,
en partenariat avec l'Observatoire de
Banyuls, souhaite mettre en place une
étude des bactéries associées à plusieurs
espèces de poissons mésopélagiques de
l'Océan Austral, afin d’étudier la
composition du microbiote et l’influence
des facteurs environnementaux et liés à
l'hôte. Pour ce faire, nous allons séquencer
des gènes bactériens pour étudier la
diversité du microbiote sur des
échantillons de tube digestif, de branchie
et de peau de poissons prélevés en
différents points, et correspondant à
différentes étapes du cycle de vie. Cette
description des bactéries permettra
d’identifier leur rôle dans la physiologie
des hôtes, ainsi que les facteurs à
l’origine de leur variabilité. Ces données
seront incorporées aux modèles de niche
écologique développés au sein de l'UMR
BOREA. Ce travail fait partie des
programmes SU EMERGENCE MicroFish et
DAPTO de l'axe Transversal
"Microorganismes" de l'UMR BOREA."
Photo : Gaëlle Toullec