Présentation des projets financés au titre de l’édition 2007 du

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Présentation des projets financés au titre de l’édition 2007 du
programme BIODIVERSITE
ACRONYME et titre du projet
Page
AMPHORE – Les aires marines protégées : outil de conservation de la
biodiversité et de gestion durable des ressources halieutiques 3
AQUAPARADOX - Biodiversité des Protistes Aquatiques: le Paradoxe 4
AQUAPHAGE - Relations entre diversité procaryotique et virale (PHAGE) au
sein de différents environnements AQUAtiques 5
BIODIVAGRIM - Conservation de la biodiversité dans les agro-écosystème :
une modélisation spatialement explicite des paysages 6
BIONEOCAL - L’endémisme en Nouvelle-Calédonie : étude phylogénétique et
populationnelle de son émergence 7
CEROPATH - Ecologie des communautés rongeurs - pathogènes en Asie du Sud
Est : effets des changements de biodiversité et implications pour l’écologie de la
santé
8
DIVERSITALP - Impacts des changements globaux sur la flore des Alpes
Françaises : distribution des diversités spécifiques, fonctionnelles et
phylogénétiques, simulations et stratégies de conservations
9
DIVOENI - Biodiversité intraspécifique chez Oenococcus oeni, une bactérie
lactique du vin : évaluation, utilisation et préservation. 10
EMERFUNDIS - Comprendre les émergences de maladies fongiques de
plantes : vers une estimation des risques liés aux changements globaux 11
GLIDES - Global Investigations on the Distribution of Endangered antarctic
Seabirds
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IMAS - Impact des Modalités d’Accès aux Semences sur la diversité des
ressources génétiques en agriculture
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INC - Incendies et biodiversité des écosystèmes en Nouvelle-Calédonie 14
PLANTADIV - Evolutions de la diversité des ressources génétiques
domestiquées dans le bassin du lac Tchad
15
RECOVER - Amendements de bassins versants forestiers acidifies et
restauration de la biodiversité
16
ULTRABIO - Biodiversité et stratégies adaptatives végétales et microbiennes
des écosystèmes ultramafiques en Nouvelle-Calédonie 17
URTICLIM - Anticipation des effets du changement climatique sur l’impact
écologique et sanitaire d’insectes forestiers urticants 18

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Programme Biodiversité
Edition 2007
Titre du projet AMPHORE – Les aires marines protégées :
outil de conservation de la biodiversité et de
gestion durable des ressources halieutiques
Résumé
Les Aires Marines Protégées sont un outil majeur de protection des
habitats essentiels pour la reproduction et la croissance des écophases
juvéniles. Elles jouent un rôle prépondérant pour la conservation de la
biodiversité. Leur efficacité à des fins halieutiques restant encore à
démontrer, le projet se propose 1) de définir des indicateurs biologiques,
écologiques, économiques et sociaux à des fins de gestion écosystémique
des pêches, 2) de tester l’efficacité réelle des AMP et d’évaluer les activités
économiques et les bénéfices induits par un travail de modélisation
écosystémique, trophodynamique, bio-économique et multi-agents, 3) de
définir les mécanismes décisionnels qui conditionnent la mise en place des
AMP et de définir des politiques régionales basées sur la notion de réseau
d’AMP.
L’étalonnage des indicateurs se fera par analyse de données historiques (2
estuaires français) et par analyse comparative (6 estuaires africains).
L’efficacité des AMP, l’étude des mécanismes décisionnels et de
gouvernance, seront étudiés à partir de réserves de taille et d’ancienneté
variables, situées en France (3), en Mauritanie (1) et au Sénégal (1).
Partenaires UR 070, IRD
UMR 5119 ECOLAG, CNRS-UMII-IFREMER
EMH, IFREMER
EPBX, CEMAGREF
LEH, Agrocampus Rennes
UMR 063 C3ED, IRD UVSQ
CEDEM, UBO
EA 3156, Université de Nice-Sophia Antipolis
US 004, ACAPPELLA IRD
CSRP, Sénégal
CNSHB, Guinée
CRODT, Sénégal
IMROP, Mauritanie
Coordinateur Monsieur Raymond LAE
[email protected]
Aide de l’ANR 992 212 Euros
Début et durée Janvier 2008 – 48 mois
Référence ANR-07-BDIV-009

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Titre du projet AQUAPARADOX - Biodiversité des Protistes
Aquatiques: le Paradoxe
Résumé
Les microbes planctoniques sont à la base des écosystèmes aquatiques.
Nous pouvons distinguer morphologiquement de nombreuses espèces,
mais elles semblent toutes avoir une aire de répartition très large.
Des études récentes suggèrent que sous cette grande diversité
morphologique, se cache une diversité génétique encore plus importante,
révélant la présence d’espèces cryptiques (morphologiquement semblables
mais génétiquement différentes) qui peuvent être adaptées à des niches
écologiques précises. Nous examinerons la diversité morphologique,
génétique et physiologique de espèces de protistes communes dans les
eaux côtières.
La structure des populations sera étudiée au niveau individuel et
populationnel (pour des populations séparées dans l’espace et dans le
temps). Pour cela, l’utilité de différents marqueurs génétiques sera évaluée
(rRNA, ITS, et gènes codant différentes protéines).
Des études morphométriques et physiologiques seront menées afin de
caractériser les limites des variabilités intraspécifiques.
Notre étude devrait permettre de mieux comprendre l’adaptation, la
spéciation et l’écologie des protistes aquatiques.
Partenaires UMR 7093 - CNRS LOV /Univ Paris 6
UMR 8079 CNRS ESE /Univ Paris-Sud
UMR 7144 CNRS RSCF/U. Paris6
UMR 6543 CNRS ISBDC /UNSA
Coordinateur Monsieur John R DOLAN
[email protected]
Aide de l’ANR 497 000 Euros
Début et durée Janvier 2008 – 36 mois
Référence ANR-07-BDIV-004

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Titre du projet AQUAPHAGE - Relations entre diversité
procaryotique et virale (PHAGE) au sein de
différents environnements AQUAtiques
Résumé
Les virus constituent l’entité biologique la plus abondante des écosystèmes
aquatiques. Il est aujourd’hui reconnu que leur rôle puisse être essentiel
dans le contrôle de la diversité des organismes procaryotes. Cependant,
l'étude des phages à l’échelle des communautés naturelles reste limitée.
C’est dans ce cadre scientifique que se situent les objectifs spécifiques
d’AQUAPHAGE:
1) déterminer l’effet des virus (par comparaison avec celui des
prédateurs) sur la dynamique et la biodiversité des procaryotes ;
2) relier la nature du cycle de vie (cycles lysogénique vs. lytique) à la
diversité des phages ;
3) valider le modèle mathématique dit du « phage kills the winner »,
entre autres ;
4) conduire des expériences in situ de co-variation entre biodiversité
virale et biodiversité des hôtes. La mise en oeuvre d'approches
métagénomiques permettra de tester la robustesse du modèle cité.
Les études seront menées dans des environnements aquatiques
contrastés (approche écologique comparative), ce qui permettra de relier
biodiversité virale et productivité des écosystèmes.
Partenaires UMR 7093 CNRS/UPMC
UMR 5119 ECOLAG CNRS-IFREMER-UM2
UMR 8621 CNRS/Univ Paris 11
UMR 42 INRA
UMR 6217 CRELA
UMR 6023 UBP CNRS
University of Bergen
Coordinateur Monsieur Markus WEINBAUER
[email protected]
Aide de l’ANR 650 000 Euros
Début et durée Janvier 2008 – 36 mois
Référence ANR-07-BDIV-015