S OME S GÉN TION DE

L’ORGANISATION DES GÉNOMES

Un exemple: le génome humain
•Génome = la totalité de
l’ADN d’un jeu haploïde de chromosome
•Peut aussi désigner la
totalité de l’information génétique d’un individu particulier (identique à génotype dans ce cas)
•Ne peut jamais être
utilisé dans les deux sens à la fois
•-ome = système,
ensemble d’éléments d’une même base
STRACHAN, 1999

Quelle est la taille d’un génome?
•Figure 2-7 shows the
size ranges of
representative genomes. Notice that
generally genome size
increases with complexity of the group, but there is considerable variation (up to a thousandfold!) in some of the groups.
Pourquoi les génomes sont-ils si grands?

Quelle est la taille d’un génome?
La valeur de C
The diversity of archaeal, bacterial, and eukaryotic genome sizes as currently known from more than 10,000 estimates. From Gregory (2005). CONSULTER :http:// www.genomesize.com/

Genome
Group
Size (kb)
Number
of
genes
Eukaryotic nucleus
Saccharomyces cerevisiae
Yeast
13,500 (L)
6,000
Caenorhabditis elegans
Nematode
100,000 (L)
13,500
Arabidopsis thaliana
Plant
120,000 (L)
25,000
Homo sapiens
Human
3,000,000 (L)
20 à 30 000
Prokaryote
Escherichia coli
Bacterium
4,700 (C)
4,500
Hemophilus influenzae
Bacterium
1,830 (C)
1,703
Methanococcus
jannaschii
Bacterium
1,660 (C)
1,738
Viruses
T4
Bacterial virus
172 (L/C)
300
HCMV (herpes group)
Human virus
229 (L)
200
Eukaryotic organelles
S. cerevisiae
mitochondria
Yeast
78 (C) 34
H. sapiens mitochondria
Human
17 (C) 37
Marchantia polymorpha
chloroplast
Liverwort
121 (C) 136
Plasmids
F plasmid
In
E. coli 100 (C) 29
kalilo
In Neurospora,
a fungus
9 (L) 2
En fonction du nombre
de gènes de l’organisme
La notion de complexité