Atelier GIS COOC Bordeaux 9/10 février 2015 Télédétection satellite et aéroportée de la concentration en chlorophylle a en milieu turbide côtier Larnicol Morgane Master SML mention physique marine, UBO David Doxaran¹, Pierre Gernez² 1 : Laboratoire Océanographique de Villefranche/mer 2 : Laboratoire Mer Molécule Santé, Université de Nantes Résultats stage Master 2 SML mention Physique Marine ➢ Télédétection de la chla en Baie de Bourgneuf Laboratoire Océanographique de Villefranche/mer Mars-septembre 2014 Sujet de thèse CIFRE, ACRI-ST ➢ Télédétection hyperspectrale des eaux littorales turbides Laboratoire Mer Molécules Santé, Université de Nantes 2015-2018 Contexte du stage : Le projet Gigassat Projet Gigassat (2012, Fabrice Pernet Ifremer, Pierre Gernez MMS) Impact des changements environnementaux sur les écosystèmes ostréicoles Composition de l'eau de mer : Matières en suspension, phytoplancton ➢ La fraction algale des MES intervient dans la croissance Phytoplancton, MEB ➢ Le phytoplancton constitue une part importante de l'alimentation de l'huître ➢ La chlorophylle a est un indicateur de la biomasse phytoplanctonique Objectif du stage : quantifier la concentration en chlorophylle a dans la Baie de Bourgneuf à partir de données satellites 9 février 2015 Atelier GIS COOC 3 Les caractéristiques de la Baie de Bourgneuf Remise en suspension des MES par les courants de marée Différences de turbidité entre le Nord et le Sud rr Ba o er r iè e us e ch La Coupelasse ~ 154 mg/L Graisselous ~ 34 mg/L Valeurs moyennes annuelles mesurées en 1995,Haure et Baud Adaptée de Barillé et al, 2000 de Barillé et al, 2000 9Adaptée février 2015 Principaux flots de marée Atelier GIS COOC 4 La remise en suspension de microalgues benthiques Marée basse Marée haute Forte variabilité tidale des MES et chla Très forte turbidité des eaux de la baie Blanchard et al, 2006 9 février 2015 Atelier GIS COOC 5 La variabilité des concentrations en chla Corrélation chla et MES Microalgues benthiques Variations de la chla en opposition de phase avec celles des hauteurs d'eau 9 février 2015 Atelier GIS COOC 6 Intérêt des observations satellites Mesures directes Précises mais ponctuelles → description spatio-temporelle limitée Mesures satellites → vue instantanée de l'ensemble de la Baie → bonne répétitivité dans le temps → bonne couverture temporelle : accès à des données en continu depuis 1998 Il est nécessaire de développer des algorithmes pour estimer la chla dans l'eau de mer à partir de données satellites. Il n'existe pas encore de modèle fiable pour les eaux côtières les plus turbides. 9 février 2015 Atelier GIS COOC 7 Les caractéristiques du radiomètre MERIS Radiomètre MERIS Plateforme ENVISAT Propriétaires Agence spatiale européenne Résolution spatiale 300 m (FR) Résolution temporelle 2/3 jours Résolution spectrale 15 bandes 412.5/900 nm Durée de vie 2002/2012 Caractéristiques du radiomètre MERIS MERIS normalised SRF, theoretical central wavelengths band 1 band 3 band 5 band 7 band 9 band 11 band 13 band 15 Response 1,000 0,800 0,600 0,400 0,200 0,000 400 Bande spectrale centrée à 665 nm 9 février 2015 500 600 700 800 band 2 band 4 band 6 band 8 band 10 band 12 band 14 900 wavelength [nm] Atelier GIS COOC 8 Les limites des algorithmes standards Eaux claires océaniques Eaux turbides côtières Spectres de réflectances, Baie de Bourgneuf Spectres de réflectances, eaux claires Utilisation du signal dans le rouge et le proche infrarouge, minima de Rrs à 675 nm 9 février 2015 Atelier GIS COOC 9 Les mesures réalisées dans la Baie de Bourgneuf Campagne de mesure avril 2013 : 31 stations chla in situ (HPLC) Rrs in situ (TRIOS, ASD) Sondes : deux ans de données (20052006) utilisées pour les match-ups 2 sites ostréicoles 9 février 2015 Atelier GIS COOC 10 Relation bio-optique de quantification de la chla pour la Baie de Bourgneuf Combinaison de Rrs in situ : Algorithme 3B, Gitelson et al, 2008 chla α [(1/Rrs665)-(1/Rrs709)]*Rrs754 Rrs in situ, Baie de Bourgneuf 2013 Algorithme 2B, Le et al, 2012 chla α Rrs709/Rrs665 9 février 2015 Atelier GIS COOC 11 Sélection des données lors des matchups (MERIS FR) 300 m 300 m Pixels MERIS Mesure in situ Cohérence spatiale Cohérence temporelle Sélection du pixel le plus proche pour limiter l'incertitude spatiale liée à une forte variabilité Sélection des valeurs les plus proches et interpolation à partir des données des sondes 9 février 2015 Atelier GIS COOC 12 Résultat des matchups (MERIS FR) Facteurs d'erreur : Résolution spectrale Résolution spatiale Correction atmosphérique → SAABIO Algorithme 3B : RMSE = 6.06 mg/m3 Algorithme 2B : RMSE = 5.25 mg/m3 9 février 2015 Atelier GIS COOC 13 Exemple de carte de concentration en Chla (MERIS FR) RMSE ~ 5,25 mg/m³ Estuaire de la Loire Baie de Bourgneuf Ile de Noirmoutier 9 février 2015 Correction atmosphérique SAABIO intégrant la BPAC Atelier GIS COOC 14 Vers une classification des eaux ? Complémentarité des algorithmes OC5, Gohin et al, 2003, 14 mars 2006 9 février 2015 Algorithme 2B (Le et al, 2012), 14 mars 2006 Atelier GIS COOC 15 Contribution des substances colorées dissoutes Eau pure Constituants colorés MES : particules algales + particules non algales CDOM : matières organiques colorées dissoutes 9 février 2015 Atelier GIS COOC 16 Conclusions du stage BILAN STAGE LIMITES MÉTHODE ➢ ➢ Caractérisation des propriétés bio-optiques de la baie ➢ ➢ Test des algorithmes standards « couleur de l'eau » ➢ ➢ ➢ Développement d'un algorithme adapté aux eaux les plus turbides Validation de l'algorithme pour la Baie de Bourgneuf 9 février 2015 ➢ Non adaptée aux eaux du plateau continental La contribution des substances dissoutes n'est pas étudiée La correction atmosphérique utilisée est source d'erreurs La résolution spectrale du satellite n'est pas optimale Atelier GIS COOC 17 Perspectives Couplage entre le modèle de croissance et les observations satellites Modèle écophysiologique de l'huître creuse, adapté de Barillé et al (1997) 9 février 2015 Atelier GIS COOC 18 Sujet de thèse : Télédétection hyperspectrale des eaux littorales turbides Thèse CIFRE, Société ACRI-ST, 2015/2018 laboratoire Mer Molécules Santé, Université de Nantes Directeur : Patrick Launeau (LPG) Co-directeur : Pierre Gernez (MMS) Co-encadrant : David Doxaran (LOV) Objectifs Détecter la concentration en chla dans les eaux très turbides bordant les vasières intertidales 9 février 2015 Atelier GIS COOC 19 Sujet de thèse : Télédétection hyperspectrale des eaux littorales turbides ➢ ➢ ➢ Amélioration des algorithmes bio-optiques Données aéroportées hyperspectrales pour étude spatio-temporelle de la chla Campagne de mesures in situ prévue en 2015 STAGE : données Baie de Marennes Oléron, projet PNTS Turbo ➢ STAGE : complexité des eaux intertidales supplémentaires Simulation des réponses des futurs capteurs satellites OLCI et MSI 9 février 2015 Atelier GIS COOC 20 9 février 2015 Atelier GIS COOC Images hypespectrales acquises en Baie de Bourgneuf en 2002 (capteur DAIS), 2009 et 2010 (capteur HySpex) 21 MERCI DE VOTRE ATTENTION ! DES QUESTIONS ? 9 février 2015 Atelier GIS COOC 22 Annexe : comparaison des différents capteurs Radiomètre Propriétaire Plateforme Résolution temporelle Résolution spatiale Résolution spectrale MERIS ESA ENVISAT 2/3 jours 300 m HR 15 bandes spectrales 412.5-865 nm OLCI ESA Sentinelle 3 2/3 jours 300 m HR 21 bandes 400-1020 nm Δλ = 15 nm MSI ESA Sentinelle 2 10 m HR DAIS Aéroportée 496-1035 nm Δλ = 15/20 nm HySpex VNIR Aéroportée 400_1000 nm Δλ = 4.5 nm 23 9 février 2015 Atelier GIS COOC Caractéristiques des capteurs MERIS et OLCI et MSI et aéroportés DAIS et HySpex