Bilan en Languedoc-Roussillon - CClin Sud-Est

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EPC: Bilan de 3 années
de surveillance en
Languedoc-Roussillon
10ème JRLIN, 19 septembre 2014, Nîmes
Alix PANTEL, Mathilde BOUC BOUCHER, Jean-Philippe LAVIGNE
Laboratoire de Microbiologie, CHRU Nîmes
UFR de Médecine Montpellier-Nîmes, INSERM U1047
Contexte


Diffusion des Bactéries MultiRésistantes (BMR)
Emergence des Bactéries Hautement Résistantes (BHRe)
Contexte



Diffusion des Bactéries MultiRésistantes (BMR)
Emergence des Bactéries Hautement Résistantes (BHRe)
Peu de nouvelles classes d’ATB
Nombre de nouveaux ATB approuvés aux États-Unis (2000-2012)
[Butler MS et al., J Antibiot 2013]
BMR / BHR: quelles bactéries?

BMR:
–
Staphylococcus aureus Résistant à la Méticilline (SARM)
–
Entérobactéries résistantes aux céphalosporines de 3ème
génération:
•
β-Lactamase à Spectre Etendu (BLSE)
•
Céphalosporinase hyperproduite
–
Acinetobacter baumannii résistant aux β-lactamines
–
Stenotrophomonas maltophilia
–
Pseudomonas aeruginosa résistant à 2 ATB dont PIP, CAZ, IPM,
CIP

BHRe:
–
Entérobactéries Productrices de Carbapénémases (EPC)
–
Enterococcus faecium Résistants aux Glycopeptides (ERG)
Problématique
BMR: Evolution
Incidence (/ 1 000 jh)

E. coli R C3G 2002
[Trystram, Jarlier, AP-HP 2010]
E. coli R C3G 2012
Données: European Antimicrobial Resistance Surveillance Network (EARS-Net)
Problématique
 Carbapénèmes:
 Alternative++ dans le TTT des infections à BGN BMR
 Résistance
Carbapénèmes
LPS
Membrane externe
Omp
Espace
périplasmique
Membrane interne
Cytoplasme
INFLUX
Problématique
 Carbapénèmes:
 Alternative++ dans le TTT des infections à BGN BMR
 Résistance
Carbapénèmes
LPS
IMPERMEABILITE
Membrane externe
Omp
Espace
périplasmique
Membrane interne
Cytoplasme
INFLUX
Problématique
 Carbapénèmes:
 Alternative++ dans le TTT des infections à BGN BMR
 Résistance
Carbapénèmes
LPS
IMPERMEABILITE
Membrane externe
Omp
Espace
périplasmique
CARBAPENEMASE
Membrane interne
Cytoplasme
INFLUX
BGN producteurs de carbapénémases

Diffusion mondiale

Classification d’Ambler:
Classe
Principales
enzymes
Bactéries
A
KPC, IMI, GES
Entérobactéries++
P. aeruginosa
NDM, VIM, IMP
Entérobactéries
P. aeruginosa
Acinetobacter spp.
OXA
Acinetobacter spp.
Entérobactéries
B
D

Impasse thérapeutique +++
EPC en Europe
 K. pneumoniae résistantes aux carbapénèmes en Europe en 2012
(infections invasives):
Données: European Antimicrobial Resistance Surveillance Network (EARS-Net)
EPC en France

Bilan national au 14 Mars 2014:
Evolution du nombre d’épisodes d’EPC rapportés en France entre 2004-2014
[Données InVS – http://www.invs.sante.fr]
EPC en France

Bilan national au 14 Mars 2014:
K. pneumoniae: 66%
OXA-48: 74%
Evolution du nombre d’épisodes d’EPC rapportés en France entre 2004-2014
[Données InVS – http://www.invs.sante.fr]
Recommandations
Circulaire du 6 décembre 2010 + Instruction du 14 Janvier 2014
Contrôle des cas importés + Prévention de la transmission croisée
 Identification des patients à risque de portage


Patients rapatriés d’un établissement de santé étranger
Patients ayant un ATCD d’hospitalisation à l’étranger dans l’année
 Isolement prophylactique: précautions complémentaires contact ± gouttelettes
 Dépistage systématique / écouvillonnage rectal
 Analyse moléculaire de la résistance par 1 « laboratoire expert »
Recommandations
Circulaire du 6 décembre 2010 + Instruction du 14 Janvier 2014
Contrôle des cas importés + Prévention de la transmission croisée
 Identification des patients à risque de portage


Patients rapatriés d’un établissement de santé étranger
Patients ayant un ATCD d’hospitalisation à l’étranger dans l’année
 Isolement prophylactique: précautions complémentaires contact ± gouttelettes
 Dépistage systématique / écouvillonnage rectal
 Analyse moléculaire de la résistance par 1 « laboratoire expert »
1/2/11: Laboratoire de Bactériologie du CHU de Nîmes =
Laboratoire de référence en Languedoc-Roussillon
Recommandations
Circulaire du 6 décembre 2010 + Instruction du 14 Janvier 2014
Contrôle des cas importés + Prévention de la transmission croisée
 Identification des patients à risque de portage


Patients rapatriés d’un établissement de santé étranger
Patients ayant un ATCD d’hospitalisation à l’étranger dans l’année
 Isolement prophylactique: précautions complémentaires contact ± gouttelettes
 Dépistage systématique / écouvillonnage rectal
 Analyse moléculaire de la résistance par 1 « laboratoire expert »
1/2/11: Laboratoire de Bactériologie du CHU de Nîmes =
Laboratoire de référence en Languedoc-Roussillon
Bilan au 19/09/14
Méthodes
Souche suspecte envoyée au laboratoire de bactériologie du CHU de Nîmes
CMI carbapénèmes
Puce CHECK-MDR CT102® (Check Point)
A
Xpert Carba-R® (Cepheid)
blaCTX-M-15
blaKPC
B
blaOXA-48
C
Depuis le 16/08/14
Analyse de la clonalité / rep-PCR (DiversiLab®, bioMérieux)
EPC en Languedoc-Roussillon
 Depuis le 01/02/2011:


425 entérobactéries reçues
348 entérobactéries R à l’ertapénème ± imipénème (82%)
EPC en Languedoc-Roussillon
 Depuis le 01/02/2011:


425 entérobactéries reçues
348 entérobactéries R à l’ertapénème ± imipénème (82%)
n=149 (43%)
E. cloacae
n=88 (25%)
K. pneumoniae
n=58 (17%)
E. coli
E. aerogenes
n=22 (6%)
n=15 (4%)
C. freundii
n=8 (2%)
K. oxytoca
H. alvei
n=3 (1%)
Autres
n=5 (2%)
0
20
Nombre de souches
40
60
80
100
120
140
160
EPC en Languedoc-Roussillon
 Depuis le 01/02/2011:



425 entérobactéries reçues
348 entérobactéries R à l’ertapénème ± imipénème (82%)
89 EPC (26% des entérobactéries R)
n=7 (8%)
E. cloacae
n=55 (62%)
K. pneumoniae
n=24 (27%)
E. coli
E. aerogenes
n=1 (1%)
n=1 (1%)
C. freundii
n=1 (1%)
K. oxytoca
H. alvei
Autres
Nombre de souches
0
20
40
60
80
100
120
140
160
0
Feb. 2011
Mar. 2011
Apr. 2011
May 2011
Jun. 2011
Jul. 2011
Aug. 2011
Sep. 2011
Oct. 2011
Nov. 2011
Dec. 2011
Jan. 2012
Feb. 2012
Mar. 2012
Apr. 2012
May 2012
Jun. 2012
Jul. 2012
Aug. 2012
Sep. 2012
Oct. 2012
Nov. 2012
Dec. 2012
Jan. 2013
Feb. 2013
Mar. 2013
Apr. 2013
May-13
Jun. 2013
Jul. 2013
Aug. 2013
Sep. 2013
Oct. 2013
Nov. 2013
Dec. 2013
Jan. 2014
Feb. 2014
Mar. 2014
Apr. 2014
May 2014
Jun. 2014
Jul. 2014
Aug. 2014
Sep. 2014
EPC en Languedoc-Roussillon
 Evolution du nombre de cas depuis février 2011:
30
25
20
15
10
5
Resistant strains received
OXA-48 producers
KPC-producers
NDM-producers
K. pneumoniae: clonalité
Rep-PCR DiversiLab® (bioMérieux)
Interprétation DiversiLab Strain Typing
K. pneumoniae: clonalité
Rep-PCR DiversiLab® (bioMérieux)
Interprétation DiversiLab Strain Typing
NIMES, MED GER, Avril 2014
NIMES, REA CHIR, Avril 2014
Inde
K. pneumoniae: clonalité
Rep-PCR DiversiLab® (bioMérieux)
Interprétation DiversiLab Strain Typing
NIMES, MED GER, Avril 2014
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Août 2014
PERPIGNAN, MEDIPOLE, Août 2014
PERPIGNAN, MEDIPOLE, Août 2014
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Août 2014
NIMES, REA CHIR, Avril 2014
Inde
K. pneumoniae: clonalité
Rep-PCR DiversiLab® (bioMérieux)
Interprétation DiversiLab Strain Typing
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Sept 2014
NIMES, MED GER, Avril 2014
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Août 2014
PERPIGNAN, MEDIPOLE, Août 2014
PERPIGNAN, MEDIPOLE, Août 2014
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Août 2014
NIMES, REA CHIR, Avril 2014
Inde
K. pneumoniae: clonalité
Rep-PCR DiversiLab® (bioMérieux)
Interprétation DiversiLab Strain Typing
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Sept 2014
NIMES, MED GER, Avril 2014
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Août 2014
CH BEZIERS, Sept 2014
PERPIGNAN, MEDIPOLE, Août 2014
PERPIGNAN, MEDIPOLE, Août 2014
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Août 2014
NIMES, REA CHIR, Avril 2014
Inde
K. pneumoniae: clonalité
Rep-PCR DiversiLab® (bioMérieux)
Interprétation DiversiLab Strain Typing
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Sept 2014
NIMES, MED GER, Avril 2014
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Août 2014
CH BEZIERS, Sept 2014
PERPIGNAN, MEDIPOLE, Août 2014
PERPIGNAN, MEDIPOLE, Août 2014
PERPIGNAN, SAINT PIERRE, Août 2014
NIMES, REA CHIR, Avril 2014
Inde
 1 seul lien avec l’étranger
 Patients porteurs d’autres espèces d’EPC
Diffusion souches + plasmides
Conclusion
 Augmentation inquiétante de l’incidence des EPC en LR
 Principales EPC = K. pneumoniae OXA-48
 Emergence des carbapénémases NDM en 2014
 Liens avec pays étranger?
 Précautions standard +++
 Bon usage des ATB +++
Outils de diagnostic
 Mileux sélectifs:


chromID CARBA®
chromID OXA48® (bioMérieux)
[Devigne et al. ECCMID 2013]
 Tests colorimétriques:
 CARBA NP test
[Nordmann et al., JAC 2012]
 Rapid CARB Screen Kit®
(ROSCO Diagnostica / EUROBIO)
 Tests phénotypiques:
 Arbre décisionnel de l’ONERBA
 KPC/MBL&OXA-48 Confirm kit
(ROSCO Diagnostica / EUROBIO)
 PCR en temps réel:
 Xpert® Carba-R (Cepheid)
Se 99%, Sp 92%
Remerciements
 Pr Lavigne
 EOH et Dr Mourlan
 Internes du laboratoire de bactériologie:
Mathilde Bouc Boucher, Marion Urbano, Nicolas Elana, Dimitri Souzy,
Alexandre Marocco, Amandine Barrot..
Merci pour votre attention
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