Les suppresseurs du RNA silencing
des phytovirus : caractérisation et mode d’action
Drissa Sérémé
1,2
Séverine Lacombe
2
Florence Vignols
2
Gnissa Konaté
1
Alfred S. Traoré
3
Christophe Brugidou
2
1
Inera, Laboratoire de virologie
et de biotechnologies végétales,
Station de Kamboinsé,
01 BP 476 Ouagadougou 01,
Burkina Faso
2
UMR UP-IRD-CNRS 5096,
Centre IRD, 911, avenue Agropolis
BP 64501, 34394 Montpellier Cedex 5,
France
3
Université de Ouagadougou,
CRSBAN, UFR SVT, 03 BP 7021
Ouagadougou 03, Burkina Faso
Résumé. L’extinction post-transcriptionnelle des gènes ou post-transcriptional
gene silencing (PTGS) est un mécanisme fondamental de défense des plantes
contre les virus, les transgènes et les transposons. Certains virus de plantes
sont cependant capables de contourner ce mécanisme de défense via la syn-
thèse de protéines virales antagonistes appelées « suppresseurs de silencing ».
Cette stratégie, bien connue chez les virus de plantes, est également présente
chez les virus qui infectent les animaux. Ces protéines inhibent le mécanisme
d’extinction post-transcriptionnelle des gènes par différentes stratégies qu’il est
possible d’analyser. Dans cette revue, nous présenterons les principales protéi-
nes « suppresseur de silencing » codées par les virus de plantes, ainsi que les
méthodes utilisées pour les identifier et caractériser leur mode d’action.
Mots clés
:
PTGS, suppresseurs de silencing, phytovirus, mode d’action
Abstract. RNA silencing or Post-transcriptional gene silencing (PTGS) in
plants is a fundamental defence mechanism against viruses, transgenes and
transposons. Most viruses, if not all, are able to overcome RNA-silencing
through the production of so-called “silencing suppressors”with counter-
defence ability”. This strategy is well known for plant and animal viruses.
Silencing suppressor proteins block the host RNA silencing by targeting diffe-
rent steps of the silencing pathway. In this review, we will focus on the major
silencing suppressor proteins encoded by plant viruses and on the methods
used to identify and characterize the molecular bases of silencing suppression.
Key words
:
PTGS, silencing suppressor, plant viruses, molecular basis of
suppression
Introduction
Le silencing est un mécanisme ancestral très conservé
dans l’évolution. Identifié tout d’abord chez les plantes
comme phénomène de « co-suppression » [1], sa véritable
mise en évidence n’a été réalisée qu’en 1998 chez le
nématode Caenorhabditis elegans [2], et son mécanisme
formellement identifié un an après avec la découverte des
petits ARNs [3], d’où son nom actuel de « post transcrip-
tional gene silencing » (PTGS). Ce mécanisme existe éga-
lement chez les Ciliates [4] et le champignon ascomycète
(Neurospora crassa) où il est appelé quelling [5], ainsi
que chez les animaux tels que la drosophile [6] et les mam-
mifères [7] où il est appelé ARNi (ARN interference). Il est
impliqué dans des fonctions cellulaires fondamentales
aussi variées que la défense antivirale, le maintien
de l’intégrité du génome, le contrôle épigénétique ou le
développement.
Le mécanisme en amont conduisant au silencing est activé
par des molécules d’ARN double brin (ARNdb) ou structure
secondaire de l’ARN (figure 1),etcomprenddeuxphases
distinctes : une phase d’initiation et une phase effectrice,
comprenant elle-même le maintien et la propagation systé-
mique du signal silencing (pour revue [8, 9]). Chez la plante
modèle Arabidopsis thaliana, les ARNdb sont reconnus par
quatre paralogues appartenant à la famille des ribonucléases
de classe III appelées Dicer (ou DCL pour Dicer-like).
Les ARNdb reconnus sont clivés spécifiquement par une
des 4 enzymes Dicer en ARN duplex de 21 à 24 paires de
base. Ces enzymes, nommées DCL1, 2, 3 et 4, possèdent un
domaine de liaison à l’ARNdb [10] et produisent respective-
mentdesduplexdepetitsARNsde21,22,24et21nt[11].
Virologie 2009, 13 (6) : 305-16
doi: 10.1684/vir.2009.0278
Tirés à part : C. Brugidou
revue
Virologie, Vol. 13, n
o
6, novembre-de
´cembre 2009 305
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