v
1.3 Cytométrie en flux et usage clinique .................................................................................... 16
1.3.1 Human Immunophenotyping Consortium ..................................................................... 16
1.3.2 Outils d’analyses de données multiparamétriques ......................................................... 18
1.3.2.1 SPADE et viSNE ..................................................................................................... 18
2. Hypothèse ................................................................................................................................... 19
3. Objectifs ..................................................................................................................................... 20
4. Méthodologie ............................................................................................................................. 21
4.1 Source des cellules mononucléées du sang, du sérum et du plasma .................................... 21
4.1.1 Participants en santé ....................................................................................................... 21
4.1.2 Patients LED .................................................................................................................. 22
4.2 Analyses phénotypiques ....................................................................................................... 23
4.2.1 Marquage extracellulaire ............................................................................................... 23
4.2.2 Anticorps ........................................................................................................................ 23
4.2.3 Acquisition et analyse des données ................................................................................ 26
4.2.3.1 Spanning-tree Progression Analysis of Density-normalized Events (SPADE) ...... 27
4.3 Dosage des facteurs solubles ................................................................................................ 28
4.3.1 ELISArray ...................................................................................................................... 28
4.3.2 Essai Bioplex ................................................................................................................. 28
4.4 Activation in vitro ................................................................................................................. 29
4.4.1 Milieu de culture ............................................................................................................ 29
4.4.2 Essais d’activation ......................................................................................................... 29
4.4.3 Mesure des facteurs solubles dans les surnageants de culture ....................................... 30
4.5 Analyses statistiques ............................................................................................................. 30
5. Résultats ..................................................................................................................................... 32
5.1 Caractéristiques médicales des patients et des participants à l’étude ................................... 32
5.2 Patron des cytokines ............................................................................................................. 35
5.2.1 Facteurs solubles dans le sérum des patients LED ........................................................ 37
5.2.3 Sécrétion in vitro ............................................................................................................ 43
5.3 Étude comparative de l’effet de la congélation sur les PBMC ............................................. 45
5.3.1 Effets de la congélation sur les lymphocytes et les monocytes ..................................... 45
5.3.2 Effets de la congélation sur les sous-populations des lymphocytes T ........................... 47