LES MICRO-ORGANISMES -I- Les Bactéries

LES MICRO-ORGANISMES
Les micro-organismes (germes) ou microbes sont des organismes vivants microscopiques
(invisible à l'œil nu) et qui ne peuvent donc être observés qu'à l'aide d'un microscope.
La maladie infectieuse est la conséquence de la pénétration et de la multiplication de micro-
organismes pathogènes dans notre organisme.
Notre environnement présente une infinité de germes. On distingue :
• Les germes non nuisibles
• Les germes agressifs qui en passant les barrières naturelles de défenses (peau) vont
avoir une activité pathogène.
Les micro-organismes sont généralement unicellulaires.
La maladie infectieuse, pour se déclarer doit présenter trois conditions :
1. Il faut un germe (micro-organisme)
2. il faut une défaillance au niveau de la barrière naturelle
3. (un déficit immunitaire (SIDA))
-I- Les Bactéries
C’est un micro-organisme unicellulaire appartenant au règne végétal. (1 micron = 1x10-6
mètre.
La plupart d’entre sont détruit par la chaleur (>60°C) ou par les désinfectants (eau de
Javel sur surface lavée avant au savon diluée dans l’eau froide) ou encore par les
antibiotiques.
Les bactéries peuvent vivre et se reproduire de manière autonome dans la nature.
Structure d’une bactérie
On y retrouve les éléments contenus dans
les cellules à savoir, la membrane, le noyau
avec sont ATN et son ADN (un seul
chromosome), les ribosomes pour la
synthèse des protéines, les mitochondries
(poumon de la cellule : cycle respiratoire).
GERMES
Virus Bactérie Prion Parasite Champignon

L’ADN est dans le noyau et il contient l’information
génétique de l’individu, c’est se qu’on appelle le
génotype, pour pouvoir faire des copies du phénotype,
l’information doit passer du noyau vers le cytoplasme,
il faut pour cela faire appel à un intermédiaire l’ARN,
c’est ce qu’on appelle la transcription.
La différenciation des bactéries :Test de Gram
1er prédicat
Le colorant dit « violet de gentiane » vire au rose lorsqu’il est en contact avec l’alcool.
2ème prédicat
Certains genres de bactéries ont en commun une membrane qui retient certains colorants. Ils
forment le groupe des bactéries Gram Positives (Gram +)
Toutes les autres bactéries soit qu'elles n'ont pas de membrane soit que la nature de leur
membrane est totalement différentes se laissent décolorer par la méthode de Gram. Elle sont
dites Gram négatives. (Gram -)
Analyse :
Les éléments tissulaires et les bactéries Gram- sont colorés en rose. Les Bactéries Gram+ sont
colorés en violet.
Différents type de bactéries
• sphériques (cocci),
• cylindriques (bacille),
• spiralées (spirille),
• enroulées (spirochète) à appendice bourgeonnante ou filamenteuse.
Un cocci est une bactérie de forme sphérique, par opposition à la forme allongée en
bâtonnet, appelée bacille.

Bacille est de forme cylindrique.
Un bacille est une bactérie en forme de bâtonnet, d'où son
nom. Il existe des bacilles à Gram négatif (comme
Escherichia coli) et des bacilles à Gram positif comme ceux
du genre Bacillus.
Spirilles : Terme désignant les bactéries en forme de filaments allongés et contournés en
spirale.
Spirochète : Bactérie très mobile ayant la forme d'une petite hélice (hélicoïdale).
Les éléments nécessaires à la vie d’une bactérie
• L’eau
• La chaleur (entre 20 et 40°C)
• La présence ou non d’O² (aérobie ou anaérobie)
• Un pH neutre (ou légèrement alcalin)
• Energie (sucre, graisse, proteïne)
Reproduction
Les bactéries sont des organismes asexués, la
reproduction se fait par division cellulaire. Une
cellule (appelée cellule mère) va donner naissance à
deux cellules identiques appelées cellules filles, qui à
leur tour deviennent mères, etc...
Dans des conditions optimales et pour certaines
espèces, le temps que met une cellule mère pour
donner deux cellules filles est de l'ordre de 20 minutes.
0 7 14
acide
Basique
pH

Les liquides ‘réservoirs ‘
• ECBU : L'examen cytobactériologique des urines, pour détecter une infection
urinaire
• ECBC : Techniquement, l’ECBC consiste en un examen direct immédiat du crachat pour le
comptage des cellules et la recherche de micro-organismes après coloration de Gram, puis sa
mise en culture dont le résultat ne revient que 48 à 72 heures plus tard
• Hémoculture : Prélèvement de sang pour mise en culture et recherche de germes
• Ponction lombaire (ponction de LCR) :La ponction lombaire est un examen médical
consistant à recueillir le liquide céphalo-rachidien (LCR), ou liquide cérébro-spinal,
pour l'étudier (examen cytologique pour rechercher des cellules, en particulier les
globules blancs, biochimique pour le dosage du glucose, des protéines, des ions
chlorure, bactériologique par la mise en culture pour identifier un éventuel germe en
cause et réaliser un antibiogramme pour savoir quels antibiotiques seront efficaces sur
ce germe).
• Le PU (prélèvement à l’aide d’écouvillon) (déchet immunitaire et de bactéries). Le pus
consiste en des macrophages (un type de leucocytes), des débris, des cellules mortes
ou mourantes
La flore commensale
S'applique spécifiquement aux micro-organismes qui colonisent l'organisme (généralement la
peau ou les muqueuses) sans provoquer de maladie.
Les bactéries commensales peuvent devenir pathogènes pour le sujet immunodéprimé.
La Flore commensale, transmise au nouveau-né au contact de la mère, et qui
participe à la digestion et à sa protection contre les agressions bactériennes
pathogènes.
Germes commensaux.
La flore saprophyte
La flore saprophyte désigne l'ensemble des bactéries nécessaires à l'organisme se situant dans
les intestins. Ces bactéries symbiotiques sont indispensables pour la digestion des aliments et
synthétisent de très nombreuses molécules nécessaires à la vie humaine ou animale telle que
certaines vitamines.
La flore pathogène
Elle est constituée par un ensemble de germes vivant sur l’hôte (ici l(homme) qui cause des
troubles pathologiques.
Exemple de bactéries
• Le Staphylocoque doré est retrouvé chez 15 à 30 % des individus sains au niveau des
fosses nasales et de la gorge. Il est également retrouvé en faible quantité dans le tube
digestif et souvent au niveau du périnée. À partir du rhinopharynx, la bactérie est
disséminée sur la peau du visage et des mains par aérosols.
• L’Escherichia coli est un bacille gram négatif de la famille des entérobactéries. C’est
un hôte commun de la microflore commensale intestinale de l’Homme.L’ E. coli
constitue alors tout au long de la vie de l’hôte l’espèce bactérienne dominante de la
microflore anaérobie facultative de l’intestin. (dans les matières fécales, les eaux
usées)

-II- Les Virus
a) Définition
Un virus est une entité biologique qui nécessite une cellule hôte, dont il utilise les
constituants pour se multiplier. Les virus sont des objets particulaires, infectieux, constitués
au minimum d'un acide nucléique et de protéines.
Les virus ont une taille qui les situe tout en bas de l'échelle des dimensions. En moyenne, la
taille d'un virus n'est qu'un millième de celle d'une bactérie, ce sont les plus petits micro-
organismes soit 10-9 m (nanomètre)
b) Structure du virus
Une particule virale complète, appelé virion, est composé d’un filament d’acide nucléique,
généralement stabilisé par des
nucléoprotéines basiques, enfermé
dans une coque protéique
protectrice appelée capside. La
forme de la capside est à la base
des différentes morphologies des
virus.
De nombreux virus sont entourés
d'une enveloppe (ou péplos) qui
prend naissance au cours de la
traversée des membranes
cellulaires. Sa constitution est complexe et présente un mélange d'éléments cellulaires et
d'éléments d'origine virale. On y trouve des protéines, des glucides et des lipides. Les virus
possédant une enveloppe sont les virus enveloppés. Les virus ne possédant pas d'enveloppe
sont les virus nus.
c) La pénétration dans la cellule et la multiplication virale
Les virus se localisent dans les cellules, c'est à dire qu'ils vont pénétrer dans une cellule,
utiliser les constituants cellulaires pour se multiplier, puis ressortir de la cellule en la
détruisant. Ainsi, puisque des cellules saines sont détruites alors l'organisme fonctionne moins
bien, ce phénomène provoque des maladies.
On observe, en quelques chiffres, que la multiplication virale est très rapide, ainsi on peut
passer d'un seul virus à presque 100 000 en une journée.
Les virus ne peuvent se multiplier qu’au sein de cellules vivantes, par réplication de leur acide
nucléique. C’est l’interaction du génome viral et de la cellule hôte qui aboutit à la production
de nouvelles particules virales. L’infection d’une cellule par un virus, puis la multiplication du
virus peuvent se résumer en différentes étapes. Toutefois, après pénétration du virus dans la
cellule, ces étapes peuvent différer selon la nature du virus en question et notamment selon
qu’il s’agit d’un virus à ADN ou d’un virus à ARN.