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Lecture et Interprétation de
l ’antibiogramme
Nantes 07.10.2005
Jocelyne Caillon
Bactériologie
Hôpital de Nantes
Pourquoi tester la sensibilité
aux antibiotiques ?
Indications de l’antibiogramme
(1)
Aide
à la décision thérapeutique
Adaptation d’un traitement probabiliste
Contrôle post-traitement
Surveillance
de la résistance bactérienne
Intérêt épidémiologique: suivi des bactéries
multirésistantes (SARM, VRE, EBLSE)
Repère pour l’antibiothérapie probabiliste
Indications de l’antibiogramme
(2)
Comparaison
de souches bactériennes
Recherche d’une souche épidémique au cours
d’infections nosocomiales
Identification
bactérienne
Entérobactéries du Groupe II résistantes aux
Amox et Ticar K. pneumoniae
Enterococcus faecalis résistant à la
pristinamycine
Mécanismes d’action des
antibiotiques
- Action sur la paroi bactérienne
- Action sur la synthèse protéique
- Action sur la réplication de l’ADN
Action sur la paroi bactérienne
Béta-lactamines
Glycopeptides
Fosfomycine
Béta-lactamines (2)
Pénétration des béta-lactamines dans la bactérie
Bactéries à Gram positif
Cible facilement atteinte
Diffusion à travers le PG libre
Bactéries à Gram négatif
Porines: moyen de passage préférentiel des bétalactamines =petites molécules hydrophiles
Facteurs influant la pénétration: hydrophobicité, taille,
charge des molécules
Lyse bactérienne
par les béta-lactamines
Inhibition
de la synthèse du
peptidoglycane (PG):
Liaison aux protéines de liaison aux pénicillines
(PLP)
Fixation irréversible, liaison covalente
Activation
de systèmes autolytiques
entraînant la lyse
Glycopeptides
Vancomycine, teicoplanine
Molécules cycliques, de poids moléculaire élevé
Actifs sur les bactéries à Gram positif
Inhibition de la phase finale de synthèse du PG
Recouvrent le D-Ala-D-Ala terminal du pentapeptide-
disaccharide
Blocage des PLP et de l’élongation du PG
Bactéricidie lente (24 à 48 heures)
Fosfomycine
Active sur les bactéries à Gram positif et négatif
Franchit la membrane externe par les porines
Traversée du PG aisée en raison de la petite taille
Franchit la membrane cytoplasmique par 2 systèmes de
transport actif
Active lors de la synthèse initiale du PG
Inhibe la pyruvyl-transférase, phase cytoplasmique
Synergie d’action avec les autres antibiotiques actifs
sur la paroi bactérienne
Action sur la synthèse
protéique
Aminosides
Macrolides,
lincosamides, streptogramines
Rifampicine, chloramphénicol, acide fusidique
Cyclines
Les aminosides (1)
Concentration rapide et importante autour de la
bactérie
Pénétration énergie-dépendante
Inactifs sur les bactéries anaérobies
Inhibition de la synthèse protéique après fixation
sur l’ARNr 16S
Synthèse de protéines de membrane anormales
Inhibition de la réplication de l’ADN
Les macrolides-lincosamidessynergistines (MLS)
Similitude
des spectres anti-bactériens et
des mécanismes d’action
MLS se fixent sur l’ARNr 23S du ribosome
50S
sites de fixation proches les uns des autres
inhibition de la phase d’élongation de la
synthèse peptidique
Action sur la réplication de
l’ADN
Fluoroquinolones
Les quinolones (1)
Deux
groupes:
Quinolones de 1ère génération ou urinaires
(aide nalidixique) actives uniquement sur les
bactéries à Gram négatif
Fluoroquinolones (ciprofloxacine, ofloxacine)
au spectre plus large et d’utilisation systémique
Les quinolones (2)
Inhibition
rapide de la synthèse de l’ADN
cibles: ADN gyrase (2 sous-unités A et B) et ADN
topo-isomérase IV
coupure du double brin d’ADN
complexe d’inhibition irréversible: quinoloneADN-gyrase
coupure non réparée
Blocage
de la réplication et de la transcription
Résistance naturelle et acquise
ACQUISE
NATURELLE
-
Toutes les souches
d ’une même espèce ⇒
Caractéristiques propre
de l ’espèce
- Quelques souches au sein
-
Transmission verticale
Gènes chromosomiques,
stables, transmis à la
descendance
d ’une espèce
- Fréquence de la résistance
dépend de la pression de
sélection des Antibiotiques
- Transmission horizontale entre
espèces
Support mobile (plasmide,
transposon, intégron)
Résistance naturelle
E.coli
Alcaligenes
Résistance acquise
P.aeruginosa
P.aeruginosa
Principaux mécanismes de
résistance
Inactivation
enzymatique
Modification de cible
Imperméabilité bactérienne
Efflux
Inactivation enzymatique
Mécanisme le plus fréquent et le mieux connu
Synthèse d’enzymes par la bactérie qui inactivent
les ATB
Béta-lactamines et aminosides: les plus touchés
Plus fréquent chez les GN que chez les GP
Mécanisme naturel ou acquis
Enzymes inactivant les
aminosides
Aminosides-phosphotransférases (APH)
Aminosides-nucléotidyltransférases (ANT)
Aminosides-acétyltransférases (AAC)
Enzymes inactivant les
aminosides
S. aureus
APH (3’) – III
ANT (4’) (4’’) – I
AAC (6’) – APH
(2’’)
PHENOTYPES DE
RESISTANCE
Kanamycine
Kanamycine
Tobramycine
Kanamycine
Tobramycine
Gentamicine
Efflux
Rejet de l’ATB dans le milieu extracellulaire
Elément-clé: pompe membranaire dont une
protéine dans la membrane cytoplasmique
Initialement: E. coli résistant à la tétracycline
Mécanisme inquiétant
Systèmes peu sélectifs ⇒ résistance à plusieurs
familles d’ATB et d’antiseptiques
Rôle physiologique important pour la bactérie
Efflux
Cocci à Gram positif:
S. aureus: résistance à la norfloxacine (norA)
S. pyogenes, S. pneumoniae: résistance à
l’érythromycine (mefA, mefE)
Bacilles à Gram négatif:
E. coli: résistance à la tétracycline (tet)
P. aeruginosa:
mécanisme d ’efflux concernant les béta-lactamines
plus récemment, caractérisation d ’un efflux vis-à-vis des
aminosides
Efflux
Exemple de P. aeruginosa
RESISTANCE
mexABoprM
Bétalactamines
mexCDoprJ
Céfépime, cefpirome, quinolones
mexEFoprN
aminosides
Expertise de
l’antibiogramme
Obligatoire
Par
Famille d’antibiotiques
Avec
l’identification de la souche
Bactéries GRAM +
Sensibles Vancomycine et Teicoplanine
Exceptions Lactobacillus, Enterococcus
casseliflavus, E.gallinarum
rares souches de Staphylocoques, et
Entérocoques(<1%)
Résistantes au Negram, Pipram 
Résistantes à l ’Aztréonam, colistine
Résistance naturelle
Bactéries GRAM Résistants : Péni G et Glycopeptides
SENSIBLES : AZTREONAM
COLISTINE
(Exceptions : Proteus, Serratia),
STAPHYLOCOCCUS AUREUS
Bêta-lactamines
– Péni G
* 90% R (pénicillinase)
R Amoxicilline , Ticarcilline, Pipéracilline
R ( PLP2A, gène mecA)
et Sta Méti R
– Oxacilline * 25 à 35 %
Sta Méti S
OXA = R R à toutes les bêta-lactamines
(Imipénème, Augmentin)
STAPHYLOCOCCUS AUREUS
Péni S S
Péni A,
S Augmentin, Imipénème
Céphalosporines I, II, III
Sta Méti S
Péni R R
Péni A,
S Augmentin, Imipènème
Céphalosporines I, II, III
STAPHYLOCOCCUS AUREUS
Péni S RARE
Sta Méti R
Péni R R Péni A,
Augmentin, Imipènème
Céphalosporines I, II, III
S.aureus et Aminosides
Amika Tobra Genta
Kana
Nétil
Sauvage
S
S
S
K
R
S
S
KT
R
R
S
KTG
R
R
R
90 % Sta Méti R
R Amikacine et Tobramycine
S.aureus
Quinolones
Si R Oflo ( péflo) alors R à toutes les
quinolones ( Résistance croisée)
Macrolides
90 % Sta Méti R sont R aux Macrolides
Bactrim : 97 % S.aureus Sensibles
S.aureus
Glycopeptides
98 %
Teico
S.aureus
Sensibles
Vanco et
1996 1ER SARM Résistant Vanco (CMI >8
mg/l) / Japon
- VRSA ou VISA ou GISA
- hétéro-VISA (CMI =4 mg/l)
SARM /sensibilité aux
glycopeptides
1997
23 SARM GISA / Japon
Dissémination « hétéroVRSA »==> capable de générer
des SARM VRSA
Pourquoi le SARM plus
épidémique que le SASM ?
Rôle du gène mec A dans la colonisation?
Epidémiologie des SARM ==> Clonalité
Hétérogène ou Homogène
Genta R puis S
SARM
S.aureus résistant à l’oxacilline (1)
Sites de portage
Nez
Transmission croisée
+++
Contamination
environnementale
++
Pression de sélection
Antibiotique
+
Diffusion clonale
++++
Peau
SARM
S.aureus résistant à l’oxacilline (2)
SARM = BMR
Bactéries «proches»
même genre
mécanismes de
résistance identiques
Mais pas S.epidermidis
SARM
facteurs de virulence
protéine A Fixation
/Fibrinogène (endothélium
bronchique) (Mongodin
Infec.Immun 2002)
Enzymes lésions
cellulaires et tissulaires ,
pénétration dans les cellules
ENTEROCOQUE
Bêta-lactamines
Résistance naturelle à Péni G , Oxacilline
SENSIBLES
Céphalosporines
Péni A, Augmentin,Pipéra,
Imipénème
– Exceptions : E. faecium Résistantes
Quinolones
Activité médiocre de Péflo, Oflo, Ciprofloxacine
Activité meilleure des nouvelles fluroquinolones
ENTEROCOQUE
Aminosides
Résistance naturelle de bas niveau
Association possible avec les bêta-lactamines si
Absence de Résistance de Haut Niveau
3% E.faecalis R de haut niveau à Genta
Macrolides
Résistance
naturelle à
Pristinamycine / E faecalis
Lincomycine
et
ENTEROCOQUE
Vancomycine
* SENSIBLES
* < 5 % E.faecium et E.faecalis résistants
- Phénotype vanA==> R Vanco et Teico
- Phénotype van B ==>R Vanco , S Teico
Streptocoques et
Pneumocoques
Bêta-lactamines
Sensibles à Péni G , Céphalosporines
SENSIBLES Péni A, Augmentin,Pipéra,
Imipénème
Pneumocoque I ou R β-lactamines
S CMI < 0.06 mg/L
I 0.12 < CMI < 1 mg/L
R CMI > 1 mg/L
ENTEROBACTERIES
GROUPE
I E.coli , Salmonella, Proteus
mirabilis
GROUPE
II Klebsielle, Citrobacter koseri
GROUPE
III
Enterobacter, Serratia,
Morganella, Citrobacter freundii
GROUPE
IV Yersinia
Entérobactéries et β-lactamines
Phénotypes GROUPE GROUPE GROUPE III
Sauvages
I
II
E.coli
Klebsielle Enterobacter
Serratia
Amoxicilline
S
R
R
Ticarcilline
S
S
R
Pipéracilline
S
S/I
S
Augmentin
S
S
R
Imipénème
S
S
S
Céphalo I/II
S
S
R
Céphalo III
S
S
S
Aztréonam
S
S
S
Entérobactéries et β-lactamines
GROUPE I
E.coli
Amoxicilline
Ticarcilline
Pipéracilline
Augmentin
Imipénème
Céphalo I/II
Céphalo III
Aztréonam
Pase
Case
BN
Case HN
BLSE
R
R
S
S/R
S
I/R
S
S
R
S
S
R
S
R
S
S
R
R
R
R
S
R
I/R
I/R
Entérobactéries
Résistantes aux céphalosporines III génération
Céfotaxime (Claforan) Ceftazidime
(Fortum)
Ceftriaxone (Rocéphine) Céfépime (Axépim)
2
Mécanismes
BêtaLactamase à Spectre Etendu (BLSE)
Hyperproduction de la Céphaloporinase
naturelle (EBCASE)
Entérobactéries
IMP
CTX
CAZ
AMC
IMP
CTX
CAZ
AMC
FEP
EBLSE
EBCASE
EBLSE
ECASE
Tube digestif
Sites de portage
Transmission croisée
+++
Contamination
environnementale
-
+
+
+
Pression de sélection
Antibiotique
Diffusion clonale
++++
+
-
Pseudomonas aeruginosa
Résistants : Bactrim, Negram
Résistants : Péni G et Péni A
Augmentin, C IG, CIIG
Cefotaxime, Ceftriaxone
SENSIBLES : Ticarcilline, Pipéracilline,
Ceftazidime Aztréonam
Imipénème
Pseudomonas aeruginosa
Ticar
Aztré Cefta Imip
Sauvage
S
S
S
S
Pase
R
S
S
S
Case HN
R
I
R
S
D2
S
S
S
R
Efflux
I
I
S/I
S/I
P.aeruginosa
Aminosides
Genta < Tobra = Amika
Quinolones
Oflo < Norflo < CIPRO
Sensibilité (%) P.aeruginosa
Nantes - GERPB D’après GERPB Cavallo
Ticarcilline
S
I+R
(%)
(%)
58
Pipéracilline
73
Ceftazidime
76
Cefépime
53
Aztréonam
58
Imipénème
81
Amikacine
62
Tobramycine
71
Ciprofloxacineene 60
42
27
24
47
42
19
38
29
41
Nantes
(% S)
52
72
78
59
62
75
83
72
53
Nantes
(%R)
48
28
22
41
38
25
17
28
45
Quels sont les antibiotiques que vous
conseilleriez pour traiter une bactériémie à
SARM ? (plusieurs réponses)
Augmentin
Vancomycine
Targocid
Tiénam
Amikacine
Oflocet
Quels sont les antibiotiques que vous
conseilleriez pour traiter une infection
respiratoire à Pseudomonas aeruginosa?
(plusieurs réponses)
Augmentin
Claforan
Fortum
Tiénam
Amikacine
Vancomycine
Le laboratoire vous répond : Présence de
E.coli avec BLSE (bêta-lactamase à spectre
étendu) dans les urines de Mr New….. Quel
traitement mettez vous en route?
Augmentin
Ciprofloxacine
Claforan
Clamoxyl
Fortum
Tiénam
Amikacine
Vancomycine
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