Brin d`ARN

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EXPRESSION DU PATRIMOINE
GENETIQUE : LA
TRANSCRIPTION DE L’ADN
INTRODUCTION - DÉFINITION
Rappel : définition moléculaire du gène
5’
A
B
ARNm
ARNr
3’
C
ARNt
Protéine fonctionnelle
Flux de l ’information génétique : ADN
Définition de la transcription
Segment d’ADN (gène)
ARN
transcription
Protéine
traduction
Brin d’ARN (séquence complémentaire de l’ADN)
ARN messager, de transfert et ribosomial
Réplication (ADN copié entièrement)≠ Transcription (copie d ’un fragment)
Régulation de la transcription : présence sur l ’ADN de séquences régulatrices
Transcrit primaire
ARN mature
Modifications post-transcriptionnelles
Concept d ’ARN messager (F. Jacob et J. Monod 1961, Nobel en 1965)
ADN
protéines
ARNm
ARNm
ribosomes
L’ARN
Acides ribonucléiques caractérisés :
• par l’ose : le ribose
• par les bases : Adénine (A) , Uracile (U) (remplace Thymine),
Cytosine (C), et Guanine (G)
• Une seule chaîne de nucléotides beaucoup plus courte que celle
de l’ADN
• Règles d’appariement : A U et C
G
On peut les observer :
soit entre 2 molécules d’ARN différentes
soit dans une même molécule dans une région repliée.
Les différents ARN
Plusieurs types d’ ARN dans les cellules, 3 principaux:
• ARNr ( ribosomiques ) ~ 71%
• ARNt ( de transfert )
~ 16%
• ARNm ( messager )
~ 2-3 %
Les ARNr et les r protéines
Ribosomes : complexes composés de protéines et d’ARN,
nécessaires à la synthèse des protéines
Présents chez eucaryotes et procaryotes
Ils sont constitués de 2 sous unités: une petite qui « lit » l’ARNm
et une grosse qui associe les acides aminés pour former la
protéine correspondante
L’ARN de transfert : ARNt
Ils véhiculent les acides aminés du cytoplasme vers le lieu de la
synthèse protéique: les ribosomes, et assurent la correspondance entre
l’information génétique contenue dans l’ARNm et les acides aminés
(AAs) de la protéine codée par cet ARNm.
Structure d’un ARNt: forme de trèfle,
~100 nucléotides, contient un site de
fixation d’acides aminés en 3’ et un site
anticodon spécifique de l’AA qu’il
transporte (ici phénylalanine).
Sablonnière et al.,
Omniscience 2010
L’ARN messager
Il porte une partie de l’information génétique contenue au niveau
de l’ADN jusqu’aux ribosomes.
La durée de vie des ARNm est très courte ( qq minutes à qq jours )
Structure:
Il est formé d’une seule chaîne de nucléotides
La séquence des bases constitue un code qui sert à transporter le
message. Chaque groupe de 3 nucléotides sur l’ARNm forme un
codon qui codera un AA particulier au niveau du ribosome.
Mécanisme général de la transcription
Réaction de biosynthèse de l ’ARN
ARN + ribonucléotides triphosphate
ARN + PPi (énergie)
ARN polymérase
- matrice
- précurseurs (ATP, GTP, CTP, UTP)
- Mg 2+
Molecular Biology of the
Cell, Alberts 2011
Complémentarité des bases
ADN matriciel
A
T
G
C
ARN produit
U
A
C
G
Promoteur de procaryotes
5’
- 35
-10
TTGACA
TATAAT
5’
GGCCAATCT
Boîte CCAAT
Départ de l’ARN
3’
Boite de Pribnow
Promoteur d ’eucaryotes
- 110
+1
CGGCGG
- 40
Boîte GC
- 25
+1
TATAAAA
Départ de l’ARN
Boîte TATA
L’ARN polymérase reconnaît une séquence en 5’ du gène: le
promoteur qui contient des motifs particuliers, c’est l’Initiation.
La fixation du complexe ARN polymérase entraine l’ouverture de
la double hélice.
L’élongation se fait dans le sens 5’ vers 3’ .
3’
ARN
Brin matrice : brin -
ADN
Brin non matrice : brin
codant = brin +
ARN polymérase ADN dépendante
Chez E.coli (390 000 Da)
Association transitoire
Cœur de l ’enzyme
ß
ß’
w a
s70
a
Cellules eucaryotes
ARN polymérase I (Pol I) : ARN r
ARN polymérase II (Pol II) : ARN m
ARN polymérase III (Pol III) : ARN t
Déroulement de la transcription
Initiation
ARN polymérase
s70
5’
3’
-1
+1
3’
5’
Synthèse de l’ARN
promoteur
ADN db
ARNm
3’
5’
Gène A
3’
5’
ARNm
5’
Gène B
3’
ARNm
3’
5’
Gène C
3’
5’
Élongation
ARN polymérase
Brin codant ou brin « + »
Boucle de transcription
3’
Brin matrice ou
brin « - »
3’
5’
5’
3’
Hybride ADN-ARN
5’
ARN
Direction de la transcription
La lecture du brin matrice par l’ARN polymérase s’accompagne
de l’ouverture de la double hélice d’ADN et est suivie par le réappariement des 2 brins d’ADN
ADN
Terminaison
Séquences « terminateurs » riches en GC sur
l’ADN matrice (Procaryotes)
Appariement des bases dans l ’ARN
C
U
C
U
G
G
A
C
G
C
C
G
5’
UAAUCCCACA
C
U
G
C
G
G
C
AUUUU(3 ’OH)
Structure en “épingle à cheveux”
Rupture de l ’hybride ADN-ARN
Autre mécanisme : protéine Rho qui détache l’ARN polymérase de l’ADN matrice
Eucaryotes: séquence AAUAAA sur l'ARN synthétisé
Exon: EXpressed regiON
Intron: INTRagenic regiON
Modifications post-transcriptionnelles et régulation de la transcription
Maturation des ARN
Modification des extrémités
Extrémité 5 ’ : addition du chapeau ou coiffe “ Cap”
7 méthylguanosine
Servent à protéger
le pré-ARN
H
Extrémité 3 ’ : queue poly (A)
ARN nouvellement synthétisé
Poly (A) polymérase
3’
Terminaison
Epissage
5’
ADN
exon 1
3’
intron A exon 2
intron B
intron A exon 2
intron B
exon 3
3’
5’
transcription
Pré ARNm =
transcrit primaire
exon 1
exon 3
épissage
ARN mature
exon A exon B
exon C
3
E
Ex : gène de l ’ovalbumine
A
1
B
2
C
D
4
5 F6
G
7
7700 pb
transcription
A
1
B
2
C
7 introns
1
2 3
3
D
4
E
5 F6
Épissage, polyadénylation
4 5 6
coiffe
1872 nucléotides
7
AAAA(A)n
G
7
L’épissage est réalisé par le spliceosome un complexe formé
de protéines et d’ARN. La maturation des ARNm eucaryotes
consiste en l’excision des introns et l’épissage des exons.
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