Sujet du stage (sous forme de titre court) : La réplication de l`ADN

Sujet du stage
(sous forme de titre court)
:
La réplication de l'ADN chez les eucaryotes
Laboratoire
Nom du Responsable : Marie-Claude MARSOLIER-KERGOAT
Affiliation administrative (CNRS,
INSERM...) et n° l'Unité :
CEA
Adresse précise du Laboratoire
:
Laboratoire du métabolisme de l'ADN et réponses aux
génotoxiques
CEA/DSV/iBiTec-S/SBIGeM, bâtiment 144
91191
Équipe d'accueil des Doctorants
Nom de l'équipe: Mécanismes de Surveillance de l'ADN
Nom du Responsable : Marie-Claude Marsolier-Kergoat
École Doctorale de rattachement
:
Gènes, Génomes, Cellules
Responsable du Stage
Nom : Arach Goldar
Numéro de téléphone : 01 69 08 64 86
Numéro de télécopie :
Adresse électronique : [email protected]
Profil de l'étudiant(e) souhaité : Physique et/ou biophysique
Renseignements complémentaires
Perspectives de poursuite de
thèse :
X oui Non
Avec une bourse spécifique : oui
X
Non
si oui précisez :
Laboratoire d'accueil (Unité
CNRS, INSERM, etc..) :
Nombre de chercheurs : 4 (dont 2 dans l'équipe
d'accueil)
Nombre d'enseignants-
chercheurs :
0 (dont 0
dans l'équipe
d'accueil)
Nombre de "HDR" : 3 (dont 1 dans l'équipe
d'accueil)
Nombre d'ITA : 3 (dont 0 dans l'équipe
d'accueil)

Nombre de "post-docs" : 2 (dont 0 dans l'équipe
d'accueil)
Nombre de visiteurs étrangers : 0 (dont 0 dans l'équipe
d'accueil)
Sujet de stage (et principales techniques) :
L’ADN génomique est associé à tout instant à des protéines. Ces protéines sont en
compétition pour interagir avec des séquences régulatrices. Le complexe protéique le plus
abondamment présent le long de l’ADN est appelé le nucléosome. Les nucléosomes
confèrent à l’ADN une structure tridimensionnelle appelée la chromatine. Cependant, les
connaissances actuelles ne permettent pas d’inscrire la structure locale et globale de la
chromatine dans le cadre des processus de régulation du cycle cellulaire.
Nous utiliserons comme système modèle la levure de boulanger, Saccharomyces
cerevisiae
Comme pour toute cellule eucaryote, le cycle cellulaire de la levure comprend trois phases avant sa
division : 1) la préparation de l’ADN à
la duplication (phase G1), 2) la duplication de l’ADN (phase
S) et 3) le contrôle de l’ADN dupliqué et la préparation à la division cellulaire (phase G2).
cerevisiae
possède 16 chromosomes. La réplication de l’ADN commence de façon asynchrone à
plusieurs loci chromosomiques appelés les « origines de réplication
». La déclenchement d’une
origine crée deux fourches de réplication qui progressent dans des sens opposés avec une vitesse
constante. Les connaissances actuelles permettent de décrire de façon dé
taillée les protéines
intervenant durant la réplication de l’ADN, cependant les facteurs qui influent sur le positionnement
des origines de réplication et leur temps de déclenchement sont mal connus.
Nous proposons d’é
tudier les relations entre la structure de la chromatine et la position des origines
de réplication. Pour cela, nous utiliserons la technique de peignage moléculaire pour détecter les
origines de réplication et analyser leur répartition spatiale et tempore
lle. En utilisant des concepts
issues de la physique statistique nous explorons l'existence d'une relation entre la distribution
spatio-temporelle des origines de réplication et la structure de la chromatine.
Techniques mises en œuvre :
Culture cellulaire,
Peignage moléculaire,
Analyse du signal
Physique statistique
Modélisation.