stage_M2_bio_Zapun_2009-10 - Institut de Biologie Structurale

Master Sciences du Vivant - UFR de Biologie
Sujet de stage de Master 2 Recherche
Année 2009/2010
Laboratoire : IBS
Intitulé de l'équipe : LIM
Directeur : Eva Pebay-Peyroula
Responsable : Thierry Vernet
Nom et qualité du responsable du stage : André Zapun CR1 CNRS
Adresse : Institut de Biologie Structurale J-P. Ebel
CNRS (UMR 5075)/CEA/UJF 41 rue Jules Horowitz
38027 Grenoble Cedex 1
Tél : 04 38 78 92 10
email : [email protected]
HDR
oui
non
Spécialité MASTER :
Biologie Cellulaire et Intégrative
Biodiversité - Ecologie – Environnement
Biochimie, Biologie Structurale
Titre du sujet : Comprendre le talon d’Achille des bactéries : l’assemblage de la paroi du
pneumocoque
Objectifs recherchés (3 lignes max) :
Identifier les protéines participants aux différentes machineries de synthèse de la paroi bactérienne, cible
des antibiotiques de la classe de pénicillines, lors des différentes phase du cycle cellulaire.
Résumé (10 lignes max) :
Deux complexes enzymatiques distincts sont supposés synthétiser la paroi cellulaire lors de la croissance
et de la division du pneumocoque, une bactérie pathogène pour l’Homme. Ces complexes seraient
composés de « penicillin-binding proteins » (PBPs) et de protéines accessoires, dont certaines
membranaires. Les PBPs mutent sous la pression de sélection par les beta-lactamines et rendent les
bactéries résistantes aux antibiotiques de cette classe. Nous allons étudier ces complexes en localisant
les diverses PBPs chez le pneumocoque par l’observation par microscopie de fluorescence des PBPs
fusionnées à la protéine fluorescente verte (GFP). L’impact d’antibiotiques bloquant spécifiquement
certaines PBPs sur leur localisation sera observée afin de comprendre leurs différents rôles.
Parallèlement, des complexes protéiques incluant des PBPs pourront être reconstitué in vitro, une
stratégie ambitieuse réalisée en collaboration avec 3 laboratoires situés en Angleterre.
Approches & matériel utilisés (3 lignes max) :
Cultures de pneumocoques recombinants fluorescents. Microscopie de fluorescence. Expression et
purification de protéines recombinantes
Publications pertinentes de l'équipe (3 max) :
Zapun, A., Vernet, T., and Pinho, M. G. (2008) The different shapes of cocci. FEMS Microbiol. Rev. 32, 345-60
Zapun, A., Contreras-Martel, C., and Vernet, T. (2008) Penicillin-binding proteins and beta-lactam resistance. FEMS
Microbiol. Rev. 32, 361-85
Le Gouëllec, A., Roux, L., Fadda, D., Massidda, O., Vernet, T. and Zapun, A. (2008) Roles of pneumococcal DivIB in
cell division. J. Bacteriol. 190, 4501-11
Domaines de compétences souhaités (quelques mots clés) :
Pour BCI indiquez aussi la sous-spécialité (Biologie Végétale, Développement et Différenciation, Immunologie, Neurosciences,
Physiologie, Microbiologie)
Microbiologie, Microscopie, Biochimie