Réseaux phylogénétiques pour la visualisation de données
07/04/2011
Séminaire MaBioVis - LABRI
Réseaux phylogénétiques
pour la visualisation de données
biologiques et textuelles
Philippe Gambette
• Les réseaux phylogénétiques
• Méthodes de reconstruction
• Limites des méthodes combinatoires
• Illustration sur des données biologiques
• Utilisation sur des données textuelles
• Perspectives
Plan
Plan
• Les réseaux phylogénétiques
• Méthodes de reconstruction
• Limites des méthodes combinatoires
• Illustration sur des données biologiques
• Utilisation sur des données textuelles
• Perspectives
D'après Lamarck : Histoire naturelle des animaux
sans vertèbres (1815)
Les arbres phylogénétiques
Arbre phylogénétique d'un ensemble d'espèces :
• Les organiser en fonction de caractères communs
• Décrire leur évolution
classification
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D'après Woese, Kandler, Wheelis : Towards a natural system of organisms: proposal for the
domains Archaea, Bacteria, and Eucarya, Proceedings of the National Academy of Sciences,
87(12), 4576–4579 (1990)
Les arbres phylogénétiques
Arbre phylogénétique d'un ensemble d'espèces :
• Les organiser en fonction de caractères communs
• Décrire leur évolution
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