Sommaire
SOMMAIRE
PROLOGUE........................................................................................................... 1
INTRODUCTION GENERALE............................................................................... 1
IL Y A SATELLITE ET MICROSATELLITE ! ..................................................................... 2
LES ESPACES D’ALTITUDE, VERITABLES CONSERVATOIRES DE BIODIVERSITE. ............. 7
Impact du changement climatique sur les espaces d’altitude (notamment
la limite supérieure de la forêt) ...................................................................... 9
Impact anthropique sur les espaces d’altitude et leur biodiversité
associée.......................................................................................................... 10
Activités agro-pastorales, modifications des habitats et biodiversité :........ 10
Domaines skiables, modifications des habitats et biodiversité : ................. 12
LES GALLIFORMES DE MONTAGNE........................................................................... 13
Le lagopède alpin :...................................................................................... 14
La perdrix grise :.......................................................................................... 17
CHAPITRE I......................................................................................................... 24
ETUDE DE LA STRUCTURATION GENETIQUE DES POPULATIONS DE
LAGOPEDE ALPIN (LAGOPUS MUTA PYRENAICA) DANS LES PYRENEES.
............................................................................................................................. 24
I/ INTRODUCTION................................................................................................ 25
II/ Zone d’étude et échantillonnage ............................................................. 26
III/ Marqueurs microsatellites....................................................................... 27
A/ Amplification des marqueurs microsatellites .......................................... 27
B/ Validation des marqueurs microsatellites ............................................... 28
IV/ Distribution de la variabilité génétique.................................................. 29
V/ Structuration génétique............................................................................ 32
VI/ Goulot d’étranglement............................................................................. 40
Annexes.......................................................................................................... 46
Annexe I1 : Détails des années de prélèvement par site d’échantillonage..... 46
Annexe I2 : Recensement des marqueurs microsatellites mis en évidence
chez les Tétraonidés. ...................................................................................... 47
Annexe I3 : Arbre phylogénétique des oiseaux et détail de l’arbre
phylogénétique des Ansériformes et galliformes............................................. 48
Annexe I4 : Article publié dans Animal Conservation. .................................... 49
Annexe I5 : Action de translocation de lagopède alpin dans les Pyrénées. ... 58
CHAPITRE 2........................................................................................................ 64
ETUDE DE LA STRUCTURATION GENETIQUE DES POPULATIONS DE
PERDRIX GRISE (PERDIX PERDIX) EN FRANCE. .......................................... 64
I/ Introduction : .............................................................................................. 65
II/ Détermination des marqueurs moléculaires :........................................ 69
A/ Détermination des marqueurs microsatellites ........................................ 69
B/ Détermination du marqueur du sexe chez la perdrix grise..................... 70