Les modèles éditoriaux par rapport aux bases de données

Les modèles éditoriaux par rapport aux bases de données
Geoscience Data Journal (Wiley)
http://onlinelibrary.wiley.com/journal/10.1002/%28ISSN%292049-6060
Geoscience Data Journal est une revue en ligne qui publie des articles courts liés à des bases de
données qui ont été déposées dans des entrepôts. Les articles de cette revue citent les bases de
données correspondantes. Cette revue est publiée par Wiley. Geoscience Data Journal permet aux
bases de données d'être décrites, citées et découvertes. De plus le peer-review permet de contrôler
les données de ces bases de données. Geoscience Data Journal est une revue en open access.
Pour publier dans Geoscience Data Journal, les auteurs doivent réaliser deux étapes :
•La base de données, avec les métadonnées, doit être archivée dans un entrepôt de données
approuvé par Geoscience Data Journal, et de préférence il doit lui être attribué un DOI.
•Un article doit être écrit et transmis en utilisant le système de soumission en ligne de
Geoscience Data Journal. Cet article décrit la base de données, donne des détails sur la
collecte des données, leur traitement, les formats des fichiers... Le texte de l'article doit
contenir entre 1200 et 6000 mots, avec des références, des mots-clés et un résumé
n'excédant pas 300 mots. Le nombre de mots doit être indiqué à la soumission de l'article.
Il y a une publication fee de 1 500 $.
Liste des entrepôts agréés par Geoscience Data Journal :
•3TU.Datacentrum
•British Atmospheric Data Centre (BADC)
•British Oceanographic Data Centre (BODC)
•CISL Research Data Archive
•CSIRO Data Access Portal
•Environmental Information Data Centre (EIDC)
•Figshare
•IEDA:EarthChem
•IEDA:MGDS
•National Center for Atmospheric Research (NCAR), USA
◦Earth Observing Lab (EOL), observational and supporting data from atmospheric
science field experiments and arctic research
◦Research Data Archive (RDA), reference datasets for weather and climate research
•National Geoscience Data Centre (NGDC)
•NERC Earth Observation Data Centre (NEODC)
•NOAA National Climatic Data Center (NCDC)
•NOAA National Oceanographic Data Center (NODC)
•NOAA National Geophysical Data Center (NGDC)
•PANGAEA
•Polar Data Centre (PDC)
•Zenodo.
Si la base de données et l'article sont validés par Geoscience Data Journal, l'article avec la
description des données et un lien vers la base de données (en général au moyen du DOI de la base
de données) sera publié. Chaque article est publié sous la licence Creative Commons.
Earth System Science Data (Copernicus)

http://www.earth-system-science-data.net/
Earth System Science Data (ESSD) est une revue internationale interdisciplinaire. Elle publie des
articles traitant de recherches qui s'appuient sur des bases de données. Cette revue est publiée par
Copernicus, elle est en open access. Le peer-review garantit que les données ne contiennent pas de
problèmes détectables, soient munies de métadonnées standard (par exemple ISO 19115) et
disponibles dans un entrepôt certifié. ESSD permet l'utilisation de données de qualité. Les articles
doivent permettre au lecteur de vérifier et d'utiliser les données avec un minimum d'efforts. Dans ce
but, toutes les informations et les références nécessaires doivent apparaitre dans l'article. En général
les articles sont courts mais il n'y a pas de limite dans le nombre de pages.
Actuellement il n'y a pas de charges pour publier dans ESSD.
Critère de la base de données :
•doit avoir un DOI
•doit être en open access
•doit être sous licence Creative Commons ou une licence équivalente
•doit être disponible sur le long terme et disposer d'un accès permanent
Exemple d'entrepôts qui ont déjà été utilisés pour la publication d'articles dans ESSD :
•BODC (British Oceanographic Data Centre)
•CDIAC (Carbon Dioxide Information Analysis Center)
•HOAPS (Hamburg Ocean Atmosphere Parameters and Fluxes from Satellite Data)
•NORPERM (Norwegian Permafrost Database)
•PANGAEA (Data Publisher for Earth & Environmental Science)
•ZALF Open Research Data (Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research).
Scientific Data (Nature)
http://www.nature.com/scientificdata/
Scientific Data est une revue en open access pour la description de bases de données scientifiques.
Elle est publiée par Nature. Cette revue existe pour aider les chercheurs à publier, découvrir et
réutiliser les données de la recherche. Les données scientifiques doivent être disponibles, citables,
découvertes, interprétables, réutilisables et reproductibles. Les objectifs de Scientific Data sont
basés sur ces besoins. Les articles sont soumis à un peer-review.
L'article doit contenir des descriptions détaillées des bases de données issues d'expériences ou
d'observations. L'article inclut la description des méthodes utilisées pour collecter les données et les
analyses techniques sur les mesures. Il n'y a pas de limite dans le nombre de pages. Les articles sont
publiés sous licence Creative Commons.
L' APC est entre 675 et 750 €.
Critères que doivent respecter les entrepôts :
•être reconnus à l'intérieur de la communauté scientifique
•assurer la persistance sur le long terme des bases de données
•fournir des identifiants stables aux bases de données
•autoriser l'accès aux données sans restriction.
Entrepôts recommandés :
•National Climatic Data Center (NCDC)
•Oak Ridge National Laboratory Distributed Active Archive Center (ORNL DAAC)
•NERC Data Centres

•PANGAEA
•Reaction Database Standard Search Interface
•SIMBAD Astronomical Database
•UK Solar System Data Centre
De manière générale, pour toutes ses revues, Copernicus recommande de déposer les données
correspondant à l'article dans un entrepôt de données fiable, de leur assigner un DOI et de citer la
base de données comme une citation propre.
Dataset Papers in Geosciences (Hindawi)
http://www.hindawi.com/journals/dpis/
Dataset Papers in Geosciences est une revue en open access avec peer-review. Elle est publiée par
Hindawi. Elle est dévolue à la publication d'articles s'appuyant sur des bases de données dans tous
les domaines dela science et de la médecine.
La revue héberge les données associées à l'article.
Il n'y a pas de limite dans le nombre de pages. L'article doit notamment contenir la méthodologie et
le matériel utilisé pour conduire les expériences ou observations décrites dans la base de données.
Les informations sur la méthodologie doivent être détaillées le plus possible. Les auteurs doivent
également fournir une description détaillée de la base de données. Si le jeu de données a été déposé
dans une base de données publique, les auteurs doivent fournir les informations pour accéder aux
données, notamment l'URL de la base de données. L'article et la base de données sont publiés sous
licence Creative Commons.
Actuellement il n'y a pas de charges pour publier dans Dataset Papers in Geosciences.
Elsevier
Elsevier crée des liens entre l'article en ligne sur ScienceDirect et la base de données présente dans
un entrepôt. Elsevier encourage les auteurs à déposer leurs bases de données dans un entrepôt.
Entrepôts supportés :
•ASTM (formerly, American Society for Testing and Materials)
•Atmospheric Radiation Measurement (ARM) Data Archive
•BGS GeoScenic
•Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC)
•EarthChem
•HepData (Durham Reaction Database)
•Marine Geoscience Data System (MGDS)
•NASA/IPAC Extragalactic Database
•Natural Environment Research Council (NERC), including BADC, BODC, EIDC and
NGDC.
•Oak Ridge National Laboratory (ORNL) Distributed Active Archive Center (DAAC)
•PANGAEA
•SIMBAD Astronomical Database
•System for Earth Sample Registration (SESAR), registry for International Geo Sample
Numbers (IGSN)
•ThermoML (NIST)
•Woods Hole Open Access Server (WHOAS).

Journal of Astronomical data
http://www.vub.ac.be/STER/JAD/jad.htm
Le Journal of Astronomical Data (JAD) est une revue en open access qui se veut complémentaire
des banques de données existantes. Elle publie des données astronomiques pour leur utilisation dans
des recherches futures et dans un but d'archivage. Elle publie des bases de données issues
d'observations, des vidéos, des images, des codes informatiques...
Les données qui sont déjà disponibles de manière permanente dans des banques de données ne sont
pas adaptées à la publication dans cette revue.
Les articles sont soumis à au moins un référent. Il n'y a pas de charges de publication.
L'article contient une description des données, de la procédure de collecte (instruments, réduction
des données), et, le cas échéant, la procédure d'étalonnage, ainsi que les données proprement dites.
L'article ne doit pas contenir l'analyse des données, celle-ci sera publiée ou a déjà été publiée dans
une autre revue. Les données doivent être transmises à la revue. Elles ne doivent pas encore être
disponibles dans une banque de données publique.
Journal of Chemical & Engineering Data (ACS)
http://pubs.acs.org/journal/jceaax
Journal of Chemical & Engineering Data (JCED) est une revue qui publie des données issues
d'expériences et de calculs. Elle est publiée par l'American Chemical Society. Cette revue publie en
premier lieu des articles qui contiennent des données sur la physique, la thermodynamique, la
composition des matériaux.
Les articles contiennent de nouvelles méthodes expérimentales, des données expérimentales, ou des
résultats de calculs. JCED encourage les articles avec des calculs de propriétés thermophysiques
incluant des comparaisons avec des données expérimentales. Tous les articles doivent inclure des
résultats et leur discussion (pas d'articles courts).
Il est possible de publier en open access (ACS AuthorChoice), l'APC est alors de 4 000 $.
Astronomy & Astrophysics ( EDP Sciences)
http://www.aanda.org/
Astronomy & Astrophysics (A&A) est une revue internationale qui publie des articles sur tous les
aspects de l'astronomie et de l'astrophysique (ce n'est pas un data journal). Elle est publiée par EDP
Sciences. Il est obligatoire pour les auteurs de publier les données qui sont présentées et discutées
dans les articles et dont on a besoin pour reproduire les résultats. La publication des données se fait
généralement au Centre de Données astronomiques de Strasbourg (CDS). Quand les données
primaires d'observation sont archivées, par exemple par l'European Southern Observatory (ESO) ou
Hubble Space Telescope (HST), et sont publiques, ce n'est pas la peine pour les auteurs de les
fournir à A&A. Dans ce cas A&A n'archive que les données réduites.
Les auteurs peuvent choisir de publier leur article en open access en payant une charge de 400 €.
Le 22/04/2013, Emilie Chirouze, stagiaire M2P IST